Doublet Group distance statistics: 51717

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.018, 0.042, 0.067, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.042 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.018, 0.043, 0.068, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.043 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.018, 0.043, 0.068, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.043 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.022, 0.052, 0.081, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.052 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.023, 0.056, 0.088, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.056 std_dev=0.033
N9	A	0, 0.026, 0.061, 0.096, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.061 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.027, 0.065, 0.103, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.065 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.039, 0.094, 0.148, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.094 std_dev=0.054
P	B	0, 0.158, 0.378, 0.598, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.378 std_dev=0.220
C5'	B	0, 0.164, 0.392, 0.619, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.392 std_dev=0.228
O4'	A	0, 0.139, 0.368, 0.597, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.368 std_dev=0.229
OP1	A	0, 0.163, 0.406, 0.649, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.406 std_dev=0.243
C4'	B	0, 0.110, 0.360, 0.610, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.360 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.133, 0.384, 0.635, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.384 std_dev=0.251
O2	B	0, 0.127, 0.378, 0.630, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.378 std_dev=0.251
N3	B	0, 0.159, 0.417, 0.675, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.417 std_dev=0.258
N1	B	0, 0.133, 0.397, 0.660, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.397 std_dev=0.263
C6	B	0, 0.156, 0.420, 0.684, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.420 std_dev=0.264
P	A	0, 0.142, 0.412, 0.681, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.412 std_dev=0.270
C4	B	0, 0.181, 0.454, 0.726, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.454 std_dev=0.273
OP2	B	0, 0.158, 0.432, 0.706, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.432 std_dev=0.274
C5	B	0, 0.176, 0.450, 0.724, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.450 std_dev=0.274
C4'	A	0, 0.194, 0.478, 0.761, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.478 std_dev=0.284
OP1	B	0, 0.173, 0.457, 0.741, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.457 std_dev=0.284
O4	B	0, 0.209, 0.511, 0.813, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.511 std_dev=0.302
C3'	A	0, 0.217, 0.524, 0.831, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.524 std_dev=0.307
O4'	B	0, 0.110, 0.417, 0.725, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.417 std_dev=0.307
C2'	B	0, 0.113, 0.423, 0.733, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.423 std_dev=0.310
C1'	B	0, 0.118, 0.429, 0.740, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.429 std_dev=0.311
O5'	A	0, 0.210, 0.521, 0.833, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.521 std_dev=0.312
O5'	B	0, 0.166, 0.480, 0.795, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.480 std_dev=0.315
C3'	B	0, 0.182, 0.499, 0.816, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.499 std_dev=0.317
OP2	A	0, 0.215, 0.546, 0.877, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.546 std_dev=0.331
C2'	A	0, 0.286, 0.688, 1.089, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.688 std_dev=0.402
C5'	A	0, 0.309, 0.738, 1.167, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.738 std_dev=0.429
O3'	A	0, 0.274, 0.740, 1.206, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.740 std_dev=0.466
O3'	B	0, 0.299, 0.912, 1.525, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.912 std_dev=0.613
O2'	B	0, 0.294, 1.008, 1.721, 1.869 max_d=1.869 avg_d=1.008 std_dev=0.713
O2'	A	0, 0.538, 1.310, 2.083, 1.890 max_d=1.890 avg_d=1.310 std_dev=0.773

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.00	0.16	0.23	0.15	0.15
C2	0.02	0.00	0.11	0.06	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.18	0.04	0.17	0.30	0.30	0.22
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.11	0.03	0.09	0.07	0.11	0.03	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.22	0.33	0.17	0.24
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.08	0.06	0.06	0.07	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.14	0.11
C4	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.03	0.16	0.30	0.29	0.22
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.03	0.15	0.31	0.35	0.24
C5'	0.05	0.07	0.11	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.06	0.09	0.09	0.06	0.07	0.10	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.15	0.32	0.38	0.25
C8	0.01	0.01	0.09	0.08	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.03	0.07	0.14	0.30	0.31	0.23
N1	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.03	0.16	0.31	0.35	0.24
N3	0.02	0.00	0.11	0.06	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.18	0.05	0.17	0.29	0.26	0.20
N6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.03	0.14	0.31	0.41	0.26
N7	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.03	0.06	0.14	0.31	0.37	0.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.03	0.16	0.28	0.25	0.20
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.07	0.05	0.15	0.03	0.11	0.08	0.15	0.06	0.00	0.04	0.06	0.21	0.41	0.14	0.24
O3'	0.14	0.18	0.03	0.00	0.12	0.01	0.08	0.10	0.10	0.03	0.14	0.18	0.07	0.03	0.09	0.04	0.00	0.10	0.09	0.13	0.32	0.23
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.07	0.03	0.05	0.03	0.06	0.03	0.06	0.10	0.00	0.10	0.12	0.13	0.09
O5'	0.16	0.17	0.22	0.02	0.16	0.02	0.15	0.01	0.15	0.14	0.16	0.17	0.14	0.14	0.16	0.21	0.09	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.23	0.30	0.33	0.07	0.30	0.02	0.31	0.01	0.32	0.30	0.31	0.29	0.31	0.31	0.28	0.41	0.13	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.30	0.17	0.14	0.29	0.07	0.35	0.07	0.38	0.31	0.35	0.26	0.41	0.37	0.25	0.14	0.32	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.22	0.24	0.11	0.22	0.03	0.24	0.01	0.25	0.23	0.24	0.20	0.26	0.25	0.20	0.24	0.23	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.12	0.20	0.19	0.17	0.17	0.14	0.10	0.09	0.14	0.10	0.16	0.29	0.33	0.24	0.17	0.05	0.07	0.09	0.05
C2	0.11	0.02	0.23	0.17	0.15	0.10	0.11	0.07	0.04	0.03	0.10	0.09	0.38	0.41	0.20	0.09	0.08	0.11	0.09	0.08
C2'	0.17	0.10	0.13	0.16	0.17	0.16	0.15	0.14	0.05	0.08	0.11	0.15	0.25	0.37	0.25	0.14	0.08	0.10	0.18	0.10
C3'	0.21	0.08	0.14	0.17	0.15	0.16	0.13	0.06	0.06	0.11	0.06	0.13	0.22	0.24	0.24	0.18	0.11	0.18	0.12	0.12
C4	0.16	0.05	0.23	0.18	0.18	0.13	0.14	0.07	0.06	0.05	0.12	0.11	0.38	0.40	0.23	0.10	0.04	0.04	0.08	0.04
C4'	0.19	0.06	0.10	0.15	0.14	0.15	0.13	0.05	0.06	0.10	0.04	0.10	0.13	0.20	0.23	0.19	0.09	0.16	0.09	0.10
C5	0.12	0.07	0.24	0.18	0.19	0.10	0.16	0.04	0.09	0.05	0.15	0.08	0.44	0.43	0.22	0.08	0.03	0.05	0.06	0.03
C5'	0.13	0.07	0.10	0.11	0.16	0.11	0.16	0.06	0.10	0.09	0.10	0.08	0.07	0.15	0.20	0.15	0.14	0.25	0.13	0.16
C6	0.07	0.08	0.24	0.16	0.18	0.07	0.15	0.04	0.10	0.05	0.15	0.06	0.47	0.45	0.21	0.10	0.06	0.09	0.06	0.06
C8	0.18	0.07	0.20	0.18	0.20	0.15	0.18	0.05	0.11	0.08	0.13	0.10	0.36	0.38	0.24	0.10	0.03	0.06	0.07	0.03
N1	0.08	0.05	0.24	0.16	0.16	0.08	0.13	0.05	0.07	0.03	0.12	0.06	0.43	0.43	0.20	0.09	0.08	0.11	0.07	0.08
N3	0.15	0.04	0.23	0.18	0.15	0.13	0.11	0.08	0.03	0.06	0.09	0.12	0.35	0.40	0.22	0.11	0.06	0.07	0.10	0.07
N6	0.02	0.11	0.23	0.15	0.18	0.05	0.16	0.03	0.12	0.08	0.15	0.07	0.51	0.46	0.20	0.13	0.06	0.10	0.05	0.06
N7	0.13	0.09	0.22	0.18	0.20	0.11	0.18	0.03	0.12	0.08	0.15	0.08	0.43	0.42	0.23	0.06	0.02	0.03	0.06	0.01
N9	0.20	0.07	0.21	0.19	0.19	0.15	0.16	0.08	0.07	0.09	0.11	0.13	0.34	0.37	0.24	0.13	0.03	0.03	0.08	0.03
O2'	0.18	0.19	0.17	0.18	0.28	0.17	0.21	0.14	0.13	0.15	0.25	0.21	0.29	0.44	0.37	0.14	0.02	0.08	0.14	0.03
O3'	0.17	0.08	0.10	0.15	0.20	0.16	0.13	0.07	0.04	0.07	0.14	0.12	0.14	0.27	0.30	0.17	0.13	0.22	0.13	0.15
O4'	0.23	0.08	0.16	0.21	0.17	0.20	0.13	0.11	0.08	0.14	0.06	0.12	0.19	0.24	0.26	0.22	0.09	0.10	0.10	0.08
O5'	0.06	0.10	0.07	0.08	0.22	0.11	0.20	0.05	0.11	0.06	0.17	0.08	0.05	0.22	0.26	0.10	0.11	0.23	0.16	0.15
OP1	0.15	0.20	0.21	0.22	0.24	0.22	0.20	0.13	0.17	0.17	0.23	0.20	0.18	0.35	0.26	0.17	0.11	0.30	0.28	0.21
OP2	0.40	0.36	0.53	0.48	0.29	0.51	0.30	0.54	0.36	0.38	0.32	0.36	0.49	0.54	0.25	0.40	0.34	0.07	0.30	0.24
P	0.18	0.21	0.27	0.24	0.24	0.27	0.23	0.25	0.21	0.20	0.23	0.20	0.21	0.36	0.25	0.20	0.07	0.15	0.15	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.01	0.00	0.10	0.14	0.08	0.11
C2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.21	0.00	0.03	0.13	0.19	0.14	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.05	0.15	0.06	0.02	0.06	0.13	0.00	0.04	0.04	0.01	0.28	0.36	0.26	0.31
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.06	0.04	0.07	0.04	0.01	0.01	0.08	0.01	0.04	0.16	0.08	0.13
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.13	0.00	0.02	0.13	0.15	0.19	0.14
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.09	0.05	0.03	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.00	0.03	0.12	0.11	0.19	0.12
C5'	0.06	0.09	0.15	0.01	0.13	0.00	0.14	0.00	0.13	0.10	0.11	0.06	0.07	0.12	0.13	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.12	0.00	0.03	0.12	0.11	0.16	0.12
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.19	0.01	0.01	0.13	0.16	0.14	0.13
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.18	0.00	0.03	0.13	0.18	0.17	0.14
O2	0.01	0.00	0.13	0.04	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.26	0.01	0.05	0.12	0.21	0.12	0.14
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.14	0.09	0.16	0.07	0.14	0.08	0.09	0.11	0.00	0.04	0.15	0.05	0.29	0.52	0.29	0.38
O3'	0.25	0.21	0.04	0.01	0.13	0.05	0.10	0.12	0.12	0.19	0.18	0.26	0.04	0.00	0.12	0.20	0.11	0.25	0.24	0.25
O4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.00	0.03	0.13	0.15	0.20	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.05	0.20	0.03	0.00	0.06	0.08	0.07	0.06
O5'	0.10	0.13	0.28	0.04	0.13	0.00	0.12	0.01	0.12	0.13	0.13	0.12	0.29	0.11	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.14	0.19	0.36	0.16	0.15	0.05	0.11	0.00	0.11	0.16	0.18	0.21	0.52	0.25	0.15	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.14	0.26	0.08	0.19	0.01	0.19	0.04	0.16	0.14	0.17	0.12	0.29	0.24	0.20	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.14	0.31	0.13	0.14	0.04	0.12	0.01	0.12	0.13	0.14	0.14	0.38	0.25	0.13	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00