Doublet Group distance statistics: 51666

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 3, 6, 2, 1, 6, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.014, 0.026, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.025, 0.042, 0.059, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.042 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.023, 0.041, 0.060, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.041 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.026, 0.044, 0.063, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.044 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.024, 0.043, 0.062, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.043 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.063, 0.111, 0.160, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.111 std_dev=0.048
N4	A	0, 0.081, 0.136, 0.191, 0.216 max_d=0.216 avg_d=0.136 std_dev=0.055
C2'	A	0, 0.069, 0.146, 0.223, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.146 std_dev=0.077
O4'	A	0, 0.065, 0.159, 0.254, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.159 std_dev=0.095
O2'	A	0, 0.074, 0.175, 0.277, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.175 std_dev=0.102
C4'	A	0, 0.129, 0.288, 0.448, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.288 std_dev=0.160
C3'	A	0, 0.143, 0.305, 0.468, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.305 std_dev=0.162
N6	B	0, 0.230, 0.419, 0.608, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.419 std_dev=0.189
O5'	A	0, 0.203, 0.408, 0.613, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.408 std_dev=0.205
C5'	A	0, 0.178, 0.407, 0.635, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.407 std_dev=0.228
C6	B	0, 0.182, 0.422, 0.661, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.422 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.211, 0.464, 0.717, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.464 std_dev=0.253
N1	B	0, 0.222, 0.480, 0.737, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.480 std_dev=0.258
C5	B	0, 0.220, 0.484, 0.748, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.484 std_dev=0.264
N7	B	0, 0.295, 0.578, 0.861, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.578 std_dev=0.283
C2	B	0, 0.276, 0.573, 0.869, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.573 std_dev=0.297
P	A	0, 0.223, 0.521, 0.819, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.521 std_dev=0.298
C4	B	0, 0.210, 0.530, 0.850, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.530 std_dev=0.320
N3	B	0, 0.261, 0.590, 0.919, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.590 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.290, 0.636, 0.982, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.636 std_dev=0.346
N9	B	0, 0.226, 0.596, 0.967, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.596 std_dev=0.371
C1'	B	0, 0.203, 0.638, 1.073, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.638 std_dev=0.435
O4'	B	0, 0.278, 0.770, 1.262, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.770 std_dev=0.492
P	B	0, 0.278, 0.778, 1.278, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.778 std_dev=0.500
C5'	B	0, 0.307, 0.817, 1.328, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.817 std_dev=0.510
O5'	B	0, 0.328, 0.850, 1.373, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.850 std_dev=0.523
C2'	B	0, 0.158, 0.714, 1.270, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.714 std_dev=0.556
OP1	B	0, 0.302, 0.908, 1.515, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.908 std_dev=0.607
C4'	B	0, 0.318, 0.949, 1.580, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.949 std_dev=0.631
OP2	B	0, 0.323, 0.982, 1.641, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.982 std_dev=0.659
O2'	B	0, 0.294, 0.989, 1.684, 2.510 max_d=2.510 avg_d=0.989 std_dev=0.695
C3'	B	0, 0.404, 1.256, 2.109, 2.593 max_d=2.593 avg_d=1.256 std_dev=0.853
OP1	A	0, 0.295, 1.624, 2.953, 3.921 max_d=3.921 avg_d=1.624 std_dev=1.329
OP2	A	0, 0.405, 1.759, 3.114, 3.555 max_d=3.555 avg_d=1.759 std_dev=1.355
O3'	B	0, 0.489, 1.884, 3.279, 4.060 max_d=4.060 avg_d=1.884 std_dev=1.395

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.57	0.27	0.14
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.13	0.80	0.71	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.24	0.18	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.08	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.16	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.18	0.92	1.07	0.23
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.15	0.19	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.19	0.90	1.06	0.24
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.11	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.13	0.41	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03	0.17	0.80	0.79	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.12	0.74	0.60	0.19
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.16	0.88	0.92	0.21
N4	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.20	0.95	1.20	0.24
O2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.08	0.03	0.11	0.75	0.59	0.18
O2'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.07	0.00	0.04	0.03	0.03	0.22	0.05	0.07
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.11	0.01	0.11	0.03	0.09	0.05	0.09	0.13	0.08	0.04	0.00	0.01	0.07	0.45	0.22	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.06	0.59	0.11	0.16
O5'	0.06	0.13	0.03	0.03	0.18	0.01	0.19	0.01	0.17	0.12	0.16	0.20	0.11	0.03	0.07	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.57	0.80	0.24	0.16	0.92	0.15	0.90	0.13	0.80	0.74	0.88	0.95	0.75	0.22	0.45	0.59	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.71	0.18	0.07	1.07	0.19	1.06	0.41	0.79	0.60	0.92	1.20	0.59	0.05	0.22	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.20	0.07	0.04	0.23	0.05	0.24	0.01	0.21	0.19	0.21	0.24	0.18	0.07	0.09	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.35	0.17	0.16	0.18	0.22	0.20	0.31	0.26	0.26	0.33	0.29	0.28	0.27	0.12	0.18	0.24	0.18	0.23	0.04	0.05	0.06
C2	0.26	0.34	0.25	0.25	0.11	0.31	0.14	0.37	0.23	0.28	0.34	0.23	0.25	0.24	0.19	0.30	0.43	0.29	0.35	0.16	0.20	0.19
C2'	0.12	0.32	0.19	0.14	0.20	0.18	0.22	0.30	0.25	0.30	0.29	0.28	0.26	0.30	0.14	0.14	0.19	0.14	0.27	0.09	0.09	0.12
C3'	0.10	0.25	0.21	0.17	0.18	0.09	0.22	0.10	0.24	0.27	0.24	0.23	0.27	0.32	0.13	0.10	0.18	0.19	0.08	0.02	0.06	0.01
C4	0.26	0.20	0.23	0.28	0.13	0.26	0.12	0.32	0.16	0.25	0.24	0.14	0.22	0.21	0.21	0.29	0.30	0.26	0.33	0.20	0.25	0.22
C4'	0.09	0.28	0.20	0.14	0.17	0.08	0.21	0.14	0.24	0.23	0.26	0.24	0.28	0.29	0.11	0.08	0.14	0.16	0.05	0.12	0.20	0.09
C5	0.19	0.24	0.16	0.29	0.13	0.19	0.13	0.24	0.21	0.19	0.26	0.18	0.27	0.17	0.15	0.25	0.18	0.19	0.26	0.16	0.19	0.17
C5'	0.09	0.23	0.22	0.24	0.15	0.11	0.20	0.05	0.23	0.18	0.23	0.20	0.29	0.26	0.09	0.17	0.28	0.19	0.12	0.22	0.34	0.19
C6	0.17	0.30	0.14	0.26	0.17	0.17	0.18	0.23	0.26	0.18	0.31	0.24	0.29	0.20	0.13	0.18	0.16	0.17	0.22	0.11	0.12	0.13
N1	0.18	0.34	0.16	0.19	0.15	0.21	0.17	0.29	0.26	0.23	0.33	0.26	0.27	0.23	0.12	0.18	0.24	0.20	0.27	0.10	0.12	0.12
N3	0.30	0.26	0.29	0.29	0.13	0.32	0.13	0.37	0.18	0.29	0.29	0.16	0.22	0.23	0.24	0.33	0.45	0.32	0.38	0.20	0.26	0.23
N4	0.29	0.15	0.28	0.31	0.20	0.28	0.18	0.33	0.12	0.27	0.16	0.18	0.17	0.23	0.26	0.36	0.34	0.29	0.36	0.23	0.29	0.25
O2	0.31	0.38	0.31	0.32	0.15	0.39	0.16	0.43	0.24	0.30	0.36	0.27	0.25	0.25	0.22	0.40	0.58	0.36	0.39	0.16	0.21	0.19
O2'	0.16	0.37	0.25	0.26	0.22	0.32	0.23	0.44	0.25	0.32	0.32	0.33	0.26	0.31	0.18	0.26	0.35	0.17	0.34	0.14	0.10	0.15
O3'	0.13	0.22	0.28	0.14	0.18	0.13	0.22	0.06	0.22	0.28	0.21	0.22	0.26	0.32	0.15	0.12	0.26	0.25	0.02	0.02	0.02	0.00
O4'	0.12	0.32	0.16	0.13	0.17	0.14	0.19	0.23	0.25	0.22	0.31	0.27	0.28	0.25	0.10	0.11	0.13	0.14	0.13	0.07	0.15	0.04
O5'	0.13	0.19	0.21	0.39	0.14	0.20	0.18	0.11	0.23	0.11	0.21	0.17	0.31	0.21	0.10	0.25	0.40	0.23	0.22	0.25	0.40	0.24
OP1	0.19	0.51	0.43	0.24	0.29	0.18	0.26	0.37	0.40	0.19	0.52	0.41	0.41	0.19	0.16	0.53	0.28	0.23	0.38	0.69	0.52	0.53
OP2	0.45	1.00	0.64	0.36	0.81	0.21	0.99	0.23	1.19	0.63	1.16	0.84	1.38	0.90	0.61	0.84	0.41	0.19	0.29	0.61	0.47	0.42
P	0.14	0.14	0.27	0.42	0.11	0.22	0.15	0.13	0.20	0.11	0.17	0.13	0.28	0.18	0.11	0.37	0.47	0.24	0.23	0.24	0.36	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.11	0.03	0.02	0.05	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.29	0.00	0.26	0.22	0.31	0.21
C2	0.06	0.00	0.17	0.17	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.25	0.33	0.09	0.24	0.22	0.36	0.22
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.24	0.06	0.13	0.12	0.18	0.05	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01	0.50	0.57	0.65	0.53
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.20	0.00	0.29	0.02	0.28	0.35	0.23	0.14	0.33	0.37	0.21	0.02	0.00	0.02	0.07	0.14	0.11	0.07
C4	0.03	0.01	0.08	0.20	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.16	0.05	0.25	0.25	0.38	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.05	0.04	0.08	0.11	0.06	0.32	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.29	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.35	0.09	0.02	0.25	0.30	0.42	0.30
C5'	0.11	0.12	0.24	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.15	0.18	0.13	0.12	0.16	0.18	0.14	0.08	0.24	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.06	0.28	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.36	0.10	0.04	0.24	0.29	0.41	0.29
C8	0.02	0.01	0.13	0.35	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.33	0.24	0.08	0.28	0.36	0.44	0.36
N1	0.05	0.00	0.12	0.23	0.02	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.31	0.20	0.07	0.24	0.25	0.39	0.25
N3	0.06	0.00	0.18	0.14	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.36	0.09	0.24	0.21	0.35	0.21
N6	0.02	0.01	0.05	0.33	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.40	0.15	0.03	0.24	0.33	0.43	0.32
N7	0.01	0.01	0.10	0.37	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.39	0.25	0.06	0.26	0.37	0.47	0.37
N9	0.00	0.02	0.03	0.21	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.22	0.07	0.01	0.27	0.26	0.37	0.26
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.26	0.32	0.35	0.08	0.36	0.33	0.31	0.21	0.40	0.39	0.22	0.00	0.05	0.21	0.36	0.43	0.73	0.43
O3'	0.29	0.33	0.02	0.00	0.16	0.02	0.09	0.24	0.10	0.24	0.20	0.36	0.15	0.25	0.07	0.05	0.00	0.23	0.28	0.32	0.30	0.29
O4'	0.00	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.07	0.09	0.03	0.06	0.01	0.21	0.23	0.00	0.07	0.09	0.07	0.09
O5'	0.26	0.24	0.50	0.07	0.25	0.02	0.25	0.01	0.24	0.28	0.24	0.24	0.24	0.26	0.27	0.36	0.28	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.22	0.22	0.57	0.14	0.25	0.06	0.30	0.06	0.29	0.36	0.25	0.21	0.33	0.37	0.26	0.43	0.32	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.36	0.65	0.11	0.38	0.04	0.42	0.02	0.41	0.44	0.39	0.35	0.43	0.47	0.37	0.73	0.30	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.22	0.53	0.07	0.25	0.03	0.30	0.02	0.29	0.36	0.25	0.21	0.32	0.37	0.26	0.43	0.29	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00