Doublet Group distance statistics: 51679

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.014, 0.042, 0.070, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.042 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.010, 0.042, 0.074, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.042 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.189, 0.351, 0.513, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.351 std_dev=0.162
O4'	A	0, 0.168, 0.361, 0.555, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.361 std_dev=0.194
O2'	A	0, 0.085, 0.298, 0.511, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.298 std_dev=0.213
C3'	A	0, 0.346, 0.633, 0.921, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.633 std_dev=0.287
N3	B	0, 0.427, 0.740, 1.052, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.740 std_dev=0.312
O5'	A	0, 0.293, 0.611, 0.928, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.611 std_dev=0.318
C4'	A	0, 0.292, 0.616, 0.941, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.616 std_dev=0.325
C2	B	0, 0.455, 0.787, 1.119, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.787 std_dev=0.332
C4	B	0, 0.370, 0.712, 1.053, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.712 std_dev=0.342
N1	B	0, 0.429, 0.783, 1.137, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.783 std_dev=0.354
O3'	A	0, 0.472, 0.837, 1.203, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.837 std_dev=0.366
C6	B	0, 0.415, 0.797, 1.180, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.797 std_dev=0.382
C5	B	0, 0.403, 0.786, 1.169, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.786 std_dev=0.383
O2'	B	0, 0.447, 0.847, 1.248, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.847 std_dev=0.400
N9	B	0, 0.343, 0.750, 1.157, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.750 std_dev=0.407
P	A	0, 0.088, 0.495, 0.903, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.495 std_dev=0.407
OP1	A	0, 0.322, 0.735, 1.147, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.735 std_dev=0.412
C1'	B	0, 0.315, 0.750, 1.185, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.750 std_dev=0.435
C2'	B	0, 0.424, 0.861, 1.298, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.861 std_dev=0.437
N6	B	0, 0.485, 0.930, 1.374, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.930 std_dev=0.445
OP2	A	0, 0.382, 0.837, 1.293, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.837 std_dev=0.456
N7	B	0, 0.478, 0.940, 1.401, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.940 std_dev=0.461
C8	B	0, 0.430, 0.904, 1.378, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.904 std_dev=0.474
C5'	A	0, 0.561, 1.175, 1.789, 1.828 max_d=1.828 avg_d=1.175 std_dev=0.614
O5'	B	0, 0.421, 1.049, 1.677, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.049 std_dev=0.628
O4'	B	0, 0.211, 0.842, 1.473, 2.017 max_d=2.017 avg_d=0.842 std_dev=0.631
C3'	B	0, 0.370, 1.023, 1.676, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.023 std_dev=0.653
O3'	B	0, 0.416, 1.100, 1.784, 2.328 max_d=2.328 avg_d=1.100 std_dev=0.684
P	B	0, 0.498, 1.192, 1.886, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.192 std_dev=0.694
OP1	B	0, 0.484, 1.214, 1.944, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.214 std_dev=0.730
OP2	B	0, 0.532, 1.321, 2.109, 2.331 max_d=2.331 avg_d=1.321 std_dev=0.789
C4'	B	0, 0.194, 0.998, 1.801, 2.653 max_d=2.653 avg_d=0.998 std_dev=0.804
C5'	B	0, 0.047, 1.126, 2.206, 3.487 max_d=3.487 avg_d=1.126 std_dev=1.080

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.18	0.05
C2	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.03	0.23	0.17	0.16	0.16
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.07	0.03	0.20	0.00	0.01	0.01	0.23	0.23	0.09	0.16
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.11	0.03	0.13	0.02	0.07	0.05	0.18	0.01	0.01	0.00	0.32	0.29	0.07	0.22
C4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.35	0.26	0.22	0.25
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.23	0.01
C5	0.00	0.00	0.09	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.37	0.27	0.22	0.26
C5'	0.02	0.06	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.04	0.04	0.01	0.00	0.10	0.30	0.01
C6	0.00	0.00	0.10	0.13	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.05	0.32	0.22	0.17	0.19
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.23	0.16	0.16	0.13
N3	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.29	0.22	0.19	0.21
N4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.37	0.29	0.26	0.28
O2	0.02	0.00	0.20	0.18	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.22	0.05	0.17	0.13	0.16	0.12
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.03	0.03	0.12	0.17	0.10	0.08
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.02	0.13	0.04	0.13	0.02	0.09	0.07	0.22	0.03	0.00	0.01	0.26	0.32	0.06	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.00	0.05	0.02	0.27	0.08
O5'	0.11	0.23	0.23	0.32	0.35	0.01	0.37	0.00	0.32	0.23	0.29	0.37	0.17	0.12	0.26	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.17	0.23	0.29	0.26	0.08	0.27	0.10	0.22	0.16	0.22	0.29	0.13	0.17	0.32	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.16	0.09	0.07	0.22	0.23	0.22	0.30	0.17	0.16	0.19	0.26	0.16	0.10	0.06	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.16	0.16	0.22	0.25	0.01	0.26	0.01	0.19	0.13	0.21	0.28	0.12	0.08	0.22	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.12	0.10	0.07	0.12	0.13	0.07	0.14	0.20	0.13	0.12	0.22	0.25	0.10	0.15	0.10	0.15	0.11	0.27	0.12	0.12
C2	0.14	0.19	0.11	0.11	0.09	0.17	0.12	0.12	0.17	0.12	0.17	0.18	0.24	0.19	0.06	0.16	0.11	0.21	0.17	0.29	0.13	0.14
C2'	0.14	0.14	0.12	0.14	0.08	0.16	0.13	0.11	0.17	0.13	0.14	0.13	0.26	0.22	0.08	0.15	0.14	0.20	0.14	0.25	0.11	0.10
C3'	0.23	0.18	0.21	0.25	0.16	0.24	0.09	0.19	0.12	0.12	0.15	0.19	0.17	0.04	0.18	0.23	0.26	0.29	0.27	0.20	0.15	0.15
C4	0.22	0.17	0.23	0.21	0.17	0.21	0.18	0.20	0.15	0.23	0.06	0.19	0.25	0.26	0.20	0.25	0.22	0.22	0.15	0.26	0.11	0.11
C4'	0.18	0.20	0.16	0.20	0.14	0.19	0.08	0.15	0.12	0.10	0.17	0.19	0.13	0.05	0.14	0.18	0.20	0.23	0.21	0.18	0.12	0.11
C5	0.25	0.16	0.27	0.26	0.22	0.25	0.26	0.28	0.22	0.31	0.11	0.20	0.32	0.35	0.25	0.27	0.26	0.24	0.17	0.27	0.16	0.16
C5'	0.25	0.29	0.24	0.29	0.24	0.26	0.20	0.22	0.22	0.19	0.26	0.28	0.19	0.15	0.23	0.25	0.30	0.30	0.33	0.22	0.24	0.24
C6	0.22	0.13	0.23	0.21	0.17	0.22	0.21	0.24	0.15	0.30	0.08	0.15	0.26	0.34	0.22	0.24	0.21	0.22	0.16	0.28	0.16	0.16
N1	0.15	0.14	0.15	0.12	0.08	0.14	0.13	0.10	0.12	0.21	0.11	0.13	0.22	0.25	0.12	0.18	0.12	0.18	0.11	0.26	0.08	0.10
N3	0.18	0.19	0.15	0.14	0.09	0.18	0.09	0.13	0.13	0.13	0.14	0.20	0.22	0.17	0.11	0.20	0.14	0.22	0.18	0.28	0.13	0.14
N4	0.25	0.21	0.27	0.27	0.21	0.24	0.22	0.25	0.21	0.24	0.13	0.24	0.28	0.26	0.23	0.29	0.28	0.24	0.17	0.26	0.14	0.13
O2	0.18	0.26	0.14	0.22	0.21	0.28	0.23	0.29	0.25	0.17	0.25	0.25	0.28	0.24	0.16	0.14	0.19	0.29	0.27	0.36	0.26	0.26
O2'	0.09	0.14	0.10	0.12	0.11	0.12	0.19	0.11	0.21	0.23	0.17	0.12	0.28	0.29	0.11	0.11	0.12	0.13	0.15	0.32	0.23	0.21
O3'	0.25	0.16	0.25	0.30	0.16	0.28	0.10	0.24	0.12	0.15	0.14	0.19	0.17	0.06	0.20	0.26	0.31	0.32	0.30	0.18	0.16	0.17
O4'	0.14	0.17	0.13	0.13	0.09	0.14	0.06	0.10	0.09	0.14	0.14	0.15	0.13	0.14	0.10	0.15	0.12	0.18	0.14	0.22	0.09	0.08
O5'	0.30	0.32	0.34	0.30	0.34	0.28	0.41	0.32	0.43	0.39	0.37	0.30	0.52	0.45	0.33	0.32	0.29	0.24	0.18	0.30	0.27	0.24
OP1	0.19	0.18	0.20	0.19	0.19	0.21	0.23	0.28	0.25	0.24	0.22	0.16	0.32	0.27	0.20	0.20	0.17	0.17	0.10	0.26	0.23	0.19
OP2	0.11	0.12	0.10	0.10	0.09	0.12	0.11	0.17	0.16	0.12	0.16	0.09	0.24	0.14	0.10	0.10	0.09	0.14	0.18	0.22	0.13	0.14
P	0.17	0.18	0.20	0.18	0.18	0.19	0.24	0.25	0.26	0.24	0.22	0.15	0.34	0.28	0.19	0.19	0.17	0.15	0.09	0.24	0.17	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.15	0.13	0.06
C2	0.01	0.00	0.14	0.23	0.00	0.15	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.24	0.01	0.14	0.21	0.13	0.09
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.06	0.10	0.15	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.20	0.18	0.29	0.18
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.12	0.18	0.21	0.07	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.29	0.27	0.37	0.26
C4	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.16	0.20	0.14	0.11
C4'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.12	0.04	0.15	0.13	0.11	0.05	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.12	0.10	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.20	0.23	0.16	0.15
C5'	0.03	0.27	0.01	0.01	0.19	0.00	0.21	0.00	0.25	0.09	0.28	0.23	0.25	0.15	0.11	0.05	0.03	0.01	0.01	0.18	0.06	0.01
C6	0.00	0.00	0.06	0.10	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.20	0.24	0.16	0.15
C8	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.01	0.24	0.23	0.20	0.18
N1	0.01	0.00	0.10	0.18	0.00	0.15	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01	0.17	0.23	0.13	0.12
N3	0.01	0.00	0.15	0.21	0.00	0.13	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.22	0.01	0.13	0.19	0.13	0.08
N6	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.22	0.26	0.17	0.18
N7	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.24	0.25	0.20	0.19
N9	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.17	0.19	0.16	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.05	0.05	0.03	0.07	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.02	0.12	0.14	0.24	0.12
O3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.09	0.02	0.03	0.03	0.08	0.13	0.18	0.22	0.04	0.10	0.02	0.05	0.00	0.03	0.26	0.30	0.45	0.30
O4'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.13	0.05	0.05
O5'	0.09	0.14	0.20	0.29	0.16	0.01	0.20	0.01	0.20	0.24	0.17	0.13	0.22	0.24	0.17	0.12	0.26	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.21	0.18	0.27	0.20	0.12	0.23	0.18	0.24	0.23	0.23	0.19	0.26	0.25	0.19	0.14	0.30	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.13	0.29	0.37	0.14	0.10	0.16	0.06	0.16	0.20	0.13	0.13	0.17	0.20	0.16	0.24	0.45	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.09	0.18	0.26	0.11	0.01	0.15	0.01	0.15	0.18	0.12	0.08	0.18	0.19	0.11	0.12	0.30	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00