Doublet Group distance statistics: 51715

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2	B	0, 0.133, 0.328, 0.523, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.328 std_dev=0.195
O2	B	0, 0.096, 0.319, 0.542, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.319 std_dev=0.223
O4'	A	0, 0.019, 0.257, 0.496, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.257 std_dev=0.239
N1	B	0, 0.141, 0.385, 0.628, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.385 std_dev=0.243
C2'	A	0, 0.051, 0.300, 0.549, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.300 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.127, 0.403, 0.678, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.403 std_dev=0.275
N3	B	0, 0.182, 0.487, 0.791, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.487 std_dev=0.305
C6	B	0, 0.176, 0.576, 0.976, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.576 std_dev=0.400
O5'	A	0, 0.131, 0.562, 0.993, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.562 std_dev=0.431
C4	B	0, 0.220, 0.657, 1.095, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.657 std_dev=0.438
O4'	B	0, 0.110, 0.554, 0.999, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.554 std_dev=0.444
C5	B	0, 0.217, 0.695, 1.173, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.695 std_dev=0.478
C2'	B	0, 0.169, 0.662, 1.155, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.662 std_dev=0.493
C5'	A	0, 0.070, 0.568, 1.065, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.568 std_dev=0.497
C4'	A	0, 0.024, 0.555, 1.085, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.555 std_dev=0.530
C3'	B	0, 0.172, 0.736, 1.300, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.736 std_dev=0.564
O2'	B	0, 0.190, 0.755, 1.320, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.755 std_dev=0.565
O4	B	0, 0.263, 0.829, 1.395, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.829 std_dev=0.566
O3'	B	0, 0.193, 0.774, 1.355, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.774 std_dev=0.581
C4'	B	0, 0.136, 0.744, 1.352, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.744 std_dev=0.608
C3'	A	0, 0.058, 0.767, 1.476, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.767 std_dev=0.709
P	B	0, 0.189, 0.915, 1.640, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.915 std_dev=0.726
O2'	A	0, 0.086, 0.818, 1.549, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.818 std_dev=0.731
OP1	A	0, 0.137, 0.913, 1.689, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.913 std_dev=0.776
C5'	B	0, 0.139, 0.916, 1.693, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.916 std_dev=0.777
P	A	0, 0.153, 0.945, 1.737, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.945 std_dev=0.792
O5'	B	0, 0.180, 1.008, 1.836, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.008 std_dev=0.828
OP1	B	0, 0.183, 1.025, 1.868, 1.866 max_d=1.866 avg_d=1.025 std_dev=0.843
O3'	A	0, 0.076, 1.390, 2.703, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.390 std_dev=1.313
OP2	B	0, 0.231, 1.724, 3.216, 3.236 max_d=3.236 avg_d=1.724 std_dev=1.492
OP2	A	0, 0.185, 2.342, 4.499, 4.570 max_d=4.570 avg_d=2.342 std_dev=2.157

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.29	0.00	0.08	0.07	0.11	0.14
C2	0.01	0.00	0.13	0.04	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.45	0.12	0.07	0.06	0.55	0.12
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.18	0.05	0.08	0.09	0.13	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.36	0.05	0.65	0.51
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.14	0.01	0.25	0.01	0.22	0.35	0.13	0.02	0.27	0.35	0.19	0.01	0.00	0.01	0.05	0.47	0.46	0.07
C4	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.24	0.06	0.09	0.09	0.54	0.12
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.20	0.03	0.09	0.09	0.18	0.08	0.27	0.01	0.00	0.01	0.28	0.37	0.03
C5	0.01	0.00	0.02	0.25	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.07	0.02	0.20	0.13	0.90	0.27
C5'	0.05	0.05	0.18	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.08	0.19	0.02	0.07	0.13	0.20	0.06	0.07	0.21	0.01	0.00	0.19	0.36	0.00
C6	0.01	0.01	0.05	0.22	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.15	0.05	0.20	0.12	0.99	0.30
C8	0.01	0.00	0.08	0.35	0.00	0.20	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.17	0.08	0.23	0.16	0.78	0.23
N1	0.01	0.00	0.09	0.13	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.32	0.09	0.14	0.09	0.81	0.23
N3	0.01	0.00	0.13	0.02	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.47	0.12	0.03	0.06	0.36	0.05
N6	0.01	0.01	0.03	0.27	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.06	0.03	0.26	0.15	1.23	0.40
N7	0.00	0.01	0.05	0.35	0.01	0.18	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.14	0.05	0.28	0.17	1.09	0.35
N9	0.00	0.01	0.01	0.19	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.11	0.00	0.08	0.10	0.38	0.06
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.16	0.27	0.29	0.07	0.27	0.35	0.17	0.03	0.33	0.38	0.20	0.00	0.01	0.20	0.28	0.04	0.82	0.52
O3'	0.29	0.45	0.01	0.00	0.24	0.01	0.07	0.21	0.15	0.17	0.32	0.47	0.06	0.14	0.11	0.01	0.00	0.19	0.22	0.94	0.31	0.22
O4'	0.00	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.09	0.12	0.03	0.05	0.00	0.20	0.19	0.00	0.02	0.10	0.06	0.03
O5'	0.08	0.07	0.36	0.05	0.09	0.01	0.20	0.00	0.20	0.23	0.14	0.03	0.26	0.28	0.08	0.28	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.06	0.05	0.47	0.09	0.28	0.13	0.19	0.12	0.16	0.09	0.06	0.15	0.17	0.10	0.04	0.94	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.55	0.65	0.46	0.54	0.37	0.90	0.36	0.99	0.78	0.81	0.36	1.23	1.09	0.38	0.82	0.31	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.12	0.51	0.07	0.12	0.03	0.27	0.00	0.30	0.23	0.23	0.05	0.40	0.35	0.06	0.52	0.22	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.04	0.24	0.30	0.19	0.29	0.24	0.19	0.16	0.05	0.08	0.13	0.19	0.45	0.24	0.18	0.39	0.11	0.22	0.05
C2	0.24	0.14	0.27	0.27	0.08	0.26	0.14	0.27	0.19	0.19	0.05	0.18	0.18	0.43	0.10	0.27	0.14	0.04	0.50	0.35
C2'	0.16	0.03	0.26	0.36	0.27	0.32	0.30	0.24	0.19	0.05	0.14	0.11	0.20	0.51	0.34	0.18	0.58	0.29	0.50	0.25
C3'	0.12	0.03	0.24	0.26	0.10	0.23	0.12	0.28	0.11	0.06	0.06	0.05	0.15	0.28	0.13	0.13	0.81	0.66	0.94	0.64
C4	0.16	0.07	0.19	0.22	0.13	0.18	0.17	0.11	0.13	0.07	0.04	0.16	0.11	0.42	0.16	0.15	0.02	0.07	0.19	0.23
C4'	0.25	0.14	0.38	0.42	0.06	0.37	0.08	0.34	0.10	0.14	0.07	0.19	0.34	0.45	0.09	0.24	0.94	0.57	1.01	0.69
C5	0.04	0.05	0.03	0.04	0.09	0.05	0.15	0.10	0.14	0.04	0.01	0.16	0.06	0.27	0.10	0.06	0.13	0.21	0.25	0.31
C5'	0.14	0.07	0.25	0.29	0.10	0.20	0.13	0.10	0.09	0.06	0.04	0.12	0.23	0.32	0.13	0.10	0.92	0.39	1.22	0.73
C6	0.03	0.07	0.02	0.02	0.06	0.06	0.10	0.07	0.09	0.03	0.04	0.17	0.10	0.22	0.06	0.06	0.26	0.24	0.44	0.40
C8	0.02	0.02	0.02	0.04	0.15	0.08	0.22	0.20	0.20	0.07	0.05	0.13	0.04	0.26	0.16	0.10	0.10	0.20	0.11	0.13
N1	0.13	0.13	0.12	0.12	0.07	0.10	0.12	0.11	0.12	0.12	0.07	0.19	0.04	0.32	0.06	0.10	0.26	0.15	0.56	0.42
N3	0.26	0.11	0.31	0.33	0.12	0.34	0.15	0.32	0.16	0.16	0.05	0.17	0.23	0.49	0.17	0.32	0.02	0.05	0.32	0.24
N6	0.09	0.07	0.14	0.15	0.06	0.19	0.08	0.18	0.09	0.06	0.07	0.16	0.26	0.07	0.07	0.17	0.35	0.32	0.48	0.45
N7	0.05	0.02	0.08	0.08	0.11	0.20	0.19	0.26	0.18	0.08	0.02	0.13	0.14	0.16	0.12	0.19	0.08	0.28	0.08	0.25
N9	0.12	0.04	0.16	0.21	0.16	0.16	0.22	0.05	0.17	0.04	0.06	0.14	0.10	0.40	0.20	0.09	0.18	0.06	0.06	0.10
O2'	0.17	0.08	0.20	0.27	0.26	0.25	0.36	0.07	0.24	0.05	0.08	0.24	0.18	0.50	0.34	0.19	0.25	0.10	0.02	0.19
O3'	0.53	0.50	0.63	0.56	0.50	0.56	0.55	0.65	0.57	0.53	0.48	0.47	0.54	0.50	0.48	0.54	1.10	1.04	1.18	0.95
O4'	0.26	0.14	0.36	0.42	0.08	0.39	0.13	0.27	0.09	0.13	0.06	0.22	0.33	0.51	0.12	0.26	0.64	0.16	0.50	0.28
O5'	0.12	0.15	0.06	0.05	0.26	0.12	0.29	0.23	0.26	0.18	0.19	0.09	0.10	0.07	0.28	0.17	0.58	0.10	0.92	0.43
OP1	0.14	0.08	0.26	0.31	0.13	0.11	0.17	0.08	0.11	0.05	0.04	0.17	0.26	0.38	0.16	0.04	0.88	0.27	1.48	0.78
OP2	0.90	0.91	0.91	0.91	0.77	0.84	0.70	0.63	0.74	0.85	0.87	0.99	1.10	1.09	0.75	0.85	0.27	0.30	0.97	0.43
P	0.31	0.30	0.31	0.31	0.35	0.36	0.38	0.42	0.37	0.33	0.31	0.26	0.38	0.31	0.35	0.35	0.44	0.04	0.95	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.19	0.01	0.00	0.49	0.31	0.63	0.46
C2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.21	0.00	0.01	0.63	0.38	1.01	0.69
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.06	0.04	0.10	0.06	0.11	0.04	0.04	0.11	0.00	0.05	0.06	0.03	0.44	0.23	0.50	0.28
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.14	0.17	0.04	0.02
C4	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.20	0.00	0.02	0.76	0.46	1.38	0.92
C4'	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.10	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.10	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.18	0.00	0.03	0.78	0.47	1.39	0.95
C5'	0.01	0.02	0.06	0.02	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.06	0.04	0.06	0.01	0.00	0.13	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.11	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.17	0.00	0.03	0.75	0.44	1.21	0.85
N1	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.19	0.01	0.01	0.66	0.39	0.99	0.69
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.21	0.00	0.01	0.70	0.42	1.21	0.81
O2	0.03	0.00	0.11	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.21	0.01	0.01	0.55	0.35	0.85	0.58
O2'	0.03	0.08	0.00	0.01	0.10	0.02	0.16	0.06	0.15	0.04	0.07	0.20	0.00	0.02	0.11	0.03	0.37	0.19	0.41	0.20
O3'	0.19	0.21	0.05	0.00	0.20	0.03	0.18	0.04	0.17	0.19	0.21	0.21	0.02	0.00	0.20	0.12	0.01	0.16	0.13	0.08
O4	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.20	0.00	0.02	0.78	0.47	1.47	0.96
O4'	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.02	0.00	0.29	0.20	0.37	0.31
O5'	0.49	0.63	0.44	0.14	0.76	0.00	0.78	0.00	0.75	0.66	0.70	0.55	0.37	0.01	0.78	0.29	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.31	0.38	0.23	0.17	0.46	0.10	0.47	0.13	0.44	0.39	0.42	0.35	0.19	0.16	0.47	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.63	1.01	0.50	0.04	1.38	0.03	1.39	0.01	1.21	0.99	1.21	0.85	0.41	0.13	1.47	0.37	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.46	0.69	0.28	0.02	0.92	0.01	0.95	0.00	0.85	0.69	0.81	0.58	0.20	0.08	0.96	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00