Doublet Group distance statistics: 51644

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.005, 0.029, 0.054, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.025
C4	B	0, 0.060, 0.381, 0.703, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.381 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.049, 0.370, 0.692, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.370 std_dev=0.322
C2	B	0, 0.086, 0.422, 0.758, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.422 std_dev=0.336
C5	B	0, 0.074, 0.470, 0.866, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.470 std_dev=0.396
N1	B	0, 0.092, 0.491, 0.890, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.491 std_dev=0.399
C6	B	0, 0.079, 0.529, 0.980, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.529 std_dev=0.450
N2	B	0, 0.110, 0.615, 1.121, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.615 std_dev=0.506
N9	B	0, 0.049, 0.562, 1.074, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.562 std_dev=0.512
N7	B	0, 0.033, 0.647, 1.261, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.647 std_dev=0.614
C8	B	0, 0.017, 0.670, 1.324, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.670 std_dev=0.654
O6	B	0, 0.038, 0.712, 1.386, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.712 std_dev=0.674
C1'	B	0, 0.008, 0.714, 1.420, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.714 std_dev=0.706
O4'	A	0, -0.376, 0.730, 1.835, 2.495 max_d=2.495 avg_d=0.730 std_dev=1.106
C2'	A	0, -0.370, 0.807, 1.985, 2.700 max_d=2.700 avg_d=0.807 std_dev=1.177
C4'	A	0, -0.466, 1.026, 2.519, 3.452 max_d=3.452 avg_d=1.026 std_dev=1.493
O4'	B	0, -0.225, 1.316, 2.857, 3.846 max_d=3.846 avg_d=1.316 std_dev=1.541
C3'	A	0, -0.491, 1.110, 2.711, 3.696 max_d=3.696 avg_d=1.110 std_dev=1.601
C2'	B	0, -0.317, 1.356, 3.030, 4.147 max_d=4.147 avg_d=1.356 std_dev=1.673
O2'	A	0, -0.515, 1.158, 2.831, 3.825 max_d=3.825 avg_d=1.158 std_dev=1.673
O2'	B	0, -0.308, 1.429, 3.165, 4.234 max_d=4.234 avg_d=1.429 std_dev=1.736
O3'	A	0, -0.525, 1.290, 3.104, 4.193 max_d=4.193 avg_d=1.290 std_dev=1.815
C4'	B	0, -0.447, 1.847, 4.140, 5.628 max_d=5.628 avg_d=1.847 std_dev=2.293
C3'	B	0, -0.526, 1.876, 4.279, 5.832 max_d=5.832 avg_d=1.876 std_dev=2.403
O3'	B	0, -0.515, 2.030, 4.574, 6.046 max_d=6.046 avg_d=2.030 std_dev=2.544
C5'	A	0, -0.885, 1.908, 4.700, 6.386 max_d=6.386 avg_d=1.908 std_dev=2.792
C5'	B	0, -0.811, 2.695, 6.200, 8.421 max_d=8.421 avg_d=2.695 std_dev=3.506
O5'	A	0, -1.119, 2.396, 5.911, 8.030 max_d=8.030 avg_d=2.396 std_dev=3.515
O5'	B	0, -0.968, 3.002, 6.971, 9.534 max_d=9.534 avg_d=3.002 std_dev=3.969
P	A	0, -1.496, 3.340, 8.176, 11.060 max_d=11.060 avg_d=3.340 std_dev=4.836
OP1	A	0, -1.560, 3.573, 8.705, 11.716 max_d=11.716 avg_d=3.573 std_dev=5.133
P	B	0, -1.558, 3.608, 8.775, 12.166 max_d=12.166 avg_d=3.608 std_dev=5.167
OP2	A	0, -1.605, 3.750, 9.105, 12.378 max_d=12.378 avg_d=3.750 std_dev=5.355
OP1	B	0, -1.629, 4.167, 9.962, 13.828 max_d=13.828 avg_d=4.167 std_dev=5.795
OP2	B	0, -1.907, 4.032, 9.971, 13.754 max_d=13.754 avg_d=4.032 std_dev=5.939

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.01	0.30	0.13	0.32	0.23
C2	0.01	0.00	0.09	0.31	0.00	0.74	0.00	1.53	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.18	0.53	0.94	1.69	1.21	1.34
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.22	0.03	0.10	0.06	0.08	0.03	0.08	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.22	0.12	0.07
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.02	0.00	0.23	0.03	0.12	0.55	0.12	0.33	0.23	0.50	0.23	0.02	0.01	0.02	0.05	0.10	0.20	0.06
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.31	0.00	0.71	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.28	0.03	0.39	0.07	0.14
C4'	0.01	0.74	0.02	0.00	0.31	0.00	0.09	0.00	0.26	0.44	0.55	0.72	0.14	0.29	0.05	0.28	0.01	0.01	0.01	0.19	0.19	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.23	0.00	0.09	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.12	0.13	0.52	0.23	0.44	0.42
C5'	0.13	1.53	0.22	0.03	0.71	0.00	0.36	0.00	0.69	0.54	1.20	1.42	0.48	0.30	0.10	0.08	0.20	0.01	0.01	0.30	0.38	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.26	0.00	0.69	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.10	0.24	0.16	0.32	0.05	0.06
C8	0.01	0.00	0.10	0.55	0.00	0.44	0.00	0.54	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.22	0.27	1.45	1.34	1.44	1.48
N1	0.01	0.00	0.06	0.12	0.01	0.55	0.00	1.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.42	0.49	1.17	0.75	0.83
N3	0.01	0.00	0.08	0.33	0.00	0.72	0.00	1.42	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.23	0.54	0.83	1.42	0.99	1.13
N6	0.01	0.01	0.03	0.23	0.01	0.14	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.19	0.16	0.45	0.15	0.35	0.34
N7	0.01	0.00	0.08	0.50	0.00	0.29	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.26	0.14	1.29	1.20	1.31	1.35
N9	0.00	0.01	0.04	0.23	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.02	0.01	0.61	0.37	0.57	0.53
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.05	0.28	0.18	0.08	0.13	0.34	0.04	0.17	0.20	0.33	0.16	0.00	0.10	0.17	0.10	0.09	0.26	0.06
O3'	0.24	0.18	0.02	0.01	0.05	0.01	0.12	0.20	0.10	0.22	0.05	0.23	0.19	0.26	0.02	0.10	0.00	0.19	0.07	0.04	0.38	0.19
O4'	0.01	0.53	0.01	0.02	0.28	0.01	0.13	0.01	0.24	0.27	0.42	0.54	0.16	0.14	0.01	0.17	0.19	0.00	0.36	0.16	0.38	0.29
O5'	0.30	0.94	0.05	0.05	0.03	0.01	0.52	0.01	0.16	1.45	0.49	0.83	0.45	1.29	0.61	0.10	0.07	0.36	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	1.69	0.22	0.10	0.39	0.19	0.23	0.30	0.32	1.34	1.17	1.42	0.15	1.20	0.37	0.09	0.04	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.32	1.21	0.12	0.20	0.07	0.19	0.44	0.38	0.05	1.44	0.75	0.99	0.35	1.31	0.57	0.26	0.38	0.38	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.23	1.34	0.07	0.06	0.14	0.02	0.42	0.01	0.06	1.48	0.83	1.13	0.34	1.35	0.53	0.06	0.19	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.42	0.17	1.05	1.27	0.13	0.50	0.09	0.45	0.30	0.34	0.29	0.20	0.12	0.14	0.31	0.81	1.24	0.09	0.98	0.46	0.87	1.29	1.10
C2	0.11	0.16	0.46	0.06	0.17	0.86	0.29	1.46	0.29	0.32	0.23	0.17	0.11	0.35	0.19	0.82	0.16	1.02	1.30	0.33	1.76	1.36	1.56
C2'	0.36	0.65	0.47	0.69	0.64	0.16	0.85	0.15	0.93	0.66	0.80	0.60	0.56	0.92	0.53	0.24	0.67	0.74	0.49	1.05	0.52	0.98	0.72
C3'	0.47	0.32	0.34	0.51	0.43	0.35	0.49	0.24	0.42	0.59	0.34	0.28	0.36	0.61	0.49	0.16	0.42	0.90	0.34	0.44	0.46	0.92	0.65
C4	0.20	0.11	0.61	0.51	0.06	0.24	0.13	0.60	0.23	0.10	0.19	0.13	0.10	0.15	0.12	0.64	0.53	0.48	0.22	0.31	0.56	0.31	0.38
C4'	0.22	0.14	0.54	0.75	0.14	0.15	0.06	0.09	0.06	0.10	0.07	0.17	0.17	0.07	0.16	0.31	0.67	0.65	0.50	0.14	0.57	1.10	0.82
C5	0.19	0.15	0.25	0.13	0.11	0.52	0.06	0.98	0.13	0.10	0.11	0.20	0.18	0.12	0.13	0.35	0.17	0.59	0.48	0.22	0.72	0.78	0.72
C5'	0.87	0.28	0.30	0.17	0.43	0.98	0.15	0.80	0.16	0.49	0.09	0.30	0.48	0.15	0.64	0.52	0.29	1.41	0.42	0.46	0.51	0.36	0.26
C6	0.26	0.06	0.18	0.43	0.12	0.97	0.10	1.62	0.17	0.13	0.11	0.10	0.16	0.12	0.18	0.26	0.32	0.87	1.18	0.26	1.44	1.63	1.54
C8	0.31	0.26	0.51	0.61	0.21	0.19	0.16	0.24	0.10	0.38	0.26	0.34	0.22	0.33	0.30	0.39	0.58	0.25	0.50	0.15	0.52	0.43	0.46
N1	0.29	0.11	0.09	0.49	0.16	1.19	0.22	1.93	0.24	0.29	0.20	0.13	0.06	0.27	0.25	0.45	0.34	1.12	1.65	0.28	2.00	1.98	2.02
N3	0.14	0.13	0.81	0.57	0.13	0.33	0.26	0.74	0.30	0.18	0.22	0.12	0.11	0.31	0.08	0.92	0.63	0.65	0.52	0.37	1.00	0.49	0.69
N6	0.37	0.11	0.49	0.79	0.17	1.17	0.08	1.91	0.19	0.14	0.13	0.17	0.26	0.09	0.24	0.24	0.66	0.91	1.42	0.31	1.61	2.11	1.86
N7	0.25	0.28	0.26	0.25	0.21	0.35	0.17	0.68	0.07	0.28	0.18	0.37	0.26	0.28	0.24	0.27	0.25	0.41	0.20	0.16	0.26	0.38	0.28
N9	0.32	0.18	0.75	0.84	0.13	0.19	0.06	0.13	0.22	0.29	0.24	0.22	0.14	0.18	0.26	0.62	0.81	0.23	0.50	0.33	0.45	0.57	0.50
O2'	0.21	1.02	0.70	1.11	0.82	0.35	1.19	0.47	1.48	0.63	1.31	0.97	0.77	1.15	0.51	0.37	1.17	0.41	1.02	1.77	1.02	1.67	1.32
O3'	0.46	0.54	0.40	0.65	0.58	0.22	0.73	0.13	0.77	0.68	0.65	0.49	0.51	0.82	0.56	0.16	0.61	0.84	0.48	0.88	0.55	1.16	0.82
O4'	0.39	0.17	0.95	1.18	0.33	0.41	0.39	0.43	0.29	0.56	0.18	0.13	0.23	0.57	0.42	0.72	1.12	0.13	0.92	0.31	0.88	1.32	1.12
O5'	0.63	0.55	0.18	0.15	0.21	0.90	0.49	0.71	0.91	0.26	0.86	0.59	0.26	0.29	0.31	0.36	0.35	1.22	0.38	1.27	0.49	0.34	0.26
OP1	0.95	0.76	0.62	0.79	0.24	1.57	0.78	1.45	1.46	0.21	1.32	0.77	0.25	0.56	0.39	0.78	1.10	1.65	1.22	2.10	1.29	0.87	0.98
OP2	0.89	0.60	0.40	0.47	0.15	1.30	0.54	1.04	1.09	0.31	1.02	0.64	0.19	0.33	0.42	0.66	0.81	1.53	0.77	1.58	0.79	0.25	0.39
P	1.02	0.59	0.56	0.68	0.14	1.50	0.52	1.30	1.12	0.43	1.05	0.64	0.18	0.27	0.52	0.79	1.01	1.69	1.01	1.65	1.03	0.52	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.25	0.00	0.38	0.01	0.56	0.35	0.36
C2	0.01	0.00	0.58	0.44	0.00	0.22	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.53	0.09	0.28	0.01	0.65	0.29	0.14
C2'	0.01	0.58	0.00	0.00	0.27	0.03	0.12	0.16	0.24	0.29	0.44	0.71	0.56	0.16	0.02	0.00	0.04	0.02	0.32	0.18	0.43	0.36	0.32
C3'	0.01	0.44	0.00	0.00	0.05	0.01	0.21	0.02	0.08	0.65	0.21	0.67	0.44	0.56	0.23	0.01	0.00	0.01	0.36	0.20	0.44	0.52	0.44
C4	0.01	0.00	0.27	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.44	0.25	0.07	0.65	0.00	0.96	0.41	0.61
C4'	0.00	0.22	0.03	0.01	0.04	0.00	0.19	0.01	0.13	0.41	0.08	0.36	0.24	0.39	0.15	0.24	0.02	0.01	0.02	0.22	0.23	0.23	0.06
C5	0.00	0.00	0.12	0.21	0.00	0.19	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.10	0.10	1.06	0.00	1.45	0.93	1.13
C5'	0.05	0.50	0.16	0.02	0.10	0.01	0.28	0.00	0.19	0.68	0.22	0.77	0.51	0.66	0.20	0.07	0.19	0.03	0.01	0.34	0.22	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.24	0.08	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.56	0.16	0.12	0.98	0.00	1.46	0.78	1.03
C8	0.01	0.00	0.29	0.65	0.00	0.41	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.30	0.05	1.38	0.00	1.56	1.48	1.53
N1	0.01	0.00	0.44	0.21	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62	0.37	0.12	0.60	0.00	1.04	0.21	0.52
N2	0.02	0.00	0.71	0.67	0.01	0.36	0.00	0.77	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.62	0.70	0.08	0.19	0.01	0.42	0.77	0.38
N3	0.01	0.00	0.56	0.44	0.00	0.24	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.52	0.52	0.07	0.22	0.00	0.57	0.26	0.12
N7	0.00	0.00	0.16	0.56	0.00	0.39	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.25	0.08	1.45	0.00	1.84	1.55	1.67
N9	0.00	0.00	0.02	0.23	0.00	0.15	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.10	0.04	0.82	0.00	1.00	0.73	0.82
O2'	0.03	0.60	0.00	0.01	0.44	0.24	0.46	0.07	0.56	0.18	0.62	0.62	0.52	0.32	0.24	0.00	0.09	0.19	0.38	0.57	0.49	0.46	0.38
O3'	0.25	0.53	0.04	0.00	0.25	0.02	0.10	0.19	0.16	0.30	0.37	0.70	0.52	0.25	0.10	0.09	0.00	0.15	0.32	0.10	0.39	0.75	0.51
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.10	0.03	0.12	0.05	0.12	0.08	0.07	0.08	0.04	0.19	0.15	0.00	0.17	0.14	0.44	0.20	0.17
O5'	0.38	0.28	0.32	0.36	0.65	0.02	1.06	0.01	0.98	1.38	0.60	0.19	0.22	1.45	0.82	0.38	0.32	0.17	0.00	1.17	0.03	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.18	0.20	0.00	0.22	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.57	0.10	0.14	1.17	0.00	1.76	1.08	1.31
OP1	0.56	0.65	0.43	0.44	0.96	0.23	1.45	0.22	1.46	1.56	1.04	0.42	0.57	1.84	1.00	0.49	0.39	0.44	0.03	1.76	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.29	0.36	0.52	0.41	0.23	0.93	0.14	0.78	1.48	0.21	0.77	0.26	1.55	0.73	0.46	0.75	0.20	0.01	1.08	0.01	0.00	0.01
P	0.36	0.14	0.32	0.44	0.61	0.06	1.13	0.01	1.03	1.53	0.52	0.38	0.12	1.67	0.82	0.38	0.51	0.17	0.00	1.31	0.01	0.01	0.00