Doublet Group distance statistics: 51667

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 4, 1, 4, 4, 5, 3, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.008, 0.013, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.011, 0.016, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.011, 0.017, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.012, 0.018, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.015, 0.023, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.018, 0.033, 0.049, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.020, 0.037, 0.053, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.037 std_dev=0.016
N7	B	0, 0.304, 0.488, 0.672, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.488 std_dev=0.184
C5	B	0, 0.287, 0.484, 0.681, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.484 std_dev=0.197
O4'	A	0, -0.064, 0.140, 0.344, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.140 std_dev=0.204
C6	B	0, 0.349, 0.564, 0.778, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.564 std_dev=0.215
C2'	A	0, -0.071, 0.146, 0.363, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.146 std_dev=0.217
N6	B	0, 0.412, 0.635, 0.857, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.635 std_dev=0.223
C8	B	0, 0.359, 0.584, 0.809, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.584 std_dev=0.225
C4	B	0, 0.295, 0.537, 0.779, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.537 std_dev=0.242
N9	B	0, 0.358, 0.613, 0.869, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.613 std_dev=0.255
N1	B	0, 0.384, 0.665, 0.946, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.665 std_dev=0.281
N3	B	0, 0.306, 0.613, 0.919, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.613 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.400, 0.711, 1.022, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.711 std_dev=0.311
C4'	A	0, -0.084, 0.234, 0.551, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.234 std_dev=0.318
C2	B	0, 0.335, 0.655, 0.975, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.655 std_dev=0.320
C3'	A	0, -0.087, 0.248, 0.583, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.248 std_dev=0.335
O2'	A	0, -0.099, 0.249, 0.596, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.249 std_dev=0.348
C1'	B	0, 0.434, 0.786, 1.138, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.786 std_dev=0.352
O5'	A	0, 0.137, 0.525, 0.914, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.525 std_dev=0.388
C5'	A	0, -0.026, 0.383, 0.791, 2.222 max_d=2.222 avg_d=0.383 std_dev=0.408
C4'	B	0, 0.329, 0.750, 1.170, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.750 std_dev=0.420
P	A	0, 0.152, 0.581, 1.010, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.581 std_dev=0.429
C2'	B	0, 0.555, 0.998, 1.440, 1.747 max_d=1.747 avg_d=0.998 std_dev=0.442
C3'	B	0, 0.415, 0.864, 1.313, 2.249 max_d=2.249 avg_d=0.864 std_dev=0.449
O3'	A	0, -0.097, 0.389, 0.876, 2.656 max_d=2.656 avg_d=0.389 std_dev=0.487
O5'	B	0, 0.050, 0.537, 1.025, 2.775 max_d=2.775 avg_d=0.537 std_dev=0.488
OP2	A	0, 0.160, 0.668, 1.176, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.668 std_dev=0.508
C5'	B	0, 0.070, 0.604, 1.137, 2.971 max_d=2.971 avg_d=0.604 std_dev=0.534
O2'	B	0, 0.762, 1.304, 1.845, 2.175 max_d=2.175 avg_d=1.304 std_dev=0.542
O3'	B	0, 0.524, 1.097, 1.670, 2.796 max_d=2.796 avg_d=1.097 std_dev=0.573
OP1	A	0, 0.203, 0.803, 1.404, 3.002 max_d=3.002 avg_d=0.803 std_dev=0.600
P	B	0, -0.087, 0.515, 1.118, 3.277 max_d=3.277 avg_d=0.515 std_dev=0.603
OP2	B	0, -0.028, 0.586, 1.201, 3.357 max_d=3.357 avg_d=0.586 std_dev=0.615
OP1	B	0, -0.106, 0.694, 1.493, 4.371 max_d=4.371 avg_d=0.694 std_dev=0.799

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.13	0.00	0.09	0.14	0.17	0.11
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.06	0.13	0.15	0.27	0.19
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.10	0.09	0.02	0.08	0.04	0.15	0.00	0.02	0.01	0.21	0.32	0.35	0.28
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.18	0.00	0.19	0.03	0.17	0.11	0.15	0.19	0.09	0.02	0.01	0.02	0.07	0.24	0.19	0.14
C4	0.02	0.01	0.04	0.18	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.13	0.03	0.20	0.29	0.42	0.30
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.04	0.08	0.05	0.14	0.02	0.00	0.02	0.12	0.07	0.04
C5	0.01	0.00	0.07	0.19	0.00	0.11	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.18	0.06	0.21	0.30	0.41	0.31
C5'	0.05	0.09	0.10	0.03	0.13	0.01	0.16	0.00	0.13	0.08	0.11	0.15	0.09	0.06	0.10	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.17	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.14	0.07	0.17	0.21	0.28	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.12	0.14	0.22	0.17
N3	0.02	0.01	0.08	0.15	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.05	0.16	0.22	0.35	0.25
N4	0.02	0.01	0.04	0.19	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.16	0.03	0.22	0.34	0.48	0.35
O2	0.03	0.00	0.15	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.15	0.10	0.11	0.13	0.23	0.16
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.15	0.14	0.19	0.06	0.18	0.08	0.11	0.16	0.15	0.00	0.05	0.10	0.17	0.30	0.42	0.27
O3'	0.13	0.08	0.02	0.01	0.13	0.02	0.18	0.10	0.14	0.06	0.08	0.16	0.15	0.05	0.00	0.09	0.14	0.25	0.20	0.16
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.05	0.03	0.10	0.10	0.09	0.00	0.08	0.08	0.14	0.11
O5'	0.09	0.13	0.21	0.07	0.20	0.02	0.21	0.01	0.17	0.12	0.16	0.22	0.11	0.17	0.14	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.15	0.32	0.24	0.29	0.12	0.30	0.07	0.21	0.14	0.22	0.34	0.13	0.30	0.25	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.27	0.35	0.19	0.42	0.07	0.41	0.04	0.28	0.22	0.35	0.48	0.23	0.42	0.20	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.19	0.28	0.14	0.30	0.04	0.31	0.01	0.23	0.17	0.25	0.35	0.16	0.27	0.16	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.16	0.34	0.22	0.18	0.24	0.17	0.27	0.17	0.22	0.16	0.18	0.20	0.20	0.23	0.36	0.21	0.27	0.24	0.15	0.16	0.15
C2	0.32	0.15	0.31	0.21	0.17	0.26	0.14	0.26	0.17	0.21	0.15	0.19	0.24	0.19	0.23	0.38	0.24	0.29	0.19	0.10	0.24	0.11
C2'	0.31	0.18	0.23	0.17	0.20	0.25	0.17	0.15	0.16	0.21	0.16	0.21	0.18	0.18	0.24	0.29	0.19	0.38	0.18	0.08	0.19	0.10
C3'	0.28	0.25	0.19	0.13	0.26	0.19	0.27	0.09	0.26	0.29	0.25	0.25	0.27	0.28	0.28	0.23	0.17	0.33	0.09	0.02	0.07	0.01
C4	0.27	0.17	0.22	0.18	0.18	0.18	0.14	0.16	0.14	0.21	0.13	0.20	0.22	0.19	0.22	0.29	0.15	0.24	0.22	0.23	0.40	0.24
C4'	0.26	0.17	0.23	0.11	0.19	0.17	0.19	0.11	0.18	0.24	0.17	0.18	0.20	0.22	0.23	0.27	0.11	0.28	0.07	0.08	0.10	0.04
C5	0.23	0.15	0.18	0.16	0.15	0.14	0.12	0.14	0.12	0.18	0.13	0.17	0.17	0.16	0.19	0.25	0.15	0.21	0.24	0.28	0.41	0.27
C5'	0.27	0.20	0.22	0.14	0.23	0.16	0.24	0.09	0.23	0.28	0.21	0.21	0.25	0.27	0.25	0.25	0.17	0.28	0.11	0.22	0.24	0.17
C6	0.23	0.13	0.21	0.13	0.14	0.14	0.11	0.14	0.12	0.18	0.12	0.15	0.17	0.15	0.18	0.27	0.13	0.22	0.21	0.21	0.31	0.21
N1	0.28	0.14	0.28	0.16	0.16	0.20	0.14	0.21	0.15	0.20	0.13	0.17	0.20	0.18	0.21	0.33	0.16	0.25	0.19	0.09	0.21	0.11
N3	0.31	0.15	0.28	0.19	0.18	0.23	0.13	0.22	0.15	0.21	0.13	0.20	0.25	0.19	0.23	0.36	0.20	0.27	0.19	0.14	0.33	0.16
N4	0.27	0.22	0.23	0.21	0.22	0.19	0.20	0.16	0.19	0.22	0.19	0.25	0.26	0.22	0.24	0.29	0.18	0.24	0.25	0.28	0.46	0.28
O2	0.37	0.19	0.39	0.30	0.20	0.35	0.18	0.36	0.21	0.22	0.19	0.22	0.27	0.21	0.26	0.47	0.37	0.34	0.24	0.19	0.21	0.15
O2'	0.29	0.22	0.41	0.26	0.25	0.26	0.31	0.21	0.30	0.35	0.26	0.21	0.35	0.37	0.27	0.41	0.24	0.32	0.30	0.18	0.43	0.25
O3'	0.22	0.22	0.22	0.11	0.23	0.15	0.26	0.10	0.26	0.26	0.24	0.21	0.28	0.28	0.23	0.21	0.11	0.26	0.01	0.01	0.02	0.00
O4'	0.29	0.16	0.31	0.19	0.18	0.23	0.15	0.25	0.15	0.21	0.15	0.18	0.17	0.18	0.22	0.34	0.17	0.27	0.17	0.10	0.10	0.08
O5'	0.29	0.27	0.27	0.23	0.28	0.19	0.30	0.15	0.30	0.33	0.28	0.27	0.31	0.33	0.30	0.28	0.27	0.29	0.20	0.28	0.32	0.24
OP1	0.31	0.33	0.38	0.35	0.32	0.29	0.36	0.29	0.38	0.35	0.36	0.31	0.43	0.38	0.32	0.39	0.41	0.31	0.32	0.42	0.43	0.35
OP2	0.34	0.38	0.39	0.34	0.37	0.29	0.39	0.26	0.42	0.37	0.41	0.36	0.45	0.39	0.35	0.44	0.39	0.33	0.29	0.33	0.35	0.28
P	0.29	0.31	0.32	0.27	0.31	0.22	0.34	0.19	0.35	0.34	0.34	0.30	0.38	0.36	0.31	0.35	0.32	0.29	0.23	0.32	0.34	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.08	0.07	0.20	0.12
C2	0.03	0.00	0.20	0.20	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.10	0.17	0.22	0.41	0.26
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.09	0.09	0.10	0.16	0.20	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.19	0.22	0.24	0.20
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.15	0.00	0.17	0.01	0.19	0.16	0.20	0.18	0.20	0.17	0.11	0.02	0.01	0.01	0.06	0.18	0.10	0.09
C4	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.05	0.17	0.21	0.38	0.25
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.10	0.05	0.05	0.08	0.10	0.05	0.14	0.02	0.00	0.01	0.10	0.06	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.17	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.12	0.03	0.22	0.31	0.47	0.32
C5'	0.04	0.08	0.09	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.07	0.13	0.14	0.07	0.07	0.09	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.05	0.23	0.34	0.51	0.34
C8	0.01	0.01	0.10	0.16	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.13	0.06	0.22	0.27	0.39	0.28
N1	0.03	0.00	0.16	0.20	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.08	0.20	0.29	0.48	0.31
N3	0.03	0.00	0.20	0.18	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.10	0.14	0.17	0.35	0.22
N6	0.01	0.01	0.07	0.20	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.16	0.04	0.26	0.41	0.57	0.39
N7	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.14	0.04	0.25	0.35	0.49	0.35
N9	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.01	0.15	0.17	0.31	0.20
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.09	0.14	0.13	0.07	0.13	0.19	0.13	0.15	0.15	0.19	0.09	0.00	0.04	0.10	0.15	0.21	0.29	0.19
O3'	0.13	0.21	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.09	0.15	0.13	0.19	0.19	0.16	0.14	0.06	0.04	0.00	0.09	0.11	0.27	0.19	0.16
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.04	0.04	0.01	0.10	0.09	0.00	0.09	0.07	0.21	0.14
O5'	0.08	0.17	0.19	0.06	0.17	0.01	0.22	0.01	0.23	0.22	0.20	0.14	0.26	0.25	0.15	0.15	0.11	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.22	0.22	0.18	0.21	0.10	0.31	0.08	0.34	0.27	0.29	0.17	0.41	0.35	0.17	0.21	0.27	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.41	0.24	0.10	0.38	0.06	0.47	0.02	0.51	0.39	0.48	0.35	0.57	0.49	0.31	0.29	0.19	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.26	0.20	0.09	0.25	0.03	0.32	0.01	0.34	0.28	0.31	0.22	0.39	0.35	0.20	0.19	0.16	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00