Doublet Group distance statistics: 51739

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 2, 9, 4, 3, 2, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.024, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.036, 0.050, 0.065, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.050 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.021, 0.036, 0.051, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.036 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.045, 0.062, 0.080, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.062 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.036, 0.054, 0.072, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.054 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.039, 0.064, 0.089, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.064 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.055, 0.081, 0.108, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.081 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.050, 0.079, 0.108, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.079 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.062, 0.091, 0.120, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.091 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.047, 0.077, 0.107, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.077 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.063, 0.095, 0.128, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.095 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.110, 0.186, 0.261, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.186 std_dev=0.076
O4'	A	0, 0.065, 0.147, 0.229, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.147 std_dev=0.082
C4'	A	0, 0.117, 0.199, 0.282, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.199 std_dev=0.083
C3'	A	0, 0.142, 0.238, 0.333, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.238 std_dev=0.095
C5'	A	0, 0.193, 0.318, 0.443, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.318 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.177, 0.312, 0.447, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.312 std_dev=0.135
C8	B	0, 0.235, 0.386, 0.537, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.386 std_dev=0.151
O4'	B	0, 0.196, 0.351, 0.506, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.351 std_dev=0.155
N9	B	0, 0.219, 0.391, 0.563, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.391 std_dev=0.172
C1'	B	0, 0.252, 0.425, 0.599, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.425 std_dev=0.174
O3'	A	0, 0.131, 0.306, 0.481, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.306 std_dev=0.175
N7	B	0, 0.269, 0.456, 0.644, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.456 std_dev=0.188
C4	B	0, 0.264, 0.471, 0.678, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.471 std_dev=0.207
C5	B	0, 0.283, 0.496, 0.708, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.496 std_dev=0.212
C4'	B	0, 0.275, 0.489, 0.703, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.489 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.273, 0.511, 0.748, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.511 std_dev=0.238
N3	B	0, 0.310, 0.557, 0.804, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.557 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.302, 0.571, 0.839, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.571 std_dev=0.269
C3'	B	0, 0.238, 0.513, 0.788, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.513 std_dev=0.275
C2	B	0, 0.310, 0.602, 0.893, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.602 std_dev=0.291
O6	B	0, 0.322, 0.616, 0.911, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.616 std_dev=0.295
N1	B	0, 0.287, 0.591, 0.896, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.591 std_dev=0.305
N2	B	0, 0.362, 0.700, 1.037, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.700 std_dev=0.337
C5'	B	0, 0.256, 0.604, 0.952, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.604 std_dev=0.348
O2'	B	0, 0.337, 0.692, 1.047, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.692 std_dev=0.355
O5'	B	0, 0.186, 0.551, 0.916, 1.918 max_d=1.918 avg_d=0.551 std_dev=0.365
O3'	B	0, 0.224, 0.676, 1.129, 2.455 max_d=2.455 avg_d=0.676 std_dev=0.453
P	B	0, 0.097, 0.651, 1.205, 3.168 max_d=3.168 avg_d=0.651 std_dev=0.554
OP1	B	0, 0.269, 0.837, 1.406, 3.150 max_d=3.150 avg_d=0.837 std_dev=0.569
OP2	B	0, 0.186, 0.879, 1.572, 3.990 max_d=3.990 avg_d=0.879 std_dev=0.693
O5'	A	0, 1.223, 2.094, 2.966, 2.809 max_d=2.809 avg_d=2.094 std_dev=0.872
P	A	0, 1.228, 2.154, 3.080, 3.250 max_d=3.250 avg_d=2.154 std_dev=0.926
OP2	A	0, 1.224, 2.171, 3.117, 4.077 max_d=4.077 avg_d=2.171 std_dev=0.947
OP1	A	0, 1.413, 2.377, 3.341, 3.382 max_d=3.382 avg_d=2.377 std_dev=0.964

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.14	0.27	0.40	0.23
C2	0.05	0.00	0.08	0.07	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.14	0.06	0.17	0.32	0.51	0.30
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.04	0.05	0.06	0.09	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.30	0.43	0.27
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.07	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.32	0.29	0.38	0.25
C4	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.19	0.33	0.53	0.32
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.19	0.23	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.24	0.36	0.61	0.37
C5'	0.02	0.06	0.05	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.07	0.09	0.06	0.07	0.09	0.10	0.06	0.04	0.06	0.02	0.01	0.20	0.35	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.24	0.37	0.62	0.38
C8	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.06	0.04	0.27	0.37	0.61	0.39
N1	0.04	0.01	0.06	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.05	0.20	0.34	0.57	0.35
N3	0.05	0.01	0.09	0.07	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.14	0.07	0.15	0.30	0.47	0.28
N6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.03	0.27	0.39	0.67	0.42
N7	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.06	0.03	0.29	0.39	0.65	0.41
N9	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.20	0.33	0.52	0.32
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.09	0.13	0.06	0.08	0.03	0.00	0.06	0.02	0.34	0.35	0.45	0.32
O3'	0.07	0.14	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.06	0.09	0.06	0.12	0.14	0.08	0.06	0.07	0.06	0.00	0.05	0.26	0.27	0.29	0.21
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.07	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.24	0.31	0.33	0.26
O5'	0.14	0.17	0.28	0.32	0.19	0.02	0.24	0.01	0.24	0.27	0.20	0.15	0.27	0.29	0.20	0.34	0.26	0.24	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.27	0.32	0.30	0.29	0.33	0.19	0.36	0.20	0.37	0.37	0.34	0.30	0.39	0.39	0.33	0.35	0.27	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.51	0.43	0.38	0.53	0.23	0.61	0.35	0.62	0.61	0.57	0.47	0.67	0.65	0.52	0.45	0.29	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.30	0.27	0.25	0.32	0.06	0.37	0.03	0.38	0.39	0.35	0.28	0.42	0.41	0.32	0.32	0.21	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.15	0.06	0.09	0.14	0.11	0.15	0.21	0.17	0.12	0.17	0.13	0.13	0.14	0.11	0.17	0.33	0.09	0.16	0.17	0.43	0.59	0.34
C2	0.16	0.14	0.16	0.17	0.14	0.18	0.14	0.21	0.12	0.17	0.12	0.16	0.15	0.18	0.16	0.16	0.28	0.18	0.23	0.13	0.38	0.48	0.28
C2'	0.09	0.14	0.08	0.08	0.12	0.09	0.14	0.22	0.15	0.13	0.15	0.14	0.13	0.14	0.11	0.19	0.29	0.10	0.24	0.16	0.45	0.63	0.39
C3'	0.17	0.17	0.16	0.10	0.17	0.17	0.17	0.33	0.17	0.18	0.18	0.17	0.17	0.17	0.17	0.28	0.22	0.18	0.33	0.18	0.52	0.70	0.47
C4	0.11	0.07	0.10	0.14	0.08	0.15	0.11	0.18	0.13	0.11	0.10	0.07	0.07	0.13	0.09	0.14	0.33	0.14	0.16	0.15	0.39	0.53	0.28
C4'	0.18	0.21	0.17	0.12	0.20	0.18	0.19	0.30	0.20	0.17	0.21	0.21	0.21	0.17	0.18	0.30	0.29	0.19	0.24	0.20	0.42	0.59	0.36
C5	0.12	0.08	0.11	0.14	0.10	0.15	0.14	0.16	0.16	0.12	0.11	0.10	0.10	0.15	0.11	0.16	0.35	0.14	0.17	0.19	0.34	0.50	0.24
C5'	0.19	0.26	0.19	0.16	0.22	0.18	0.21	0.29	0.24	0.18	0.26	0.28	0.25	0.18	0.19	0.33	0.35	0.20	0.22	0.23	0.38	0.56	0.32
C6	0.15	0.14	0.14	0.16	0.14	0.17	0.15	0.18	0.14	0.16	0.10	0.18	0.16	0.18	0.14	0.18	0.34	0.17	0.22	0.18	0.31	0.47	0.23
C8	0.07	0.16	0.11	0.13	0.11	0.13	0.15	0.17	0.19	0.09	0.20	0.15	0.12	0.13	0.07	0.19	0.39	0.10	0.13	0.21	0.36	0.53	0.26
N1	0.17	0.18	0.16	0.17	0.16	0.18	0.16	0.20	0.13	0.18	0.14	0.20	0.17	0.19	0.17	0.18	0.30	0.18	0.24	0.14	0.33	0.46	0.25
N3	0.13	0.09	0.13	0.16	0.10	0.17	0.11	0.20	0.11	0.13	0.09	0.10	0.10	0.14	0.12	0.14	0.28	0.17	0.18	0.13	0.42	0.53	0.31
N6	0.16	0.18	0.15	0.16	0.15	0.17	0.17	0.18	0.17	0.17	0.14	0.23	0.18	0.19	0.15	0.20	0.36	0.16	0.23	0.23	0.27	0.45	0.21
N7	0.10	0.12	0.12	0.14	0.10	0.14	0.15	0.16	0.19	0.11	0.18	0.12	0.10	0.14	0.09	0.18	0.39	0.11	0.15	0.23	0.33	0.50	0.24
N9	0.06	0.12	0.08	0.12	0.10	0.14	0.13	0.18	0.16	0.09	0.16	0.11	0.10	0.12	0.06	0.15	0.36	0.10	0.13	0.18	0.39	0.55	0.29
O2'	0.12	0.11	0.12	0.15	0.13	0.13	0.15	0.19	0.15	0.17	0.13	0.11	0.11	0.17	0.14	0.14	0.31	0.14	0.30	0.17	0.46	0.62	0.40
O3'	0.24	0.20	0.22	0.16	0.23	0.23	0.23	0.41	0.22	0.26	0.21	0.18	0.21	0.25	0.24	0.33	0.13	0.25	0.46	0.22	0.63	0.79	0.59
O4'	0.15	0.21	0.13	0.09	0.20	0.16	0.20	0.26	0.21	0.17	0.22	0.19	0.20	0.18	0.17	0.25	0.32	0.17	0.17	0.21	0.41	0.56	0.32
O5'	0.33	0.35	0.47	0.38	0.30	0.31	0.27	0.34	0.28	0.25	0.32	0.39	0.35	0.25	0.29	0.67	0.53	0.19	0.22	0.25	0.37	0.50	0.27
OP1	0.31	0.38	0.46	0.37	0.32	0.28	0.29	0.29	0.30	0.26	0.34	0.43	0.37	0.27	0.29	0.66	0.53	0.20	0.17	0.29	0.31	0.47	0.22
OP2	0.30	0.47	0.44	0.36	0.40	0.21	0.41	0.22	0.44	0.33	0.46	0.50	0.44	0.36	0.34	0.61	0.49	0.18	0.20	0.44	0.29	0.32	0.15
P	0.29	0.35	0.45	0.36	0.30	0.26	0.28	0.30	0.29	0.25	0.32	0.39	0.34	0.25	0.28	0.64	0.50	0.15	0.22	0.28	0.33	0.46	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.16	0.01	0.14	0.03	0.25	0.23	0.10
C2	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.22	0.06	0.23	0.01	0.17	0.28	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.11	0.03	0.07	0.03	0.09	0.06	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.23	0.05	0.25	0.22	0.23
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.06	0.04	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.18	0.06	0.24	0.24	0.14
C4	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.08	0.17	0.03	0.25	0.02	0.19	0.25	0.10
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.08	0.04	0.09	0.06	0.07	0.03	0.11	0.02	0.00	0.01	0.07	0.22	0.22	0.07
C5	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.13	0.02	0.31	0.02	0.15	0.24	0.14
C5'	0.05	0.07	0.11	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.15	0.19	0.10	0.08	0.06	0.20	0.11	0.06	0.11	0.01	0.01	0.20	0.14	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.15	0.03	0.33	0.01	0.13	0.25	0.15
C8	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.08	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.04	0.32	0.04	0.18	0.21	0.14
N1	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.18	0.05	0.28	0.01	0.15	0.26	0.12
N2	0.05	0.01	0.09	0.06	0.02	0.09	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.11	0.25	0.08	0.20	0.02	0.19	0.30	0.10
N3	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.22	0.06	0.20	0.01	0.20	0.28	0.09
N7	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.20	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.09	0.03	0.35	0.05	0.15	0.23	0.17
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.12	0.01	0.24	0.03	0.21	0.23	0.10
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.08	0.11	0.12	0.06	0.12	0.13	0.09	0.11	0.07	0.14	0.08	0.00	0.04	0.06	0.17	0.14	0.29	0.22	0.23
O3'	0.16	0.22	0.03	0.01	0.17	0.02	0.13	0.11	0.15	0.08	0.18	0.25	0.22	0.09	0.12	0.04	0.00	0.11	0.24	0.14	0.26	0.27	0.17
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.05	0.33	0.31	0.16
O5'	0.14	0.23	0.23	0.18	0.25	0.01	0.31	0.01	0.33	0.32	0.28	0.20	0.20	0.35	0.24	0.17	0.24	0.09	0.00	0.38	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.05	0.06	0.02	0.07	0.02	0.20	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.14	0.14	0.05	0.38	0.00	0.14	0.25	0.19
OP1	0.25	0.17	0.25	0.24	0.19	0.22	0.15	0.14	0.13	0.18	0.15	0.19	0.20	0.15	0.21	0.29	0.26	0.33	0.02	0.14	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.28	0.22	0.24	0.25	0.22	0.24	0.20	0.25	0.21	0.26	0.30	0.28	0.23	0.23	0.22	0.27	0.31	0.02	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.10	0.23	0.14	0.10	0.07	0.14	0.01	0.15	0.14	0.12	0.10	0.09	0.17	0.10	0.23	0.17	0.16	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00