Doublet Group distance statistics: 51649

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C4	B	0, 0.158, 0.352, 0.546, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.352 std_dev=0.194
N9	B	0, 0.153, 0.353, 0.552, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.353 std_dev=0.199
C2	B	0, 0.182, 0.399, 0.616, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.399 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.209, 0.432, 0.655, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.432 std_dev=0.223
N1	B	0, 0.227, 0.459, 0.691, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.459 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.234, 0.477, 0.719, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.477 std_dev=0.242
C3'	B	0, 0.226, 0.477, 0.728, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.477 std_dev=0.251
N2	B	0, 0.286, 0.581, 0.877, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.581 std_dev=0.295
C5	B	0, 0.195, 0.557, 0.919, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.557 std_dev=0.362
O3'	B	0, 0.301, 0.663, 1.025, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.663 std_dev=0.362
C8	B	0, 0.215, 0.586, 0.957, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.586 std_dev=0.371
C6	B	0, 0.206, 0.635, 1.063, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.635 std_dev=0.428
C4'	B	0, 0.353, 0.795, 1.236, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.795 std_dev=0.441
O4'	B	0, 0.371, 0.836, 1.301, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.836 std_dev=0.465
O4'	A	0, 0.089, 0.566, 1.043, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.566 std_dev=0.477
C2'	A	0, 0.074, 0.630, 1.187, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.630 std_dev=0.556
N7	B	0, 0.154, 0.722, 1.289, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.722 std_dev=0.567
C2'	B	0, 0.190, 0.866, 1.542, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.866 std_dev=0.676
O6	B	0, 0.172, 0.857, 1.542, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.857 std_dev=0.685
C4'	A	0, 0.057, 0.843, 1.628, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.843 std_dev=0.786
O2'	A	0, 0.162, 0.954, 1.747, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.954 std_dev=0.792
O5'	B	0, 0.328, 1.121, 1.913, 2.105 max_d=2.105 avg_d=1.121 std_dev=0.793
C5'	B	0, 0.426, 1.237, 2.048, 2.184 max_d=2.184 avg_d=1.237 std_dev=0.811
C3'	A	0, 0.012, 0.841, 1.669, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.841 std_dev=0.829
P	B	0, 0.303, 1.279, 2.255, 2.509 max_d=2.509 avg_d=1.279 std_dev=0.976
C5'	A	0, 0.222, 1.206, 2.189, 2.374 max_d=2.374 avg_d=1.206 std_dev=0.983
OP1	B	0, 0.337, 1.356, 2.375, 2.641 max_d=2.641 avg_d=1.356 std_dev=1.019
OP2	B	0, 0.211, 1.281, 2.351, 2.644 max_d=2.644 avg_d=1.281 std_dev=1.070
O3'	A	0, -0.070, 1.134, 2.337, 2.641 max_d=2.641 avg_d=1.134 std_dev=1.204
O5'	A	0, 0.127, 1.341, 2.556, 2.817 max_d=2.817 avg_d=1.341 std_dev=1.214
P	A	0, -0.009, 1.524, 3.056, 3.403 max_d=3.403 avg_d=1.524 std_dev=1.533
O2'	B	0, -0.002, 1.662, 3.326, 3.742 max_d=3.742 avg_d=1.662 std_dev=1.664
OP2	A	0, 0.038, 2.052, 4.066, 4.503 max_d=4.503 avg_d=2.052 std_dev=2.014
OP1	A	0, 0.312, 2.850, 5.387, 5.929 max_d=5.929 avg_d=2.850 std_dev=2.537

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.01	0.15	0.65	0.05	0.31
C2	0.02	0.00	0.45	0.42	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.05	0.19	0.07	0.84	0.51	0.24
C2'	0.00	0.45	0.00	0.00	0.23	0.01	0.10	0.20	0.20	0.23	0.35	0.45	0.13	0.12	0.00	0.00	0.04	0.02	0.44	0.53	0.31	0.53
C3'	0.01	0.42	0.00	0.00	0.33	0.01	0.35	0.01	0.41	0.17	0.44	0.36	0.41	0.27	0.20	0.02	0.01	0.02	0.10	0.25	0.05	0.07
C4	0.01	0.01	0.23	0.33	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.11	0.05	0.89	0.42	0.29
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.04	0.08	0.08	0.05	0.28	0.02	0.00	0.01	0.16	0.12	0.03
C5	0.01	0.00	0.10	0.35	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.07	0.06	0.07	1.03	0.55	0.31
C5'	0.08	0.05	0.20	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.09	0.23	0.01	0.01	0.13	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.20	0.41	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.12	0.10	0.09	1.02	0.64	0.28
C8	0.01	0.00	0.23	0.17	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.02	0.09	0.08	1.04	0.37	0.39
N1	0.02	0.00	0.35	0.44	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.15	0.09	0.94	0.62	0.25
N3	0.02	0.00	0.45	0.36	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.06	0.18	0.04	0.79	0.40	0.25
N6	0.01	0.00	0.13	0.41	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.16	0.07	0.11	1.08	0.73	0.28
N7	0.01	0.00	0.12	0.27	0.00	0.08	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.07	0.03	0.07	1.12	0.55	0.36
N9	0.00	0.01	0.00	0.20	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.10	0.02	0.07	0.86	0.28	0.33
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.28	0.23	0.09	0.16	0.39	0.03	0.19	0.24	0.39	0.19	0.00	0.08	0.18	0.32	0.35	0.29	0.43
O3'	0.32	0.05	0.04	0.01	0.04	0.02	0.07	0.23	0.12	0.02	0.11	0.06	0.16	0.07	0.10	0.08	0.00	0.23	0.24	0.70	0.29	0.37
O4'	0.01	0.19	0.02	0.02	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.09	0.15	0.18	0.07	0.03	0.02	0.18	0.23	0.00	0.06	0.55	0.10	0.12
O5'	0.15	0.07	0.44	0.10	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.08	0.09	0.04	0.11	0.07	0.07	0.32	0.24	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.65	0.84	0.53	0.25	0.89	0.16	1.03	0.13	1.02	1.04	0.94	0.79	1.08	1.12	0.86	0.35	0.70	0.55	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.51	0.31	0.05	0.42	0.12	0.55	0.29	0.64	0.37	0.62	0.40	0.73	0.55	0.28	0.29	0.29	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.31	0.24	0.53	0.07	0.29	0.03	0.31	0.01	0.28	0.39	0.25	0.25	0.28	0.36	0.33	0.43	0.37	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.31	0.48	0.11	0.15	0.21	0.06	0.14	0.08	0.04	0.18	0.48	0.31	0.07	0.10	0.28	0.37	0.38	0.06	0.08	0.22	0.19	0.02
C2	0.18	0.13	0.19	0.24	0.07	0.06	0.12	0.14	0.18	0.08	0.09	0.22	0.18	0.17	0.07	0.53	0.24	0.18	0.34	0.27	0.19	0.57	0.40
C2'	0.11	0.56	0.60	0.36	0.25	0.05	0.19	0.15	0.30	0.04	0.47	0.79	0.44	0.05	0.10	0.37	0.02	0.22	0.28	0.27	0.07	0.36	0.23
C3'	0.15	0.31	0.46	0.09	0.17	0.12	0.13	0.05	0.17	0.04	0.26	0.42	0.27	0.06	0.11	0.31	0.31	0.27	0.03	0.16	0.34	0.03	0.09
C4	0.23	0.25	0.29	0.18	0.11	0.09	0.08	0.04	0.11	0.07	0.09	0.38	0.30	0.15	0.09	0.30	0.29	0.28	0.22	0.18	0.03	0.37	0.21
C4'	0.19	0.11	0.79	0.26	0.21	0.07	0.25	0.10	0.22	0.30	0.15	0.09	0.12	0.31	0.24	0.80	0.21	0.03	0.20	0.23	0.23	0.19	0.07
C5	0.29	0.20	0.15	0.20	0.09	0.05	0.14	0.13	0.18	0.12	0.07	0.30	0.29	0.23	0.09	0.64	0.24	0.23	0.29	0.27	0.06	0.41	0.27
C5'	0.46	0.29	1.02	0.46	0.44	0.34	0.47	0.35	0.41	0.55	0.33	0.19	0.34	0.53	0.49	1.14	0.04	0.29	0.40	0.42	0.11	0.30	0.21
C6	0.27	0.11	0.09	0.24	0.06	0.09	0.22	0.23	0.28	0.15	0.13	0.20	0.22	0.30	0.08	0.93	0.18	0.14	0.40	0.39	0.23	0.57	0.43
C8	0.28	0.26	0.34	0.11	0.13	0.16	0.09	0.04	0.10	0.11	0.11	0.38	0.32	0.17	0.10	0.11	0.33	0.34	0.12	0.17	0.19	0.18	0.04
N1	0.21	0.08	0.10	0.26	0.06	0.09	0.20	0.22	0.30	0.12	0.16	0.15	0.17	0.25	0.07	0.80	0.19	0.13	0.41	0.41	0.28	0.64	0.48
N3	0.19	0.22	0.29	0.21	0.09	0.08	0.07	0.05	0.10	0.06	0.08	0.35	0.24	0.12	0.07	0.29	0.29	0.26	0.25	0.17	0.06	0.45	0.28
N6	0.30	0.06	0.27	0.25	0.05	0.16	0.28	0.34	0.35	0.20	0.17	0.14	0.18	0.40	0.08	1.28	0.13	0.09	0.50	0.48	0.34	0.65	0.53
N7	0.33	0.21	0.17	0.15	0.11	0.08	0.14	0.10	0.16	0.14	0.08	0.32	0.30	0.24	0.10	0.56	0.25	0.26	0.22	0.24	0.06	0.27	0.15
N9	0.24	0.28	0.39	0.13	0.13	0.16	0.06	0.06	0.08	0.07	0.13	0.43	0.32	0.12	0.10	0.08	0.34	0.34	0.12	0.13	0.15	0.24	0.08
O2'	0.15	0.65	0.62	0.40	0.26	0.03	0.17	0.12	0.28	0.07	0.51	0.96	0.51	0.07	0.11	0.35	0.04	0.31	0.34	0.23	0.21	0.56	0.36
O3'	0.11	0.14	0.64	0.23	0.18	0.05	0.24	0.10	0.24	0.25	0.20	0.10	0.12	0.28	0.19	0.44	0.23	0.06	0.21	0.27	0.22	0.22	0.08
O4'	0.10	0.16	0.72	0.17	0.22	0.09	0.30	0.06	0.30	0.29	0.24	0.10	0.14	0.33	0.22	0.69	0.38	0.15	0.12	0.34	0.29	0.18	0.03
O5'	0.32	0.22	0.86	0.41	0.34	0.31	0.38	0.35	0.34	0.46	0.27	0.18	0.25	0.46	0.38	0.87	0.14	0.23	0.36	0.36	0.19	0.21	0.16
OP1	2.09	1.51	2.54	2.08	1.89	2.13	1.90	2.13	1.74	2.12	1.56	1.25	1.69	2.05	2.06	2.64	1.78	2.09	2.04	1.72	1.36	1.71	1.72
OP2	0.06	0.13	0.40	0.06	0.04	0.16	0.03	0.19	0.06	0.10	0.11	0.18	0.09	0.07	0.06	0.49	0.12	0.10	0.08	0.06	0.61	0.40	0.34
P	0.83	0.56	1.33	0.89	0.78	0.87	0.83	0.91	0.75	0.96	0.62	0.40	0.63	0.94	0.87	1.39	0.66	0.80	0.85	0.77	0.27	0.60	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.33	0.00	0.07	0.01	0.26	0.12	0.10
C2	0.01	0.00	0.27	0.15	0.00	0.09	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.36	0.19	0.15	0.00	0.05	0.39	0.25
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.14	0.01	0.06	0.19	0.11	0.14	0.20	0.33	0.26	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.44	0.07	0.73	0.69	0.60
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.22	0.00	0.32	0.01	0.32	0.35	0.24	0.10	0.11	0.39	0.22	0.02	0.01	0.02	0.06	0.37	0.44	0.20	0.24
C4	0.01	0.00	0.14	0.22	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.20	0.09	0.19	0.00	0.11	0.36	0.28
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.08	0.25	0.01	0.16	0.10	0.23	0.10	0.32	0.01	0.00	0.01	0.13	0.16	0.05	0.06
C5	0.00	0.01	0.06	0.32	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.04	0.03	0.35	0.01	0.36	0.62	0.50
C5'	0.05	0.06	0.19	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.13	0.27	0.03	0.13	0.08	0.28	0.09	0.11	0.20	0.01	0.00	0.19	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.32	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.32	0.07	0.07	0.37	0.00	0.41	0.72	0.56
C8	0.01	0.01	0.14	0.35	0.00	0.25	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.42	0.13	0.14	0.38	0.01	0.37	0.47	0.47
N1	0.01	0.00	0.20	0.24	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.22	0.14	0.27	0.00	0.24	0.59	0.42
N2	0.01	0.01	0.33	0.10	0.01	0.16	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.47	0.24	0.09	0.01	0.07	0.34	0.17
N3	0.01	0.00	0.26	0.11	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.39	0.19	0.09	0.00	0.06	0.26	0.15
N7	0.01	0.01	0.08	0.39	0.00	0.23	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.46	0.14	0.08	0.46	0.01	0.53	0.73	0.64
N9	0.00	0.00	0.01	0.22	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.12	0.01	0.17	0.01	0.07	0.22	0.21
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.19	0.32	0.34	0.11	0.32	0.42	0.18	0.12	0.04	0.46	0.24	0.00	0.03	0.22	0.32	0.39	0.72	0.84	0.58
O3'	0.33	0.36	0.02	0.01	0.20	0.01	0.04	0.20	0.07	0.13	0.22	0.47	0.39	0.14	0.12	0.03	0.00	0.21	0.16	0.02	0.11	0.07	0.04
O4'	0.00	0.19	0.03	0.02	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.14	0.14	0.24	0.19	0.08	0.01	0.22	0.21	0.00	0.06	0.04	0.04	0.09	0.10
O5'	0.07	0.15	0.44	0.06	0.19	0.01	0.35	0.00	0.37	0.38	0.27	0.09	0.09	0.46	0.17	0.32	0.16	0.06	0.00	0.44	0.03	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.37	0.00	0.13	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.39	0.02	0.04	0.44	0.00	0.56	0.87	0.69
OP1	0.26	0.05	0.73	0.44	0.11	0.16	0.36	0.05	0.41	0.37	0.24	0.07	0.06	0.53	0.07	0.72	0.11	0.04	0.03	0.56	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.39	0.69	0.20	0.36	0.05	0.62	0.01	0.72	0.47	0.59	0.34	0.26	0.73	0.22	0.84	0.07	0.09	0.01	0.87	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.25	0.60	0.24	0.28	0.06	0.50	0.01	0.56	0.47	0.42	0.17	0.15	0.64	0.21	0.58	0.04	0.10	0.00	0.69	0.01	0.00	0.00