Doublet Group distance statistics: 51687

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N4	A	0, 0.000, 0.073, 0.147, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.073 std_dev=0.073
N3	B	0, 0.000, 0.234, 0.468, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.234 std_dev=0.234
C2	B	0, 0.000, 0.433, 0.866, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.433 std_dev=0.433
C4	B	0, 0.000, 0.441, 0.883, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.441 std_dev=0.441
N9	B	0, 0.000, 0.684, 1.369, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.684 std_dev=0.684
N1	B	0, 0.000, 0.735, 1.471, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.735 std_dev=0.735
C5	B	0, 0.000, 0.742, 1.483, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.742 std_dev=0.742
C1'	B	0, 0.000, 0.849, 1.698, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.849 std_dev=0.849
C6	B	0, 0.000, 0.875, 1.749, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.875 std_dev=0.875
C8	B	0, 0.000, 0.958, 1.916, 1.916 max_d=1.916 avg_d=0.958 std_dev=0.958
O2'	B	0, 0.000, 0.983, 1.965, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.983 std_dev=0.983
N7	B	0, 0.000, 1.024, 2.048, 2.048 max_d=2.048 avg_d=1.024 std_dev=1.024
C2'	B	0, 0.000, 1.202, 2.403, 2.403 max_d=2.403 avg_d=1.202 std_dev=1.202
N6	B	0, 0.000, 1.270, 2.540, 2.540 max_d=2.540 avg_d=1.270 std_dev=1.270
O4'	A	0, 0.000, 1.295, 2.591, 2.591 max_d=2.591 avg_d=1.295 std_dev=1.295
C2'	A	0, 0.000, 1.318, 2.636, 2.636 max_d=2.636 avg_d=1.318 std_dev=1.318
O2'	A	0, 0.000, 1.559, 3.118, 3.118 max_d=3.118 avg_d=1.559 std_dev=1.559
C4'	A	0, 0.000, 1.772, 3.543, 3.543 max_d=3.543 avg_d=1.772 std_dev=1.772
O4'	B	0, 0.000, 1.921, 3.841, 3.841 max_d=3.841 avg_d=1.921 std_dev=1.921
C3'	A	0, 0.000, 2.022, 4.044, 4.044 max_d=4.044 avg_d=2.022 std_dev=2.022
C3'	B	0, 0.000, 2.220, 4.441, 4.441 max_d=4.441 avg_d=2.220 std_dev=2.220
C4'	B	0, 0.000, 2.514, 5.027, 5.027 max_d=5.027 avg_d=2.514 std_dev=2.514
O3'	A	0, 0.000, 2.761, 5.522, 5.522 max_d=5.522 avg_d=2.761 std_dev=2.761
O3'	B	0, 0.000, 2.915, 5.831, 5.831 max_d=5.831 avg_d=2.915 std_dev=2.915
C5'	A	0, 0.000, 3.202, 6.405, 6.405 max_d=6.405 avg_d=3.202 std_dev=3.202
C5'	B	0, 0.000, 3.670, 7.341, 7.341 max_d=7.341 avg_d=3.670 std_dev=3.670
O5'	A	0, 0.000, 3.953, 7.906, 7.906 max_d=7.906 avg_d=3.953 std_dev=3.953
O5'	B	0, 0.000, 4.441, 8.883, 8.883 max_d=8.883 avg_d=4.441 std_dev=4.441
OP1	A	0, 0.000, 5.103, 10.206, 10.206 max_d=10.206 avg_d=5.103 std_dev=5.103
P	A	0, 0.000, 5.256, 10.512, 10.512 max_d=10.512 avg_d=5.256 std_dev=5.256
P	B	0, 0.000, 5.684, 11.369, 11.369 max_d=11.369 avg_d=5.684 std_dev=5.684
OP2	B	0, 0.000, 5.910, 11.820, 11.820 max_d=11.820 avg_d=5.910 std_dev=5.910
OP1	B	0, 0.000, 6.023, 12.046, 12.046 max_d=12.046 avg_d=6.023 std_dev=6.023
OP2	A	0, 0.000, 6.214, 12.429, 12.429 max_d=12.429 avg_d=6.214 std_dev=6.214

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.12	0.15	0.06
C2	0.00	0.00	0.09	0.23	0.02	0.37	0.02	0.62	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.25	0.16	0.33	0.68	0.79	0.73	0.82
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.02	0.07
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.15	0.04	0.20	0.07	0.41	0.01	0.00	0.01	0.14	0.09	0.05	0.13
C4	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.00	0.06	0.08	0.11	0.14
C4'	0.01	0.37	0.01	0.00	0.05	0.00	0.23	0.01	0.30	0.02	0.30	0.07	0.68	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.14	0.03
C5	0.00	0.02	0.08	0.10	0.01	0.23	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.17	0.06	0.26	0.52	0.72	0.62	0.60
C5'	0.02	0.62	0.00	0.01	0.14	0.01	0.32	0.00	0.43	0.07	0.55	0.17	1.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.15	0.01
C6	0.00	0.01	0.10	0.15	0.01	0.30	0.00	0.43	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.22	0.09	0.35	0.62	0.83	0.74	0.70
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02
N3	0.00	0.01	0.06	0.20	0.01	0.30	0.00	0.55	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.20	0.15	0.24	0.60	0.77	0.73	0.80
N4	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.07	0.02	0.17	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.07	0.01	0.10	0.16	0.20	0.22
O2	0.00	0.01	0.20	0.41	0.03	0.68	0.02	1.13	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.49	0.27	0.60	1.32	1.51	1.40	1.54
O2'	0.02	0.25	0.00	0.01	0.02	0.01	0.17	0.01	0.22	0.00	0.20	0.03	0.49	0.00	0.03	0.04	0.09	0.03	0.06	0.05
O3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.09	0.03	0.15	0.07	0.27	0.03	0.00	0.00	0.22	0.15	0.15	0.21
O4'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.01	0.35	0.00	0.24	0.01	0.60	0.04	0.00	0.00	0.13	0.19	0.26	0.17
O5'	0.03	0.68	0.07	0.14	0.06	0.01	0.52	0.00	0.62	0.01	0.60	0.10	1.32	0.09	0.22	0.13	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.12	0.79	0.01	0.09	0.08	0.03	0.72	0.09	0.83	0.06	0.77	0.16	1.51	0.03	0.15	0.19	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.73	0.02	0.05	0.11	0.14	0.62	0.15	0.74	0.05	0.73	0.20	1.40	0.06	0.15	0.26	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.82	0.07	0.13	0.14	0.03	0.60	0.01	0.70	0.02	0.80	0.22	1.54	0.05	0.21	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.56	0.19	0.11	0.39	0.04	1.04	0.26	1.38	0.51	0.17	0.43	0.05	0.75	0.20	0.30	0.10	0.32	1.17	1.96	2.20	2.49	2.49
C2	0.45	0.10	0.16	0.12	0.05	0.49	0.20	0.61	0.36	0.06	0.29	0.10	0.49	0.18	0.22	0.01	0.22	0.81	1.05	1.11	1.42	1.39
C2'	1.30	0.23	0.83	1.23	0.61	1.96	0.28	2.38	0.08	0.88	0.05	0.56	0.39	0.41	0.99	0.73	1.13	2.05	2.88	3.14	3.25	3.38
C3'	0.97	0.30	0.54	1.05	0.61	1.73	0.49	2.36	0.24	0.96	0.19	0.50	0.10	0.68	0.88	0.25	0.89	1.75	3.00	3.43	3.58	3.67
C4	0.34	0.02	0.26	0.53	0.18	0.01	0.10	0.01	0.05	0.25	0.11	0.14	0.11	0.16	0.28	0.00	0.73	0.42	0.50	0.49	1.13	0.86
C4'	0.16	0.11	0.22	0.28	0.01	0.89	0.03	1.53	0.12	0.15	0.14	0.03	0.16	0.05	0.12	0.50	0.17	0.89	2.20	2.76	2.94	2.95
C5	0.44	0.10	0.10	0.29	0.23	0.25	0.16	0.32	0.10	0.40	0.23	0.12	0.20	0.28	0.38	0.09	0.48	0.59	0.93	0.95	1.71	1.37
C5'	0.40	0.18	0.78	0.23	0.18	0.30	0.00	1.03	0.06	0.06	0.05	0.25	0.21	0.11	0.23	1.20	0.39	0.29	1.75	2.45	2.70	2.57
C6	0.53	0.15	0.02	0.01	0.19	0.57	0.03	0.74	0.29	0.40	0.34	0.10	0.48	0.19	0.41	0.13	0.16	0.83	1.39	1.47	2.15	1.88
N1	0.54	0.14	0.01	0.10	0.11	0.71	0.15	0.92	0.40	0.24	0.36	0.09	0.59	0.06	0.34	0.09	0.01	0.96	1.49	1.60	2.05	1.94
N3	0.33	0.02	0.32	0.47	0.09	0.10	0.07	0.13	0.19	0.09	0.16	0.13	0.27	0.05	0.19	0.06	0.63	0.50	0.54	0.56	0.98	0.85
N4	0.21	0.09	0.39	0.82	0.18	0.32	0.19	0.42	0.15	0.22	0.09	0.14	0.14	0.21	0.21	0.06	1.09	0.15	0.02	0.03	0.68	0.34
O2	0.40	0.11	0.21	0.03	0.05	0.61	0.31	0.75	0.41	0.13	0.30	0.06	0.55	0.36	0.09	0.09	0.07	0.89	1.07	1.17	1.24	1.36
O2'	1.37	0.13	1.01	1.50	0.50	2.26	0.06	2.70	0.34	0.68	0.24	0.51	0.75	0.13	0.90	0.96	1.50	2.20	3.09	3.47	3.34	3.61
O3'	1.24	0.44	0.89	1.56	0.78	2.27	0.63	3.06	0.35	1.14	0.30	0.67	0.17	0.82	1.09	0.54	1.42	2.12	3.65	4.35	4.14	4.46
O4'	0.09	0.34	0.48	0.12	0.29	0.47	0.39	0.94	0.45	0.25	0.40	0.26	0.50	0.39	0.19	0.60	0.19	0.53	1.61	1.98	2.31	2.26
O5'	0.34	0.11	0.84	0.37	0.11	0.15	0.45	0.84	0.56	0.30	0.37	0.04	0.83	0.63	0.01	1.32	0.63	0.27	1.57	2.18	2.58	2.33
OP1	1.63	0.43	2.24	1.86	0.70	1.40	0.13	0.77	0.25	0.65	0.04	0.81	0.76	0.05	1.05	2.78	2.13	1.14	0.11	0.49	0.83	0.60
OP2	1.06	0.12	1.59	1.10	0.25	0.65	0.26	0.13	0.53	0.11	0.30	0.42	0.99	0.40	0.51	2.31	1.44	0.49	0.77	1.62	1.77	1.57
P	1.03	0.12	1.61	1.18	0.25	0.69	0.27	0.01	0.55	0.11	0.31	0.42	1.01	0.42	0.51	2.21	1.50	0.49	0.69	1.38	1.71	1.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.40	0.16	0.23	0.37
C2	0.03	0.00	0.10	0.69	0.00	0.58	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.74	0.34	0.24	0.58	0.33	0.09
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.11	0.02	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.20	0.10	0.03	0.15
C3'	0.03	0.69	0.00	0.00	0.36	0.00	0.19	0.00	0.31	0.21	0.53	0.69	0.22	0.10	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.12	0.01
C4	0.01	0.00	0.06	0.36	0.00	0.27	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.34	0.18	0.37	0.07	0.75	0.50
C4'	0.02	0.58	0.03	0.00	0.27	0.00	0.08	0.01	0.20	0.33	0.42	0.58	0.10	0.22	0.01	0.14	0.03	0.00	0.02	0.04	0.32	0.06
C5	0.00	0.00	0.03	0.19	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.21	0.06	0.78	0.50	1.36	1.00
C5'	0.03	0.81	0.02	0.00	0.29	0.01	0.00	0.00	0.20	0.60	0.56	0.77	0.04	0.47	0.10	0.13	0.09	0.01	0.01	0.00	0.19	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.31	0.01	0.20	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.36	0.13	0.57	0.29	1.30	0.83
C8	0.01	0.00	0.05	0.21	0.01	0.33	0.00	0.60	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.20	0.22	1.39	1.11	1.66	1.54
N1	0.03	0.00	0.07	0.53	0.01	0.42	0.01	0.56	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.59	0.25	0.11	0.22	0.80	0.32
N3	0.03	0.00	0.11	0.69	0.00	0.58	0.01	0.77	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.67	0.34	0.23	0.53	0.19	0.11
N6	0.01	0.01	0.02	0.22	0.01	0.10	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.28	0.08	0.80	0.57	1.68	1.13
N7	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.22	0.00	0.47	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.13	1.33	1.11	1.92	1.60
N9	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.72	0.42	0.86	0.79
O2'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.13	0.14	0.07	0.13	0.13	0.08	0.22	0.26	0.10	0.04	0.02	0.00	0.15	0.06	0.14	0.20	0.51	0.24
O3'	0.07	0.74	0.05	0.01	0.34	0.03	0.21	0.09	0.36	0.20	0.59	0.67	0.28	0.08	0.03	0.15	0.00	0.06	0.40	0.22	0.55	0.42
O4'	0.00	0.34	0.00	0.03	0.18	0.00	0.06	0.01	0.13	0.22	0.25	0.34	0.08	0.13	0.00	0.06	0.06	0.00	0.32	0.07	0.05	0.28
O5'	0.40	0.24	0.20	0.02	0.37	0.02	0.78	0.01	0.57	1.39	0.11	0.23	0.80	1.33	0.72	0.14	0.40	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.16	0.58	0.10	0.02	0.07	0.04	0.50	0.00	0.29	1.11	0.22	0.53	0.57	1.11	0.42	0.20	0.22	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.33	0.03	0.12	0.75	0.32	1.36	0.19	1.30	1.66	0.80	0.19	1.68	1.92	0.86	0.51	0.55	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.37	0.09	0.15	0.01	0.50	0.06	1.00	0.02	0.83	1.54	0.32	0.11	1.13	1.60	0.79	0.24	0.42	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00