Doublet Group distance statistics: 51665

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 8, 4, 8, 10, 3, 5, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.024, 0.050, 0.075, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.050 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.016, 0.044, 0.072, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.044 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.066, 0.189, 0.312, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.189 std_dev=0.123
C2'	A	0, 0.073, 0.201, 0.329, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.201 std_dev=0.128
O2'	A	0, 0.092, 0.230, 0.367, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.230 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.100, 0.290, 0.479, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.290 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.223, 0.419, 0.615, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.419 std_dev=0.196
N9	B	0, 0.225, 0.425, 0.626, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.425 std_dev=0.200
C3'	A	0, 0.113, 0.315, 0.516, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.315 std_dev=0.202
C1'	B	0, 0.204, 0.415, 0.626, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.415 std_dev=0.211
O4'	B	0, 0.184, 0.402, 0.620, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.402 std_dev=0.218
O5'	B	0, 0.310, 0.532, 0.754, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.532 std_dev=0.222
N3	B	0, 0.229, 0.451, 0.674, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.451 std_dev=0.222
C5	B	0, 0.291, 0.517, 0.743, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.517 std_dev=0.226
C4'	B	0, 0.252, 0.489, 0.725, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.489 std_dev=0.237
C8	B	0, 0.316, 0.560, 0.804, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.560 std_dev=0.244
P	B	0, 0.215, 0.470, 0.725, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.470 std_dev=0.255
N7	B	0, 0.374, 0.630, 0.885, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.630 std_dev=0.255
C2	B	0, 0.257, 0.518, 0.779, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.518 std_dev=0.261
OP2	B	0, 0.234, 0.499, 0.765, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.499 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.265, 0.531, 0.797, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.531 std_dev=0.266
O3'	A	0, 0.183, 0.450, 0.718, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.450 std_dev=0.268
C5'	B	0, 0.271, 0.546, 0.820, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.546 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.284, 0.560, 0.837, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.560 std_dev=0.276
C3'	B	0, 0.286, 0.565, 0.845, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.565 std_dev=0.280
O5'	A	0, 0.166, 0.453, 0.741, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.453 std_dev=0.287
P	A	0, 0.356, 0.652, 0.948, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.652 std_dev=0.296
N1	B	0, 0.236, 0.536, 0.836, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.536 std_dev=0.300
OP1	B	0, 0.259, 0.559, 0.860, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.559 std_dev=0.301
O2'	B	0, 0.288, 0.591, 0.893, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.591 std_dev=0.302
C5'	A	0, 0.151, 0.479, 0.808, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.479 std_dev=0.329
N6	B	0, 0.371, 0.701, 1.032, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.701 std_dev=0.330
O3'	B	0, 0.310, 0.663, 1.015, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.663 std_dev=0.352
OP1	A	0, 0.420, 0.856, 1.291, 2.113 max_d=2.113 avg_d=0.856 std_dev=0.435
OP2	A	0, 0.270, 0.799, 1.329, 3.145 max_d=3.145 avg_d=0.799 std_dev=0.529

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.18	0.25	0.28	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.05	0.13	0.00	0.02	0.01	0.12	0.15	0.12	0.10
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.08	0.03	0.07	0.06	0.13	0.02	0.01	0.01	0.18	0.21	0.14	0.13
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.25	0.33	0.45	0.26
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.09	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03	0.26	0.34	0.46	0.27
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.06	0.08	0.10	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.03	0.23	0.30	0.34	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.17	0.25	0.24	0.17
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.22	0.29	0.37	0.22
N4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.08	0.03	0.26	0.35	0.52	0.28
O2	0.04	0.01	0.13	0.13	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.15	0.04	0.14	0.23	0.22	0.16
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.05	0.11	0.00	0.04	0.03	0.05	0.11	0.12	0.05
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.09	0.04	0.08	0.08	0.15	0.04	0.00	0.01	0.16	0.31	0.21	0.14
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.19	0.17	0.11
O5'	0.09	0.18	0.12	0.18	0.25	0.02	0.26	0.01	0.23	0.17	0.22	0.26	0.14	0.05	0.16	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.18	0.25	0.15	0.21	0.33	0.09	0.34	0.12	0.30	0.25	0.29	0.35	0.23	0.11	0.31	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.28	0.12	0.14	0.45	0.17	0.46	0.26	0.34	0.24	0.37	0.52	0.22	0.12	0.21	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.10	0.13	0.26	0.03	0.27	0.01	0.22	0.17	0.22	0.28	0.16	0.05	0.14	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.19	0.10	0.09	0.17	0.09	0.22	0.17	0.24	0.24	0.22	0.17	0.28	0.27	0.16	0.11	0.10	0.08	0.13	0.05	0.08	0.05
C2	0.18	0.25	0.18	0.15	0.22	0.14	0.25	0.18	0.27	0.27	0.26	0.22	0.28	0.28	0.21	0.18	0.14	0.15	0.17	0.12	0.13	0.10
C2'	0.12	0.16	0.09	0.10	0.16	0.09	0.21	0.18	0.21	0.24	0.19	0.15	0.24	0.26	0.16	0.10	0.11	0.09	0.14	0.08	0.10	0.08
C3'	0.13	0.15	0.10	0.11	0.16	0.09	0.22	0.13	0.23	0.23	0.19	0.14	0.26	0.27	0.16	0.11	0.11	0.12	0.06	0.02	0.05	0.02
C4	0.17	0.25	0.18	0.14	0.18	0.14	0.21	0.15	0.27	0.19	0.27	0.21	0.29	0.21	0.16	0.20	0.15	0.15	0.17	0.11	0.17	0.11
C4'	0.13	0.18	0.10	0.11	0.18	0.08	0.24	0.14	0.26	0.25	0.22	0.15	0.31	0.29	0.17	0.11	0.11	0.11	0.05	0.05	0.11	0.05
C5	0.15	0.22	0.15	0.12	0.16	0.14	0.20	0.16	0.26	0.17	0.26	0.18	0.30	0.20	0.14	0.17	0.12	0.15	0.18	0.13	0.19	0.13
C5'	0.18	0.22	0.17	0.16	0.22	0.13	0.29	0.14	0.31	0.28	0.27	0.20	0.36	0.33	0.22	0.16	0.16	0.16	0.12	0.11	0.21	0.11
C6	0.13	0.20	0.12	0.10	0.16	0.12	0.21	0.16	0.25	0.18	0.24	0.17	0.30	0.23	0.13	0.14	0.10	0.13	0.16	0.11	0.17	0.12
N1	0.13	0.21	0.11	0.09	0.18	0.10	0.23	0.16	0.25	0.24	0.24	0.18	0.28	0.27	0.16	0.13	0.09	0.09	0.14	0.07	0.11	0.06
N3	0.19	0.27	0.21	0.17	0.22	0.16	0.25	0.17	0.28	0.24	0.29	0.24	0.29	0.25	0.20	0.22	0.17	0.16	0.18	0.12	0.15	0.10
N4	0.19	0.27	0.21	0.17	0.18	0.17	0.19	0.16	0.27	0.17	0.29	0.23	0.30	0.19	0.17	0.24	0.18	0.17	0.18	0.13	0.20	0.13
O2	0.24	0.27	0.23	0.22	0.25	0.21	0.27	0.25	0.27	0.31	0.27	0.26	0.28	0.30	0.26	0.23	0.20	0.23	0.22	0.20	0.16	0.16
O2'	0.15	0.18	0.14	0.17	0.17	0.16	0.21	0.24	0.21	0.24	0.19	0.17	0.23	0.25	0.18	0.15	0.19	0.15	0.20	0.11	0.09	0.10
O3'	0.12	0.14	0.11	0.13	0.15	0.10	0.20	0.14	0.21	0.21	0.18	0.13	0.25	0.25	0.14	0.12	0.15	0.12	0.01	0.02	0.02	0.01
O4'	0.12	0.19	0.09	0.08	0.17	0.07	0.23	0.15	0.26	0.24	0.23	0.16	0.31	0.29	0.16	0.11	0.09	0.08	0.08	0.03	0.09	0.02
O5'	0.27	0.33	0.27	0.27	0.33	0.22	0.38	0.22	0.40	0.35	0.37	0.31	0.44	0.41	0.31	0.26	0.26	0.24	0.27	0.16	0.25	0.21
OP1	0.27	0.36	0.30	0.34	0.33	0.27	0.38	0.29	0.42	0.34	0.41	0.32	0.47	0.39	0.30	0.28	0.37	0.26	0.38	0.39	0.45	0.39
OP2	0.31	0.45	0.34	0.33	0.41	0.25	0.47	0.24	0.52	0.39	0.50	0.41	0.58	0.47	0.36	0.31	0.34	0.25	0.28	0.38	0.38	0.31
P	0.26	0.35	0.28	0.27	0.34	0.21	0.40	0.19	0.43	0.35	0.40	0.32	0.49	0.42	0.31	0.26	0.27	0.22	0.25	0.19	0.28	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.06	0.18	0.06
C2	0.02	0.00	0.15	0.15	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.20	0.04	0.16	0.16	0.26	0.16
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.10	0.04	0.13	0.15	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.16	0.08
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.07	0.14	0.14	0.11	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.14	0.15	0.14	0.10
C4	0.01	0.01	0.09	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.16	0.14	0.24	0.15
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.20	0.19	0.27	0.20
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.09	0.06	0.12	0.13	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.02	0.21	0.21	0.29	0.21
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.08	0.04	0.20	0.16	0.23	0.17
N1	0.02	0.00	0.13	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.03	0.19	0.19	0.29	0.19
N3	0.02	0.00	0.15	0.14	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.04	0.14	0.13	0.24	0.13
N6	0.03	0.01	0.09	0.11	0.02	0.06	0.02	0.12	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.15	0.03	0.23	0.24	0.31	0.24
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.23	0.21	0.28	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.14	0.11	0.21	0.12
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.04	0.10	0.03	0.13	0.14	0.09	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.07	0.11	0.15	0.06
O3'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.15	0.08	0.19	0.18	0.15	0.08	0.05	0.04	0.00	0.01	0.14	0.20	0.14	0.13
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.07	0.20	0.08
O5'	0.07	0.16	0.11	0.14	0.16	0.01	0.20	0.01	0.21	0.20	0.19	0.14	0.23	0.23	0.14	0.07	0.14	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.16	0.12	0.15	0.14	0.08	0.19	0.09	0.21	0.16	0.19	0.13	0.24	0.21	0.11	0.11	0.20	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.26	0.16	0.14	0.24	0.15	0.27	0.14	0.29	0.23	0.29	0.24	0.31	0.28	0.21	0.15	0.14	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.08	0.10	0.15	0.02	0.20	0.01	0.21	0.17	0.19	0.13	0.24	0.22	0.12	0.06	0.13	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00