Doublet Group distance statistics: 51646

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.012, 0.033, 0.055, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.013, 0.041, 0.068, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.041 std_dev=0.028
C2	B	0, 0.147, 0.312, 0.476, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.312 std_dev=0.165
N2	B	0, 0.180, 0.402, 0.623, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.402 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.138, 0.376, 0.613, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.376 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.150, 0.413, 0.675, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.413 std_dev=0.263
C5	B	0, 0.262, 0.534, 0.806, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.534 std_dev=0.272
N3	B	0, 0.137, 0.416, 0.695, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.416 std_dev=0.279
O4'	A	0, 0.042, 0.336, 0.629, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.336 std_dev=0.293
C2'	A	0, 0.081, 0.382, 0.683, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.382 std_dev=0.301
C3'	B	0, 0.238, 0.575, 0.912, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.575 std_dev=0.337
N9	B	0, 0.206, 0.544, 0.882, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.544 std_dev=0.338
C8	B	0, 0.299, 0.638, 0.977, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.638 std_dev=0.339
N7	B	0, 0.349, 0.708, 1.067, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.708 std_dev=0.359
O2'	A	0, 0.156, 0.521, 0.885, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.521 std_dev=0.364
OP2	A	0, 0.241, 0.629, 1.016, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.629 std_dev=0.387
C6	B	0, 0.153, 0.547, 0.941, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.547 std_dev=0.394
O3'	B	0, 0.294, 0.700, 1.106, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.700 std_dev=0.406
P	A	0, 0.218, 0.635, 1.051, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.635 std_dev=0.417
C4'	B	0, 0.295, 0.731, 1.168, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.731 std_dev=0.437
C1'	B	0, 0.266, 0.738, 1.209, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.738 std_dev=0.472
O4'	B	0, 0.334, 0.808, 1.282, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.808 std_dev=0.474
C4'	A	0, 0.000, 0.481, 0.962, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.481 std_dev=0.481
OP1	A	0, 0.185, 0.673, 1.160, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.673 std_dev=0.488
C3'	A	0, 0.038, 0.556, 1.073, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.556 std_dev=0.518
O5'	A	0, 0.162, 0.681, 1.200, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.681 std_dev=0.519
C5'	B	0, 0.309, 0.904, 1.499, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.904 std_dev=0.595
C5'	A	0, 0.128, 0.746, 1.363, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.746 std_dev=0.618
O6	B	0, 0.083, 0.733, 1.384, 2.065 max_d=2.065 avg_d=0.733 std_dev=0.651
C2'	B	0, 0.159, 0.821, 1.484, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.821 std_dev=0.663
O5'	B	0, 0.731, 1.403, 2.075, 2.078 max_d=2.078 avg_d=1.403 std_dev=0.672
P	B	0, 0.874, 1.645, 2.417, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.645 std_dev=0.772
O3'	A	0, 0.041, 0.840, 1.639, 2.396 max_d=2.396 avg_d=0.840 std_dev=0.799
OP1	B	0, 1.042, 1.980, 2.917, 2.885 max_d=2.885 avg_d=1.980 std_dev=0.938
OP2	B	0, 0.833, 2.117, 3.401, 4.362 max_d=4.362 avg_d=2.117 std_dev=1.284
O2'	B	0, -0.139, 1.266, 2.670, 4.213 max_d=4.213 avg_d=1.266 std_dev=1.405

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.19	0.30	0.27	0.20
C2	0.02	0.00	0.29	0.30	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.28	0.16	0.21	0.24	0.22	0.17
C2'	0.00	0.29	0.00	0.01	0.16	0.02	0.08	0.13	0.14	0.14	0.23	0.29	0.10	0.09	0.03	0.00	0.04	0.01	0.32	0.63	0.54	0.45
C3'	0.02	0.30	0.01	0.00	0.24	0.00	0.24	0.02	0.28	0.13	0.31	0.27	0.28	0.19	0.15	0.02	0.01	0.02	0.05	0.44	0.16	0.19
C4	0.01	0.00	0.16	0.24	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.19	0.08	0.21	0.24	0.23	0.17
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.08	0.04	0.06	0.04	0.07	0.03	0.21	0.02	0.00	0.01	0.15	0.05	0.05
C5	0.01	0.00	0.08	0.24	0.00	0.04	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.21	0.04	0.22	0.21	0.22	0.16
C5'	0.08	0.16	0.13	0.02	0.15	0.00	0.17	0.00	0.17	0.16	0.17	0.15	0.18	0.17	0.13	0.09	0.14	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.14	0.28	0.00	0.04	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.27	0.07	0.21	0.20	0.20	0.15
C8	0.01	0.00	0.14	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.12	0.11	0.24	0.23	0.25	0.17
N1	0.01	0.00	0.23	0.31	0.00	0.04	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.29	0.12	0.21	0.22	0.21	0.16
N3	0.02	0.00	0.29	0.27	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.23	0.16	0.21	0.26	0.23	0.18
N6	0.01	0.01	0.10	0.28	0.01	0.04	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.28	0.05	0.21	0.17	0.18	0.14
N7	0.01	0.00	0.09	0.19	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.18	0.06	0.23	0.19	0.22	0.15
N9	0.00	0.00	0.03	0.15	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.22	0.26	0.26	0.18
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.07	0.21	0.13	0.09	0.11	0.21	0.11	0.16	0.14	0.21	0.10	0.00	0.05	0.13	0.22	0.55	0.57	0.39
O3'	0.08	0.28	0.04	0.01	0.19	0.02	0.21	0.14	0.27	0.12	0.29	0.23	0.28	0.18	0.09	0.05	0.00	0.09	0.15	0.33	0.12	0.11
O4'	0.00	0.16	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.12	0.16	0.05	0.06	0.01	0.13	0.09	0.00	0.04	0.13	0.13	0.18
O5'	0.19	0.21	0.32	0.05	0.21	0.01	0.22	0.01	0.21	0.24	0.21	0.21	0.21	0.23	0.22	0.22	0.15	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.30	0.24	0.63	0.44	0.24	0.15	0.21	0.04	0.20	0.23	0.22	0.26	0.17	0.19	0.26	0.55	0.33	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.22	0.54	0.16	0.23	0.05	0.22	0.01	0.20	0.25	0.21	0.23	0.18	0.22	0.26	0.57	0.12	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.17	0.45	0.19	0.17	0.05	0.16	0.01	0.15	0.17	0.16	0.18	0.14	0.15	0.18	0.39	0.11	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.52	0.18	0.36	0.17	0.26	0.38	0.22	0.23	0.25	0.26	0.22	0.17	0.30	0.23	0.33	0.38	0.32	0.62	0.58	0.32	0.64	0.41	0.61
C2	0.39	0.18	0.19	0.18	0.21	0.20	0.25	0.14	0.35	0.22	0.25	0.29	0.30	0.27	0.26	0.51	0.25	0.42	0.66	0.50	0.69	0.77	0.59
C2'	0.35	0.16	0.25	0.18	0.12	0.18	0.17	0.17	0.26	0.10	0.19	0.24	0.23	0.20	0.15	0.18	0.25	0.41	0.45	0.36	0.60	0.32	0.48
C3'	0.31	0.11	0.28	0.17	0.16	0.10	0.27	0.15	0.33	0.24	0.25	0.09	0.13	0.32	0.18	0.14	0.10	0.32	0.46	0.42	0.67	0.46	0.57
C4	0.47	0.14	0.24	0.18	0.23	0.24	0.25	0.14	0.33	0.24	0.25	0.18	0.31	0.27	0.30	0.54	0.27	0.48	0.66	0.45	0.69	0.61	0.60
C4'	0.21	0.23	0.39	0.16	0.14	0.19	0.26	0.13	0.34	0.17	0.32	0.26	0.12	0.26	0.09	0.30	0.18	0.33	0.38	0.41	0.58	0.42	0.53
C5	0.45	0.10	0.22	0.20	0.21	0.18	0.27	0.19	0.38	0.24	0.26	0.18	0.29	0.30	0.28	0.75	0.22	0.38	0.70	0.51	0.70	0.75	0.61
C5'	0.16	0.51	0.50	0.23	0.40	0.07	0.48	0.17	0.56	0.33	0.56	0.52	0.43	0.44	0.29	0.44	0.02	0.13	0.28	0.60	0.56	0.35	0.42
C6	0.37	0.10	0.19	0.21	0.17	0.14	0.27	0.23	0.41	0.22	0.25	0.24	0.26	0.31	0.23	0.78	0.20	0.30	0.71	0.60	0.69	0.92	0.61
C8	0.56	0.14	0.32	0.20	0.24	0.26	0.24	0.17	0.30	0.26	0.24	0.12	0.27	0.26	0.34	0.73	0.27	0.48	0.66	0.39	0.68	0.49	0.62
N1	0.36	0.14	0.16	0.20	0.18	0.15	0.25	0.19	0.38	0.21	0.24	0.28	0.27	0.29	0.23	0.65	0.22	0.34	0.69	0.56	0.69	0.90	0.60
N3	0.43	0.18	0.24	0.17	0.23	0.26	0.24	0.14	0.33	0.23	0.25	0.24	0.31	0.26	0.28	0.44	0.28	0.49	0.65	0.44	0.68	0.63	0.59
N6	0.32	0.11	0.23	0.22	0.12	0.15	0.27	0.31	0.44	0.21	0.24	0.24	0.22	0.34	0.19	0.90	0.16	0.21	0.74	0.69	0.69	1.08	0.64
N7	0.50	0.13	0.30	0.21	0.23	0.19	0.28	0.23	0.36	0.26	0.26	0.15	0.27	0.31	0.31	0.92	0.21	0.37	0.72	0.47	0.70	0.69	0.62
N9	0.53	0.15	0.29	0.17	0.25	0.30	0.23	0.16	0.29	0.25	0.23	0.14	0.30	0.25	0.33	0.50	0.30	0.54	0.63	0.38	0.68	0.47	0.61
O2'	0.44	0.25	0.35	0.11	0.20	0.28	0.13	0.14	0.20	0.11	0.17	0.37	0.34	0.14	0.24	0.37	0.22	0.54	0.43	0.30	0.57	0.25	0.47
O3'	0.28	0.06	0.30	0.22	0.14	0.13	0.26	0.23	0.31	0.26	0.22	0.11	0.08	0.33	0.18	0.12	0.09	0.30	0.48	0.42	0.74	0.56	0.62
O4'	0.47	0.18	0.45	0.31	0.18	0.49	0.21	0.39	0.27	0.27	0.28	0.23	0.11	0.23	0.28	0.45	0.46	0.62	0.60	0.33	0.68	0.56	0.70
O5'	0.14	0.49	0.29	0.22	0.39	0.11	0.50	0.30	0.58	0.34	0.57	0.49	0.40	0.47	0.26	0.16	0.01	0.08	0.40	0.64	0.65	0.36	0.50
OP1	0.23	0.31	0.11	0.14	0.18	0.11	0.25	0.18	0.34	0.10	0.35	0.35	0.23	0.22	0.07	0.17	0.02	0.17	0.28	0.40	0.64	0.78	0.64
OP2	0.26	0.33	0.36	0.04	0.22	0.17	0.35	0.48	0.45	0.22	0.41	0.34	0.24	0.36	0.11	0.89	0.02	0.08	0.55	0.53	0.81	0.51	0.69
P	0.21	0.31	0.10	0.01	0.21	0.06	0.30	0.29	0.38	0.18	0.37	0.33	0.23	0.29	0.10	0.35	0.00	0.09	0.36	0.44	0.67	0.48	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.02	0.23	0.00	0.28	0.01	0.38	0.40	0.27
C2	0.03	0.00	0.34	0.31	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.20	0.49	0.01	0.49	0.63	0.27
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.17	0.01	0.08	0.16	0.15	0.19	0.26	0.42	0.34	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.59	0.11	0.84	0.51	0.80
C3'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.27	0.00	0.31	0.02	0.35	0.20	0.35	0.30	0.27	0.27	0.19	0.02	0.00	0.01	0.38	0.37	0.52	0.42	0.56
C4	0.01	0.00	0.17	0.27	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.10	0.10	0.49	0.01	0.49	0.64	0.25
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.10	0.16	0.06	0.08	0.05	0.16	0.08	0.25	0.02	0.00	0.01	0.13	0.19	0.37	0.12
C5	0.01	0.01	0.08	0.31	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.12	0.04	0.57	0.01	0.53	0.88	0.32
C5'	0.05	0.08	0.16	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.16	0.09	0.09	0.08	0.17	0.07	0.08	0.19	0.01	0.01	0.15	0.30	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.15	0.35	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.08	0.59	0.01	0.54	0.95	0.36
C8	0.01	0.00	0.19	0.20	0.00	0.16	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.36	0.08	0.13	0.54	0.01	0.51	0.81	0.27
N1	0.02	0.00	0.26	0.35	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.15	0.55	0.01	0.52	0.82	0.32
N2	0.03	0.00	0.42	0.30	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.18	0.24	0.47	0.02	0.48	0.56	0.27
N3	0.03	0.00	0.34	0.27	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.15	0.19	0.45	0.01	0.47	0.52	0.25
N7	0.00	0.01	0.11	0.27	0.00	0.16	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.13	0.07	0.60	0.01	0.54	0.99	0.36
N9	0.00	0.01	0.02	0.19	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.07	0.01	0.45	0.01	0.47	0.57	0.22
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.09	0.25	0.23	0.08	0.19	0.36	0.08	0.23	0.14	0.36	0.17	0.00	0.03	0.19	0.32	0.25	0.74	0.57	0.73
O3'	0.23	0.15	0.02	0.00	0.10	0.02	0.12	0.19	0.16	0.08	0.15	0.18	0.15	0.13	0.07	0.03	0.00	0.15	0.19	0.19	0.47	0.34	0.38
O4'	0.00	0.20	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.13	0.15	0.24	0.19	0.07	0.01	0.19	0.15	0.00	0.05	0.05	0.09	0.60	0.25
O5'	0.28	0.49	0.59	0.38	0.49	0.01	0.57	0.01	0.59	0.54	0.55	0.47	0.45	0.60	0.45	0.32	0.19	0.05	0.00	0.62	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.11	0.37	0.01	0.13	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.25	0.19	0.05	0.62	0.00	0.55	1.10	0.42
OP1	0.38	0.49	0.84	0.52	0.49	0.19	0.53	0.30	0.54	0.51	0.52	0.48	0.47	0.54	0.47	0.74	0.47	0.09	0.01	0.55	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.63	0.51	0.42	0.64	0.37	0.88	0.35	0.95	0.81	0.82	0.56	0.52	0.99	0.57	0.57	0.34	0.60	0.02	1.10	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.27	0.80	0.56	0.25	0.12	0.32	0.02	0.36	0.27	0.32	0.27	0.25	0.36	0.22	0.73	0.38	0.25	0.01	0.42	0.01	0.01	0.00