Doublet Group distance statistics: 51653

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.007, 0.029, 0.050, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.010, 0.033, 0.056, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.009, 0.032, 0.056, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.009, 0.033, 0.058, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.021, 0.076, 0.131, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.076 std_dev=0.055
N3	B	0, 0.088, 0.305, 0.521, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.305 std_dev=0.216
C4	B	0, 0.091, 0.322, 0.554, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.322 std_dev=0.231
C2	B	0, 0.091, 0.345, 0.598, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.345 std_dev=0.254
C5	B	0, 0.109, 0.383, 0.656, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.383 std_dev=0.273
N9	B	0, 0.089, 0.390, 0.692, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.390 std_dev=0.302
N7	B	0, 0.126, 0.432, 0.737, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.432 std_dev=0.305
C8	B	0, 0.126, 0.439, 0.752, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.439 std_dev=0.313
N2	B	0, 0.069, 0.393, 0.718, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.393 std_dev=0.324
N1	B	0, 0.132, 0.461, 0.790, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.461 std_dev=0.329
C6	B	0, 0.127, 0.484, 0.841, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.484 std_dev=0.357
O3'	B	0, 0.127, 0.534, 0.941, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.534 std_dev=0.407
OP2	A	0, 0.168, 0.607, 1.045, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.607 std_dev=0.438
C1'	B	0, 0.047, 0.499, 0.951, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.499 std_dev=0.452
O6	B	0, 0.143, 0.635, 1.127, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.635 std_dev=0.492
O4'	A	0, -0.129, 0.439, 1.007, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.439 std_dev=0.568
C2'	A	0, -0.138, 0.497, 1.132, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.497 std_dev=0.635
C3'	B	0, 0.000, 0.642, 1.283, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.642 std_dev=0.641
O4'	B	0, -0.005, 0.672, 1.349, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.672 std_dev=0.677
C2'	B	0, -0.035, 0.771, 1.577, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.771 std_dev=0.806
C4'	B	0, -0.025, 0.816, 1.657, 1.974 max_d=1.974 avg_d=0.816 std_dev=0.841
C4'	A	0, -0.213, 0.674, 1.560, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.674 std_dev=0.886
C3'	A	0, -0.230, 0.694, 1.618, 2.000 max_d=2.000 avg_d=0.694 std_dev=0.924
O2'	A	0, -0.195, 0.763, 1.721, 2.114 max_d=2.114 avg_d=0.763 std_dev=0.958
C5'	A	0, -0.280, 0.845, 1.969, 2.434 max_d=2.434 avg_d=0.845 std_dev=1.125
O5'	A	0, -0.080, 1.073, 2.225, 2.672 max_d=2.672 avg_d=1.073 std_dev=1.152
P	A	0, -0.022, 1.173, 2.369, 2.815 max_d=2.815 avg_d=1.173 std_dev=1.196
O3'	A	0, -0.330, 1.017, 2.363, 2.920 max_d=2.920 avg_d=1.017 std_dev=1.347
O2'	B	0, -0.162, 1.387, 2.935, 3.548 max_d=3.548 avg_d=1.387 std_dev=1.549
C5'	B	0, -0.191, 1.386, 2.964, 3.593 max_d=3.593 avg_d=1.386 std_dev=1.577
OP1	A	0, -0.286, 1.971, 4.229, 5.132 max_d=5.132 avg_d=1.971 std_dev=2.258
O5'	B	0, -0.441, 2.233, 4.906, 5.991 max_d=5.991 avg_d=2.233 std_dev=2.673
P	B	0, -0.574, 3.010, 6.595, 8.047 max_d=8.047 avg_d=3.010 std_dev=3.584
OP2	B	0, -0.594, 3.239, 7.071, 8.622 max_d=8.622 avg_d=3.239 std_dev=3.832
OP1	B	0, -0.632, 3.227, 7.085, 8.651 max_d=8.651 avg_d=3.227 std_dev=3.858

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.30	0.00	0.45	0.53	0.09	0.34
C2	0.03	0.00	0.33	0.30	0.01	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.24	0.82	1.33	0.20	0.79
C2'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.17	0.02	0.07	0.23	0.14	0.19	0.25	0.33	0.09	0.11	0.00	0.00	0.02	0.00	0.56	0.58	0.50	0.61
C3'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.29	0.00	0.35	0.01	0.37	0.27	0.35	0.25	0.40	0.34	0.22	0.00	0.00	0.03	0.18	0.13	0.16	0.19
C4	0.01	0.01	0.17	0.29	0.00	0.01	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.03	0.13	0.80	1.21	0.16	0.75
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.12	0.03	0.06	0.04	0.10	0.04	0.32	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.35	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.12	0.07	0.92	1.48	0.18	0.92
C5'	0.12	0.19	0.23	0.01	0.15	0.01	0.13	0.00	0.15	0.06	0.18	0.18	0.13	0.08	0.11	0.08	0.23	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.37	0.01	0.02	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.13	0.12	0.95	1.62	0.21	0.98
C8	0.02	0.01	0.19	0.27	0.00	0.12	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.39	0.13	0.12	0.85	1.20	0.14	0.81
N1	0.02	0.00	0.25	0.35	0.01	0.03	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.20	0.91	1.54	0.21	0.91
N3	0.03	0.00	0.33	0.25	0.00	0.06	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.23	0.74	1.13	0.17	0.68
N6	0.02	0.01	0.09	0.40	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.28	0.22	0.09	1.00	1.78	0.22	1.07
N7	0.02	0.01	0.11	0.34	0.01	0.10	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.39	0.20	0.05	0.93	1.50	0.17	0.96
N9	0.00	0.02	0.00	0.22	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.19	0.05	0.01	0.73	0.99	0.13	0.64
O2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.10	0.32	0.25	0.08	0.20	0.39	0.07	0.10	0.28	0.39	0.19	0.00	0.04	0.21	0.16	0.15	0.31	0.28
O3'	0.30	0.07	0.02	0.00	0.03	0.02	0.12	0.23	0.13	0.13	0.05	0.14	0.22	0.20	0.05	0.04	0.00	0.23	0.14	0.27	0.16	0.15
O4'	0.00	0.24	0.00	0.03	0.13	0.00	0.07	0.02	0.12	0.12	0.20	0.23	0.09	0.05	0.01	0.21	0.23	0.00	0.18	0.27	0.20	0.01
O5'	0.45	0.82	0.56	0.18	0.80	0.02	0.92	0.01	0.95	0.85	0.91	0.74	1.00	0.93	0.73	0.16	0.14	0.18	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.53	1.33	0.58	0.13	1.21	0.03	1.48	0.06	1.62	1.20	1.54	1.13	1.78	1.50	0.99	0.15	0.27	0.27	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.09	0.20	0.50	0.16	0.16	0.04	0.18	0.02	0.21	0.14	0.21	0.17	0.22	0.17	0.13	0.31	0.16	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.34	0.79	0.61	0.19	0.75	0.04	0.92	0.01	0.98	0.81	0.91	0.68	1.07	0.96	0.64	0.28	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.19	0.60	0.16	0.14	0.51	0.07	0.45	0.08	0.07	0.12	0.27	0.22	0.03	0.14	0.63	0.32	0.66	0.42	0.10	0.25	0.32	0.44
C2	0.13	0.10	0.50	0.43	0.07	0.10	0.11	0.11	0.16	0.05	0.14	0.13	0.11	0.10	0.06	0.14	0.14	0.34	0.47	0.21	0.61	0.63	0.53
C2'	0.18	0.35	0.71	0.37	0.21	0.28	0.17	0.18	0.20	0.08	0.28	0.46	0.31	0.09	0.15	0.70	0.17	0.51	0.13	0.17	0.11	0.09	0.14
C3'	0.31	0.19	0.48	0.09	0.22	0.50	0.19	0.44	0.16	0.23	0.16	0.21	0.22	0.19	0.24	0.52	0.41	0.62	0.43	0.13	0.25	0.32	0.44
C4	0.24	0.17	0.54	0.32	0.13	0.26	0.06	0.09	0.09	0.04	0.11	0.23	0.22	0.03	0.13	0.28	0.19	0.50	0.18	0.13	0.36	0.33	0.23
C4'	0.08	0.25	0.79	0.20	0.18	0.35	0.21	0.36	0.25	0.15	0.27	0.28	0.20	0.19	0.14	0.98	0.29	0.36	0.46	0.27	0.36	0.38	0.51
C5	0.29	0.14	0.45	0.39	0.13	0.11	0.03	0.15	0.06	0.05	0.07	0.19	0.21	0.02	0.15	0.12	0.14	0.39	0.54	0.12	0.73	0.73	0.62
C5'	0.29	0.41	0.98	0.36	0.38	0.14	0.40	0.16	0.42	0.36	0.43	0.41	0.39	0.39	0.35	1.24	0.16	0.11	0.27	0.44	0.18	0.19	0.32
C6	0.22	0.07	0.36	0.50	0.08	0.11	0.04	0.39	0.10	0.02	0.06	0.11	0.15	0.07	0.11	0.31	0.14	0.22	0.92	0.16	1.09	1.15	1.04
C8	0.35	0.19	0.48	0.20	0.17	0.34	0.06	0.16	0.05	0.09	0.09	0.25	0.25	0.03	0.19	0.31	0.26	0.56	0.05	0.07	0.28	0.23	0.11
N1	0.14	0.05	0.39	0.49	0.04	0.09	0.10	0.33	0.16	0.03	0.11	0.07	0.09	0.10	0.05	0.20	0.13	0.22	0.82	0.22	0.98	1.05	0.94
N3	0.17	0.16	0.56	0.35	0.10	0.24	0.09	0.10	0.13	0.05	0.14	0.22	0.17	0.07	0.09	0.30	0.18	0.48	0.15	0.17	0.31	0.28	0.19
N6	0.23	0.04	0.18	0.58	0.08	0.31	0.08	0.68	0.12	0.07	0.07	0.07	0.11	0.12	0.12	0.66	0.22	0.03	1.38	0.18	1.56	1.68	1.55
N7	0.37	0.16	0.40	0.31	0.16	0.16	0.04	0.11	0.03	0.10	0.07	0.21	0.24	0.03	0.20	0.10	0.16	0.43	0.45	0.08	0.68	0.65	0.55
N9	0.28	0.19	0.56	0.22	0.15	0.39	0.07	0.26	0.08	0.07	0.11	0.26	0.24	0.03	0.16	0.44	0.26	0.60	0.11	0.10	0.10	0.09	0.09
O2'	0.15	0.36	0.79	0.45	0.15	0.29	0.07	0.18	0.11	0.06	0.24	0.55	0.31	0.08	0.07	0.74	0.21	0.53	0.14	0.08	0.13	0.09	0.15
O3'	0.10	0.33	0.63	0.15	0.17	0.37	0.19	0.31	0.29	0.06	0.36	0.43	0.23	0.12	0.08	0.63	0.38	0.42	0.28	0.32	0.13	0.11	0.28
O4'	0.07	0.28	0.74	0.14	0.20	0.48	0.25	0.49	0.32	0.16	0.33	0.30	0.20	0.22	0.13	0.91	0.39	0.49	0.56	0.35	0.47	0.47	0.61
O5'	0.95	0.88	1.69	1.02	1.00	0.49	1.05	0.41	1.02	1.08	0.94	0.75	0.91	1.09	1.03	2.01	0.67	0.51	0.18	1.05	0.23	0.26	0.09
OP1	2.02	1.57	2.67	2.00	1.89	1.60	1.92	1.42	1.81	2.10	1.65	1.32	1.70	2.05	2.02	3.19	1.74	1.67	1.02	1.83	0.95	1.00	0.86
OP2	0.19	0.21	0.77	0.18	0.24	0.16	0.28	0.22	0.29	0.29	0.26	0.17	0.20	0.31	0.25	1.15	0.05	0.14	0.45	0.32	0.35	0.36	0.50
P	0.97	0.79	1.68	1.05	0.97	0.57	1.03	0.46	0.98	1.11	0.87	0.62	0.84	1.11	1.03	2.09	0.82	0.59	0.18	1.01	0.22	0.24	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.28	0.00	0.24	0.01	0.12	0.00	0.19
C2	0.03	0.00	0.39	0.20	0.01	0.28	0.01	0.31	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.32	0.22	0.42	0.16	0.01	0.23	0.37	0.25
C2'	0.00	0.39	0.00	0.00	0.18	0.02	0.07	0.10	0.15	0.24	0.29	0.47	0.38	0.14	0.02	0.00	0.05	0.01	0.30	0.09	0.10	0.06	0.20
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.22	0.01	0.30	0.05	0.31	0.30	0.26	0.16	0.16	0.34	0.20	0.01	0.00	0.02	0.43	0.34	0.30	0.29	0.37
C4	0.01	0.01	0.18	0.22	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.21	0.31	0.01	0.21	0.14	0.28
C4'	0.01	0.28	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.03	0.39	0.14	0.41	0.28	0.32	0.11	0.28	0.03	0.00	0.02	0.09	0.01	0.20	0.01
C5	0.00	0.01	0.07	0.30	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.03	0.07	0.67	0.01	0.57	0.59	0.70
C5'	0.01	0.31	0.10	0.05	0.04	0.01	0.21	0.00	0.13	0.57	0.13	0.48	0.30	0.51	0.18	0.14	0.24	0.01	0.01	0.22	0.01	0.24	0.01
C6	0.00	0.01	0.15	0.31	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.05	0.16	0.53	0.00	0.46	0.48	0.55
C8	0.01	0.02	0.24	0.30	0.00	0.39	0.00	0.57	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.57	0.09	0.28	1.20	0.01	0.98	1.07	1.23
N1	0.01	0.00	0.29	0.26	0.01	0.14	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.12	0.31	0.15	0.01	0.11	0.10	0.13
N2	0.04	0.01	0.47	0.16	0.02	0.41	0.01	0.48	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.50	0.30	0.52	0.46	0.02	0.53	0.69	0.59
N3	0.02	0.00	0.38	0.16	0.01	0.28	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.33	0.24	0.42	0.15	0.01	0.21	0.36	0.23
N7	0.01	0.01	0.14	0.34	0.00	0.32	0.00	0.51	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.53	0.11	0.17	1.15	0.01	1.03	1.18	1.26
N9	0.00	0.02	0.02	0.20	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.23	0.09	0.02	0.58	0.01	0.42	0.36	0.54
O2'	0.01	0.32	0.00	0.01	0.07	0.28	0.26	0.14	0.17	0.57	0.14	0.50	0.33	0.53	0.23	0.00	0.07	0.21	0.39	0.27	0.25	0.11	0.31
O3'	0.28	0.22	0.05	0.00	0.12	0.03	0.03	0.24	0.05	0.09	0.12	0.30	0.24	0.11	0.09	0.07	0.00	0.14	0.43	0.07	0.58	0.40	0.47
O4'	0.00	0.42	0.01	0.02	0.21	0.00	0.07	0.01	0.16	0.28	0.31	0.52	0.42	0.17	0.02	0.21	0.14	0.00	0.06	0.10	0.05	0.32	0.06
O5'	0.24	0.16	0.30	0.43	0.31	0.02	0.67	0.01	0.53	1.20	0.15	0.46	0.15	1.15	0.58	0.39	0.43	0.06	0.00	0.70	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.34	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.27	0.07	0.10	0.70	0.00	0.66	0.73	0.77
OP1	0.12	0.23	0.10	0.30	0.21	0.01	0.57	0.01	0.46	0.98	0.11	0.53	0.21	1.03	0.42	0.25	0.58	0.05	0.02	0.66	0.00	0.01	0.01
OP2	0.00	0.37	0.06	0.29	0.14	0.20	0.59	0.24	0.48	1.07	0.10	0.69	0.36	1.18	0.36	0.11	0.40	0.32	0.01	0.73	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.25	0.20	0.37	0.28	0.01	0.70	0.01	0.55	1.23	0.13	0.59	0.23	1.26	0.54	0.31	0.47	0.06	0.00	0.77	0.01	0.01	0.00