Doublet Group distance statistics: 51669

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 1, 1, 7, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.016, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.002, 0.044, 0.087, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.044 std_dev=0.043
N4	A	0, 0.007, 0.053, 0.099, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.053 std_dev=0.046
O4'	A	0, -0.007, 0.137, 0.281, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.137 std_dev=0.144
C2'	A	0, 0.010, 0.159, 0.308, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.159 std_dev=0.149
C5	B	0, 0.157, 0.349, 0.540, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.349 std_dev=0.191
O2'	A	0, 0.015, 0.206, 0.398, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.206 std_dev=0.192
N7	B	0, 0.184, 0.378, 0.572, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.378 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.020, 0.222, 0.424, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.222 std_dev=0.202
N9	B	0, 0.180, 0.391, 0.603, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.391 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.148, 0.363, 0.578, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.363 std_dev=0.215
C8	B	0, 0.180, 0.397, 0.614, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.397 std_dev=0.217
C3'	A	0, 0.028, 0.261, 0.494, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.261 std_dev=0.233
C6	B	0, 0.204, 0.445, 0.686, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.445 std_dev=0.241
N3	B	0, 0.187, 0.470, 0.752, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.470 std_dev=0.283
C3'	B	0, 0.152, 0.440, 0.728, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.440 std_dev=0.288
C1'	B	0, 0.208, 0.498, 0.788, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.498 std_dev=0.290
N1	B	0, 0.247, 0.539, 0.831, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.539 std_dev=0.292
O4'	B	0, 0.190, 0.487, 0.784, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.487 std_dev=0.297
N6	B	0, 0.224, 0.525, 0.827, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.525 std_dev=0.301
C2	B	0, 0.238, 0.543, 0.848, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.543 std_dev=0.305
C4'	B	0, 0.136, 0.457, 0.778, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.457 std_dev=0.321
O3'	B	0, 0.206, 0.541, 0.876, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.541 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.189, 0.527, 0.865, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.527 std_dev=0.338
O3'	A	0, 0.068, 0.407, 0.747, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.407 std_dev=0.340
O5'	B	0, 0.117, 0.477, 0.837, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.477 std_dev=0.360
C5'	A	0, 0.004, 0.389, 0.775, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.389 std_dev=0.385
C5'	B	0, 0.119, 0.507, 0.894, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.507 std_dev=0.387
O2'	B	0, 0.296, 0.690, 1.085, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.690 std_dev=0.395
P	B	0, 0.079, 0.492, 0.905, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.492 std_dev=0.413
O5'	A	0, 0.011, 0.460, 0.908, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.460 std_dev=0.448
OP2	B	0, 0.063, 0.512, 0.961, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.512 std_dev=0.449
P	A	0, 0.084, 0.605, 1.127, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.605 std_dev=0.521
OP1	B	0, 0.125, 0.671, 1.217, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.671 std_dev=0.546
OP1	A	0, 0.107, 0.765, 1.422, 2.236 max_d=2.236 avg_d=0.765 std_dev=0.657
OP2	A	0, 0.063, 0.745, 1.426, 2.582 max_d=2.582 avg_d=0.745 std_dev=0.681

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.12	0.29	0.11	0.10
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.03	0.21	0.42	0.28	0.19
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.05	0.05	0.12	0.00	0.01	0.01	0.15	0.20	0.10	0.13
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.11	0.05	0.10	0.12	0.11	0.02	0.01	0.01	0.21	0.22	0.11	0.17
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.03	0.27	0.53	0.45	0.25
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.05	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.16	0.01
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.05	0.28	0.54	0.45	0.25
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.10	0.06	0.09	0.14	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.15	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.06	0.26	0.47	0.32	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.21	0.40	0.24	0.17
N3	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.02	0.24	0.48	0.38	0.23
N4	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.17	0.04	0.28	0.56	0.51	0.27
O2	0.05	0.00	0.12	0.11	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.11	0.14	0.07	0.18	0.38	0.22	0.17
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.01	0.03	0.03	0.11	0.00	0.03	0.04	0.06	0.12	0.09	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.14	0.02	0.15	0.02	0.13	0.06	0.12	0.17	0.14	0.03	0.00	0.01	0.22	0.31	0.18	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.01	0.00	0.11	0.28	0.14	0.09
O5'	0.12	0.21	0.15	0.21	0.27	0.01	0.28	0.01	0.26	0.21	0.24	0.28	0.18	0.06	0.22	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.29	0.42	0.20	0.22	0.53	0.11	0.54	0.15	0.47	0.40	0.48	0.56	0.38	0.12	0.31	0.28	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.28	0.10	0.11	0.45	0.16	0.45	0.28	0.32	0.24	0.38	0.51	0.22	0.09	0.18	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.19	0.13	0.17	0.25	0.01	0.25	0.01	0.21	0.17	0.23	0.27	0.17	0.06	0.19	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.20	0.20	0.14	0.17	0.15	0.15	0.19	0.17	0.19	0.19	0.21	0.18	0.17	0.19	0.26	0.13	0.21	0.19	0.05	0.06	0.06
C2	0.22	0.22	0.21	0.16	0.15	0.17	0.14	0.21	0.18	0.21	0.21	0.20	0.20	0.17	0.17	0.26	0.16	0.18	0.21	0.12	0.17	0.13
C2'	0.23	0.18	0.19	0.15	0.18	0.15	0.17	0.19	0.18	0.20	0.17	0.19	0.19	0.19	0.19	0.22	0.14	0.22	0.21	0.10	0.10	0.11
C3'	0.23	0.22	0.18	0.17	0.22	0.15	0.25	0.15	0.26	0.25	0.24	0.21	0.29	0.28	0.22	0.19	0.17	0.23	0.07	0.01	0.05	0.01
C4	0.20	0.18	0.19	0.15	0.14	0.15	0.12	0.18	0.14	0.24	0.17	0.17	0.19	0.22	0.18	0.23	0.15	0.17	0.26	0.22	0.30	0.23
C4'	0.22	0.21	0.17	0.16	0.21	0.14	0.24	0.18	0.26	0.25	0.24	0.20	0.31	0.28	0.21	0.19	0.15	0.22	0.05	0.09	0.16	0.06
C5	0.20	0.17	0.17	0.13	0.14	0.14	0.12	0.17	0.14	0.22	0.17	0.16	0.17	0.18	0.18	0.21	0.13	0.19	0.25	0.23	0.30	0.23
C5'	0.26	0.34	0.23	0.23	0.32	0.17	0.38	0.18	0.41	0.34	0.38	0.30	0.47	0.40	0.29	0.21	0.23	0.24	0.11	0.18	0.30	0.16
C6	0.22	0.17	0.17	0.12	0.15	0.14	0.12	0.15	0.15	0.20	0.17	0.17	0.18	0.15	0.18	0.22	0.12	0.20	0.22	0.17	0.23	0.18
N1	0.22	0.19	0.18	0.12	0.16	0.13	0.14	0.16	0.16	0.20	0.18	0.19	0.18	0.16	0.18	0.24	0.12	0.18	0.19	0.09	0.15	0.11
N3	0.22	0.20	0.22	0.17	0.13	0.18	0.13	0.20	0.18	0.23	0.21	0.18	0.22	0.20	0.18	0.26	0.18	0.19	0.25	0.17	0.24	0.18
N4	0.21	0.18	0.21	0.19	0.15	0.17	0.15	0.20	0.15	0.25	0.17	0.17	0.24	0.26	0.19	0.24	0.19	0.18	0.30	0.27	0.36	0.27
O2	0.23	0.25	0.24	0.20	0.16	0.22	0.15	0.27	0.19	0.21	0.24	0.22	0.21	0.17	0.17	0.30	0.21	0.22	0.21	0.14	0.14	0.13
O2'	0.30	0.25	0.28	0.23	0.23	0.24	0.20	0.27	0.20	0.22	0.22	0.26	0.20	0.20	0.24	0.32	0.23	0.29	0.31	0.14	0.13	0.15
O3'	0.22	0.26	0.20	0.22	0.25	0.18	0.29	0.20	0.31	0.27	0.29	0.24	0.35	0.32	0.24	0.18	0.22	0.23	0.02	0.01	0.02	0.01
O4'	0.23	0.19	0.17	0.13	0.17	0.14	0.17	0.18	0.19	0.20	0.19	0.19	0.23	0.21	0.18	0.22	0.12	0.21	0.11	0.04	0.11	0.02
O5'	0.43	0.43	0.44	0.42	0.43	0.39	0.44	0.33	0.45	0.44	0.44	0.43	0.47	0.45	0.43	0.41	0.41	0.43	0.37	0.40	0.52	0.39
OP1	0.47	0.62	0.48	0.46	0.56	0.40	0.61	0.37	0.68	0.51	0.67	0.57	0.74	0.58	0.50	0.44	0.47	0.45	0.43	0.57	0.58	0.47
OP2	0.46	0.55	0.47	0.44	0.52	0.38	0.54	0.30	0.58	0.50	0.57	0.52	0.62	0.53	0.49	0.45	0.44	0.45	0.37	0.38	0.46	0.35
P	0.45	0.51	0.47	0.45	0.49	0.39	0.52	0.33	0.54	0.48	0.53	0.49	0.58	0.51	0.47	0.44	0.44	0.44	0.38	0.41	0.52	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.14	0.10
C2	0.01	0.00	0.16	0.22	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.26	0.03	0.32	0.35	0.38	0.32
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.12	0.16	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.20	0.06	0.12
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.02	0.17	0.13	0.20	0.20	0.17	0.13	0.08	0.01	0.00	0.02	0.21	0.26	0.08	0.16
C4	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.02	0.29	0.29	0.31	0.27
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.10	0.10	0.08	0.12	0.11	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.02	0.36	0.36	0.40	0.35
C5'	0.02	0.15	0.02	0.02	0.14	0.00	0.19	0.00	0.21	0.19	0.19	0.12	0.23	0.22	0.12	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.21	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.17	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.20	0.03	0.38	0.42	0.47	0.39
C8	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.13	0.03	0.30	0.26	0.27	0.26
N1	0.01	0.00	0.12	0.20	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.25	0.03	0.37	0.41	0.45	0.38
N3	0.01	0.00	0.16	0.20	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.23	0.03	0.27	0.28	0.31	0.26
N6	0.02	0.01	0.06	0.17	0.01	0.12	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.20	0.03	0.41	0.47	0.52	0.44
N7	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.14	0.02	0.36	0.36	0.39	0.35
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.23	0.21	0.23	0.20
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.10	0.12	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.15	0.08	0.06
O3'	0.01	0.26	0.01	0.00	0.15	0.02	0.15	0.02	0.20	0.13	0.25	0.23	0.20	0.14	0.07	0.04	0.00	0.02	0.18	0.32	0.15	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.09	0.21	0.13
O5'	0.09	0.32	0.15	0.21	0.29	0.01	0.36	0.01	0.38	0.30	0.37	0.27	0.41	0.36	0.23	0.06	0.18	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.10	0.35	0.20	0.26	0.29	0.09	0.36	0.10	0.42	0.26	0.41	0.28	0.47	0.36	0.21	0.15	0.32	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.38	0.06	0.08	0.31	0.15	0.40	0.21	0.47	0.27	0.45	0.31	0.52	0.39	0.23	0.08	0.15	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.32	0.12	0.16	0.27	0.03	0.35	0.01	0.39	0.26	0.38	0.26	0.44	0.35	0.20	0.06	0.19	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00