Doublet Group distance statistics: 51675

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.011 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.001, 0.033, 0.065, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.033 std_dev=0.032
N4	A	0, -0.008, 0.031, 0.071, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.031 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.156, 0.281, 0.406, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.281 std_dev=0.125
O4'	A	0, 0.129, 0.255, 0.380, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.255 std_dev=0.126
O2'	A	0, 0.199, 0.342, 0.484, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.342 std_dev=0.143
C4'	A	0, 0.184, 0.365, 0.546, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.365 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.232, 0.431, 0.631, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.431 std_dev=0.199
C8	B	0, 0.225, 0.454, 0.683, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.454 std_dev=0.229
N9	B	0, 0.254, 0.491, 0.728, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.491 std_dev=0.237
N7	B	0, 0.180, 0.420, 0.661, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.420 std_dev=0.241
C1'	B	0, 0.337, 0.596, 0.855, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.596 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.228, 0.490, 0.753, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.490 std_dev=0.262
C4	B	0, 0.235, 0.515, 0.795, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.515 std_dev=0.280
O3'	A	0, 0.326, 0.609, 0.892, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.609 std_dev=0.283
O4'	B	0, 0.355, 0.647, 0.939, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.647 std_dev=0.292
O5'	B	0, 0.395, 0.694, 0.994, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.694 std_dev=0.300
C6	B	0, 0.313, 0.614, 0.914, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.614 std_dev=0.300
OP2	B	0, 0.387, 0.696, 1.005, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.696 std_dev=0.309
C5'	A	0, 0.346, 0.659, 0.972, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.659 std_dev=0.313
C2'	B	0, 0.419, 0.738, 1.056, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.738 std_dev=0.319
P	B	0, 0.323, 0.651, 0.979, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.651 std_dev=0.328
N3	B	0, 0.298, 0.631, 0.964, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.631 std_dev=0.333
N6	B	0, 0.296, 0.631, 0.966, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.631 std_dev=0.335
N1	B	0, 0.411, 0.759, 1.106, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.759 std_dev=0.348
C2	B	0, 0.394, 0.750, 1.107, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.750 std_dev=0.356
O2'	B	0, 0.519, 0.877, 1.235, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.877 std_dev=0.358
C3'	B	0, 0.440, 0.820, 1.200, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.820 std_dev=0.380
C4'	B	0, 0.427, 0.812, 1.197, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.812 std_dev=0.385
C5'	B	0, 0.409, 0.868, 1.327, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.868 std_dev=0.459
OP1	B	0, 0.340, 0.804, 1.269, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.804 std_dev=0.465
O3'	B	0, 0.578, 1.077, 1.576, 1.678 max_d=1.678 avg_d=1.077 std_dev=0.499
O5'	A	0, 1.690, 2.660, 3.630, 3.431 max_d=3.431 avg_d=2.660 std_dev=0.970
P	A	0, 2.465, 3.849, 5.232, 4.724 max_d=4.724 avg_d=3.849 std_dev=1.383
OP1	A	0, 2.953, 4.588, 6.223, 5.564 max_d=5.564 avg_d=4.588 std_dev=1.635
OP2	A	0, 2.904, 4.654, 6.404, 6.209 max_d=6.209 avg_d=4.654 std_dev=1.750

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.43	0.16	0.13
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.17	0.65	0.42	0.27
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.10	0.14	0.09	0.09
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.07	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.11	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.20	0.88	0.69	0.36
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.21	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.19	0.95	0.71	0.36
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.07	0.00	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.14	0.36	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.17	0.83	0.53	0.30
N1	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.64	0.37	0.24
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.20	0.77	0.56	0.33
N4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.20	0.93	0.80	0.39
O2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.16	0.53	0.32	0.23
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.16	0.05
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.02	0.06	0.07	0.08	0.03	0.00	0.01	0.10	0.45	0.28	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.44	0.08	0.09
O5'	0.08	0.17	0.10	0.12	0.20	0.01	0.19	0.01	0.17	0.15	0.20	0.20	0.16	0.05	0.10	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.43	0.65	0.14	0.17	0.88	0.08	0.95	0.14	0.83	0.64	0.77	0.93	0.53	0.08	0.45	0.44	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.42	0.09	0.11	0.69	0.21	0.71	0.36	0.53	0.37	0.56	0.80	0.32	0.16	0.28	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.27	0.09	0.07	0.36	0.03	0.36	0.01	0.30	0.24	0.33	0.39	0.23	0.05	0.04	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.15	0.15	0.23	0.11	0.27	0.12	0.37	0.14	0.15	0.16	0.12	0.15	0.13	0.11	0.16	0.26	0.21	0.17	0.01	0.16	0.02
C2	0.23	0.16	0.22	0.26	0.12	0.32	0.11	0.35	0.14	0.17	0.16	0.14	0.16	0.13	0.17	0.23	0.27	0.32	0.29	0.07	0.21	0.06
C2'	0.09	0.15	0.12	0.23	0.11	0.25	0.13	0.38	0.15	0.13	0.15	0.13	0.15	0.13	0.10	0.11	0.26	0.15	0.16	0.06	0.18	0.03
C3'	0.06	0.13	0.07	0.17	0.10	0.15	0.12	0.26	0.13	0.10	0.14	0.11	0.15	0.11	0.07	0.06	0.21	0.06	0.12	0.04	0.10	0.01
C4	0.23	0.21	0.20	0.21	0.18	0.24	0.15	0.24	0.14	0.19	0.18	0.21	0.15	0.17	0.19	0.21	0.21	0.26	0.29	0.08	0.24	0.07
C4'	0.06	0.13	0.08	0.18	0.09	0.17	0.11	0.28	0.13	0.10	0.14	0.11	0.15	0.11	0.07	0.08	0.22	0.08	0.08	0.10	0.08	0.03
C5	0.20	0.20	0.18	0.19	0.18	0.21	0.17	0.21	0.17	0.20	0.19	0.19	0.17	0.19	0.18	0.19	0.19	0.22	0.25	0.13	0.22	0.07
C5'	0.09	0.18	0.07	0.13	0.15	0.11	0.18	0.19	0.21	0.14	0.21	0.15	0.23	0.19	0.12	0.07	0.16	0.07	0.10	0.20	0.13	0.06
C6	0.18	0.17	0.17	0.19	0.15	0.21	0.15	0.24	0.16	0.19	0.17	0.16	0.17	0.18	0.16	0.17	0.20	0.21	0.22	0.12	0.20	0.06
N1	0.18	0.15	0.18	0.23	0.12	0.27	0.12	0.32	0.14	0.18	0.16	0.14	0.15	0.15	0.15	0.19	0.24	0.24	0.24	0.03	0.19	0.03
N3	0.26	0.17	0.23	0.24	0.17	0.30	0.12	0.30	0.13	0.19	0.16	0.19	0.17	0.15	0.20	0.24	0.25	0.31	0.31	0.07	0.24	0.07
N4	0.23	0.25	0.19	0.19	0.20	0.22	0.16	0.20	0.15	0.18	0.20	0.24	0.16	0.18	0.20	0.21	0.19	0.25	0.30	0.11	0.27	0.10
O2	0.26	0.18	0.25	0.32	0.12	0.40	0.12	0.43	0.17	0.16	0.19	0.14	0.18	0.11	0.17	0.27	0.34	0.38	0.30	0.16	0.20	0.09
O2'	0.13	0.19	0.16	0.28	0.16	0.31	0.16	0.48	0.18	0.15	0.19	0.18	0.18	0.15	0.15	0.12	0.33	0.18	0.10	0.11	0.16	0.04
O3'	0.09	0.12	0.10	0.19	0.11	0.12	0.12	0.25	0.13	0.10	0.13	0.12	0.14	0.12	0.09	0.06	0.23	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00
O4'	0.11	0.14	0.12	0.21	0.10	0.23	0.11	0.33	0.13	0.13	0.15	0.11	0.14	0.11	0.09	0.13	0.23	0.16	0.13	0.07	0.11	0.03
O5'	0.24	0.35	0.21	0.19	0.32	0.16	0.37	0.15	0.39	0.32	0.38	0.32	0.41	0.37	0.29	0.21	0.17	0.20	0.24	0.25	0.25	0.17
OP1	0.23	0.65	0.23	0.36	0.48	0.30	0.57	0.44	0.72	0.35	0.75	0.52	0.81	0.49	0.33	0.19	0.48	0.19	0.42	1.04	0.58	0.64
OP2	0.29	0.62	0.25	0.16	0.52	0.11	0.61	0.12	0.70	0.42	0.70	0.53	0.78	0.56	0.40	0.23	0.14	0.19	0.23	0.37	0.30	0.27
P	0.25	0.47	0.20	0.15	0.40	0.11	0.47	0.07	0.54	0.35	0.53	0.41	0.59	0.45	0.33	0.19	0.12	0.19	0.18	0.34	0.23	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	0.09	0.37	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.03	0.21	0.10	0.32	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.17	0.15	0.29	0.05
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.09	0.06	0.10	0.08	0.10	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.25	0.22	0.24	0.12
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.22	0.11	0.33	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.06	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.13	0.33	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.27	0.13	0.30	0.12
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.03	0.12	0.12	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.16	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.28	0.14	0.28	0.13
C8	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.07	0.04	0.28	0.12	0.32	0.11
N1	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.25	0.12	0.30	0.12
N3	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.03	0.18	0.09	0.34	0.10
N6	0.02	0.00	0.04	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.30	0.16	0.25	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.31	0.14	0.28	0.13
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.20	0.10	0.35	0.10
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.07	0.06	0.06	0.04	0.02	0.00	0.06	0.02	0.05	0.14	0.31	0.05
O3'	0.03	0.09	0.03	0.00	0.06	0.02	0.08	0.03	0.10	0.07	0.10	0.08	0.11	0.09	0.04	0.06	0.00	0.02	0.23	0.29	0.23	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.12	0.41	0.16
O5'	0.09	0.21	0.17	0.25	0.22	0.01	0.27	0.01	0.28	0.28	0.25	0.18	0.30	0.31	0.20	0.05	0.23	0.09	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.09	0.10	0.15	0.22	0.11	0.13	0.13	0.16	0.14	0.12	0.12	0.09	0.16	0.14	0.10	0.14	0.29	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.32	0.29	0.24	0.33	0.33	0.30	0.29	0.28	0.32	0.30	0.34	0.25	0.28	0.35	0.31	0.23	0.41	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.11	0.05	0.12	0.10	0.06	0.12	0.01	0.13	0.11	0.12	0.10	0.15	0.13	0.10	0.05	0.16	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00