Doublet Group distance statistics: 51648

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.012, 0.031, 0.050, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.011, 0.033, 0.054, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.013, 0.035, 0.056, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.007, 0.033, 0.060, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.053, 0.152, 0.251, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.152 std_dev=0.099
O4'	A	0, 0.004, 0.154, 0.303, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.154 std_dev=0.150
C4'	A	0, 0.070, 0.232, 0.395, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.232 std_dev=0.163
N1	B	0, 0.130, 0.382, 0.633, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.382 std_dev=0.252
C2	B	0, 0.140, 0.411, 0.682, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.411 std_dev=0.271
N2	B	0, 0.103, 0.432, 0.761, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.432 std_dev=0.329
C6	B	0, 0.060, 0.398, 0.735, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.398 std_dev=0.338
N3	B	0, 0.137, 0.495, 0.853, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.495 std_dev=0.358
O6	B	0, 0.103, 0.489, 0.875, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.489 std_dev=0.386
C5	B	0, 0.074, 0.463, 0.853, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.463 std_dev=0.390
C4	B	0, 0.110, 0.510, 0.911, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.510 std_dev=0.400
O2'	A	0, 0.191, 0.660, 1.129, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.660 std_dev=0.469
N7	B	0, 0.136, 0.605, 1.075, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.605 std_dev=0.470
C5'	A	0, 0.008, 0.525, 1.042, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.525 std_dev=0.517
N9	B	0, 0.132, 0.660, 1.187, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.660 std_dev=0.527
C8	B	0, 0.163, 0.700, 1.237, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.700 std_dev=0.537
C3'	A	0, 0.172, 0.806, 1.440, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.806 std_dev=0.634
C1'	B	0, 0.164, 0.822, 1.480, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.822 std_dev=0.658
C2'	B	0, 0.189, 0.971, 1.753, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.971 std_dev=0.782
O2'	B	0, 0.193, 1.049, 1.905, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.049 std_dev=0.856
O5'	A	0, 0.264, 1.155, 2.046, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.155 std_dev=0.891
O4'	B	0, 0.225, 1.211, 2.197, 2.143 max_d=2.143 avg_d=1.211 std_dev=0.986
C3'	B	0, 0.270, 1.406, 2.543, 2.466 max_d=2.466 avg_d=1.406 std_dev=1.137
OP1	B	0, 0.290, 1.482, 2.674, 3.082 max_d=3.082 avg_d=1.482 std_dev=1.192
C4'	B	0, 0.288, 1.510, 2.732, 2.655 max_d=2.655 avg_d=1.510 std_dev=1.222
P	B	0, 0.397, 1.690, 2.984, 2.803 max_d=2.803 avg_d=1.690 std_dev=1.293
OP2	B	0, 0.450, 1.750, 3.049, 3.008 max_d=3.008 avg_d=1.750 std_dev=1.299
O3'	A	0, 0.338, 1.672, 3.006, 2.790 max_d=2.790 avg_d=1.672 std_dev=1.334
O3'	B	0, 0.346, 1.788, 3.230, 3.137 max_d=3.137 avg_d=1.788 std_dev=1.442
O5'	B	0, 0.306, 1.809, 3.311, 3.371 max_d=3.371 avg_d=1.809 std_dev=1.503
C5'	B	0, 0.337, 1.920, 3.502, 3.521 max_d=3.521 avg_d=1.920 std_dev=1.583
P	A	0, 0.541, 2.450, 4.359, 4.233 max_d=4.233 avg_d=2.450 std_dev=1.909
OP2	A	0, 0.588, 2.730, 4.873, 4.509 max_d=4.509 avg_d=2.730 std_dev=2.142
OP1	A	0, 0.744, 3.434, 6.123, 6.027 max_d=6.027 avg_d=3.434 std_dev=2.689

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.30	0.00	0.15	0.14	0.09	0.17
C2	0.02	0.00	0.04	0.43	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.47	0.09	0.22	0.19	0.28	0.16
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.02	0.44	0.56	0.54	0.37
C3'	0.02	0.43	0.00	0.00	0.28	0.00	0.25	0.01	0.32	0.06	0.39	0.40	0.30	0.14	0.13	0.01	0.00	0.01	0.11	0.40	0.17	0.11
C4	0.01	0.00	0.01	0.28	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.11	0.05	0.12	0.18	0.12	0.23
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.08	0.12	0.06	0.05	0.04	0.23	0.03	0.00	0.01	0.07	0.04	0.10
C5	0.01	0.00	0.02	0.25	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.04	0.03	0.04	0.38	0.28	0.40
C5'	0.07	0.18	0.20	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.06	0.08	0.12	0.18	0.05	0.08	0.05	0.03	0.16	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.32	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.30	0.18	0.04	0.06	0.32	0.25	0.33
C8	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.32	0.06	0.03	0.51	0.34	0.52
N1	0.02	0.00	0.02	0.39	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.30	0.37	0.07	0.12	0.07	0.08	0.10
N3	0.02	0.00	0.04	0.40	0.00	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.39	0.09	0.25	0.22	0.30	0.16
N6	0.02	0.00	0.02	0.30	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.13	0.04	0.05	0.46	0.37	0.43
N7	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.20	0.05	0.05	0.57	0.41	0.56
N9	0.01	0.00	0.03	0.13	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.16	0.01	0.07	0.27	0.16	0.32
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.24	0.23	0.27	0.03	0.30	0.19	0.30	0.24	0.31	0.25	0.17	0.00	0.04	0.14	0.36	0.54	0.67	0.37
O3'	0.30	0.47	0.02	0.00	0.11	0.03	0.04	0.16	0.18	0.32	0.37	0.39	0.13	0.20	0.16	0.04	0.00	0.22	0.19	0.26	0.22	0.12
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.05	0.01	0.14	0.22	0.00	0.08	0.39	0.25	0.39
O5'	0.15	0.22	0.44	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.12	0.25	0.05	0.05	0.07	0.36	0.19	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.14	0.19	0.56	0.40	0.18	0.07	0.38	0.03	0.32	0.51	0.07	0.22	0.46	0.57	0.27	0.54	0.26	0.39	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.28	0.54	0.17	0.12	0.04	0.28	0.01	0.25	0.34	0.08	0.30	0.37	0.41	0.16	0.67	0.22	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.16	0.37	0.11	0.23	0.10	0.40	0.01	0.33	0.52	0.10	0.16	0.43	0.56	0.32	0.37	0.12	0.39	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.16	0.18	0.07	0.20	0.03	0.22	0.13	0.21	0.23	0.16	0.14	0.18	0.24	0.21	0.25	0.10	0.10	0.68	0.23	0.13	0.22	0.24
C2	0.21	0.11	0.28	0.29	0.17	0.22	0.14	0.27	0.08	0.22	0.08	0.10	0.14	0.18	0.21	0.29	0.37	0.21	0.72	0.05	0.26	0.29	0.34
C2'	0.19	0.10	0.11	0.07	0.17	0.10	0.21	0.16	0.19	0.24	0.12	0.08	0.13	0.26	0.20	0.15	0.05	0.15	0.77	0.24	0.25	0.31	0.37
C3'	0.07	0.06	0.17	0.18	0.03	0.19	0.01	0.29	0.06	0.04	0.07	0.09	0.05	0.03	0.04	0.20	0.21	0.13	0.49	0.10	0.25	0.20	0.05
C4	0.15	0.08	0.16	0.06	0.13	0.05	0.14	0.18	0.10	0.17	0.08	0.06	0.10	0.17	0.15	0.21	0.09	0.05	0.63	0.09	0.10	0.20	0.18
C4'	0.13	0.13	0.15	0.05	0.13	0.08	0.15	0.25	0.15	0.15	0.12	0.15	0.13	0.18	0.12	0.23	0.09	0.05	0.60	0.19	0.21	0.31	0.26
C5	0.07	0.14	0.12	0.05	0.06	0.12	0.05	0.28	0.11	0.07	0.16	0.16	0.09	0.04	0.06	0.18	0.06	0.09	0.51	0.12	0.04	0.29	0.03
C5'	0.23	0.19	0.20	0.11	0.26	0.17	0.33	0.34	0.32	0.36	0.23	0.16	0.19	0.40	0.27	0.27	0.11	0.21	0.72	0.39	0.40	0.55	0.51
C6	0.09	0.21	0.16	0.07	0.15	0.16	0.15	0.32	0.19	0.04	0.21	0.22	0.19	0.07	0.10	0.21	0.17	0.20	0.46	0.18	0.05	0.34	0.04
C8	0.18	0.04	0.21	0.22	0.11	0.19	0.09	0.28	0.08	0.14	0.08	0.05	0.08	0.12	0.14	0.27	0.27	0.11	0.52	0.11	0.08	0.30	0.05
N1	0.19	0.17	0.28	0.28	0.17	0.20	0.14	0.28	0.15	0.14	0.16	0.18	0.18	0.10	0.18	0.29	0.38	0.23	0.59	0.15	0.15	0.19	0.17
N3	0.20	0.09	0.22	0.20	0.18	0.16	0.18	0.22	0.12	0.24	0.07	0.06	0.13	0.23	0.21	0.24	0.24	0.15	0.73	0.08	0.24	0.29	0.34
N6	0.16	0.31	0.13	0.06	0.26	0.30	0.25	0.49	0.26	0.17	0.29	0.32	0.30	0.21	0.20	0.20	0.12	0.35	0.32	0.24	0.21	0.58	0.26
N7	0.13	0.13	0.19	0.24	0.02	0.24	0.01	0.36	0.10	0.11	0.16	0.17	0.04	0.06	0.09	0.23	0.27	0.15	0.45	0.11	0.14	0.39	0.12
N9	0.18	0.09	0.16	0.08	0.15	0.06	0.16	0.18	0.14	0.18	0.10	0.06	0.12	0.18	0.17	0.23	0.11	0.04	0.61	0.15	0.06	0.21	0.15
O2'	0.62	0.49	0.44	0.45	0.62	0.54	0.67	0.57	0.67	0.68	0.55	0.38	0.54	0.71	0.64	0.43	0.37	0.63	1.16	0.74	0.63	0.64	0.77
O3'	0.12	0.35	0.09	0.02	0.18	0.09	0.12	0.24	0.19	0.04	0.32	0.46	0.28	0.06	0.10	0.16	0.05	0.08	0.49	0.15	0.33	0.24	0.08
O4'	0.18	0.16	0.18	0.05	0.17	0.06	0.19	0.24	0.18	0.20	0.15	0.17	0.17	0.22	0.17	0.27	0.09	0.03	0.61	0.22	0.18	0.31	0.26
O5'	0.31	0.29	0.19	0.17	0.38	0.29	0.49	0.45	0.50	0.49	0.37	0.21	0.29	0.57	0.39	0.21	0.10	0.34	0.74	0.61	0.45	0.63	0.58
OP1	0.11	0.12	0.19	0.24	0.26	0.26	0.50	0.47	0.56	0.50	0.32	0.10	0.09	0.67	0.27	0.29	0.40	0.25	0.65	0.80	0.40	0.76	0.64
OP2	0.36	0.32	0.13	0.23	0.46	0.42	0.64	0.61	0.65	0.66	0.45	0.23	0.32	0.80	0.47	0.06	0.19	0.47	0.75	0.83	0.54	0.87	0.76
P	0.09	0.10	0.16	0.21	0.18	0.28	0.36	0.47	0.39	0.40	0.19	0.18	0.10	0.53	0.20	0.23	0.29	0.25	0.61	0.58	0.38	0.68	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.02	0.06	0.78	0.31
C2	0.02	0.00	0.24	0.26	0.00	0.11	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.34	0.04	0.38	0.02	0.10	0.60	0.17
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.11	0.02	0.04	0.01	0.09	0.11	0.17	0.29	0.24	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.30	0.06	0.29	0.51	0.05
C3'	0.02	0.26	0.00	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.06	0.24	0.18	0.34	0.24	0.18	0.06	0.00	0.00	0.01	0.39	0.02	0.52	0.29	0.17
C4	0.02	0.00	0.11	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.11	0.03	0.43	0.01	0.10	0.62	0.17
C4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.14	0.07	0.14	0.10	0.10	0.04	0.05	0.02	0.00	0.00	0.03	0.19	0.59	0.16
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.56	0.01	0.13	0.49	0.12
C5'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.18	0.09	0.17	0.11	0.15	0.06	0.05	0.04	0.00	0.01	0.08	0.27	0.43	0.00
C6	0.02	0.01	0.09	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.08	0.04	0.57	0.01	0.14	0.42	0.12
C8	0.01	0.00	0.11	0.24	0.00	0.14	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.26	0.02	0.60	0.01	0.12	0.56	0.12
N1	0.02	0.01	0.17	0.18	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.24	0.03	0.48	0.01	0.12	0.50	0.13
N2	0.03	0.00	0.29	0.34	0.01	0.14	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.47	0.04	0.32	0.02	0.09	0.62	0.19
N3	0.03	0.00	0.24	0.24	0.00	0.10	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.31	0.04	0.33	0.01	0.08	0.66	0.20
N7	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.20	0.02	0.65	0.01	0.14	0.40	0.12
N9	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.40	0.01	0.09	0.69	0.20
O2'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.10	0.05	0.05	0.05	0.09	0.07	0.16	0.26	0.19	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.13	0.07	0.29	0.56	0.12
O3'	0.01	0.34	0.01	0.00	0.11	0.02	0.02	0.04	0.08	0.26	0.24	0.47	0.31	0.20	0.05	0.04	0.00	0.01	0.35	0.03	0.78	0.13	0.32
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.04	0.17	0.90	0.45
O5'	0.16	0.38	0.30	0.39	0.43	0.00	0.56	0.01	0.57	0.60	0.48	0.32	0.33	0.65	0.40	0.13	0.35	0.05	0.00	0.62	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.04	0.62	0.00	0.16	0.31	0.13
OP1	0.06	0.10	0.29	0.52	0.10	0.19	0.13	0.27	0.14	0.12	0.12	0.09	0.08	0.14	0.09	0.29	0.78	0.17	0.02	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.78	0.60	0.51	0.29	0.62	0.59	0.49	0.43	0.42	0.56	0.50	0.62	0.66	0.40	0.69	0.56	0.13	0.90	0.02	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.31	0.17	0.05	0.17	0.17	0.16	0.12	0.00	0.12	0.12	0.13	0.19	0.20	0.12	0.20	0.12	0.32	0.45	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00