Doublet Group distance statistics: 51654

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, -0.001, 0.012, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C6	A	0, -0.002, 0.017, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.004, 0.025, 0.047, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.021
O4'	A	0, -0.001, 0.038, 0.078, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.038 std_dev=0.039
N6	A	0, 0.005, 0.046, 0.087, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.046 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.024, 0.081, 0.139, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.081 std_dev=0.058
C3'	A	0, 0.045, 0.157, 0.269, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.157 std_dev=0.112
O3'	A	0, 0.047, 0.181, 0.314, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.181 std_dev=0.134
O2'	A	0, 0.042, 0.198, 0.354, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.198 std_dev=0.156
C4'	A	0, 0.054, 0.222, 0.389, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.222 std_dev=0.167
N3	B	0, 0.107, 0.392, 0.678, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.392 std_dev=0.285
C2	B	0, -0.005, 0.287, 0.578, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.287 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.135, 0.479, 0.822, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.479 std_dev=0.343
C5	B	0, 0.142, 0.489, 0.836, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.489 std_dev=0.347
C6	B	0, 0.076, 0.424, 0.771, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.424 std_dev=0.348
N1	B	0, -0.012, 0.338, 0.687, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.338 std_dev=0.350
C5'	A	0, 0.147, 0.503, 0.859, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.503 std_dev=0.356
N2	B	0, -0.014, 0.363, 0.740, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.363 std_dev=0.377
O5'	A	0, 0.075, 0.523, 0.971, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.523 std_dev=0.448
P	A	0, 0.184, 0.647, 1.111, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.647 std_dev=0.463
O6	B	0, 0.037, 0.528, 1.020, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.528 std_dev=0.491
N7	B	0, 0.192, 0.688, 1.184, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.688 std_dev=0.496
O3'	B	0, 0.181, 0.689, 1.197, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.689 std_dev=0.508
N9	B	0, 0.184, 0.702, 1.221, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.702 std_dev=0.518
C8	B	0, 0.207, 0.791, 1.375, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.791 std_dev=0.584
OP1	A	0, 0.229, 0.815, 1.400, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.815 std_dev=0.586
C1'	B	0, 0.230, 0.828, 1.426, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.828 std_dev=0.598
C3'	B	0, 0.244, 0.849, 1.453, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.849 std_dev=0.605
C2'	B	0, 0.228, 0.856, 1.484, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.856 std_dev=0.628
O2'	B	0, 0.202, 0.850, 1.498, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.850 std_dev=0.648
C4'	B	0, 0.273, 0.933, 1.593, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.933 std_dev=0.660
O4'	B	0, 0.274, 0.934, 1.595, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.934 std_dev=0.661
OP2	A	0, 0.299, 1.019, 1.740, 1.537 max_d=1.537 avg_d=1.019 std_dev=0.721
C5'	B	0, 0.304, 1.057, 1.809, 1.695 max_d=1.695 avg_d=1.057 std_dev=0.753
OP2	B	0, 0.357, 1.234, 2.111, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.234 std_dev=0.877
P	B	0, 0.384, 1.402, 2.420, 2.386 max_d=2.386 avg_d=1.402 std_dev=1.018
OP1	B	0, 0.406, 1.545, 2.685, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.545 std_dev=1.139
O5'	B	0, 0.545, 1.886, 3.228, 3.006 max_d=3.006 avg_d=1.886 std_dev=1.342

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.05	0.30	0.06
C2	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01	0.08	0.04	0.33	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.04	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.15	0.12	0.22	0.06
C3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.09	0.14	0.05	0.01	0.11	0.14	0.06	0.02	0.01	0.01	0.22	0.18	0.14	0.12
C4	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.09	0.04	0.33	0.07
C4'	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.03	0.01	0.09	0.10	0.04	0.10	0.00	0.00	0.02	0.10	0.21	0.02
C5	0.03	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.09	0.03	0.13	0.09	0.31	0.08
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.10	0.05	0.16	0.16	0.08	0.09	0.05	0.01	0.01	0.11	0.20	0.02
C6	0.03	0.00	0.03	0.09	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.08	0.04	0.13	0.11	0.30	0.10
C8	0.03	0.02	0.07	0.14	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.16	0.07	0.31	0.05
N1	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02	0.10	0.08	0.32	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.07	0.02	0.33	0.08
N6	0.04	0.01	0.04	0.11	0.02	0.09	0.02	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.11	0.05	0.17	0.16	0.29	0.12
N7	0.04	0.01	0.06	0.14	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.14	0.03	0.17	0.11	0.30	0.08
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.32	0.06
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.04	0.10	0.03	0.09	0.05	0.06	0.08	0.09	0.04	0.04	0.01	0.00	0.03	0.06	0.14	0.20	0.18	0.08
O3'	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.09	0.05	0.08	0.14	0.04	0.01	0.11	0.14	0.06	0.03	0.00	0.01	0.21	0.24	0.12	0.16
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.06	0.29	0.07
O5'	0.07	0.08	0.15	0.22	0.09	0.02	0.13	0.01	0.13	0.16	0.10	0.07	0.17	0.17	0.10	0.14	0.21	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.04	0.12	0.18	0.04	0.10	0.09	0.11	0.11	0.07	0.08	0.02	0.16	0.11	0.01	0.20	0.24	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.30	0.33	0.22	0.14	0.33	0.21	0.31	0.20	0.30	0.31	0.32	0.33	0.29	0.30	0.32	0.18	0.12	0.29	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.06	0.12	0.07	0.02	0.08	0.02	0.10	0.05	0.09	0.08	0.12	0.08	0.06	0.08	0.16	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.24	0.15	0.09	0.14	0.11	0.11	0.09	0.10	0.22	0.19	0.35	0.19	0.16	0.22	0.23	0.13	0.20	0.27	0.08	0.08	0.22	0.16
C2	0.14	0.15	0.06	0.08	0.15	0.07	0.17	0.09	0.20	0.18	0.22	0.17	0.12	0.19	0.17	0.07	0.13	0.14	0.22	0.24	0.07	0.13	0.12
C2'	0.24	0.22	0.19	0.15	0.15	0.14	0.11	0.14	0.09	0.23	0.18	0.32	0.19	0.17	0.22	0.26	0.16	0.21	0.34	0.06	0.12	0.20	0.19
C3'	0.26	0.27	0.24	0.23	0.17	0.20	0.11	0.21	0.12	0.21	0.22	0.36	0.25	0.14	0.22	0.32	0.22	0.23	0.39	0.09	0.14	0.13	0.21
C4	0.21	0.18	0.12	0.09	0.17	0.11	0.14	0.12	0.11	0.23	0.16	0.24	0.16	0.18	0.23	0.15	0.12	0.19	0.27	0.10	0.10	0.18	0.16
C4'	0.22	0.26	0.18	0.12	0.11	0.12	0.05	0.10	0.09	0.17	0.20	0.37	0.23	0.10	0.16	0.30	0.16	0.18	0.27	0.08	0.05	0.23	0.13
C5	0.22	0.08	0.14	0.11	0.19	0.14	0.17	0.16	0.08	0.25	0.07	0.10	0.14	0.22	0.25	0.16	0.12	0.21	0.32	0.05	0.13	0.17	0.18
C5'	0.19	0.26	0.19	0.15	0.08	0.16	0.06	0.14	0.13	0.13	0.21	0.37	0.23	0.11	0.10	0.33	0.19	0.17	0.28	0.16	0.05	0.27	0.11
C6	0.17	0.04	0.11	0.11	0.17	0.13	0.18	0.15	0.12	0.22	0.05	0.04	0.12	0.21	0.21	0.11	0.13	0.18	0.30	0.11	0.13	0.12	0.17
C8	0.31	0.11	0.25	0.15	0.19	0.19	0.16	0.18	0.06	0.31	0.05	0.18	0.15	0.25	0.30	0.27	0.11	0.27	0.38	0.06	0.16	0.24	0.24
N1	0.13	0.06	0.08	0.10	0.15	0.09	0.18	0.12	0.18	0.19	0.14	0.04	0.11	0.20	0.17	0.07	0.14	0.14	0.25	0.22	0.10	0.09	0.14
N3	0.16	0.21	0.07	0.07	0.15	0.08	0.15	0.09	0.18	0.19	0.23	0.29	0.15	0.17	0.19	0.10	0.13	0.16	0.22	0.19	0.07	0.16	0.12
N6	0.16	0.09	0.13	0.14	0.16	0.16	0.18	0.19	0.10	0.24	0.08	0.13	0.11	0.23	0.20	0.12	0.15	0.20	0.35	0.08	0.17	0.10	0.21
N7	0.28	0.06	0.22	0.15	0.21	0.20	0.19	0.20	0.09	0.32	0.00	0.09	0.14	0.27	0.31	0.22	0.10	0.27	0.39	0.09	0.17	0.22	0.24
N9	0.24	0.20	0.17	0.11	0.16	0.13	0.12	0.13	0.08	0.24	0.15	0.28	0.18	0.18	0.24	0.22	0.12	0.21	0.30	0.05	0.11	0.21	0.18
O2'	0.22	0.21	0.16	0.16	0.15	0.13	0.11	0.14	0.09	0.22	0.17	0.31	0.18	0.16	0.21	0.22	0.21	0.19	0.30	0.07	0.09	0.19	0.17
O3'	0.24	0.26	0.22	0.22	0.16	0.19	0.11	0.21	0.12	0.20	0.21	0.36	0.23	0.14	0.21	0.29	0.22	0.21	0.38	0.09	0.14	0.13	0.20
O4'	0.24	0.27	0.17	0.09	0.14	0.11	0.09	0.08	0.10	0.20	0.20	0.38	0.23	0.14	0.20	0.27	0.13	0.20	0.26	0.07	0.07	0.24	0.15
O5'	0.28	0.14	0.28	0.11	0.09	0.14	0.07	0.05	0.02	0.22	0.10	0.21	0.11	0.16	0.20	0.48	0.02	0.23	0.30	0.01	0.08	0.22	0.17
OP1	0.05	0.23	0.10	0.02	0.14	0.05	0.23	0.15	0.25	0.27	0.23	0.30	0.20	0.31	0.13	0.21	0.01	0.01	0.21	0.31	0.26	0.47	0.26
OP2	0.13	0.36	0.20	0.02	0.30	0.13	0.37	0.27	0.42	0.29	0.41	0.36	0.30	0.37	0.24	0.27	0.01	0.05	0.31	0.45	0.11	0.21	0.09
P	0.09	0.21	0.14	0.01	0.13	0.04	0.19	0.11	0.21	0.22	0.21	0.26	0.17	0.24	0.12	0.24	0.00	0.03	0.25	0.25	0.09	0.32	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.08	0.10	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.09	0.04	0.15	0.16	0.08
C2	0.09	0.00	0.24	0.21	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.29	0.28	0.01	0.12	0.01	0.12	0.22	0.07
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.01	0.05	0.02	0.10	0.10	0.19	0.30	0.25	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.07	0.04	0.24	0.08
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.10	0.02	0.11	0.15	0.17	0.26	0.21	0.14	0.07	0.02	0.01	0.00	0.20	0.11	0.08	0.29	0.15
C4	0.05	0.01	0.12	0.12	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.13	0.02	0.10	0.01	0.12	0.22	0.07
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.09	0.05	0.11	0.09	0.09	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.16	0.01
C5	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.03	0.05	0.01	0.10	0.24	0.08
C5'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.04	0.04	0.03	0.14	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.13	0.19	0.12	0.01
C6	0.05	0.02	0.10	0.11	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.13	0.14	0.03	0.05	0.01	0.11	0.26	0.09
C8	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.17	0.02	0.04	0.01	0.10	0.22	0.07
N1	0.08	0.01	0.19	0.17	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.23	0.22	0.02	0.09	0.01	0.09	0.24	0.07
N2	0.10	0.00	0.30	0.26	0.01	0.11	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.36	0.36	0.00	0.14	0.03	0.14	0.21	0.08
N3	0.09	0.00	0.25	0.21	0.00	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.28	0.27	0.01	0.14	0.01	0.15	0.20	0.09
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.17	0.03	0.01	0.01	0.12	0.25	0.10
N9	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.03	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.02	0.13	0.20	0.08
O2'	0.02	0.29	0.00	0.02	0.13	0.03	0.07	0.03	0.13	0.07	0.23	0.36	0.28	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.08	0.11	0.06	0.22	0.06
O3'	0.03	0.28	0.03	0.01	0.13	0.01	0.11	0.03	0.14	0.17	0.22	0.36	0.27	0.17	0.05	0.05	0.00	0.02	0.30	0.14	0.19	0.36	0.25
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.19	0.04	0.26	0.13	0.16
O5'	0.09	0.12	0.11	0.20	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.09	0.14	0.14	0.01	0.10	0.08	0.30	0.19	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00
O6	0.04	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.11	0.14	0.04	0.01	0.00	0.15	0.28	0.12
OP1	0.15	0.12	0.04	0.08	0.12	0.14	0.10	0.19	0.11	0.10	0.09	0.14	0.15	0.12	0.13	0.06	0.19	0.26	0.03	0.15	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.22	0.24	0.29	0.22	0.16	0.24	0.12	0.26	0.22	0.24	0.21	0.20	0.25	0.20	0.22	0.36	0.13	0.01	0.28	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.07	0.08	0.15	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.07	0.07	0.08	0.09	0.10	0.08	0.06	0.25	0.16	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00