Doublet Group distance statistics: 51723

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C5	B	0, 0.000, 0.292, 0.583, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C6	B	0, 0.000, 0.320, 0.640, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.320 std_dev=0.320
C4	B	0, 0.000, 0.462, 0.923, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.462 std_dev=0.462
N1	B	0, 0.000, 0.480, 0.960, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.480 std_dev=0.480
N3	B	0, 0.000, 0.651, 1.303, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.651 std_dev=0.651
C2	B	0, 0.000, 0.681, 1.361, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.681 std_dev=0.681
C2'	B	0, 0.000, 0.721, 1.441, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.721 std_dev=0.721
C3'	B	0, 0.000, 0.752, 1.504, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.752 std_dev=0.752
O4	B	0, 0.000, 0.809, 1.618, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.809 std_dev=0.809
O3'	B	0, 0.000, 0.830, 1.660, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.830 std_dev=0.830
C1'	B	0, 0.000, 0.883, 1.766, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.883 std_dev=0.883
O4'	A	0, 0.000, 0.923, 1.846, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.923 std_dev=0.923
C2'	A	0, 0.000, 1.020, 2.041, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.020 std_dev=1.020
O2	B	0, 0.000, 1.117, 2.233, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.117 std_dev=1.117
O2'	B	0, 0.000, 1.133, 2.265, 2.265 max_d=2.265 avg_d=1.133 std_dev=1.133
O3'	A	0, 0.000, 1.178, 2.355, 2.355 max_d=2.355 avg_d=1.178 std_dev=1.178
O4'	B	0, 0.000, 1.180, 2.361, 2.361 max_d=2.361 avg_d=1.180 std_dev=1.180
C3'	A	0, 0.000, 1.212, 2.424, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.212 std_dev=1.212
C4'	B	0, 0.000, 1.246, 2.491, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.246 std_dev=1.246
C4'	A	0, 0.000, 1.274, 2.548, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.274 std_dev=1.274
O5'	B	0, 0.000, 1.434, 2.868, 2.868 max_d=2.868 avg_d=1.434 std_dev=1.434
O2'	A	0, 0.000, 1.514, 3.028, 3.028 max_d=3.028 avg_d=1.514 std_dev=1.514
C5'	B	0, 0.000, 1.576, 3.153, 3.153 max_d=3.153 avg_d=1.576 std_dev=1.576
OP2	B	0, 0.000, 1.749, 3.497, 3.497 max_d=3.497 avg_d=1.749 std_dev=1.749
P	B	0, 0.000, 1.814, 3.627, 3.627 max_d=3.627 avg_d=1.814 std_dev=1.814
OP1	B	0, 0.000, 2.200, 4.400, 4.400 max_d=4.400 avg_d=2.200 std_dev=2.200
C5'	A	0, 0.000, 2.257, 4.515, 4.515 max_d=4.515 avg_d=2.257 std_dev=2.257
O5'	A	0, 0.000, 2.662, 5.325, 5.325 max_d=5.325 avg_d=2.662 std_dev=2.662
OP1	A	0, 0.000, 2.889, 5.777, 5.777 max_d=5.777 avg_d=2.889 std_dev=2.889
P	A	0, 0.000, 3.000, 6.000, 6.000 max_d=6.000 avg_d=3.000 std_dev=3.000
OP2	A	0, 0.000, 3.473, 6.945, 6.945 max_d=6.945 avg_d=3.473 std_dev=3.473

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.16	0.00	0.03	0.47	0.82	0.33
C2	0.03	0.00	0.35	0.11	0.02	0.31	0.01	0.48	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.44	0.04	0.39	0.25	0.80	1.26	0.72
C2'	0.00	0.35	0.00	0.01	0.20	0.03	0.13	0.03	0.20	0.13	0.30	0.34	0.17	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.13	0.73	0.85	0.52
C3'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.15	0.01	0.23	0.02	0.23	0.25	0.17	0.08	0.27	0.28	0.15	0.03	0.01	0.02	0.01	0.33	0.45	0.22
C4	0.02	0.02	0.20	0.15	0.00	0.11	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.21	0.02	0.63	0.96	0.45
C4'	0.01	0.31	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.08	0.26	0.22	0.30	0.02	0.19	0.05	0.24	0.01	0.00	0.01	0.07	0.58	0.16
C5	0.03	0.01	0.13	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.09	0.09	0.21	0.56	0.72	0.28
C5'	0.00	0.48	0.03	0.02	0.16	0.01	0.00	0.00	0.14	0.38	0.35	0.44	0.04	0.29	0.07	0.20	0.12	0.01	0.00	0.23	0.36	0.00
C6	0.03	0.00	0.20	0.23	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.09	0.18	0.11	0.65	0.84	0.40
C8	0.01	0.02	0.13	0.25	0.00	0.26	0.01	0.38	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.45	0.10	0.21	0.54	0.31	0.27	0.08
N1	0.03	0.00	0.30	0.17	0.02	0.22	0.01	0.35	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.28	0.03	0.31	0.10	0.76	1.10	0.60
N3	0.03	0.00	0.34	0.08	0.00	0.30	0.00	0.44	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.43	0.07	0.39	0.24	0.75	1.23	0.68
N6	0.03	0.00	0.17	0.27	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.04	0.14	0.12	0.22	0.59	0.66	0.28
N7	0.02	0.02	0.03	0.28	0.01	0.19	0.00	0.29	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.35	0.14	0.12	0.50	0.37	0.30	0.03
N9	0.00	0.03	0.02	0.15	0.01	0.05	0.03	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.15	0.01	0.01	0.19	0.49	0.72	0.25
O2'	0.01	0.44	0.00	0.03	0.11	0.24	0.07	0.20	0.06	0.45	0.28	0.43	0.04	0.35	0.15	0.00	0.00	0.13	0.00	0.58	0.76	0.37
O3'	0.16	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.09	0.10	0.03	0.07	0.14	0.14	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.05	0.20	0.04
O4'	0.00	0.39	0.03	0.02	0.21	0.00	0.09	0.01	0.18	0.21	0.31	0.39	0.12	0.12	0.01	0.13	0.06	0.00	0.06	0.27	0.81	0.25
O5'	0.03	0.25	0.13	0.01	0.02	0.01	0.21	0.00	0.11	0.54	0.10	0.24	0.22	0.50	0.19	0.00	0.15	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.47	0.80	0.73	0.33	0.63	0.07	0.56	0.23	0.65	0.31	0.76	0.75	0.59	0.37	0.49	0.58	0.05	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.82	1.26	0.85	0.45	0.96	0.58	0.72	0.36	0.84	0.27	1.10	1.23	0.66	0.30	0.72	0.76	0.20	0.81	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.33	0.72	0.52	0.22	0.45	0.16	0.28	0.00	0.40	0.08	0.60	0.68	0.28	0.03	0.25	0.37	0.04	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.17	0.22	0.23	0.19	0.34	0.08	0.36	0.09	0.20	0.05	0.28	0.26	0.22	0.41	0.37	0.20	0.28	0.01	0.09
C2	0.31	0.22	0.18	0.36	0.26	0.60	0.04	0.76	0.21	0.13	0.40	0.34	0.13	0.35	0.39	0.63	0.61	0.76	0.49	0.57
C2'	0.34	0.35	0.31	0.33	0.22	0.36	0.22	0.38	0.28	0.33	0.28	0.40	0.29	0.32	0.13	0.36	0.29	0.37	0.19	0.20
C3'	0.44	0.47	0.45	0.37	0.06	0.36	0.01	0.28	0.15	0.35	0.32	0.68	0.53	0.40	0.12	0.36	0.12	0.21	0.08	0.01
C4	0.25	0.04	0.16	0.26	0.20	0.39	0.01	0.49	0.16	0.15	0.24	0.04	0.13	0.24	0.35	0.41	0.37	0.45	0.22	0.28
C4'	0.72	0.65	0.70	0.57	0.06	0.63	0.06	0.50	0.22	0.53	0.34	0.97	0.86	0.61	0.40	0.64	0.25	0.37	0.04	0.10
C5	0.10	0.14	0.05	0.19	0.14	0.29	0.07	0.42	0.14	0.05	0.24	0.19	0.02	0.18	0.22	0.27	0.36	0.39	0.23	0.26
C5'	0.96	0.95	1.01	0.80	0.03	0.79	0.05	0.57	0.30	0.73	0.59	1.39	1.25	0.88	0.37	0.77	0.26	0.42	0.08	0.09
C6	0.03	0.30	0.00	0.22	0.16	0.35	0.10	0.56	0.17	0.02	0.34	0.43	0.11	0.20	0.20	0.33	0.53	0.56	0.42	0.44
C8	0.11	0.08	0.08	0.12	0.06	0.15	0.01	0.20	0.06	0.09	0.00	0.11	0.06	0.11	0.16	0.15	0.11	0.12	0.06	0.02
N1	0.16	0.33	0.07	0.31	0.22	0.54	0.08	0.75	0.20	0.03	0.41	0.51	0.03	0.30	0.30	0.54	0.65	0.75	0.54	0.60
N3	0.36	0.06	0.23	0.35	0.25	0.55	0.01	0.65	0.20	0.19	0.31	0.09	0.22	0.33	0.42	0.58	0.49	0.63	0.35	0.43
N6	0.19	0.37	0.13	0.13	0.11	0.20	0.13	0.49	0.12	0.16	0.32	0.53	0.29	0.12	0.10	0.10	0.54	0.52	0.46	0.46
N7	0.01	0.05	0.01	0.10	0.04	0.12	0.06	0.21	0.07	0.02	0.08	0.06	0.05	0.09	0.07	0.08	0.17	0.16	0.04	0.05
N9	0.23	0.09	0.15	0.20	0.17	0.29	0.04	0.34	0.10	0.15	0.09	0.14	0.15	0.19	0.33	0.31	0.21	0.27	0.05	0.11
O2'	0.24	0.16	0.14	0.25	0.19	0.35	0.29	0.46	0.31	0.25	0.12	0.11	0.07	0.20	0.14	0.37	0.40	0.45	0.32	0.33
O3'	0.51	0.50	0.51	0.44	0.08	0.46	0.04	0.39	0.21	0.41	0.32	0.71	0.60	0.46	0.11	0.47	0.21	0.29	0.04	0.06
O4'	0.67	0.56	0.61	0.52	0.16	0.61	0.10	0.52	0.20	0.49	0.22	0.84	0.75	0.53	0.55	0.64	0.27	0.38	0.01	0.13
O5'	0.81	0.96	0.94	0.70	0.15	0.58	0.07	0.32	0.22	0.66	0.73	1.39	1.15	0.79	0.15	0.54	0.06	0.20	0.24	0.11
OP1	1.52	1.76	1.67	1.45	1.17	1.28	0.87	1.01	1.07	1.46	1.67	2.07	1.82	1.53	0.97	1.23	0.79	0.88	0.51	0.61
OP2	1.75	2.09	1.89	1.57	1.16	1.39	0.80	1.03	1.10	1.65	1.90	2.50	2.08	1.64	0.80	1.37	0.74	0.79	0.30	0.48
P	1.33	1.57	1.48	1.21	0.74	1.04	0.44	0.73	0.73	1.21	1.38	1.98	1.69	1.30	0.43	1.00	0.46	0.58	0.13	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.22	0.13	0.05
C2	0.03	0.00	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.04	0.02	0.03	0.05	0.18	0.11	0.03
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.37	0.30	0.19
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.00	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.38	0.34	0.25
C4	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.06	0.04	0.09	0.04	0.02
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.24	0.15	0.09
C5	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.03
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.10	0.04	0.01
N1	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.17	0.09	0.02
N3	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.03	0.01	0.04	0.04	0.15	0.09	0.01
O2	0.05	0.00	0.10	0.08	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.00	0.03	0.08	0.20	0.13	0.03
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.08	0.13	0.00	0.01	0.07	0.00	0.02	0.43	0.32	0.22
O3'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.52	0.44	0.35
O4	0.05	0.02	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.06	0.03	0.06	0.02	0.03
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.06	0.00	0.08	0.12	0.00	0.04
O5'	0.05	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.08	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.22	0.18	0.37	0.38	0.09	0.24	0.07	0.04	0.10	0.17	0.15	0.20	0.43	0.52	0.06	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.11	0.30	0.34	0.04	0.15	0.01	0.01	0.04	0.09	0.09	0.13	0.32	0.44	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.03	0.19	0.25	0.02	0.09	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.22	0.35	0.03	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00