Doublet Group distance statistics: 51684

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, -0.002, 0.009, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.003, 0.040, 0.078, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.040 std_dev=0.037
N4	A	0, -0.002, 0.037, 0.075, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.037 std_dev=0.039
C2	B	0, 0.005, 0.328, 0.651, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.328 std_dev=0.323
N3	B	0, 0.003, 0.332, 0.661, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.332 std_dev=0.329
O4'	A	0, -0.004, 0.352, 0.708, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.352 std_dev=0.356
N1	B	0, 0.008, 0.383, 0.758, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.383 std_dev=0.375
OP2	B	0, 0.009, 0.399, 0.788, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.399 std_dev=0.390
C4	B	0, 0.004, 0.394, 0.783, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.394 std_dev=0.390
C2'	A	0, -0.006, 0.396, 0.799, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.396 std_dev=0.402
C1'	B	0, 0.003, 0.420, 0.836, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.420 std_dev=0.417
N9	B	0, 0.005, 0.432, 0.860, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.432 std_dev=0.427
C6	B	0, 0.007, 0.444, 0.881, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.444 std_dev=0.437
C5	B	0, 0.003, 0.449, 0.896, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.449 std_dev=0.447
N6	B	0, 0.010, 0.500, 0.989, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.500 std_dev=0.489
C8	B	0, 0.006, 0.505, 1.005, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.505 std_dev=0.500
O2'	A	0, 0.000, 0.507, 1.014, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.507 std_dev=0.507
N7	B	0, 0.002, 0.516, 1.029, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.516 std_dev=0.513
C2'	B	0, 0.010, 0.524, 1.038, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.524 std_dev=0.514
C4'	A	0, 0.000, 0.516, 1.032, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.516 std_dev=0.516
O4'	B	0, 0.002, 0.526, 1.050, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.526 std_dev=0.524
P	B	0, 0.006, 0.608, 1.211, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.608 std_dev=0.602
C3'	A	0, -0.003, 0.608, 1.218, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.608 std_dev=0.611
OP1	B	0, 0.006, 0.630, 1.253, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.630 std_dev=0.624
O2'	B	0, 0.017, 0.643, 1.269, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.643 std_dev=0.626
O5'	A	0, 0.013, 0.705, 1.397, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.705 std_dev=0.692
O5'	B	0, 0.006, 0.720, 1.433, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.720 std_dev=0.713
C4'	B	0, 0.008, 0.738, 1.469, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.738 std_dev=0.730
C3'	B	0, 0.013, 0.763, 1.512, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.763 std_dev=0.749
OP2	A	0, 0.016, 0.799, 1.583, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.799 std_dev=0.783
P	A	0, 0.017, 0.878, 1.738, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.878 std_dev=0.861
C5'	A	0, -0.007, 0.874, 1.755, 2.008 max_d=2.008 avg_d=0.874 std_dev=0.881
O3'	A	0, -0.005, 0.898, 1.802, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.898 std_dev=0.904
C5'	B	0, 0.009, 1.004, 1.999, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.004 std_dev=0.995
O3'	B	0, 0.018, 1.022, 2.026, 2.029 max_d=2.029 avg_d=1.022 std_dev=1.004
OP1	A	0, 0.015, 1.047, 2.078, 2.184 max_d=2.184 avg_d=1.047 std_dev=1.032

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.06	0.09
C2	0.03	0.00	0.15	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.15	0.04	0.11	0.10	0.11	0.13
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.02	0.11	0.01	0.13	0.04	0.28	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.11	0.07
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.03	0.00	0.14	0.02	0.17	0.03	0.09	0.03	0.23	0.01	0.00	0.01	0.14	0.16	0.18	0.15
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.13	0.14	0.17	0.17
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.05	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.04	0.14	0.16	0.17	0.17
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.10	0.13	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.11	0.17	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.18	0.06	0.12	0.13	0.12	0.14
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.10	0.09	0.10	0.11
N3	0.03	0.00	0.13	0.09	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.13	0.03	0.12	0.12	0.14	0.15
N4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.14	0.16	0.20	0.19
O2	0.05	0.00	0.28	0.23	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.28	0.29	0.05	0.12	0.11	0.11	0.13
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.08	0.02	0.14	0.07	0.28	0.00	0.01	0.04	0.07	0.11	0.09	0.07
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.03	0.01	0.15	0.03	0.18	0.02	0.13	0.02	0.29	0.01	0.00	0.00	0.21	0.28	0.28	0.24
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.00	0.00	0.14	0.13	0.16	0.17
O5'	0.07	0.11	0.07	0.14	0.13	0.01	0.14	0.01	0.12	0.10	0.12	0.14	0.12	0.07	0.21	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.10	0.10	0.16	0.14	0.01	0.16	0.06	0.13	0.09	0.12	0.16	0.11	0.11	0.28	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.06	0.11	0.11	0.18	0.17	0.01	0.17	0.01	0.12	0.10	0.14	0.20	0.11	0.09	0.28	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.13	0.07	0.15	0.17	0.02	0.17	0.01	0.14	0.11	0.15	0.19	0.13	0.07	0.24	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.23	0.02	0.18	0.24	0.28	0.34	0.42	0.37	0.30	0.31	0.18	0.42	0.38	0.20	0.02	0.23	0.16	0.46	0.05	0.03	0.12
C2	0.08	0.17	0.05	0.22	0.13	0.32	0.25	0.47	0.31	0.13	0.26	0.09	0.38	0.25	0.05	0.02	0.21	0.29	0.27	0.04	0.02	0.03
C2'	0.32	0.49	0.19	0.04	0.49	0.15	0.52	0.39	0.53	0.47	0.52	0.46	0.53	0.50	0.44	0.18	0.12	0.09	0.51	0.16	0.18	0.23
C3'	0.53	0.58	0.42	0.25	0.62	0.18	0.65	0.04	0.63	0.68	0.60	0.58	0.62	0.68	0.63	0.37	0.13	0.41	0.15	0.05	0.08	0.01
C4	0.18	0.09	0.15	0.36	0.02	0.45	0.11	0.64	0.23	0.10	0.20	0.02	0.35	0.10	0.11	0.07	0.35	0.38	0.24	0.07	0.10	0.10
C4'	0.40	0.42	0.32	0.20	0.49	0.14	0.56	0.03	0.53	0.61	0.47	0.41	0.56	0.63	0.51	0.26	0.11	0.30	0.16	0.23	0.31	0.14
C5	0.17	0.11	0.18	0.41	0.03	0.49	0.15	0.71	0.25	0.05	0.21	0.03	0.36	0.14	0.07	0.12	0.44	0.38	0.32	0.15	0.16	0.19
C5'	0.46	0.43	0.40	0.32	0.52	0.27	0.59	0.19	0.55	0.68	0.48	0.43	0.58	0.69	0.56	0.34	0.23	0.39	0.15	0.45	0.57	0.33
C6	0.11	0.15	0.15	0.36	0.10	0.46	0.23	0.67	0.30	0.11	0.25	0.07	0.39	0.25	0.02	0.11	0.41	0.33	0.39	0.16	0.14	0.21
N1	0.06	0.18	0.08	0.27	0.16	0.38	0.28	0.55	0.33	0.18	0.28	0.11	0.40	0.30	0.09	0.05	0.30	0.29	0.38	0.07	0.06	0.12
N3	0.15	0.12	0.09	0.27	0.03	0.37	0.16	0.54	0.26	0.08	0.23	0.02	0.36	0.14	0.08	0.02	0.25	0.35	0.21	0.02	0.04	0.03
N4	0.21	0.04	0.17	0.37	0.08	0.46	0.05	0.66	0.15	0.18	0.14	0.06	0.29	0.11	0.17	0.07	0.36	0.40	0.19	0.07	0.11	0.09
O2	0.00	0.18	0.04	0.10	0.17	0.20	0.26	0.32	0.31	0.17	0.27	0.12	0.36	0.26	0.11	0.10	0.08	0.20	0.22	0.12	0.07	0.07
O2'	0.34	0.49	0.21	0.13	0.47	0.19	0.48	0.36	0.50	0.42	0.51	0.47	0.50	0.45	0.43	0.19	0.18	0.19	0.71	0.26	0.25	0.32
O3'	0.75	0.73	0.63	0.49	0.76	0.47	0.74	0.28	0.72	0.79	0.72	0.74	0.68	0.74	0.79	0.56	0.34	0.70	0.02	0.01	0.01	0.00
O4'	0.17	0.25	0.11	0.02	0.31	0.09	0.42	0.20	0.42	0.44	0.33	0.22	0.48	0.51	0.31	0.08	0.08	0.03	0.28	0.15	0.24	0.06
O5'	0.33	0.40	0.25	0.12	0.45	0.08	0.53	0.12	0.52	0.56	0.46	0.38	0.56	0.61	0.45	0.21	0.08	0.22	0.06	0.18	0.35	0.10
OP1	0.39	0.43	0.31	0.19	0.49	0.15	0.56	0.04	0.55	0.61	0.48	0.42	0.59	0.64	0.50	0.24	0.08	0.30	0.12	0.24	0.41	0.15
OP2	0.20	0.31	0.14	0.06	0.33	0.11	0.42	0.27	0.43	0.41	0.37	0.28	0.48	0.48	0.31	0.11	0.16	0.09	0.02	0.11	0.23	0.05
P	0.32	0.37	0.24	0.12	0.42	0.08	0.50	0.11	0.49	0.53	0.43	0.36	0.54	0.58	0.42	0.20	0.08	0.21	0.05	0.20	0.36	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.25	0.38	0.16	0.38
C2	0.05	0.00	0.19	0.13	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.20	0.00	0.40	0.45	0.31	0.46
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.09	0.01	0.03	0.02	0.07	0.10	0.14	0.20	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.23	0.01	0.25
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.04	0.21	0.06	0.13	0.09	0.19	0.07	0.01	0.00	0.00	0.20	0.17	0.17	0.15
C4	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.04	0.01	0.43	0.46	0.31	0.49
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.14	0.02	0.07	0.08	0.13	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.21	0.11
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.02	0.49	0.47	0.37	0.52
C5'	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.15	0.00	0.14	0.20	0.08	0.01	0.20	0.22	0.08	0.02	0.03	0.01	0.00	0.20	0.41	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.02	0.02	0.49	0.47	0.37	0.51
C8	0.02	0.01	0.10	0.21	0.01	0.14	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.23	0.02	0.51	0.49	0.37	0.55
N1	0.04	0.00	0.14	0.06	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.11	0.01	0.45	0.46	0.35	0.49
N3	0.05	0.00	0.20	0.13	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.20	0.01	0.37	0.44	0.28	0.45
N6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.08	0.00	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.09	0.04	0.50	0.46	0.39	0.50
N7	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.13	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.21	0.03	0.53	0.49	0.41	0.54
N9	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.42	0.46	0.29	0.49
O2'	0.03	0.29	0.00	0.01	0.14	0.02	0.09	0.02	0.15	0.06	0.23	0.27	0.12	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.11	0.08	0.13
O3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.03	0.02	0.23	0.11	0.20	0.09	0.21	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.35	0.05
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.38	0.09	0.34
O5'	0.25	0.40	0.21	0.20	0.43	0.01	0.49	0.00	0.49	0.51	0.45	0.37	0.50	0.53	0.42	0.02	0.02	0.16	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.38	0.45	0.23	0.17	0.46	0.18	0.47	0.20	0.47	0.49	0.46	0.44	0.46	0.49	0.46	0.11	0.05	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.31	0.01	0.17	0.31	0.21	0.37	0.41	0.37	0.37	0.35	0.28	0.39	0.41	0.29	0.08	0.35	0.09	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.38	0.46	0.25	0.15	0.49	0.11	0.52	0.01	0.51	0.55	0.49	0.45	0.50	0.54	0.49	0.13	0.05	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00