Doublet Group distance statistics: 51647

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.030 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.017, 0.031, 0.046, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.031 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.021, 0.040, 0.059, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.040 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.024, 0.046, 0.068, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.046 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.025, 0.049, 0.073, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.049 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.028, 0.059, 0.091, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.059 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.039, 0.078, 0.117, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.078 std_dev=0.039
C2'	B	0, 0.121, 0.280, 0.440, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.280 std_dev=0.159
N9	B	0, 0.153, 0.327, 0.501, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.327 std_dev=0.174
C3'	B	0, 0.134, 0.318, 0.502, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.318 std_dev=0.184
P	A	0, 0.211, 0.402, 0.593, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.402 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.116, 0.314, 0.511, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.314 std_dev=0.198
OP1	A	0, 0.204, 0.407, 0.609, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.407 std_dev=0.202
O2'	B	0, 0.223, 0.425, 0.628, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.425 std_dev=0.203
C4	B	0, 0.103, 0.322, 0.541, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.322 std_dev=0.219
OP2	A	0, 0.260, 0.495, 0.730, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.495 std_dev=0.235
C8	B	0, 0.167, 0.412, 0.656, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.412 std_dev=0.244
O3'	B	0, 0.120, 0.365, 0.610, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.365 std_dev=0.245
O4'	A	0, 0.026, 0.274, 0.522, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.274 std_dev=0.248
N3	B	0, 0.081, 0.350, 0.619, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.350 std_dev=0.269
O5'	A	0, 0.204, 0.480, 0.756, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.480 std_dev=0.276
C2'	A	0, 0.031, 0.313, 0.595, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.313 std_dev=0.282
C5	B	0, 0.086, 0.377, 0.667, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.377 std_dev=0.290
C4'	B	0, 0.034, 0.333, 0.631, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.333 std_dev=0.298
N7	B	0, 0.123, 0.431, 0.739, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.431 std_dev=0.308
O4'	B	0, 0.017, 0.335, 0.652, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.335 std_dev=0.317
C2	B	0, 0.056, 0.423, 0.789, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.423 std_dev=0.366
C5'	A	0, 0.139, 0.513, 0.887, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.513 std_dev=0.374
C6	B	0, 0.075, 0.459, 0.843, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.459 std_dev=0.384
N1	B	0, 0.057, 0.468, 0.880, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.468 std_dev=0.412
N2	B	0, 0.098, 0.540, 0.982, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.540 std_dev=0.442
O6	B	0, 0.134, 0.587, 1.039, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.587 std_dev=0.453
O2'	A	0, 0.142, 0.612, 1.081, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.612 std_dev=0.469
C5'	B	0, -0.062, 0.423, 0.908, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.423 std_dev=0.485
C4'	A	0, 0.014, 0.516, 1.019, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.516 std_dev=0.502
O5'	B	0, 0.125, 0.689, 1.252, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.689 std_dev=0.563
OP1	B	0, 0.246, 0.973, 1.699, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.973 std_dev=0.726
C3'	A	0, -0.108, 0.641, 1.389, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.641 std_dev=0.749
P	B	0, 0.114, 1.041, 1.968, 2.422 max_d=2.422 avg_d=1.041 std_dev=0.927
OP2	B	0, 0.759, 1.953, 3.147, 3.484 max_d=3.484 avg_d=1.953 std_dev=1.194
O3'	A	0, -0.193, 1.160, 2.513, 3.090 max_d=3.090 avg_d=1.160 std_dev=1.353

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.33	0.00	0.17	0.14	0.31	0.19
C2	0.02	0.00	0.17	0.14	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.37	0.10	0.09	0.11	0.22	0.12
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.22	0.09	0.08	0.14	0.17	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.40	0.39	0.54	0.42
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.22	0.01	0.34	0.01	0.33	0.42	0.24	0.09	0.39	0.44	0.24	0.02	0.00	0.01	0.10	0.12	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.09	0.22	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.18	0.05	0.09	0.11	0.24	0.13
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.09	0.21	0.03	0.03	0.13	0.19	0.10	0.31	0.03	0.00	0.02	0.08	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.34	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.05	0.02	0.12	0.13	0.22	0.13
C5'	0.06	0.04	0.22	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.10	0.16	0.06	0.05	0.14	0.17	0.05	0.09	0.22	0.02	0.01	0.08	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.33	0.00	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.03	0.04	0.13	0.14	0.20	0.14
C8	0.01	0.01	0.08	0.42	0.01	0.21	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.25	0.07	0.13	0.12	0.25	0.13
N1	0.01	0.00	0.14	0.24	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.20	0.08	0.10	0.12	0.20	0.12
N3	0.02	0.00	0.17	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.41	0.10	0.10	0.11	0.25	0.13
N6	0.01	0.01	0.07	0.39	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.37	0.11	0.03	0.17	0.17	0.20	0.17
N7	0.01	0.01	0.04	0.44	0.00	0.19	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.37	0.26	0.04	0.17	0.15	0.22	0.15
N9	0.00	0.01	0.01	0.24	0.00	0.10	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.07	0.01	0.09	0.11	0.27	0.13
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.23	0.31	0.32	0.09	0.32	0.32	0.25	0.12	0.37	0.37	0.21	0.00	0.02	0.22	0.26	0.22	0.56	0.30
O3'	0.33	0.37	0.01	0.00	0.18	0.03	0.05	0.22	0.03	0.25	0.20	0.41	0.11	0.26	0.07	0.02	0.00	0.25	0.29	0.51	0.36	0.35
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.04	0.07	0.08	0.10	0.03	0.04	0.01	0.22	0.25	0.00	0.05	0.03	0.17	0.06
O5'	0.17	0.09	0.40	0.10	0.09	0.02	0.12	0.01	0.13	0.13	0.10	0.10	0.17	0.17	0.09	0.26	0.29	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.14	0.11	0.39	0.12	0.11	0.08	0.13	0.08	0.14	0.12	0.12	0.11	0.17	0.15	0.11	0.22	0.51	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.22	0.54	0.13	0.24	0.04	0.22	0.01	0.20	0.25	0.20	0.25	0.20	0.22	0.27	0.56	0.36	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.12	0.42	0.10	0.13	0.02	0.13	0.02	0.14	0.13	0.12	0.13	0.17	0.15	0.13	0.30	0.35	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.29	0.12	0.06	0.18	0.05	0.19	0.06	0.27	0.10	0.31	0.32	0.23	0.13	0.14	0.26	0.12	0.14	0.15	0.29	0.32	0.26	0.20
C2	0.12	0.06	0.07	0.09	0.11	0.08	0.25	0.15	0.34	0.20	0.20	0.18	0.12	0.29	0.12	0.15	0.08	0.11	0.26	0.47	0.34	0.39	0.31
C2'	0.07	0.29	0.03	0.23	0.16	0.16	0.17	0.26	0.25	0.05	0.30	0.35	0.22	0.11	0.07	0.15	0.32	0.03	0.34	0.27	0.59	0.45	0.42
C3'	0.16	0.29	0.14	0.11	0.16	0.10	0.18	0.10	0.21	0.25	0.27	0.39	0.22	0.23	0.18	0.15	0.07	0.13	0.12	0.22	0.19	0.21	0.13
C4	0.15	0.08	0.11	0.10	0.12	0.09	0.18	0.14	0.23	0.14	0.17	0.05	0.11	0.19	0.13	0.19	0.09	0.11	0.23	0.28	0.34	0.33	0.27
C4'	0.06	0.39	0.05	0.05	0.19	0.05	0.17	0.07	0.25	0.06	0.35	0.48	0.31	0.07	0.07	0.13	0.09	0.05	0.10	0.24	0.26	0.18	0.14
C5	0.14	0.10	0.13	0.15	0.10	0.14	0.11	0.22	0.11	0.14	0.06	0.14	0.12	0.16	0.12	0.16	0.13	0.12	0.29	0.16	0.40	0.38	0.33
C5'	0.07	0.33	0.07	0.04	0.17	0.04	0.13	0.06	0.19	0.08	0.29	0.42	0.28	0.06	0.07	0.11	0.07	0.05	0.09	0.17	0.28	0.19	0.15
C6	0.12	0.20	0.11	0.16	0.09	0.16	0.11	0.24	0.10	0.18	0.14	0.27	0.17	0.21	0.11	0.13	0.14	0.13	0.33	0.19	0.43	0.44	0.38
C8	0.18	0.08	0.19	0.15	0.11	0.15	0.08	0.19	0.09	0.12	0.08	0.08	0.11	0.08	0.14	0.24	0.13	0.14	0.25	0.11	0.42	0.35	0.31
N1	0.10	0.18	0.07	0.12	0.07	0.12	0.18	0.20	0.20	0.20	0.06	0.31	0.15	0.28	0.10	0.13	0.11	0.11	0.31	0.36	0.40	0.44	0.36
N3	0.14	0.13	0.08	0.08	0.15	0.06	0.26	0.11	0.36	0.17	0.29	0.06	0.12	0.26	0.13	0.18	0.09	0.12	0.22	0.44	0.31	0.34	0.26
N6	0.13	0.28	0.12	0.20	0.13	0.21	0.12	0.31	0.18	0.19	0.27	0.35	0.21	0.20	0.12	0.12	0.18	0.17	0.39	0.20	0.50	0.50	0.44
N7	0.17	0.10	0.18	0.19	0.12	0.19	0.10	0.25	0.10	0.14	0.09	0.10	0.12	0.12	0.15	0.20	0.17	0.16	0.31	0.12	0.45	0.40	0.36
N9	0.18	0.16	0.14	0.09	0.13	0.08	0.14	0.12	0.19	0.10	0.19	0.15	0.14	0.12	0.13	0.23	0.10	0.12	0.19	0.22	0.35	0.30	0.24
O2'	0.26	0.36	0.19	0.07	0.18	0.08	0.22	0.11	0.34	0.05	0.37	0.45	0.30	0.18	0.12	0.45	0.14	0.19	0.28	0.42	0.57	0.52	0.40
O3'	0.13	0.74	0.08	0.07	0.37	0.06	0.32	0.09	0.47	0.06	0.66	0.94	0.59	0.12	0.17	0.17	0.16	0.08	0.10	0.44	0.17	0.22	0.14
O4'	0.10	0.36	0.08	0.05	0.19	0.06	0.20	0.05	0.29	0.05	0.36	0.43	0.28	0.11	0.07	0.22	0.10	0.09	0.11	0.29	0.24	0.19	0.14
O5'	0.12	0.25	0.13	0.06	0.12	0.05	0.09	0.04	0.13	0.15	0.21	0.32	0.21	0.11	0.10	0.16	0.01	0.08	0.08	0.11	0.28	0.21	0.15
OP1	0.03	0.21	0.06	0.02	0.09	0.07	0.05	0.15	0.09	0.12	0.16	0.29	0.19	0.10	0.03	0.12	0.01	0.04	0.21	0.08	0.47	0.37	0.33
OP2	0.08	0.21	0.07	0.07	0.14	0.09	0.16	0.14	0.17	0.19	0.19	0.25	0.18	0.19	0.12	0.08	0.02	0.10	0.22	0.18	0.40	0.39	0.33
P	0.02	0.19	0.04	0.02	0.08	0.05	0.06	0.10	0.09	0.13	0.15	0.26	0.17	0.10	0.03	0.09	0.01	0.03	0.15	0.08	0.36	0.28	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.13	0.09
C2	0.04	0.00	0.15	0.13	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.17	0.05	0.09	0.02	0.09	0.19	0.14
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.08	0.12	0.19	0.15	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.09	0.07	0.04
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.06	0.11	0.10	0.17	0.12	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.05	0.06	0.12	0.07	0.06
C4	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.08	0.03	0.08	0.01	0.09	0.18	0.13
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.04	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.03	0.10	0.01	0.11	0.22	0.15
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.09	0.09	0.07	0.04	0.04	0.10	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.11	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.05	0.11	0.00	0.13	0.24	0.17
C8	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.11	0.02	0.11	0.19	0.13
N1	0.03	0.01	0.12	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.13	0.05	0.10	0.01	0.11	0.22	0.16
N2	0.05	0.00	0.19	0.17	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.22	0.05	0.09	0.02	0.08	0.18	0.13
N3	0.04	0.00	0.15	0.12	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.15	0.05	0.09	0.01	0.09	0.17	0.12
N7	0.00	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.12	0.02	0.14	0.23	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.09	0.16	0.11
O2'	0.00	0.21	0.00	0.04	0.11	0.06	0.07	0.06	0.11	0.05	0.17	0.27	0.20	0.03	0.02	0.00	0.08	0.04	0.02	0.09	0.11	0.04	0.02
O3'	0.02	0.17	0.03	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.11	0.13	0.22	0.15	0.09	0.04	0.08	0.00	0.03	0.08	0.07	0.19	0.14	0.11
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.00	0.08	0.05	0.10	0.14	0.12
O5'	0.06	0.09	0.04	0.05	0.08	0.01	0.10	0.01	0.11	0.11	0.10	0.09	0.09	0.12	0.08	0.02	0.08	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.07	0.05	0.13	0.00	0.16	0.28	0.20
OP1	0.07	0.09	0.09	0.12	0.09	0.07	0.11	0.07	0.13	0.11	0.11	0.08	0.09	0.14	0.09	0.11	0.19	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.19	0.07	0.07	0.18	0.04	0.22	0.01	0.24	0.19	0.22	0.18	0.17	0.23	0.16	0.04	0.14	0.14	0.01	0.28	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.04	0.06	0.13	0.02	0.15	0.01	0.17	0.13	0.16	0.13	0.12	0.16	0.11	0.02	0.11	0.12	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00