Doublet Group distance statistics: 51746

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 3, 5, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.008, 0.030, 0.051, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N7	A	0, -0.002, 0.026, 0.054, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.026 std_dev=0.028
C8	A	0, -0.002, 0.028, 0.058, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.028 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.024, 0.115, 0.206, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.115 std_dev=0.091
O2'	A	0, 0.065, 0.156, 0.247, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.156 std_dev=0.091
O4'	A	0, 0.015, 0.112, 0.209, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.112 std_dev=0.097
C3'	A	0, 0.038, 0.193, 0.347, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.193 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.011, 0.169, 0.327, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.169 std_dev=0.158
N3	B	0, 0.267, 0.427, 0.587, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.427 std_dev=0.160
C2	B	0, 0.270, 0.440, 0.610, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.440 std_dev=0.170
N1	B	0, 0.232, 0.414, 0.596, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.414 std_dev=0.182
O4'	B	0, 0.254, 0.456, 0.658, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.456 std_dev=0.202
C4	B	0, 0.193, 0.402, 0.611, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.402 std_dev=0.209
N2	B	0, 0.301, 0.517, 0.733, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.517 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.212, 0.430, 0.648, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.430 std_dev=0.218
O3'	A	0, 0.060, 0.285, 0.511, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.285 std_dev=0.226
C5'	A	0, 0.060, 0.297, 0.535, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.297 std_dev=0.238
O2'	B	0, 0.337, 0.575, 0.814, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.575 std_dev=0.238
C2'	B	0, 0.305, 0.550, 0.794, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.550 std_dev=0.244
C4'	B	0, 0.305, 0.551, 0.796, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.551 std_dev=0.246
C6	B	0, 0.148, 0.396, 0.644, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.396 std_dev=0.248
N9	B	0, 0.156, 0.413, 0.670, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.413 std_dev=0.257
O5'	A	0, 0.122, 0.390, 0.658, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.390 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.124, 0.400, 0.676, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.400 std_dev=0.276
O6	B	0, 0.112, 0.412, 0.712, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.412 std_dev=0.300
P	A	0, 0.223, 0.532, 0.841, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.532 std_dev=0.309
C3'	B	0, 0.316, 0.627, 0.939, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.627 std_dev=0.312
C5'	B	0, 0.354, 0.672, 0.989, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.672 std_dev=0.318
C8	B	0, 0.069, 0.435, 0.802, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.435 std_dev=0.366
N7	B	0, 0.052, 0.433, 0.814, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.433 std_dev=0.381
O3'	B	0, 0.358, 0.746, 1.135, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.746 std_dev=0.389
OP1	A	0, 0.192, 0.693, 1.194, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.693 std_dev=0.501
OP2	B	0, 0.332, 0.863, 1.394, 2.467 max_d=2.467 avg_d=0.863 std_dev=0.531
P	B	0, 0.336, 0.885, 1.434, 2.506 max_d=2.506 avg_d=0.885 std_dev=0.549
O5'	B	0, 0.231, 0.802, 1.373, 2.623 max_d=2.623 avg_d=0.802 std_dev=0.571
OP2	A	0, 0.063, 0.721, 1.379, 2.847 max_d=2.847 avg_d=0.721 std_dev=0.658
OP1	B	0, 0.225, 1.111, 1.996, 4.174 max_d=4.174 avg_d=1.111 std_dev=0.885

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.18	0.15	0.08
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.15	0.03	0.13	0.17	0.29	0.14
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.09	0.10	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.33	0.15	0.14
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.10	0.06	0.11	0.10	0.10	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.05	0.39	0.11	0.15
C4	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.13	0.16	0.27	0.14
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.24	0.16	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.15	0.19	0.37	0.18
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.09	0.07	0.04	0.10	0.10	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.21	0.19	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.01	0.16	0.21	0.40	0.19
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.04	0.14	0.16	0.32	0.17
N1	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.03	0.15	0.19	0.35	0.17
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.13	0.03	0.12	0.16	0.24	0.13
N6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.17	0.25	0.47	0.21
N7	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.16	0.21	0.43	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.15	0.21	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.03	0.08	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.04	0.32	0.15	0.09
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.13	0.07	0.15	0.13	0.13	0.09	0.05	0.05	0.00	0.02	0.07	0.48	0.09	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.13	0.24	0.08
O5'	0.08	0.13	0.05	0.05	0.13	0.01	0.15	0.01	0.16	0.14	0.15	0.12	0.17	0.16	0.12	0.04	0.07	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.17	0.33	0.39	0.16	0.24	0.19	0.21	0.21	0.16	0.19	0.16	0.25	0.21	0.15	0.32	0.48	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.29	0.15	0.11	0.27	0.16	0.37	0.19	0.40	0.32	0.35	0.24	0.47	0.43	0.21	0.15	0.09	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.14	0.14	0.15	0.14	0.03	0.18	0.01	0.19	0.17	0.17	0.13	0.21	0.20	0.13	0.09	0.15	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.16	0.29	0.35	0.28	0.29	0.35	0.32	0.32	0.37	0.20	0.10	0.19	0.40	0.30	0.21	0.36	0.24	0.46	0.36	0.45	0.45	0.34
C2	0.27	0.19	0.32	0.31	0.27	0.24	0.29	0.25	0.23	0.35	0.19	0.21	0.20	0.33	0.31	0.25	0.31	0.23	0.27	0.22	0.25	0.27	0.19
C2'	0.31	0.20	0.34	0.38	0.32	0.32	0.37	0.34	0.34	0.41	0.24	0.13	0.24	0.43	0.35	0.26	0.39	0.29	0.45	0.36	0.42	0.45	0.32
C3'	0.28	0.17	0.31	0.36	0.28	0.30	0.33	0.32	0.29	0.38	0.20	0.11	0.20	0.40	0.31	0.24	0.36	0.27	0.43	0.31	0.38	0.45	0.30
C4	0.27	0.07	0.29	0.33	0.28	0.27	0.34	0.30	0.25	0.41	0.12	0.07	0.15	0.42	0.33	0.21	0.32	0.25	0.36	0.25	0.31	0.36	0.24
C4'	0.20	0.14	0.23	0.29	0.20	0.23	0.25	0.26	0.23	0.28	0.16	0.13	0.16	0.30	0.23	0.17	0.31	0.19	0.42	0.26	0.42	0.43	0.31
C5	0.28	0.06	0.28	0.33	0.25	0.29	0.31	0.33	0.20	0.44	0.08	0.09	0.12	0.43	0.34	0.21	0.31	0.28	0.33	0.21	0.23	0.34	0.21
C5'	0.14	0.14	0.18	0.23	0.15	0.17	0.19	0.20	0.18	0.21	0.15	0.15	0.14	0.23	0.16	0.13	0.25	0.14	0.35	0.20	0.34	0.38	0.24
C6	0.28	0.08	0.27	0.29	0.21	0.26	0.24	0.29	0.15	0.40	0.08	0.14	0.10	0.36	0.31	0.22	0.27	0.27	0.23	0.15	0.14	0.25	0.14
C8	0.28	0.13	0.30	0.37	0.28	0.32	0.36	0.37	0.29	0.45	0.16	0.10	0.17	0.48	0.33	0.22	0.37	0.28	0.43	0.32	0.35	0.46	0.32
N1	0.28	0.15	0.29	0.28	0.23	0.23	0.24	0.24	0.17	0.35	0.14	0.19	0.16	0.31	0.30	0.25	0.27	0.23	0.19	0.16	0.14	0.22	0.11
N3	0.27	0.15	0.30	0.33	0.29	0.26	0.33	0.27	0.27	0.37	0.19	0.13	0.19	0.37	0.32	0.23	0.32	0.23	0.34	0.26	0.33	0.33	0.24
N6	0.27	0.09	0.26	0.29	0.17	0.28	0.19	0.33	0.11	0.38	0.07	0.15	0.10	0.32	0.28	0.23	0.27	0.29	0.24	0.12	0.20	0.23	0.19
N7	0.28	0.10	0.29	0.37	0.26	0.33	0.33	0.38	0.24	0.47	0.13	0.10	0.15	0.48	0.34	0.22	0.35	0.30	0.40	0.26	0.30	0.43	0.29
N9	0.27	0.12	0.29	0.35	0.28	0.29	0.36	0.33	0.30	0.41	0.16	0.07	0.17	0.45	0.32	0.21	0.34	0.26	0.42	0.32	0.37	0.42	0.30
O2'	0.29	0.23	0.34	0.39	0.32	0.31	0.36	0.33	0.34	0.38	0.27	0.15	0.25	0.40	0.33	0.25	0.39	0.27	0.47	0.37	0.49	0.46	0.36
O3'	0.30	0.19	0.32	0.37	0.29	0.31	0.32	0.33	0.28	0.38	0.21	0.14	0.22	0.39	0.32	0.26	0.37	0.28	0.44	0.30	0.39	0.45	0.31
O4'	0.19	0.14	0.23	0.30	0.20	0.23	0.26	0.27	0.23	0.29	0.16	0.15	0.15	0.32	0.22	0.16	0.31	0.19	0.45	0.28	0.46	0.45	0.34
O5'	0.13	0.17	0.14	0.18	0.14	0.14	0.15	0.16	0.14	0.18	0.15	0.20	0.15	0.20	0.14	0.13	0.19	0.13	0.27	0.16	0.21	0.31	0.16
OP1	0.44	0.21	0.47	0.58	0.38	0.55	0.45	0.64	0.34	0.61	0.22	0.18	0.27	0.62	0.48	0.38	0.59	0.49	0.73	0.37	0.66	0.87	0.66
OP2	0.18	0.17	0.21	0.28	0.21	0.18	0.31	0.22	0.34	0.29	0.24	0.14	0.17	0.37	0.21	0.17	0.30	0.17	0.31	0.46	0.32	0.48	0.25
P	0.15	0.10	0.19	0.27	0.16	0.19	0.23	0.24	0.20	0.28	0.12	0.11	0.11	0.32	0.19	0.13	0.29	0.14	0.36	0.27	0.31	0.48	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.10	0.16	0.06
C2	0.02	0.00	0.10	0.16	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.19	0.02	0.30	0.01	0.41	0.18	0.22
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.04	0.08	0.12	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.25	0.11	0.09
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.11	0.06	0.15	0.19	0.14	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.20	0.11	0.33	0.09	0.16
C4	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.26	0.01	0.30	0.15	0.16
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.08	0.10	0.07	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.11	0.18	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.31	0.01	0.35	0.20	0.21
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.09	0.07	0.10	0.11	0.09	0.07	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.10	0.09	0.22	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.35	0.00	0.43	0.25	0.25
C8	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.23	0.01	0.19	0.15	0.12
N1	0.01	0.00	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.18	0.02	0.34	0.00	0.45	0.23	0.25
N2	0.02	0.00	0.12	0.19	0.01	0.10	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.23	0.03	0.29	0.01	0.43	0.19	0.22
N3	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.02	0.25	0.01	0.33	0.15	0.17
N7	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.30	0.01	0.29	0.19	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.19	0.01	0.19	0.13	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.06	0.09	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.04	0.21	0.12	0.06
O3'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.10	0.02	0.10	0.02	0.14	0.06	0.18	0.23	0.17	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.18	0.14	0.42	0.11	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.02	0.07	0.22	0.13
O5'	0.07	0.30	0.14	0.20	0.26	0.01	0.31	0.01	0.35	0.23	0.34	0.29	0.25	0.30	0.19	0.07	0.18	0.06	0.00	0.38	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.02	0.38	0.00	0.46	0.29	0.29
OP1	0.10	0.41	0.25	0.33	0.30	0.11	0.35	0.09	0.43	0.19	0.45	0.43	0.33	0.29	0.19	0.21	0.42	0.07	0.01	0.46	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.18	0.11	0.09	0.15	0.18	0.20	0.22	0.25	0.15	0.23	0.19	0.15	0.19	0.13	0.12	0.11	0.22	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.22	0.09	0.16	0.16	0.02	0.21	0.01	0.25	0.12	0.25	0.22	0.17	0.18	0.10	0.06	0.21	0.13	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00