Doublet Group distance statistics: 51681

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N3	A	0, -0.002, 0.012, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.004, 0.018, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.006, 0.027, 0.047, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.027 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.008, 0.031, 0.054, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.023
O2	A	0, -0.005, 0.027, 0.058, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.027 std_dev=0.032
N4	A	0, 0.015, 0.060, 0.104, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.060 std_dev=0.044
C4	B	0, 0.188, 0.421, 0.654, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.421 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.208, 0.456, 0.703, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.456 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.226, 0.481, 0.736, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.481 std_dev=0.255
C5	B	0, 0.249, 0.505, 0.761, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.505 std_dev=0.256
N9	B	0, 0.244, 0.503, 0.762, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.503 std_dev=0.259
C1'	B	0, 0.222, 0.489, 0.755, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.489 std_dev=0.267
N6	B	0, 0.278, 0.560, 0.843, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.560 std_dev=0.283
C2	B	0, 0.268, 0.552, 0.836, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.552 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.218, 0.513, 0.808, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.513 std_dev=0.295
N7	B	0, 0.324, 0.688, 1.052, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.688 std_dev=0.364
C8	B	0, 0.328, 0.692, 1.057, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.692 std_dev=0.365
C2'	B	0, 0.286, 0.669, 1.052, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.669 std_dev=0.383
O3'	B	0, 0.298, 0.693, 1.087, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.693 std_dev=0.394
C3'	B	0, 0.328, 0.734, 1.140, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.734 std_dev=0.406
O4'	A	0, 0.137, 0.570, 1.002, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.570 std_dev=0.432
O4'	B	0, 0.180, 0.642, 1.103, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.642 std_dev=0.461
C2'	A	0, 0.150, 0.638, 1.126, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.638 std_dev=0.488
O2'	B	0, 0.319, 0.824, 1.330, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.824 std_dev=0.506
P	B	0, 0.438, 0.963, 1.488, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.963 std_dev=0.525
C4'	B	0, 0.275, 0.800, 1.325, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.800 std_dev=0.525
OP2	B	0, 0.397, 0.936, 1.475, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.936 std_dev=0.539
O5'	B	0, 0.502, 1.061, 1.621, 1.520 max_d=1.520 avg_d=1.061 std_dev=0.560
OP1	B	0, 0.294, 0.930, 1.566, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.930 std_dev=0.636
C5'	B	0, 0.430, 1.077, 1.725, 2.008 max_d=2.008 avg_d=1.077 std_dev=0.648
C4'	A	0, 0.248, 0.968, 1.688, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.968 std_dev=0.720
O5'	A	0, 0.286, 1.049, 1.812, 2.002 max_d=2.002 avg_d=1.049 std_dev=0.763
C3'	A	0, 0.256, 1.029, 1.802, 1.665 max_d=1.665 avg_d=1.029 std_dev=0.773
OP2	A	0, 0.230, 1.051, 1.872, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.051 std_dev=0.821
O2'	A	0, 0.228, 1.053, 1.878, 1.936 max_d=1.936 avg_d=1.053 std_dev=0.825
C5'	A	0, 0.331, 1.217, 2.102, 2.178 max_d=2.178 avg_d=1.217 std_dev=0.885
P	A	0, 0.319, 1.237, 2.155, 2.488 max_d=2.488 avg_d=1.237 std_dev=0.918
OP1	A	0, 0.423, 1.579, 2.735, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.579 std_dev=1.156
O3'	A	0, 0.403, 1.679, 2.954, 2.881 max_d=2.881 avg_d=1.679 std_dev=1.275

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.29	0.01	0.13	0.12	0.17	0.14
C2	0.01	0.00	0.13	0.20	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.16	0.09	0.04	0.03	0.08	0.06
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.04	0.01	0.14	0.17	0.17	0.02	0.10	0.05	0.24	0.00	0.03	0.02	0.32	0.34	0.38	0.36
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.29	0.00	0.28	0.02	0.23	0.18	0.26	0.31	0.12	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.14	0.06
C4	0.03	0.02	0.04	0.29	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.33	0.09	0.05	0.10	0.10	0.12	0.09
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.12	0.06	0.04	0.08	0.06	0.25	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02
C5	0.03	0.01	0.14	0.28	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.38	0.14	0.03	0.12	0.10	0.10	0.09
C5'	0.06	0.02	0.17	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.09	0.02	0.03	0.07	0.07	0.08	0.16	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.17	0.23	0.01	0.12	0.01	0.09	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.33	0.08	0.06	0.07	0.05	0.09	0.04
N1	0.01	0.01	0.02	0.18	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.20	0.11	0.02	0.04	0.04	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.10	0.26	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.08	0.08	0.06	0.07	0.10	0.07
N4	0.04	0.02	0.05	0.31	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.36	0.12	0.06	0.12	0.13	0.15	0.12
O2	0.02	0.01	0.24	0.12	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.30	0.14	0.07	0.05	0.09	0.09
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.33	0.25	0.38	0.08	0.33	0.20	0.23	0.36	0.12	0.00	0.04	0.17	0.21	0.25	0.42	0.28
O3'	0.29	0.16	0.03	0.01	0.09	0.03	0.14	0.16	0.08	0.11	0.08	0.12	0.30	0.04	0.00	0.20	0.21	0.40	0.36	0.29
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.14	0.17	0.20	0.00	0.05	0.01	0.09	0.06
O5'	0.13	0.04	0.32	0.05	0.10	0.01	0.12	0.01	0.07	0.04	0.06	0.12	0.07	0.21	0.21	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.12	0.03	0.34	0.05	0.10	0.03	0.10	0.04	0.05	0.04	0.07	0.13	0.05	0.25	0.40	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.08	0.38	0.14	0.12	0.02	0.10	0.01	0.09	0.10	0.10	0.15	0.09	0.42	0.36	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.06	0.36	0.06	0.09	0.02	0.09	0.02	0.04	0.06	0.07	0.12	0.09	0.28	0.29	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.19	0.14	0.15	0.10	0.21	0.11	0.47	0.10	0.23	0.16	0.16	0.10	0.26	0.11	0.12	0.13	0.12	0.33	0.23	0.19	0.23
C2	0.07	0.21	0.10	0.14	0.07	0.29	0.12	0.53	0.06	0.31	0.15	0.17	0.09	0.32	0.12	0.14	0.11	0.26	0.41	0.35	0.16	0.30
C2'	0.32	0.19	0.19	0.21	0.22	0.22	0.14	0.10	0.11	0.21	0.14	0.24	0.19	0.14	0.26	0.23	0.26	0.32	0.10	0.24	0.15	0.19
C3'	0.50	0.68	0.40	0.33	0.61	0.26	0.61	0.11	0.65	0.45	0.69	0.65	0.62	0.50	0.52	0.48	0.36	0.39	0.08	0.20	0.23	0.18
C4	0.11	0.25	0.09	0.10	0.09	0.28	0.16	0.43	0.10	0.29	0.17	0.18	0.15	0.31	0.16	0.25	0.10	0.33	0.41	0.32	0.12	0.27
C4'	0.25	0.50	0.19	0.11	0.37	0.07	0.38	0.26	0.47	0.23	0.52	0.43	0.48	0.28	0.28	0.30	0.14	0.11	0.10	0.10	0.14	0.07
C5	0.09	0.25	0.11	0.09	0.11	0.23	0.18	0.39	0.15	0.27	0.21	0.18	0.20	0.31	0.14	0.23	0.11	0.26	0.38	0.27	0.13	0.24
C5'	0.26	0.54	0.24	0.15	0.39	0.07	0.41	0.22	0.52	0.24	0.58	0.46	0.56	0.30	0.29	0.35	0.15	0.11	0.10	0.13	0.19	0.10
C6	0.07	0.23	0.11	0.10	0.10	0.21	0.15	0.40	0.11	0.25	0.19	0.17	0.15	0.30	0.12	0.18	0.12	0.19	0.36	0.24	0.14	0.22
N1	0.07	0.21	0.11	0.12	0.09	0.24	0.12	0.47	0.07	0.27	0.16	0.17	0.09	0.30	0.11	0.14	0.12	0.19	0.37	0.27	0.15	0.25
N3	0.11	0.22	0.08	0.13	0.05	0.32	0.13	0.50	0.04	0.32	0.14	0.17	0.10	0.31	0.16	0.21	0.11	0.36	0.43	0.37	0.13	0.31
N4	0.15	0.25	0.12	0.10	0.12	0.28	0.18	0.39	0.14	0.28	0.17	0.18	0.18	0.29	0.18	0.32	0.10	0.37	0.41	0.33	0.12	0.27
O2	0.09	0.20	0.15	0.19	0.10	0.31	0.13	0.61	0.10	0.32	0.15	0.17	0.11	0.31	0.14	0.13	0.12	0.25	0.43	0.41	0.25	0.36
O2'	0.26	0.47	0.47	0.35	0.45	0.24	0.58	0.44	0.62	0.48	0.55	0.41	0.71	0.65	0.39	0.49	0.29	0.16	0.36	0.17	0.40	0.24
O3'	0.31	0.62	0.24	0.15	0.50	0.13	0.57	0.28	0.68	0.36	0.68	0.54	0.75	0.48	0.38	0.32	0.16	0.19	0.13	0.12	0.19	0.10
O4'	0.08	0.30	0.11	0.15	0.15	0.26	0.14	0.50	0.23	0.17	0.31	0.23	0.22	0.15	0.09	0.14	0.16	0.17	0.32	0.20	0.12	0.19
O5'	0.25	0.56	0.27	0.18	0.39	0.08	0.38	0.19	0.51	0.21	0.59	0.47	0.53	0.25	0.28	0.39	0.17	0.10	0.14	0.10	0.17	0.08
OP1	0.35	0.61	0.40	0.31	0.47	0.18	0.48	0.12	0.59	0.33	0.65	0.53	0.63	0.37	0.38	0.50	0.27	0.22	0.06	0.26	0.33	0.22
OP2	0.30	0.62	0.41	0.31	0.42	0.15	0.40	0.12	0.54	0.25	0.66	0.52	0.56	0.27	0.32	0.54	0.27	0.15	0.10	0.16	0.29	0.15
P	0.27	0.59	0.33	0.23	0.40	0.10	0.40	0.15	0.54	0.23	0.64	0.49	0.58	0.28	0.30	0.46	0.21	0.11	0.12	0.14	0.24	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.21	0.15	0.25	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.09	0.07	0.33	0.17	0.13	0.13
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.07	0.05	0.08	0.09	0.12	0.05	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.50	0.44	0.06	0.33
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.07	0.05	0.07	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.32	0.39	0.09	0.22
C4	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.31	0.13	0.16	0.09
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.02	0.02	0.05	0.06	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.12	0.33	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.32	0.11	0.14	0.09
C5'	0.03	0.06	0.07	0.03	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.13	0.07	0.05	0.12	0.13	0.07	0.07	0.04	0.02	0.00	0.11	0.34	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.34	0.11	0.12	0.11
C8	0.01	0.02	0.08	0.07	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.08	0.11	0.06	0.29	0.11	0.24	0.10
N1	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.09	0.05	0.34	0.14	0.12	0.12
N3	0.03	0.00	0.12	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.09	0.07	0.31	0.17	0.15	0.12
N6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.10	0.02	0.34	0.12	0.13	0.12
N7	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.10	0.04	0.30	0.10	0.19	0.10
N9	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.28	0.13	0.21	0.08
O2'	0.04	0.15	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.07	0.05	0.08	0.10	0.16	0.05	0.06	0.03	0.00	0.03	0.03	0.53	0.54	0.20	0.41
O3'	0.10	0.09	0.03	0.00	0.09	0.02	0.09	0.04	0.10	0.11	0.09	0.09	0.10	0.10	0.10	0.03	0.00	0.10	0.17	0.31	0.12	0.14
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.05	0.07	0.02	0.04	0.01	0.03	0.10	0.00	0.13	0.14	0.48	0.23
O5'	0.21	0.33	0.50	0.32	0.31	0.02	0.32	0.00	0.34	0.29	0.34	0.31	0.34	0.30	0.28	0.53	0.17	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.17	0.44	0.39	0.13	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.14	0.17	0.12	0.10	0.13	0.54	0.31	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.13	0.06	0.09	0.16	0.33	0.14	0.34	0.12	0.24	0.12	0.15	0.13	0.19	0.21	0.20	0.12	0.48	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.33	0.22	0.09	0.05	0.09	0.01	0.11	0.10	0.12	0.12	0.12	0.10	0.08	0.41	0.14	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00