Doublet Group distance statistics: 51745

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 6, 1, 0, 2, 1, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.013, 0.029, 0.046, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.012, 0.028, 0.045, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.028 std_dev=0.016
O4'	A	0, 0.161, 0.292, 0.422, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.292 std_dev=0.130
C2'	A	0, 0.157, 0.303, 0.448, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.303 std_dev=0.146
N2	B	0, 0.272, 0.453, 0.633, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.453 std_dev=0.181
O2'	A	0, 0.147, 0.343, 0.538, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.343 std_dev=0.195
C4'	A	0, 0.259, 0.458, 0.657, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.458 std_dev=0.199
C2	B	0, 0.250, 0.468, 0.686, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.468 std_dev=0.218
C3'	A	0, 0.269, 0.488, 0.707, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.488 std_dev=0.219
N1	B	0, 0.330, 0.561, 0.793, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.561 std_dev=0.231
P	A	0, 0.327, 0.565, 0.803, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.565 std_dev=0.238
OP2	A	0, 0.221, 0.478, 0.734, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.478 std_dev=0.257
O5'	A	0, 0.265, 0.553, 0.841, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.553 std_dev=0.288
N3	B	0, 0.229, 0.525, 0.820, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.525 std_dev=0.295
C6	B	0, 0.409, 0.713, 1.017, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.713 std_dev=0.304
C5'	A	0, 0.395, 0.717, 1.039, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.717 std_dev=0.322
O3'	A	0, 0.457, 0.788, 1.120, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.788 std_dev=0.332
O6	B	0, 0.529, 0.862, 1.194, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.862 std_dev=0.333
C4	B	0, 0.295, 0.651, 1.007, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.651 std_dev=0.356
OP1	A	0, 0.462, 0.818, 1.174, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.818 std_dev=0.356
C5	B	0, 0.387, 0.746, 1.105, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.746 std_dev=0.359
N9	B	0, 0.390, 0.816, 1.243, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.816 std_dev=0.427
N7	B	0, 0.498, 0.936, 1.374, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.936 std_dev=0.438
C1'	B	0, 0.436, 0.902, 1.368, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.902 std_dev=0.466
C8	B	0, 0.494, 0.961, 1.428, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.961 std_dev=0.467
O2'	B	0, 0.464, 0.949, 1.433, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.949 std_dev=0.484
C2'	B	0, 0.421, 0.971, 1.520, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.971 std_dev=0.549
O4'	B	0, 0.639, 1.299, 1.959, 2.765 max_d=2.765 avg_d=1.299 std_dev=0.660
C3'	B	0, 0.491, 1.322, 2.152, 3.898 max_d=3.898 avg_d=1.322 std_dev=0.830
C4'	B	0, 0.591, 1.462, 2.334, 4.023 max_d=4.023 avg_d=1.462 std_dev=0.872
O3'	B	0, 0.473, 1.442, 2.412, 4.641 max_d=4.641 avg_d=1.442 std_dev=0.970
O5'	B	0, 0.852, 2.039, 3.226, 6.036 max_d=6.036 avg_d=2.039 std_dev=1.187
C5'	B	0, 0.624, 1.863, 3.102, 6.017 max_d=6.017 avg_d=1.863 std_dev=1.239
P	B	0, 0.907, 2.438, 3.969, 7.761 max_d=7.761 avg_d=2.438 std_dev=1.531
OP1	B	0, 1.081, 2.719, 4.357, 8.012 max_d=8.012 avg_d=2.719 std_dev=1.638
OP2	B	0, 0.745, 2.544, 4.344, 9.198 max_d=9.198 avg_d=2.544 std_dev=1.800

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.06	0.18	0.11
C2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.03	0.12	0.13	0.27	0.18
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.01	0.07	0.05	0.09	0.10	0.07	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.09	0.10	0.09	0.09	0.10	0.10	0.05	0.03	0.01	0.02	0.05	0.15	0.11	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.02	0.12	0.12	0.26	0.17
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.04	0.06	0.07	0.03	0.07	0.05	0.00	0.01	0.08	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.16	0.17	0.30	0.21
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.05	0.12	0.12	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.11	0.02	0.17	0.19	0.32	0.22
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.15	0.16	0.27	0.19
N1	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.03	0.15	0.16	0.30	0.20
N3	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.11	0.03	0.11	0.10	0.25	0.16
N6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.13	0.02	0.19	0.23	0.34	0.25
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.18	0.20	0.32	0.22
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.11	0.11	0.24	0.15
O2'	0.02	0.15	0.01	0.03	0.08	0.07	0.07	0.06	0.10	0.03	0.13	0.14	0.09	0.04	0.03	0.00	0.15	0.05	0.05	0.14	0.10	0.06
O3'	0.05	0.12	0.07	0.01	0.07	0.05	0.10	0.03	0.11	0.11	0.12	0.11	0.13	0.12	0.05	0.15	0.00	0.05	0.09	0.25	0.22	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.07	0.19	0.13
O5'	0.06	0.12	0.05	0.05	0.12	0.01	0.16	0.01	0.17	0.15	0.15	0.11	0.19	0.18	0.11	0.05	0.09	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.13	0.11	0.15	0.12	0.08	0.17	0.08	0.19	0.16	0.16	0.10	0.23	0.20	0.11	0.14	0.25	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.18	0.27	0.12	0.11	0.26	0.05	0.30	0.03	0.32	0.27	0.30	0.25	0.34	0.32	0.24	0.10	0.22	0.19	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.11	0.18	0.07	0.08	0.17	0.03	0.21	0.01	0.22	0.19	0.20	0.16	0.25	0.22	0.15	0.06	0.16	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.19	0.32	0.34	0.17	0.60	0.20	0.82	0.24	0.20	0.23	0.24	0.17	0.21	0.19	0.42	0.43	0.53	0.76	0.27	1.00	1.24	0.94
C2	0.26	0.18	0.27	0.37	0.15	0.58	0.20	0.78	0.26	0.23	0.23	0.23	0.15	0.23	0.20	0.31	0.42	0.53	0.78	0.31	1.08	1.18	0.94
C2'	0.29	0.23	0.35	0.44	0.22	0.70	0.25	0.96	0.27	0.26	0.26	0.27	0.21	0.27	0.24	0.46	0.55	0.58	0.87	0.30	1.10	1.41	1.08
C3'	0.27	0.19	0.33	0.42	0.19	0.68	0.21	0.96	0.23	0.24	0.22	0.24	0.18	0.23	0.22	0.45	0.52	0.57	0.87	0.26	1.13	1.44	1.10
C4	0.24	0.15	0.27	0.32	0.14	0.56	0.18	0.77	0.22	0.20	0.20	0.23	0.14	0.20	0.19	0.34	0.39	0.52	0.75	0.27	1.06	1.19	0.93
C4'	0.24	0.18	0.33	0.35	0.17	0.61	0.18	0.86	0.20	0.19	0.20	0.22	0.17	0.19	0.19	0.44	0.44	0.54	0.78	0.24	1.02	1.30	0.98
C5	0.25	0.17	0.27	0.30	0.17	0.51	0.17	0.70	0.18	0.21	0.16	0.24	0.18	0.20	0.21	0.31	0.36	0.49	0.70	0.25	1.08	1.11	0.89
C5'	0.22	0.16	0.33	0.32	0.14	0.57	0.15	0.82	0.17	0.16	0.17	0.21	0.16	0.16	0.17	0.43	0.40	0.52	0.75	0.20	1.02	1.26	0.96
C6	0.28	0.21	0.28	0.31	0.21	0.48	0.19	0.65	0.18	0.24	0.19	0.25	0.22	0.22	0.24	0.31	0.35	0.46	0.67	0.26	1.09	1.03	0.85
C8	0.23	0.13	0.29	0.30	0.15	0.53	0.17	0.74	0.18	0.19	0.15	0.20	0.15	0.19	0.18	0.35	0.37	0.50	0.71	0.24	1.06	1.16	0.91
N1	0.29	0.19	0.29	0.34	0.18	0.50	0.17	0.67	0.21	0.24	0.19	0.24	0.20	0.22	0.24	0.31	0.38	0.47	0.70	0.30	1.10	1.06	0.87
N3	0.25	0.19	0.27	0.37	0.16	0.61	0.21	0.83	0.26	0.22	0.25	0.25	0.15	0.23	0.20	0.34	0.43	0.55	0.79	0.30	1.05	1.23	0.96
N6	0.31	0.25	0.31	0.32	0.26	0.44	0.24	0.57	0.22	0.29	0.24	0.28	0.26	0.27	0.28	0.32	0.35	0.43	0.60	0.27	1.08	0.90	0.78
N7	0.24	0.17	0.28	0.30	0.18	0.50	0.18	0.69	0.18	0.21	0.15	0.23	0.18	0.21	0.21	0.32	0.35	0.48	0.68	0.23	1.07	1.10	0.88
N9	0.23	0.15	0.29	0.32	0.15	0.57	0.18	0.79	0.21	0.19	0.19	0.21	0.14	0.20	0.18	0.37	0.39	0.52	0.74	0.26	1.04	1.21	0.94
O2'	0.31	0.29	0.38	0.46	0.27	0.71	0.29	0.96	0.31	0.29	0.30	0.32	0.27	0.30	0.28	0.50	0.59	0.58	0.85	0.33	1.01	1.36	1.03
O3'	0.32	0.20	0.39	0.51	0.21	0.76	0.23	1.05	0.24	0.27	0.22	0.23	0.20	0.26	0.26	0.50	0.63	0.61	0.95	0.27	1.19	1.54	1.18
O4'	0.23	0.17	0.33	0.31	0.16	0.55	0.17	0.77	0.20	0.18	0.20	0.21	0.16	0.18	0.18	0.43	0.38	0.51	0.71	0.24	0.96	1.18	0.90
O5'	0.20	0.17	0.29	0.28	0.15	0.55	0.16	0.79	0.18	0.17	0.18	0.22	0.16	0.17	0.16	0.39	0.36	0.50	0.73	0.21	1.05	1.25	0.95
OP1	0.22	0.17	0.31	0.28	0.16	0.55	0.17	0.81	0.20	0.18	0.18	0.21	0.17	0.19	0.17	0.42	0.36	0.51	0.74	0.24	1.09	1.27	0.98
OP2	0.22	0.27	0.25	0.29	0.27	0.54	0.33	0.78	0.38	0.31	0.35	0.25	0.23	0.35	0.25	0.28	0.35	0.52	0.74	0.44	1.13	1.23	0.97
P	0.18	0.17	0.26	0.24	0.16	0.52	0.20	0.76	0.23	0.20	0.20	0.18	0.15	0.22	0.17	0.34	0.31	0.49	0.70	0.27	1.05	1.20	0.93

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.15	0.03	0.27	0.20	0.15
C2	0.05	0.00	0.25	0.24	0.01	0.22	0.01	0.33	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.26	0.29	0.38	0.01	0.59	0.54	0.43
C2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.14	0.02	0.10	0.04	0.14	0.10	0.21	0.30	0.25	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.22	0.12	0.34	0.13	0.20
C3'	0.03	0.24	0.01	0.00	0.19	0.01	0.22	0.03	0.24	0.20	0.25	0.26	0.22	0.23	0.14	0.02	0.01	0.02	0.25	0.25	0.32	0.09	0.20
C4	0.03	0.01	0.14	0.19	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.15	0.32	0.01	0.49	0.37	0.32
C4'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.10	0.00	0.09	0.01	0.11	0.19	0.17	0.29	0.21	0.16	0.07	0.12	0.05	0.01	0.03	0.11	0.13	0.23	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.22	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.21	0.09	0.37	0.01	0.53	0.40	0.36
C5'	0.06	0.33	0.04	0.03	0.19	0.01	0.21	0.00	0.24	0.29	0.28	0.41	0.29	0.28	0.14	0.09	0.04	0.03	0.02	0.25	0.24	0.33	0.03
C6	0.03	0.00	0.14	0.24	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.24	0.14	0.38	0.01	0.59	0.45	0.39
C8	0.01	0.02	0.10	0.20	0.01	0.19	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.18	0.13	0.40	0.02	0.40	0.41	0.35
N1	0.04	0.00	0.21	0.25	0.01	0.17	0.01	0.28	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.26	0.23	0.38	0.01	0.61	0.51	0.42
N2	0.07	0.01	0.30	0.26	0.02	0.29	0.01	0.41	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.26	0.31	0.35	0.42	0.01	0.62	0.65	0.50
N3	0.05	0.01	0.25	0.22	0.01	0.21	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.18	0.23	0.28	0.35	0.01	0.52	0.48	0.39
N7	0.01	0.01	0.06	0.23	0.01	0.16	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.22	0.06	0.43	0.02	0.49	0.49	0.40
N9	0.01	0.02	0.03	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.10	0.02	0.27	0.02	0.39	0.26	0.24
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.06	0.12	0.06	0.09	0.06	0.18	0.12	0.26	0.18	0.15	0.07	0.00	0.04	0.09	0.07	0.08	0.19	0.11	0.08
O3'	0.07	0.26	0.03	0.01	0.18	0.05	0.21	0.04	0.24	0.18	0.26	0.31	0.23	0.22	0.10	0.04	0.00	0.07	0.19	0.26	0.36	0.15	0.19
O4'	0.01	0.29	0.01	0.02	0.15	0.01	0.09	0.03	0.14	0.13	0.23	0.35	0.28	0.06	0.02	0.09	0.07	0.00	0.11	0.12	0.15	0.27	0.12
O5'	0.15	0.38	0.22	0.25	0.32	0.03	0.37	0.02	0.38	0.40	0.38	0.42	0.35	0.43	0.27	0.07	0.19	0.11	0.00	0.40	0.03	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.12	0.25	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.26	0.12	0.40	0.00	0.60	0.48	0.42
OP1	0.27	0.59	0.34	0.32	0.49	0.13	0.53	0.24	0.59	0.40	0.61	0.62	0.52	0.49	0.39	0.19	0.36	0.15	0.03	0.60	0.00	0.02	0.02
OP2	0.20	0.54	0.13	0.09	0.37	0.23	0.40	0.33	0.45	0.41	0.51	0.65	0.48	0.49	0.26	0.11	0.15	0.27	0.03	0.48	0.02	0.00	0.02
P	0.15	0.43	0.20	0.20	0.32	0.04	0.36	0.03	0.39	0.35	0.42	0.50	0.39	0.40	0.24	0.08	0.19	0.12	0.01	0.42	0.02	0.02	0.00