Doublet Group distance statistics: 51695

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 29, 35, 13, 15, 9, 5, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.007, 0.032, 0.057, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.032 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.009, 0.037, 0.065, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.037 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.006, 0.034, 0.062, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.034 std_dev=0.028
O3'	A	0, 0.073, 0.160, 0.248, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.160 std_dev=0.087
C3'	A	0, 0.048, 0.190, 0.332, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.190 std_dev=0.142
C6	B	0, 0.142, 0.308, 0.474, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.308 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.117, 0.284, 0.451, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.284 std_dev=0.167
C2'	A	0, 0.032, 0.201, 0.369, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.201 std_dev=0.169
C5	B	0, 0.122, 0.292, 0.461, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.292 std_dev=0.170
O4'	A	0, 0.030, 0.203, 0.377, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.203 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.114, 0.289, 0.464, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.289 std_dev=0.175
N3	B	0, 0.118, 0.300, 0.482, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.300 std_dev=0.182
O4	B	0, 0.147, 0.340, 0.532, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.340 std_dev=0.193
C2	B	0, 0.099, 0.293, 0.487, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.293 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.052, 0.252, 0.452, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.252 std_dev=0.200
C1'	B	0, 0.149, 0.361, 0.572, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.361 std_dev=0.212
O5'	A	0, 0.162, 0.382, 0.601, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.382 std_dev=0.220
O4'	B	0, 0.186, 0.408, 0.630, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.408 std_dev=0.222
O2	B	0, 0.109, 0.356, 0.603, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.356 std_dev=0.247
C2'	B	0, 0.151, 0.418, 0.685, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.418 std_dev=0.267
O5'	B	0, 0.338, 0.612, 0.885, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.612 std_dev=0.273
C4'	B	0, 0.233, 0.510, 0.786, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.510 std_dev=0.277
C3'	B	0, 0.212, 0.495, 0.777, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.495 std_dev=0.282
O2'	A	0, 0.042, 0.334, 0.626, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.334 std_dev=0.292
C5'	B	0, 0.300, 0.599, 0.897, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.599 std_dev=0.298
P	B	0, 0.388, 0.696, 1.004, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.696 std_dev=0.308
O2'	B	0, 0.190, 0.508, 0.826, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.508 std_dev=0.318
O3'	B	0, 0.250, 0.607, 0.965, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.607 std_dev=0.357
OP2	B	0, 0.425, 0.791, 1.156, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.791 std_dev=0.365
C5'	A	0, 0.062, 0.431, 0.799, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.431 std_dev=0.369
OP1	B	0, 0.408, 0.816, 1.225, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.816 std_dev=0.408
P	A	0, 0.041, 0.464, 0.887, 2.865 max_d=2.865 avg_d=0.464 std_dev=0.423
OP2	A	0, -0.049, 0.646, 1.341, 4.299 max_d=4.299 avg_d=0.646 std_dev=0.695
OP1	A	0, -0.231, 0.609, 1.450, 5.255 max_d=5.255 avg_d=0.609 std_dev=0.841

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.15	0.24	0.21	0.11
C2	0.02	0.00	0.14	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.09	0.08	0.20	0.32	0.36	0.17
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.11	0.14	0.05	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.29	0.27	0.30	0.22
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.08	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.30	0.24	0.17
C4	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.06	0.04	0.21	0.35	0.33	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.16	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.24	0.43	0.37	0.21
C5'	0.03	0.05	0.04	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.05	0.09	0.09	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.11	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.04	0.25	0.42	0.40	0.21
C8	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.06	0.06	0.24	0.47	0.32	0.22
N1	0.02	0.00	0.11	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.08	0.06	0.23	0.37	0.39	0.19
N3	0.02	0.00	0.14	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.08	0.08	0.19	0.30	0.32	0.15
N6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.07	0.04	0.26	0.46	0.43	0.24
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.05	0.04	0.25	0.51	0.37	0.24
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.20	0.34	0.28	0.16
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.10	0.01	0.06	0.04	0.10	0.10	0.17	0.22	0.08	0.08	0.03	0.00	0.04	0.01	0.31	0.33	0.34	0.26
O3'	0.05	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.06	0.08	0.08	0.07	0.05	0.05	0.04	0.00	0.04	0.12	0.29	0.18	0.13
O4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.08	0.04	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.26	0.17	0.12
O5'	0.15	0.20	0.29	0.20	0.21	0.01	0.24	0.01	0.25	0.24	0.23	0.19	0.26	0.25	0.20	0.31	0.12	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.24	0.32	0.27	0.30	0.35	0.16	0.43	0.11	0.42	0.47	0.37	0.30	0.46	0.51	0.34	0.33	0.29	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.36	0.30	0.24	0.33	0.12	0.37	0.22	0.40	0.32	0.39	0.32	0.43	0.37	0.28	0.34	0.18	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.17	0.22	0.17	0.17	0.05	0.21	0.02	0.21	0.22	0.19	0.15	0.24	0.24	0.16	0.26	0.13	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.11	0.12	0.11	0.13	0.14	0.14	0.18	0.14	0.10	0.14	0.14	0.16	0.12	0.17	0.14	0.15	0.12	0.21	0.13
C2	0.17	0.18	0.18	0.16	0.14	0.14	0.19	0.16	0.18	0.16	0.18	0.22	0.21	0.17	0.14	0.15	0.18	0.19	0.34	0.21
C2'	0.10	0.12	0.11	0.09	0.15	0.13	0.16	0.18	0.14	0.08	0.14	0.17	0.17	0.11	0.19	0.11	0.14	0.15	0.20	0.14
C3'	0.12	0.14	0.13	0.11	0.12	0.14	0.11	0.19	0.10	0.10	0.14	0.18	0.17	0.12	0.16	0.11	0.15	0.20	0.14	0.14
C4	0.14	0.11	0.14	0.12	0.11	0.13	0.15	0.14	0.14	0.11	0.10	0.17	0.19	0.13	0.17	0.14	0.14	0.12	0.28	0.15
C4'	0.14	0.17	0.14	0.13	0.16	0.17	0.14	0.23	0.13	0.13	0.18	0.20	0.17	0.14	0.18	0.15	0.22	0.31	0.20	0.24
C5	0.16	0.12	0.17	0.14	0.14	0.15	0.16	0.15	0.14	0.12	0.10	0.19	0.23	0.15	0.21	0.15	0.15	0.12	0.28	0.16
C5'	0.28	0.25	0.29	0.33	0.21	0.38	0.21	0.41	0.23	0.25	0.23	0.27	0.30	0.35	0.21	0.34	0.39	0.48	0.33	0.39
C6	0.17	0.16	0.19	0.16	0.14	0.15	0.17	0.14	0.15	0.15	0.12	0.23	0.25	0.18	0.20	0.16	0.16	0.14	0.31	0.18
C8	0.15	0.12	0.15	0.14	0.19	0.18	0.17	0.19	0.14	0.11	0.18	0.15	0.21	0.15	0.24	0.18	0.18	0.15	0.25	0.16
N1	0.17	0.19	0.19	0.17	0.14	0.15	0.18	0.15	0.17	0.16	0.17	0.24	0.23	0.18	0.16	0.15	0.17	0.18	0.34	0.21
N3	0.15	0.15	0.15	0.14	0.11	0.13	0.17	0.15	0.17	0.14	0.14	0.19	0.18	0.14	0.13	0.14	0.16	0.16	0.31	0.19
N6	0.19	0.17	0.21	0.18	0.16	0.17	0.17	0.15	0.15	0.15	0.13	0.24	0.28	0.21	0.22	0.17	0.16	0.14	0.32	0.18
N7	0.17	0.11	0.18	0.16	0.18	0.18	0.16	0.18	0.14	0.12	0.15	0.17	0.25	0.17	0.25	0.19	0.17	0.13	0.27	0.16
N9	0.12	0.08	0.12	0.11	0.14	0.14	0.15	0.16	0.13	0.08	0.13	0.14	0.17	0.11	0.19	0.14	0.15	0.12	0.24	0.14
O2'	0.13	0.13	0.13	0.15	0.22	0.17	0.28	0.24	0.24	0.14	0.16	0.15	0.16	0.14	0.26	0.16	0.23	0.24	0.35	0.26
O3'	0.19	0.14	0.19	0.21	0.13	0.23	0.14	0.28	0.17	0.15	0.13	0.17	0.21	0.22	0.15	0.21	0.22	0.20	0.22	0.19
O4'	0.10	0.15	0.11	0.10	0.16	0.14	0.15	0.19	0.13	0.09	0.17	0.17	0.15	0.11	0.19	0.14	0.18	0.22	0.18	0.19
O5'	0.21	0.20	0.26	0.24	0.17	0.26	0.14	0.27	0.14	0.16	0.20	0.25	0.32	0.28	0.19	0.21	0.26	0.35	0.20	0.25
OP1	0.60	0.60	0.70	0.63	0.46	0.54	0.41	0.46	0.44	0.55	0.54	0.69	0.77	0.68	0.43	0.49	0.48	0.41	0.38	0.39
OP2	0.46	0.42	0.56	0.56	0.36	0.56	0.30	0.54	0.32	0.38	0.41	0.49	0.67	0.65	0.38	0.45	0.49	0.56	0.33	0.42
P	0.34	0.30	0.41	0.39	0.23	0.37	0.21	0.35	0.24	0.29	0.27	0.35	0.48	0.44	0.23	0.32	0.33	0.38	0.23	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.09	0.12	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.02	0.14	0.13	0.23	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.05	0.13	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.09	0.06	0.11	0.11	0.02	0.01	0.12	0.01	0.07	0.06	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.01	0.03	0.19	0.19	0.30	0.20
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.05	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.03	0.19	0.18	0.27	0.19
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.08	0.11	0.08	0.05	0.03	0.15	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.16	0.14	0.20	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.12	0.11	0.18	0.11
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.02	0.17	0.16	0.28	0.18
O2	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.13	0.01	0.03	0.14	0.12	0.23	0.14
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.09	0.00	0.03	0.04	0.05	0.06	0.07	0.12	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.12	0.01	0.12	0.03	0.10	0.06	0.12	0.13	0.03	0.00	0.15	0.01	0.10	0.09	0.15	0.11
O4	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.03	0.20	0.21	0.33	0.22
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.13	0.10	0.10
O5'	0.06	0.14	0.05	0.07	0.19	0.02	0.19	0.01	0.16	0.12	0.17	0.14	0.06	0.10	0.20	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.13	0.05	0.06	0.19	0.07	0.18	0.07	0.14	0.11	0.16	0.12	0.07	0.09	0.21	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.23	0.13	0.12	0.30	0.05	0.27	0.02	0.20	0.18	0.28	0.23	0.12	0.15	0.33	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.06	0.08	0.20	0.03	0.19	0.01	0.14	0.11	0.18	0.14	0.06	0.11	0.22	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00