Doublet Group distance statistics: 51737

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 10, 6, 3, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.010, 0.028, 0.047, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.003, 0.023, 0.042, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.023 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.005, 0.029, 0.054, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.029 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.002, 0.031, 0.060, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.031 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.009, 0.039, 0.069, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.039 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.006, 0.038, 0.069, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.038 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.005, 0.049, 0.093, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.049 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.013, 0.097, 0.181, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.097 std_dev=0.084
C4'	A	0, 0.065, 0.207, 0.350, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.207 std_dev=0.143
C2'	A	0, -0.009, 0.144, 0.298, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.144 std_dev=0.154
C2	B	0, 0.124, 0.300, 0.476, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.300 std_dev=0.176
N3	B	0, 0.138, 0.325, 0.512, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.325 std_dev=0.187
O5'	A	0, 0.104, 0.294, 0.484, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.294 std_dev=0.190
N2	B	0, 0.127, 0.320, 0.514, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.320 std_dev=0.193
N1	B	0, 0.102, 0.300, 0.498, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.300 std_dev=0.198
C5'	A	0, 0.069, 0.277, 0.486, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.277 std_dev=0.209
P	A	0, 0.130, 0.345, 0.561, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.345 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.134, 0.352, 0.570, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.352 std_dev=0.218
OP2	A	0, 0.170, 0.400, 0.629, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.400 std_dev=0.229
C6	B	0, 0.093, 0.327, 0.561, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.327 std_dev=0.234
O2'	A	0, 0.031, 0.270, 0.510, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.270 std_dev=0.240
C5	B	0, 0.115, 0.354, 0.594, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.354 std_dev=0.240
C3'	A	0, 0.027, 0.270, 0.513, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.270 std_dev=0.243
OP1	A	0, 0.121, 0.373, 0.626, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.373 std_dev=0.252
O6	B	0, 0.069, 0.360, 0.650, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.360 std_dev=0.291
N9	B	0, 0.135, 0.427, 0.718, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.427 std_dev=0.291
N7	B	0, 0.109, 0.419, 0.729, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.419 std_dev=0.310
C8	B	0, 0.122, 0.452, 0.783, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.452 std_dev=0.330
C1'	B	0, 0.163, 0.513, 0.864, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.513 std_dev=0.350
O3'	A	0, -0.005, 0.434, 0.873, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.434 std_dev=0.439
C2'	B	0, 0.124, 0.714, 1.304, 2.538 max_d=2.538 avg_d=0.714 std_dev=0.590
O4'	B	0, 0.096, 0.823, 1.551, 3.522 max_d=3.522 avg_d=0.823 std_dev=0.728
C3'	B	0, 0.060, 0.920, 1.780, 3.161 max_d=3.161 avg_d=0.920 std_dev=0.860
C4'	B	0, 0.110, 0.977, 1.843, 3.771 max_d=3.771 avg_d=0.977 std_dev=0.867
O2'	B	0, 0.027, 0.940, 1.854, 4.315 max_d=4.315 avg_d=0.940 std_dev=0.913
O3'	B	0, 0.084, 1.091, 2.098, 3.937 max_d=3.937 avg_d=1.091 std_dev=1.007
C5'	B	0, -0.253, 1.358, 2.968, 6.682 max_d=6.682 avg_d=1.358 std_dev=1.611
O5'	B	0, -0.594, 1.512, 3.617, 8.153 max_d=8.153 avg_d=1.512 std_dev=2.105
P	B	0, -0.860, 1.936, 4.731, 10.936 max_d=10.936 avg_d=1.936 std_dev=2.796
OP1	B	0, -0.777, 2.305, 5.387, 12.206 max_d=12.206 avg_d=2.305 std_dev=3.082
OP2	B	0, -1.095, 2.330, 5.755, 12.510 max_d=12.510 avg_d=2.330 std_dev=3.425

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.06	0.13	0.08
C2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.14	0.03	0.09	0.11	0.17	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.07	0.09	0.10	0.09	0.07	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.08	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.02	0.13	0.14	0.12	0.09	0.15	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.08	0.10	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.02	0.09	0.10	0.16	0.11
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.04	0.06	0.08	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.03	0.12	0.12	0.17	0.13
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.07	0.04	0.11	0.12	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.12	0.14	0.18	0.14
C8	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.16	0.04	0.12	0.11	0.16	0.12
N1	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.03	0.11	0.12	0.18	0.13
N3	0.03	0.00	0.10	0.09	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.03	0.09	0.10	0.16	0.11
N6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.20	0.04	0.14	0.16	0.20	0.16
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.19	0.04	0.14	0.14	0.17	0.14
N9	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.09	0.09	0.15	0.10
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.12	0.13	0.08	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.11	0.07	0.05
O3'	0.03	0.14	0.02	0.01	0.10	0.03	0.15	0.04	0.17	0.16	0.16	0.11	0.20	0.19	0.07	0.05	0.00	0.03	0.13	0.21	0.20	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.09	0.08	0.15	0.11
O5'	0.06	0.09	0.04	0.08	0.09	0.02	0.12	0.01	0.12	0.12	0.11	0.09	0.14	0.14	0.09	0.05	0.13	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.11	0.07	0.10	0.10	0.06	0.12	0.06	0.14	0.11	0.12	0.10	0.16	0.14	0.09	0.11	0.21	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.17	0.08	0.11	0.16	0.04	0.17	0.02	0.18	0.16	0.18	0.16	0.20	0.17	0.15	0.07	0.20	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.05	0.08	0.11	0.02	0.13	0.02	0.14	0.12	0.13	0.11	0.16	0.14	0.10	0.05	0.17	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.24	0.30	0.37	0.31	0.55	0.33	1.01	0.30	0.35	0.26	0.18	0.27	0.35	0.32	0.37	0.36	0.45	0.93	0.31	1.31	1.05	1.06
C2	0.33	0.14	0.36	0.32	0.26	0.43	0.28	0.59	0.17	0.39	0.12	0.21	0.17	0.38	0.34	0.51	0.39	0.47	0.60	0.17	1.02	0.90	0.77
C2'	0.44	0.28	0.37	0.48	0.38	0.63	0.38	1.06	0.32	0.43	0.26	0.22	0.34	0.41	0.43	0.46	0.49	0.54	1.04	0.31	1.45	1.27	1.23
C3'	0.42	0.25	0.35	0.46	0.35	0.63	0.34	1.11	0.29	0.40	0.23	0.22	0.31	0.38	0.39	0.47	0.46	0.53	1.10	0.28	1.52	1.35	1.30
C4	0.29	0.12	0.28	0.28	0.27	0.42	0.31	0.72	0.26	0.36	0.14	0.14	0.18	0.37	0.31	0.35	0.31	0.41	0.61	0.27	0.99	0.75	0.67
C4'	0.33	0.27	0.33	0.41	0.31	0.62	0.31	1.16	0.29	0.34	0.26	0.25	0.29	0.33	0.33	0.45	0.37	0.50	1.14	0.30	1.59	1.38	1.37
C5	0.28	0.11	0.26	0.22	0.26	0.37	0.31	0.61	0.26	0.36	0.13	0.14	0.17	0.38	0.30	0.36	0.26	0.39	0.54	0.30	0.94	0.83	0.63
C5'	0.30	0.24	0.31	0.37	0.28	0.61	0.29	1.16	0.28	0.31	0.24	0.23	0.25	0.31	0.29	0.42	0.32	0.48	1.12	0.29	1.59	1.34	1.35
C6	0.30	0.11	0.28	0.23	0.25	0.35	0.30	0.50	0.22	0.38	0.11	0.17	0.15	0.39	0.31	0.45	0.27	0.41	0.57	0.25	1.00	1.07	0.77
C8	0.27	0.16	0.26	0.25	0.26	0.43	0.31	0.80	0.30	0.33	0.21	0.13	0.19	0.35	0.29	0.31	0.25	0.40	0.66	0.34	1.06	0.78	0.72
N1	0.32	0.14	0.34	0.28	0.24	0.39	0.28	0.51	0.18	0.40	0.13	0.20	0.16	0.40	0.33	0.54	0.33	0.45	0.63	0.19	1.08	1.13	0.88
N3	0.31	0.13	0.32	0.34	0.27	0.45	0.29	0.71	0.21	0.37	0.11	0.18	0.19	0.36	0.33	0.40	0.39	0.45	0.63	0.20	0.99	0.75	0.70
N6	0.29	0.12	0.28	0.23	0.23	0.34	0.28	0.44	0.21	0.38	0.12	0.17	0.15	0.39	0.30	0.48	0.25	0.40	0.63	0.24	1.05	1.28	0.88
N7	0.27	0.13	0.24	0.20	0.25	0.37	0.31	0.66	0.28	0.35	0.17	0.13	0.17	0.37	0.29	0.32	0.22	0.38	0.55	0.33	0.95	0.79	0.61
N9	0.29	0.17	0.28	0.30	0.28	0.46	0.32	0.85	0.29	0.34	0.21	0.12	0.21	0.35	0.31	0.32	0.30	0.42	0.73	0.31	1.10	0.81	0.80
O2'	0.54	0.38	0.46	0.58	0.47	0.71	0.45	1.16	0.39	0.51	0.35	0.33	0.45	0.47	0.51	0.59	0.59	0.61	1.20	0.36	1.60	1.53	1.45
O3'	0.52	0.32	0.45	0.56	0.41	0.72	0.38	1.19	0.31	0.46	0.27	0.30	0.39	0.42	0.47	0.60	0.57	0.60	1.23	0.29	1.68	1.59	1.50
O4'	0.27	0.24	0.30	0.35	0.27	0.57	0.29	1.09	0.29	0.30	0.26	0.21	0.24	0.31	0.28	0.38	0.31	0.46	1.02	0.31	1.44	1.16	1.19
O5'	0.32	0.25	0.29	0.32	0.31	0.54	0.33	1.04	0.32	0.35	0.27	0.21	0.26	0.36	0.32	0.37	0.29	0.46	0.96	0.34	1.38	1.12	1.12
OP1	0.31	0.24	0.29	0.32	0.30	0.56	0.33	1.09	0.33	0.35	0.27	0.20	0.25	0.37	0.32	0.38	0.29	0.46	1.02	0.37	1.49	1.23	1.23
OP2	0.37	0.28	0.25	0.27	0.35	0.52	0.39	0.93	0.39	0.42	0.32	0.22	0.30	0.43	0.38	0.29	0.25	0.51	0.81	0.43	1.20	0.94	0.92
P	0.32	0.25	0.26	0.28	0.31	0.53	0.34	1.01	0.34	0.36	0.28	0.20	0.26	0.38	0.33	0.34	0.25	0.47	0.92	0.38	1.35	1.06	1.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.19	0.01	0.24	0.02	0.39	0.40	0.34
C2	0.05	0.00	0.22	0.20	0.01	0.37	0.01	0.72	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.19	0.41	0.48	0.01	0.82	0.52	0.42
C2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.12	0.03	0.07	0.10	0.11	0.12	0.17	0.26	0.21	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.19	0.09	0.29	0.25	0.14
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.17	0.01	0.24	0.03	0.24	0.30	0.20	0.25	0.19	0.31	0.17	0.02	0.01	0.03	0.25	0.27	0.26	0.31	0.14
C4	0.02	0.01	0.12	0.17	0.00	0.14	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.22	0.31	0.01	0.58	0.69	0.36
C4'	0.01	0.37	0.03	0.01	0.14	0.00	0.07	0.00	0.10	0.29	0.25	0.49	0.36	0.23	0.07	0.22	0.04	0.00	0.03	0.08	0.23	0.12	0.09
C5	0.02	0.01	0.07	0.24	0.01	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.17	0.10	0.54	0.01	0.78	1.15	0.71
C5'	0.06	0.72	0.10	0.03	0.31	0.00	0.18	0.00	0.27	0.44	0.52	0.96	0.67	0.36	0.12	0.14	0.17	0.04	0.01	0.22	0.17	0.11	0.02
C6	0.03	0.01	0.11	0.24	0.01	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.20	0.18	0.45	0.00	0.74	1.08	0.57
C8	0.02	0.02	0.12	0.30	0.01	0.29	0.01	0.44	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.37	0.12	0.22	0.94	0.02	1.10	1.52	1.21
N1	0.04	0.00	0.17	0.20	0.01	0.25	0.01	0.52	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.19	0.31	0.35	0.01	0.71	0.70	0.29
N2	0.06	0.01	0.26	0.25	0.01	0.49	0.01	0.96	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.27	0.22	0.49	0.74	0.02	1.12	0.71	0.78
N3	0.05	0.00	0.21	0.19	0.01	0.36	0.01	0.67	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.18	0.41	0.44	0.01	0.74	0.44	0.36
N7	0.02	0.01	0.07	0.31	0.01	0.23	0.01	0.36	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.36	0.18	0.13	0.90	0.02	1.13	1.66	1.21
N9	0.01	0.02	0.02	0.17	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.17	0.09	0.04	0.47	0.02	0.62	0.84	0.62
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.10	0.22	0.22	0.14	0.18	0.37	0.11	0.27	0.17	0.36	0.17	0.00	0.06	0.14	0.16	0.23	0.23	0.13	0.14
O3'	0.19	0.19	0.03	0.01	0.14	0.04	0.17	0.17	0.20	0.12	0.19	0.22	0.18	0.18	0.09	0.06	0.00	0.11	0.27	0.23	0.39	0.39	0.21
O4'	0.01	0.41	0.02	0.03	0.22	0.00	0.10	0.04	0.18	0.22	0.31	0.49	0.41	0.13	0.04	0.14	0.11	0.00	0.26	0.13	0.36	0.39	0.37
O5'	0.24	0.48	0.19	0.25	0.31	0.03	0.54	0.01	0.45	0.94	0.35	0.74	0.44	0.90	0.47	0.16	0.27	0.26	0.00	0.57	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.27	0.01	0.08	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.23	0.23	0.13	0.57	0.00	0.85	1.34	0.76
OP1	0.39	0.82	0.29	0.26	0.58	0.23	0.78	0.17	0.74	1.10	0.71	1.12	0.74	1.13	0.62	0.23	0.39	0.36	0.03	0.85	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.52	0.25	0.31	0.69	0.12	1.15	0.11	1.08	1.52	0.70	0.71	0.44	1.66	0.84	0.13	0.39	0.39	0.02	1.34	0.01	0.00	0.01
P	0.34	0.42	0.14	0.14	0.36	0.09	0.71	0.02	0.57	1.21	0.29	0.78	0.36	1.21	0.62	0.14	0.21	0.37	0.01	0.76	0.01	0.01	0.00