Doublet Group distance statistics: 51668

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 7, 3, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.008 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.001, 0.017, 0.034, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.020, 0.048, 0.075, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.048 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.005, 0.040, 0.074, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.040 std_dev=0.035
C4	B	0, 0.162, 0.271, 0.380, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.271 std_dev=0.109
C2	B	0, 0.133, 0.247, 0.361, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.247 std_dev=0.114
N3	B	0, 0.158, 0.283, 0.407, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.283 std_dev=0.125
O4'	A	0, 0.059, 0.187, 0.315, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.187 std_dev=0.128
C5	B	0, 0.174, 0.310, 0.446, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.310 std_dev=0.136
C2'	A	0, 0.050, 0.207, 0.364, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.207 std_dev=0.157
N7	B	0, 0.240, 0.422, 0.603, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.422 std_dev=0.181
N1	B	0, 0.109, 0.294, 0.479, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.294 std_dev=0.185
N9	B	0, 0.179, 0.366, 0.554, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.366 std_dev=0.187
C8	B	0, 0.235, 0.423, 0.611, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.423 std_dev=0.188
C6	B	0, 0.172, 0.361, 0.550, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.361 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.046, 0.307, 0.568, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.307 std_dev=0.261
N6	B	0, 0.262, 0.553, 0.844, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.553 std_dev=0.291
C5'	A	0, 0.167, 0.460, 0.753, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.460 std_dev=0.293
O4'	B	0, 0.217, 0.526, 0.834, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.526 std_dev=0.309
C1'	B	0, 0.151, 0.464, 0.777, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.464 std_dev=0.313
C3'	A	0, 0.026, 0.348, 0.670, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.348 std_dev=0.322
O2'	A	0, -0.080, 0.293, 0.666, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.293 std_dev=0.373
C2'	B	0, 0.118, 0.567, 1.016, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.567 std_dev=0.449
C4'	B	0, 0.176, 0.658, 1.140, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.658 std_dev=0.482
O5'	A	0, 0.060, 0.549, 1.038, 2.269 max_d=2.269 avg_d=0.549 std_dev=0.489
C5'	B	0, 0.182, 0.691, 1.200, 2.460 max_d=2.460 avg_d=0.691 std_dev=0.509
C3'	B	0, 0.145, 0.685, 1.226, 2.498 max_d=2.498 avg_d=0.685 std_dev=0.541
P	A	0, 0.007, 0.557, 1.106, 2.489 max_d=2.489 avg_d=0.557 std_dev=0.550
O2'	B	0, 0.077, 0.661, 1.245, 2.606 max_d=2.606 avg_d=0.661 std_dev=0.584
O3'	A	0, -0.027, 0.571, 1.170, 2.835 max_d=2.835 avg_d=0.571 std_dev=0.598
OP2	A	0, 0.049, 0.693, 1.337, 2.912 max_d=2.912 avg_d=0.693 std_dev=0.644
OP1	A	0, 0.069, 0.740, 1.412, 3.230 max_d=3.230 avg_d=0.740 std_dev=0.671
O3'	B	0, 0.102, 0.854, 1.605, 3.408 max_d=3.408 avg_d=0.854 std_dev=0.752
O5'	B	0, -0.071, 0.751, 1.573, 3.910 max_d=3.910 avg_d=0.751 std_dev=0.822
P	B	0, -0.437, 0.869, 2.175, 6.018 max_d=6.018 avg_d=0.869 std_dev=1.306
OP1	B	0, -0.438, 0.962, 2.363, 6.446 max_d=6.446 avg_d=0.962 std_dev=1.400
OP2	B	0, -0.798, 1.072, 2.943, 8.495 max_d=8.495 avg_d=1.072 std_dev=1.871

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.17	0.00	0.15	0.29	0.15	0.12
C2	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.09	0.04	0.30	0.44	0.19	0.30
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.10	0.09	0.01	0.05	0.03	0.17	0.00	0.02	0.02	0.24	0.27	0.18	0.22
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.19	0.00	0.19	0.01	0.16	0.12	0.16	0.21	0.12	0.02	0.01	0.01	0.19	0.19	0.04	0.14
C4	0.03	0.01	0.03	0.19	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.22	0.07	0.04	0.43	0.57	0.33	0.45
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.04	0.08	0.05	0.17	0.02	0.00	0.02	0.15	0.17	0.01
C5	0.03	0.01	0.07	0.19	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.11	0.04	0.45	0.58	0.33	0.47
C5'	0.03	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.05	0.10	0.05	0.08	0.10	0.01	0.01	0.17	0.20	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.16	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.19	0.07	0.05	0.39	0.51	0.23	0.38
N1	0.01	0.01	0.01	0.12	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.13	0.05	0.01	0.29	0.42	0.16	0.27
N3	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.18	0.05	0.05	0.37	0.52	0.26	0.38
N4	0.03	0.02	0.03	0.21	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.24	0.10	0.05	0.46	0.61	0.40	0.50
O2	0.04	0.00	0.17	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.18	0.06	0.23	0.38	0.16	0.23
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.22	0.17	0.23	0.08	0.19	0.13	0.18	0.24	0.07	0.00	0.04	0.11	0.10	0.11	0.18	0.12
O3'	0.17	0.09	0.02	0.01	0.07	0.02	0.11	0.10	0.07	0.05	0.05	0.10	0.18	0.04	0.00	0.11	0.18	0.18	0.16	0.16
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.05	0.06	0.11	0.11	0.00	0.05	0.25	0.23	0.05
O5'	0.15	0.30	0.24	0.19	0.43	0.02	0.45	0.01	0.39	0.29	0.37	0.46	0.23	0.10	0.18	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.29	0.44	0.27	0.19	0.57	0.15	0.58	0.17	0.51	0.42	0.52	0.61	0.38	0.11	0.18	0.25	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.19	0.18	0.04	0.33	0.17	0.33	0.20	0.23	0.16	0.26	0.40	0.16	0.18	0.16	0.23	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.30	0.22	0.14	0.45	0.01	0.47	0.02	0.38	0.27	0.38	0.50	0.23	0.12	0.16	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.09	0.12	0.09	0.09	0.12	0.09	0.11	0.11	0.13	0.11	0.09	0.13	0.11	0.11	0.13	0.11	0.13	0.14	0.26	0.26	0.13
C2	0.24	0.08	0.24	0.21	0.09	0.23	0.07	0.17	0.09	0.16	0.10	0.09	0.12	0.11	0.16	0.28	0.24	0.23	0.21	0.42	0.12	0.11
C2'	0.11	0.09	0.12	0.15	0.08	0.20	0.12	0.24	0.13	0.12	0.11	0.08	0.17	0.17	0.07	0.17	0.18	0.16	0.15	0.06	0.42	0.33
C3'	0.33	0.31	0.37	0.43	0.32	0.40	0.31	0.44	0.30	0.31	0.31	0.32	0.29	0.30	0.33	0.37	0.43	0.34	0.39	0.23	0.87	0.66
C4	0.21	0.08	0.22	0.16	0.10	0.17	0.08	0.12	0.11	0.15	0.11	0.10	0.16	0.12	0.16	0.28	0.18	0.18	0.13	0.18	0.26	0.16
C4'	0.19	0.19	0.24	0.33	0.19	0.30	0.21	0.39	0.22	0.21	0.21	0.18	0.24	0.22	0.20	0.22	0.35	0.22	0.33	0.24	0.92	0.67
C5	0.16	0.11	0.15	0.09	0.09	0.12	0.08	0.11	0.12	0.13	0.13	0.11	0.17	0.11	0.12	0.20	0.10	0.14	0.20	0.07	0.56	0.36
C5'	0.22	0.21	0.29	0.40	0.23	0.35	0.25	0.45	0.25	0.26	0.23	0.20	0.28	0.27	0.23	0.26	0.43	0.24	0.48	0.49	1.29	0.90
C6	0.14	0.12	0.13	0.08	0.10	0.11	0.09	0.12	0.13	0.12	0.13	0.11	0.16	0.10	0.12	0.16	0.08	0.14	0.19	0.06	0.58	0.38
N1	0.17	0.10	0.16	0.12	0.09	0.15	0.08	0.11	0.10	0.14	0.11	0.10	0.13	0.10	0.13	0.19	0.13	0.17	0.12	0.22	0.27	0.16
N3	0.26	0.07	0.27	0.22	0.10	0.24	0.07	0.17	0.09	0.17	0.10	0.10	0.13	0.11	0.18	0.32	0.26	0.23	0.16	0.36	0.09	0.08
N4	0.21	0.08	0.24	0.18	0.12	0.19	0.12	0.13	0.15	0.16	0.13	0.11	0.20	0.15	0.17	0.31	0.20	0.18	0.15	0.17	0.25	0.17
O2	0.26	0.07	0.28	0.28	0.10	0.31	0.08	0.24	0.08	0.18	0.09	0.09	0.11	0.12	0.17	0.32	0.33	0.28	0.37	0.65	0.43	0.35
O2'	0.34	0.36	0.34	0.32	0.40	0.25	0.43	0.20	0.41	0.50	0.38	0.36	0.41	0.49	0.42	0.25	0.29	0.30	0.39	0.23	0.07	0.07
O3'	0.31	0.30	0.40	0.49	0.32	0.43	0.33	0.52	0.32	0.35	0.31	0.30	0.33	0.34	0.33	0.38	0.52	0.31	0.39	0.28	0.79	0.69
O4'	0.10	0.10	0.09	0.13	0.08	0.13	0.11	0.20	0.14	0.09	0.13	0.09	0.17	0.11	0.08	0.11	0.14	0.12	0.14	0.06	0.60	0.39
O5'	0.42	0.57	0.47	0.51	0.54	0.40	0.60	0.44	0.63	0.53	0.61	0.53	0.65	0.61	0.49	0.41	0.51	0.35	0.58	0.50	1.35	0.92
OP1	0.30	0.54	0.29	0.31	0.44	0.23	0.48	0.34	0.56	0.35	0.58	0.48	0.60	0.43	0.36	0.27	0.32	0.23	0.48	0.54	1.34	0.90
OP2	0.47	0.61	0.59	0.67	0.58	0.51	0.65	0.55	0.69	0.55	0.66	0.57	0.74	0.64	0.53	0.53	0.73	0.40	0.73	0.71	1.68	1.10
P	0.39	0.59	0.45	0.49	0.53	0.37	0.60	0.41	0.66	0.48	0.64	0.53	0.71	0.58	0.46	0.39	0.51	0.32	0.58	0.55	1.44	0.95

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.06	0.12	0.04
C2	0.03	0.00	0.11	0.07	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.16	0.10	0.03	0.23	0.14	0.33	0.27
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.09	0.10	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.12	0.16	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.10	0.05	0.07	0.05	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.19	0.25	0.13	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02	0.25	0.17	0.37	0.30
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.37	0.12
C5	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.34	0.29	0.66	0.47
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.05	0.08	0.03	0.03	0.07	0.09	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.19	0.21	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.34	0.30	0.71	0.50
C8	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.02	0.34	0.28	0.61	0.46
N1	0.03	0.01	0.09	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.14	0.08	0.02	0.29	0.23	0.55	0.40
N3	0.03	0.01	0.10	0.07	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.14	0.09	0.03	0.19	0.09	0.21	0.20
N6	0.02	0.03	0.07	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.10	0.08	0.02	0.38	0.39	0.90	0.61
N7	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.39	0.36	0.84	0.58
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.24	0.14	0.29	0.26
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.08	0.04	0.07	0.04	0.10	0.02	0.14	0.14	0.10	0.03	0.03	0.00	0.03	0.04	0.06	0.06	0.43	0.13
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.11	0.08	0.09	0.08	0.11	0.04	0.03	0.00	0.02	0.15	0.28	0.29	0.04
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.11	0.23	0.08
O5'	0.10	0.23	0.14	0.19	0.25	0.01	0.34	0.01	0.34	0.34	0.29	0.19	0.38	0.39	0.24	0.06	0.15	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.06	0.14	0.12	0.25	0.17	0.07	0.29	0.19	0.30	0.28	0.23	0.09	0.39	0.36	0.14	0.06	0.28	0.11	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.12	0.33	0.16	0.13	0.37	0.37	0.66	0.21	0.71	0.61	0.55	0.21	0.90	0.84	0.29	0.43	0.29	0.23	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.04	0.27	0.04	0.08	0.30	0.12	0.47	0.02	0.50	0.46	0.40	0.20	0.61	0.58	0.26	0.13	0.04	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00