Doublet Group distance statistics: 51740

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 6, 4, 3, 2, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.013, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.003, 0.023, 0.042, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.023 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.027 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.003, 0.025, 0.047, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.025 std_dev=0.022
C5	B	0, 0.127, 0.266, 0.405, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.266 std_dev=0.139
C6	B	0, 0.101, 0.264, 0.427, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.264 std_dev=0.163
N7	B	0, 0.129, 0.292, 0.456, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.292 std_dev=0.164
C4	B	0, 0.108, 0.297, 0.485, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.297 std_dev=0.189
O6	B	0, 0.089, 0.278, 0.468, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.278 std_dev=0.190
C8	B	0, 0.122, 0.321, 0.520, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.321 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.112, 0.316, 0.520, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.316 std_dev=0.204
N9	B	0, 0.082, 0.319, 0.557, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.319 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.122, 0.360, 0.599, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.360 std_dev=0.239
N3	B	0, 0.098, 0.345, 0.593, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.345 std_dev=0.248
N2	B	0, 0.129, 0.444, 0.758, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.444 std_dev=0.314
OP2	B	0, 0.142, 0.479, 0.816, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.479 std_dev=0.337
O5'	B	0, 0.142, 0.489, 0.835, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.489 std_dev=0.347
P	B	0, 0.164, 0.513, 0.862, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.513 std_dev=0.349
OP1	B	0, 0.255, 0.625, 0.995, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.625 std_dev=0.370
C1'	B	0, -0.010, 0.364, 0.739, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.364 std_dev=0.374
O4'	A	0, -0.160, 0.220, 0.599, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.220 std_dev=0.380
C5'	B	0, 0.088, 0.525, 0.962, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.525 std_dev=0.437
O4'	B	0, 0.009, 0.455, 0.901, 1.969 max_d=1.969 avg_d=0.455 std_dev=0.446
C3'	B	0, -0.049, 0.400, 0.850, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.400 std_dev=0.450
C2'	B	0, -0.095, 0.356, 0.807, 1.977 max_d=1.977 avg_d=0.356 std_dev=0.451
C4'	B	0, 0.010, 0.468, 0.927, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.468 std_dev=0.459
C2'	A	0, -0.209, 0.251, 0.710, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.251 std_dev=0.460
C3'	A	0, -0.177, 0.308, 0.793, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.308 std_dev=0.485
C4'	A	0, -0.192, 0.314, 0.820, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.314 std_dev=0.506
OP2	A	0, -0.024, 0.520, 1.065, 2.313 max_d=2.313 avg_d=0.520 std_dev=0.544
O5'	A	0, -0.111, 0.443, 0.997, 2.614 max_d=2.614 avg_d=0.443 std_dev=0.554
P	A	0, -0.058, 0.497, 1.052, 2.617 max_d=2.617 avg_d=0.497 std_dev=0.555
OP1	A	0, -0.060, 0.536, 1.131, 3.032 max_d=3.032 avg_d=0.536 std_dev=0.595
O3'	B	0, -0.190, 0.437, 1.063, 2.823 max_d=2.823 avg_d=0.437 std_dev=0.627
O3'	A	0, -0.243, 0.428, 1.099, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.428 std_dev=0.671
C5'	A	0, -0.283, 0.486, 1.254, 2.544 max_d=2.544 avg_d=0.486 std_dev=0.768
O2'	A	0, -0.324, 0.446, 1.216, 2.527 max_d=2.527 avg_d=0.446 std_dev=0.770
O2'	B	0, -0.356, 0.425, 1.206, 3.879 max_d=3.879 avg_d=0.425 std_dev=0.781

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.28	0.00	0.09	0.11	0.25	0.14
C2	0.03	0.00	0.33	0.14	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.44	0.13	0.17	0.16	0.16	0.22	0.16
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.18	0.03	0.09	0.17	0.15	0.14	0.26	0.33	0.11	0.06	0.02	0.00	0.06	0.02	0.23	0.30	0.57	0.38
C3'	0.03	0.14	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.09	0.13	0.11	0.13	0.10	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.20	0.23	0.39	0.27
C4	0.01	0.01	0.18	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.13	0.08	0.12	0.14	0.21	0.14
C4'	0.01	0.10	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.09	0.10	0.06	0.03	0.01	0.13	0.04	0.00	0.02	0.04	0.13	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.13	0.04	0.11	0.14	0.19	0.14
C5'	0.06	0.19	0.17	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.16	0.09	0.18	0.17	0.16	0.11	0.08	0.08	0.16	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.15	0.09	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.09	0.06	0.13	0.15	0.19	0.15
C8	0.01	0.01	0.14	0.13	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.24	0.09	0.10	0.12	0.21	0.14
N1	0.02	0.00	0.26	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.40	0.09	0.12	0.15	0.17	0.21	0.16
N3	0.03	0.00	0.33	0.13	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.40	0.13	0.18	0.15	0.15	0.21	0.15
N6	0.02	0.01	0.11	0.10	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.28	0.10	0.05	0.12	0.16	0.19	0.15
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.19	0.07	0.10	0.13	0.20	0.14
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.20	0.02	0.10	0.12	0.22	0.14
O2'	0.01	0.44	0.00	0.02	0.28	0.13	0.24	0.08	0.31	0.07	0.40	0.40	0.28	0.10	0.12	0.00	0.09	0.08	0.14	0.23	0.62	0.33
O3'	0.28	0.13	0.06	0.01	0.13	0.04	0.13	0.16	0.09	0.24	0.09	0.13	0.10	0.19	0.20	0.09	0.00	0.22	0.18	0.26	0.43	0.28
O4'	0.00	0.17	0.02	0.01	0.08	0.00	0.04	0.02	0.06	0.09	0.12	0.18	0.05	0.07	0.02	0.08	0.22	0.00	0.20	0.21	0.18	0.20
O5'	0.09	0.16	0.23	0.20	0.12	0.02	0.11	0.01	0.13	0.10	0.15	0.15	0.12	0.10	0.10	0.14	0.18	0.20	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.11	0.16	0.30	0.23	0.14	0.04	0.14	0.06	0.15	0.12	0.17	0.15	0.16	0.13	0.12	0.23	0.26	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.22	0.57	0.39	0.21	0.13	0.19	0.10	0.19	0.21	0.21	0.21	0.19	0.20	0.22	0.62	0.43	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.16	0.38	0.27	0.14	0.05	0.14	0.01	0.15	0.14	0.16	0.15	0.15	0.14	0.14	0.33	0.28	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.23	0.17	0.08	0.12	0.08	0.09	0.10	0.14	0.13	0.17	0.09	0.13	0.11	0.46	0.22	0.14	0.10	0.16	0.10	0.14	0.10
C2	0.17	0.20	0.30	0.20	0.14	0.18	0.14	0.15	0.15	0.16	0.19	0.26	0.17	0.16	0.15	0.58	0.22	0.21	0.14	0.18	0.15	0.19	0.15
C2'	0.14	0.33	0.26	0.19	0.17	0.19	0.13	0.24	0.17	0.14	0.29	0.43	0.26	0.16	0.13	0.46	0.21	0.19	0.26	0.16	0.37	0.40	0.35
C3'	0.20	0.17	0.23	0.20	0.22	0.24	0.27	0.22	0.27	0.29	0.21	0.18	0.17	0.32	0.23	0.43	0.17	0.30	0.21	0.34	0.16	0.15	0.16
C4	0.15	0.14	0.26	0.18	0.09	0.14	0.08	0.11	0.10	0.14	0.13	0.19	0.11	0.14	0.12	0.50	0.23	0.15	0.12	0.16	0.12	0.17	0.13
C4'	0.18	0.18	0.28	0.21	0.17	0.20	0.19	0.19	0.20	0.20	0.19	0.20	0.17	0.21	0.17	0.54	0.23	0.24	0.19	0.25	0.18	0.18	0.18
C5	0.18	0.16	0.26	0.19	0.12	0.17	0.07	0.15	0.08	0.15	0.14	0.19	0.15	0.13	0.15	0.50	0.26	0.16	0.16	0.13	0.16	0.21	0.17
C5'	0.22	0.26	0.35	0.23	0.20	0.22	0.20	0.22	0.23	0.17	0.26	0.31	0.24	0.19	0.19	0.66	0.28	0.24	0.24	0.28	0.26	0.27	0.26
C6	0.21	0.19	0.29	0.21	0.13	0.19	0.07	0.17	0.09	0.15	0.15	0.22	0.19	0.13	0.16	0.55	0.27	0.19	0.18	0.13	0.18	0.24	0.20
C8	0.17	0.13	0.23	0.18	0.12	0.15	0.10	0.14	0.10	0.17	0.13	0.16	0.12	0.15	0.15	0.42	0.26	0.15	0.15	0.15	0.14	0.18	0.15
N1	0.20	0.21	0.31	0.21	0.14	0.19	0.12	0.17	0.13	0.16	0.17	0.26	0.19	0.15	0.16	0.60	0.24	0.21	0.16	0.15	0.16	0.23	0.18
N3	0.15	0.16	0.28	0.19	0.11	0.16	0.12	0.12	0.14	0.15	0.17	0.22	0.13	0.15	0.13	0.54	0.21	0.18	0.12	0.18	0.13	0.16	0.13
N6	0.26	0.20	0.31	0.24	0.17	0.24	0.07	0.23	0.09	0.16	0.15	0.23	0.23	0.11	0.20	0.55	0.31	0.23	0.24	0.11	0.23	0.28	0.25
N7	0.20	0.16	0.25	0.20	0.15	0.18	0.12	0.17	0.12	0.19	0.15	0.18	0.16	0.16	0.18	0.43	0.28	0.17	0.18	0.14	0.18	0.22	0.19
N9	0.14	0.12	0.24	0.17	0.08	0.13	0.07	0.10	0.08	0.14	0.12	0.16	0.09	0.13	0.12	0.46	0.23	0.14	0.11	0.15	0.11	0.15	0.12
O2'	0.42	0.70	0.47	0.43	0.51	0.48	0.47	0.58	0.58	0.34	0.71	0.79	0.61	0.34	0.42	0.55	0.43	0.48	0.60	0.55	0.72	0.75	0.72
O3'	0.14	0.18	0.22	0.16	0.16	0.21	0.19	0.23	0.21	0.21	0.20	0.23	0.15	0.23	0.16	0.46	0.14	0.24	0.24	0.26	0.24	0.24	0.24
O4'	0.19	0.17	0.30	0.25	0.15	0.23	0.14	0.22	0.14	0.17	0.16	0.21	0.17	0.16	0.17	0.53	0.28	0.23	0.23	0.18	0.22	0.22	0.21
O5'	0.19	0.19	0.33	0.20	0.19	0.19	0.21	0.18	0.22	0.21	0.20	0.22	0.19	0.23	0.19	0.64	0.22	0.23	0.18	0.26	0.18	0.17	0.17
OP1	0.16	0.17	0.30	0.18	0.18	0.21	0.22	0.20	0.23	0.21	0.20	0.18	0.16	0.24	0.18	0.61	0.17	0.26	0.19	0.27	0.20	0.17	0.18
OP2	0.14	0.16	0.30	0.13	0.17	0.16	0.21	0.14	0.24	0.20	0.20	0.17	0.15	0.23	0.16	0.60	0.14	0.23	0.13	0.29	0.17	0.12	0.12
P	0.15	0.17	0.30	0.16	0.18	0.18	0.22	0.17	0.24	0.21	0.21	0.17	0.15	0.25	0.17	0.61	0.15	0.23	0.16	0.29	0.15	0.12	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.10	0.01	0.10	0.16	0.11
C2	0.03	0.00	0.21	0.08	0.01	0.12	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.36	0.08	0.20	0.13	0.01	0.12	0.17	0.12
C2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.11	0.01	0.07	0.13	0.11	0.10	0.17	0.25	0.21	0.06	0.03	0.00	0.03	0.02	0.26	0.10	0.27	0.36	0.29
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.10	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.11	0.09	0.07
C4	0.01	0.01	0.11	0.04	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.10	0.09	0.12	0.01	0.13	0.19	0.14
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.09	0.15	0.10	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.05	0.12	0.01	0.14	0.19	0.15
C5'	0.05	0.10	0.13	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.09	0.13	0.08	0.11	0.08	0.06	0.11	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.06	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.10	0.09	0.13	0.01	0.14	0.18	0.14
C8	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.15	0.08	0.12	0.01	0.14	0.19	0.16
N1	0.02	0.00	0.17	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.08	0.15	0.13	0.01	0.13	0.17	0.13
N2	0.04	0.01	0.25	0.10	0.01	0.15	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.41	0.09	0.24	0.14	0.01	0.13	0.15	0.11
N3	0.02	0.01	0.21	0.07	0.00	0.10	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.08	0.19	0.11	0.01	0.12	0.18	0.12
N7	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.04	0.13	0.01	0.14	0.19	0.16
N9	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.13	0.01	0.12	0.01	0.12	0.19	0.14
O2'	0.02	0.36	0.00	0.02	0.20	0.09	0.17	0.06	0.24	0.12	0.32	0.41	0.32	0.09	0.06	0.00	0.07	0.05	0.26	0.23	0.29	0.45	0.31
O3'	0.15	0.08	0.03	0.01	0.10	0.02	0.11	0.11	0.10	0.15	0.08	0.09	0.08	0.14	0.13	0.07	0.00	0.11	0.08	0.11	0.19	0.08	0.11
O4'	0.00	0.20	0.02	0.01	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.08	0.15	0.24	0.19	0.04	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.07	0.07	0.12	0.09
O5'	0.10	0.13	0.26	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.13	0.12	0.13	0.14	0.11	0.13	0.12	0.26	0.08	0.07	0.00	0.13	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.11	0.07	0.13	0.00	0.14	0.18	0.15
OP1	0.10	0.12	0.27	0.11	0.13	0.06	0.14	0.05	0.14	0.14	0.13	0.13	0.12	0.14	0.12	0.29	0.19	0.07	0.02	0.14	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.17	0.36	0.09	0.19	0.04	0.19	0.02	0.18	0.19	0.17	0.15	0.18	0.19	0.19	0.45	0.08	0.12	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.12	0.29	0.07	0.14	0.02	0.15	0.01	0.14	0.16	0.13	0.11	0.12	0.16	0.14	0.31	0.11	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00