Doublet Group distance statistics: 51694

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 27, 36, 18, 14, 12, 2, 3, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.016, 0.022, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.019, 0.030, 0.042, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.030 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.054, 0.068, 0.083, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.068 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.019, 0.034, 0.049, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.034 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.042, 0.057, 0.072, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.057 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.067, 0.083, 0.100, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.083 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.064, 0.083, 0.102, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.083 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.030, 0.052, 0.074, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.052 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.060, 0.082, 0.104, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.082 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.078, 0.100, 0.122, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.100 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.053, 0.078, 0.104, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.078 std_dev=0.026
C3'	A	0, 0.121, 0.261, 0.402, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.261 std_dev=0.141
C6	B	0, 0.357, 0.515, 0.673, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.515 std_dev=0.158
C5	B	0, 0.340, 0.517, 0.693, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.517 std_dev=0.176
N1	B	0, 0.300, 0.478, 0.656, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.478 std_dev=0.178
C2'	A	0, 0.085, 0.267, 0.450, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.267 std_dev=0.183
C4'	A	0, 0.137, 0.323, 0.508, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.323 std_dev=0.185
O4'	B	0, 0.314, 0.500, 0.685, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.500 std_dev=0.185
O3'	A	0, 0.093, 0.287, 0.481, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.287 std_dev=0.194
C1'	B	0, 0.319, 0.515, 0.711, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.515 std_dev=0.196
O5'	B	0, 0.358, 0.567, 0.777, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.567 std_dev=0.209
O4'	A	0, 0.102, 0.312, 0.522, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.312 std_dev=0.210
C5'	B	0, 0.359, 0.575, 0.791, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.575 std_dev=0.216
C4'	B	0, 0.344, 0.562, 0.779, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.562 std_dev=0.218
C4	B	0, 0.291, 0.514, 0.736, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.514 std_dev=0.222
P	B	0, 0.374, 0.603, 0.832, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.603 std_dev=0.229
O4	B	0, 0.328, 0.567, 0.807, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.567 std_dev=0.240
C3'	B	0, 0.394, 0.634, 0.875, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.634 std_dev=0.240
OP2	B	0, 0.426, 0.681, 0.936, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.681 std_dev=0.255
C2'	B	0, 0.298, 0.554, 0.809, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.554 std_dev=0.255
C2	B	0, 0.273, 0.533, 0.793, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.533 std_dev=0.260
OP1	B	0, 0.410, 0.670, 0.931, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.670 std_dev=0.261
N3	B	0, 0.288, 0.550, 0.812, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.550 std_dev=0.262
O2'	B	0, 0.325, 0.617, 0.910, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.617 std_dev=0.292
O3'	B	0, 0.418, 0.744, 1.070, 1.900 max_d=1.900 avg_d=0.744 std_dev=0.326
O2	B	0, 0.329, 0.667, 1.005, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.667 std_dev=0.338
C5'	A	0, 0.316, 0.669, 1.023, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.669 std_dev=0.354
O5'	A	0, 0.631, 0.986, 1.341, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.986 std_dev=0.355
O2'	A	0, 0.138, 0.504, 0.871, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.504 std_dev=0.366
P	A	0, 0.188, 1.001, 1.815, 3.372 max_d=3.372 avg_d=1.001 std_dev=0.813
OP2	A	0, 0.242, 1.116, 1.990, 4.681 max_d=4.681 avg_d=1.116 std_dev=0.874
OP1	A	0, 0.063, 2.004, 3.945, 5.687 max_d=5.687 avg_d=2.004 std_dev=1.941

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.24	0.53	0.29	0.19
C2	0.04	0.00	0.15	0.10	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.24	0.20	0.09	0.31	0.91	0.40	0.33
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.07	0.07	0.08	0.12	0.15	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.48	0.33	0.69	0.35
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.05	0.07	0.08	0.10	0.04	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.32	0.60	0.51	0.35
C4	0.02	0.01	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.13	0.05	0.31	1.01	0.35	0.37
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.04	0.06	0.05	0.07	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.22	0.20	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.11	0.04	0.34	1.30	0.35	0.50
C5'	0.04	0.07	0.07	0.03	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.15	0.09	0.07	0.15	0.16	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.17	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.13	0.14	0.05	0.35	1.32	0.38	0.51
C8	0.02	0.02	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.12	0.07	0.06	0.35	1.36	0.29	0.53
N1	0.03	0.00	0.12	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.18	0.08	0.33	1.13	0.40	0.42
N3	0.04	0.01	0.15	0.10	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.23	0.19	0.09	0.29	0.80	0.38	0.29
N6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.02	0.05	0.02	0.15	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.13	0.13	0.05	0.36	1.48	0.39	0.58
N7	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.11	0.08	0.05	0.36	1.52	0.33	0.60
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.30	0.96	0.31	0.36
O2'	0.02	0.24	0.00	0.01	0.12	0.02	0.10	0.06	0.13	0.12	0.19	0.23	0.13	0.11	0.05	0.00	0.05	0.02	0.51	0.45	0.88	0.44
O3'	0.10	0.20	0.03	0.01	0.13	0.03	0.11	0.03	0.14	0.07	0.18	0.19	0.13	0.08	0.09	0.05	0.00	0.08	0.18	0.61	0.41	0.29
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.06	0.08	0.09	0.05	0.05	0.02	0.02	0.08	0.00	0.07	0.65	0.19	0.30
O5'	0.24	0.31	0.48	0.32	0.31	0.02	0.34	0.01	0.35	0.35	0.33	0.29	0.36	0.36	0.30	0.51	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.53	0.91	0.33	0.60	1.01	0.22	1.30	0.17	1.32	1.36	1.13	0.80	1.48	1.52	0.96	0.45	0.61	0.65	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.40	0.69	0.51	0.35	0.20	0.35	0.40	0.38	0.29	0.40	0.38	0.39	0.33	0.31	0.88	0.41	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.33	0.35	0.35	0.37	0.07	0.50	0.01	0.51	0.53	0.42	0.29	0.58	0.60	0.36	0.44	0.29	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.19	0.15	0.11	0.17	0.12	0.16	0.17	0.15	0.14	0.19	0.24	0.18	0.11	0.19	0.12	0.18	0.15	0.20	0.16
C2	0.18	0.24	0.20	0.16	0.15	0.15	0.17	0.19	0.16	0.17	0.24	0.30	0.23	0.16	0.18	0.15	0.24	0.26	0.34	0.27
C2'	0.13	0.16	0.14	0.12	0.18	0.16	0.18	0.20	0.14	0.11	0.18	0.21	0.19	0.14	0.23	0.14	0.18	0.16	0.19	0.15
C3'	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.17	0.15	0.23	0.14	0.13	0.17	0.22	0.19	0.16	0.18	0.15	0.19	0.20	0.19	0.18
C4	0.15	0.18	0.16	0.12	0.14	0.13	0.17	0.17	0.13	0.12	0.17	0.26	0.21	0.13	0.20	0.13	0.21	0.20	0.28	0.21
C4'	0.17	0.17	0.18	0.21	0.14	0.24	0.17	0.32	0.17	0.15	0.15	0.22	0.20	0.21	0.15	0.22	0.30	0.32	0.29	0.30
C5	0.17	0.17	0.19	0.14	0.16	0.15	0.19	0.17	0.14	0.12	0.14	0.27	0.25	0.16	0.25	0.15	0.20	0.18	0.28	0.20
C5'	0.36	0.24	0.39	0.46	0.20	0.52	0.25	0.57	0.30	0.29	0.21	0.27	0.38	0.48	0.19	0.48	0.51	0.51	0.44	0.47
C6	0.18	0.20	0.22	0.16	0.13	0.15	0.17	0.16	0.14	0.14	0.15	0.30	0.28	0.18	0.22	0.15	0.20	0.20	0.30	0.22
C8	0.16	0.18	0.18	0.15	0.23	0.17	0.23	0.20	0.18	0.14	0.21	0.24	0.23	0.17	0.27	0.18	0.22	0.18	0.25	0.19
N1	0.18	0.23	0.22	0.17	0.13	0.15	0.17	0.17	0.15	0.17	0.21	0.32	0.26	0.18	0.17	0.15	0.22	0.24	0.33	0.25
N3	0.16	0.21	0.17	0.14	0.15	0.14	0.16	0.20	0.15	0.15	0.22	0.27	0.20	0.14	0.18	0.14	0.23	0.24	0.31	0.25
N6	0.20	0.20	0.24	0.19	0.15	0.17	0.18	0.16	0.14	0.15	0.14	0.31	0.32	0.22	0.24	0.17	0.19	0.19	0.30	0.21
N7	0.18	0.16	0.20	0.17	0.23	0.18	0.22	0.19	0.17	0.14	0.18	0.25	0.27	0.19	0.30	0.18	0.21	0.18	0.27	0.20
N9	0.13	0.17	0.15	0.11	0.17	0.13	0.18	0.18	0.15	0.11	0.18	0.24	0.19	0.12	0.21	0.13	0.20	0.17	0.24	0.19
O2'	0.13	0.19	0.13	0.12	0.27	0.12	0.29	0.19	0.22	0.16	0.23	0.21	0.17	0.11	0.32	0.12	0.21	0.22	0.30	0.24
O3'	0.24	0.23	0.24	0.22	0.23	0.22	0.25	0.24	0.26	0.24	0.22	0.25	0.24	0.22	0.23	0.23	0.26	0.25	0.29	0.27
O4'	0.14	0.17	0.14	0.14	0.15	0.17	0.18	0.25	0.17	0.12	0.15	0.22	0.18	0.14	0.16	0.17	0.26	0.26	0.27	0.25
O5'	0.24	0.22	0.29	0.28	0.19	0.28	0.19	0.28	0.19	0.19	0.21	0.28	0.36	0.32	0.21	0.24	0.26	0.25	0.22	0.22
OP1	1.26	1.63	1.36	1.04	1.34	0.71	1.09	0.51	1.06	1.34	1.57	1.84	1.38	1.00	1.34	0.79	0.62	0.38	0.63	0.47
OP2	0.80	0.58	1.02	1.02	0.38	0.94	0.40	0.85	0.50	0.61	0.46	0.69	1.19	1.17	0.34	0.77	0.77	0.70	0.61	0.64
P	0.60	0.69	0.67	0.56	0.56	0.43	0.48	0.36	0.48	0.59	0.65	0.79	0.73	0.57	0.56	0.44	0.37	0.29	0.34	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.09	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.02	0.13	0.11	0.17	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.06	0.11	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.08	0.04	0.07	0.10	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.07	0.09	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.03	0.17	0.14	0.22	0.15
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.04	0.02	0.07	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.04	0.18	0.14	0.22	0.16
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.07	0.04	0.04	0.13	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.04	0.16	0.12	0.19	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.12	0.10	0.15	0.10
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.02	0.15	0.12	0.20	0.13
O2	0.04	0.01	0.09	0.10	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.03	0.13	0.12	0.18	0.12
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.07	0.11	0.00	0.04	0.06	0.04	0.05	0.07	0.09	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.04	0.09	0.04	0.08	0.12	0.04	0.00	0.10	0.01	0.08	0.10	0.11	0.08
O4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.10	0.00	0.04	0.18	0.16	0.24	0.17
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.09	0.13	0.11	0.11
O5'	0.08	0.13	0.05	0.05	0.17	0.02	0.18	0.01	0.16	0.12	0.15	0.13	0.05	0.08	0.18	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.11	0.06	0.07	0.14	0.07	0.14	0.07	0.12	0.10	0.12	0.12	0.07	0.10	0.16	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.17	0.11	0.09	0.22	0.05	0.22	0.02	0.19	0.15	0.20	0.18	0.09	0.11	0.24	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.06	0.06	0.15	0.03	0.16	0.01	0.13	0.10	0.13	0.12	0.05	0.08	0.17	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00