Doublet Group distance statistics: 51748

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 2, 3, 2, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.001, 0.012, 0.024, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.001, 0.014, 0.028, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.003, 0.013, 0.028, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.013 std_dev=0.015
C1'	A	0, -0.008, 0.011, 0.029, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.011 std_dev=0.018
C4	A	0, -0.002, 0.017, 0.036, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.017 std_dev=0.019
C6	A	0, -0.008, 0.011, 0.031, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.011 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.012, 0.009, 0.030, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.009 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, -0.008, 0.017, 0.043, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.017 std_dev=0.025
N6	A	0, -0.035, 0.038, 0.110, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.038 std_dev=0.073
N7	B	0, 0.165, 0.314, 0.463, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.314 std_dev=0.149
C5	B	0, 0.167, 0.318, 0.468, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.318 std_dev=0.151
C4	B	0, 0.170, 0.355, 0.539, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.355 std_dev=0.184
C8	B	0, 0.147, 0.343, 0.538, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.343 std_dev=0.196
O4'	A	0, -0.079, 0.126, 0.330, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.126 std_dev=0.204
N9	B	0, 0.158, 0.370, 0.582, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.370 std_dev=0.212
C6	B	0, 0.147, 0.365, 0.584, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.365 std_dev=0.218
N3	B	0, 0.177, 0.428, 0.679, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.428 std_dev=0.251
O6	B	0, 0.138, 0.404, 0.670, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.404 std_dev=0.266
C2'	A	0, -0.109, 0.159, 0.427, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.159 std_dev=0.268
N1	B	0, 0.119, 0.416, 0.712, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.416 std_dev=0.296
C2	B	0, 0.148, 0.447, 0.746, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.447 std_dev=0.299
C1'	B	0, 0.142, 0.455, 0.769, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.455 std_dev=0.313
O5'	B	0, 0.190, 0.504, 0.818, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.504 std_dev=0.314
OP2	A	0, 0.199, 0.527, 0.855, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.527 std_dev=0.328
C4'	A	0, -0.138, 0.205, 0.547, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.205 std_dev=0.342
O4'	B	0, 0.114, 0.480, 0.846, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.480 std_dev=0.366
C3'	A	0, -0.134, 0.234, 0.602, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.234 std_dev=0.368
O2'	A	0, -0.149, 0.224, 0.597, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.224 std_dev=0.373
N2	B	0, 0.125, 0.535, 0.945, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.535 std_dev=0.410
C2'	B	0, 0.143, 0.554, 0.966, 1.629 max_d=1.629 avg_d=0.554 std_dev=0.411
C5'	B	0, 0.112, 0.568, 1.023, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.568 std_dev=0.455
C4'	B	0, 0.099, 0.561, 1.023, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.561 std_dev=0.462
C3'	B	0, 0.118, 0.580, 1.043, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.580 std_dev=0.463
C5'	A	0, -0.138, 0.328, 0.794, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.328 std_dev=0.466
O2'	B	0, 0.165, 0.639, 1.112, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.639 std_dev=0.473
P	B	0, 0.034, 0.524, 1.015, 2.120 max_d=2.120 avg_d=0.524 std_dev=0.491
O3'	A	0, -0.191, 0.341, 0.873, 2.210 max_d=2.210 avg_d=0.341 std_dev=0.532
P	A	0, -0.048, 0.506, 1.060, 2.346 max_d=2.346 avg_d=0.506 std_dev=0.554
O3'	B	0, 0.116, 0.702, 1.287, 2.289 max_d=2.289 avg_d=0.702 std_dev=0.585
OP2	B	0, -0.029, 0.609, 1.247, 2.699 max_d=2.699 avg_d=0.609 std_dev=0.638
O5'	A	0, -0.260, 0.436, 1.131, 2.872 max_d=2.872 avg_d=0.436 std_dev=0.695
OP1	A	0, -0.201, 0.666, 1.533, 3.671 max_d=3.671 avg_d=0.666 std_dev=0.867
OP1	B	0, -0.478, 0.708, 1.894, 4.948 max_d=4.948 avg_d=0.708 std_dev=1.186

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.00	0.21	0.32	0.27	0.10
C2	0.03	0.00	0.18	0.21	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.15	0.06	0.36	0.60	0.19	0.32
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.08	0.01	0.02	0.10	0.03	0.12	0.11	0.19	0.04	0.09	0.02	0.00	0.02	0.00	0.10	0.13	0.50	0.13
C3'	0.02	0.21	0.01	0.00	0.14	0.00	0.11	0.01	0.13	0.07	0.17	0.20	0.08	0.08	0.09	0.02	0.01	0.01	0.08	0.19	0.38	0.14
C4	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.01	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.09	0.05	0.35	0.59	0.20	0.30
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.02	0.04	0.10	0.07	0.02	0.16	0.01	0.01	0.01	0.09	0.21	0.08
C5	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.11	0.09	0.05	0.37	0.70	0.21	0.35
C5'	0.07	0.11	0.10	0.01	0.13	0.01	0.19	0.00	0.20	0.19	0.16	0.08	0.27	0.21	0.12	0.07	0.11	0.01	0.01	0.14	0.08	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.05	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.10	0.11	0.07	0.36	0.72	0.21	0.36
C8	0.02	0.01	0.12	0.07	0.01	0.07	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.15	0.07	0.01	0.37	0.66	0.22	0.33
N1	0.01	0.00	0.11	0.17	0.01	0.02	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.07	0.36	0.68	0.20	0.35
N3	0.04	0.00	0.19	0.20	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.13	0.05	0.34	0.54	0.19	0.28
N6	0.04	0.02	0.04	0.08	0.02	0.10	0.03	0.27	0.00	0.06	0.02	0.01	0.00	0.06	0.05	0.15	0.09	0.10	0.32	0.74	0.24	0.36
N7	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.07	0.00	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.16	0.08	0.02	0.38	0.76	0.21	0.39
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.02	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.08	0.04	0.01	0.33	0.53	0.22	0.25
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.16	0.11	0.07	0.10	0.15	0.06	0.08	0.15	0.16	0.08	0.00	0.02	0.10	0.14	0.13	0.46	0.11
O3'	0.07	0.15	0.02	0.01	0.09	0.01	0.09	0.11	0.11	0.07	0.14	0.13	0.09	0.08	0.04	0.02	0.00	0.08	0.07	0.34	0.25	0.14
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.10	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.18	0.39	0.11	0.16
O5'	0.21	0.36	0.10	0.08	0.35	0.01	0.37	0.01	0.36	0.37	0.36	0.34	0.32	0.38	0.33	0.14	0.07	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.60	0.13	0.19	0.59	0.09	0.70	0.14	0.72	0.66	0.68	0.54	0.74	0.76	0.53	0.13	0.34	0.39	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.19	0.50	0.38	0.20	0.21	0.21	0.08	0.21	0.22	0.20	0.19	0.24	0.21	0.22	0.46	0.25	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.32	0.13	0.14	0.30	0.08	0.35	0.02	0.36	0.33	0.35	0.28	0.36	0.39	0.25	0.11	0.14	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.18	0.19	0.21	0.08	0.27	0.09	0.28	0.17	0.21	0.21	0.21	0.11	0.12	0.15	0.23	0.23	0.28	0.21	0.19	1.06	0.06	0.38
C2	0.11	0.29	0.08	0.09	0.09	0.15	0.10	0.19	0.17	0.22	0.31	0.39	0.18	0.21	0.11	0.10	0.08	0.18	0.19	0.19	0.89	0.24	0.32
C2'	0.09	0.21	0.09	0.11	0.10	0.16	0.10	0.19	0.16	0.13	0.21	0.26	0.16	0.11	0.07	0.11	0.13	0.14	0.15	0.15	1.04	0.07	0.33
C3'	0.07	0.18	0.07	0.08	0.13	0.12	0.16	0.16	0.19	0.07	0.20	0.18	0.14	0.12	0.07	0.12	0.10	0.09	0.22	0.20	0.76	0.18	0.09
C4	0.14	0.23	0.11	0.12	0.05	0.18	0.05	0.20	0.15	0.21	0.25	0.29	0.14	0.16	0.12	0.14	0.12	0.20	0.18	0.15	0.89	0.18	0.30
C4'	0.08	0.29	0.08	0.09	0.25	0.12	0.30	0.16	0.34	0.19	0.33	0.29	0.25	0.27	0.17	0.10	0.11	0.08	0.22	0.35	0.75	0.16	0.09
C5	0.13	0.22	0.10	0.11	0.07	0.15	0.06	0.17	0.06	0.18	0.18	0.30	0.15	0.16	0.12	0.12	0.10	0.17	0.18	0.08	0.76	0.22	0.23
C5'	0.23	0.42	0.19	0.18	0.40	0.15	0.43	0.19	0.45	0.35	0.45	0.41	0.39	0.40	0.34	0.13	0.15	0.18	0.30	0.44	0.55	0.15	0.08
C6	0.11	0.26	0.09	0.09	0.09	0.12	0.08	0.15	0.04	0.17	0.18	0.38	0.19	0.18	0.11	0.10	0.09	0.14	0.17	0.10	0.72	0.27	0.21
C8	0.20	0.16	0.19	0.19	0.11	0.22	0.09	0.22	0.11	0.19	0.16	0.19	0.12	0.13	0.17	0.22	0.20	0.23	0.20	0.11	0.78	0.15	0.25
N1	0.09	0.30	0.08	0.08	0.09	0.12	0.09	0.15	0.11	0.19	0.26	0.42	0.20	0.20	0.10	0.08	0.08	0.14	0.17	0.13	0.79	0.27	0.26
N3	0.14	0.27	0.10	0.12	0.08	0.19	0.09	0.21	0.20	0.22	0.30	0.34	0.16	0.19	0.12	0.13	0.11	0.21	0.19	0.22	0.95	0.20	0.34
N6	0.14	0.25	0.15	0.14	0.13	0.14	0.11	0.16	0.10	0.15	0.11	0.39	0.23	0.17	0.13	0.15	0.15	0.15	0.19	0.18	0.60	0.32	0.15
N7	0.17	0.17	0.15	0.16	0.12	0.18	0.11	0.19	0.09	0.19	0.13	0.22	0.15	0.15	0.16	0.17	0.16	0.19	0.20	0.09	0.70	0.20	0.21
N9	0.19	0.19	0.17	0.18	0.06	0.23	0.07	0.24	0.15	0.21	0.21	0.23	0.11	0.14	0.15	0.20	0.18	0.24	0.20	0.15	0.93	0.12	0.32
O2'	0.21	0.20	0.22	0.29	0.08	0.35	0.09	0.41	0.13	0.30	0.21	0.27	0.12	0.23	0.18	0.22	0.31	0.31	0.35	0.14	1.38	0.33	0.64
O3'	0.07	0.22	0.07	0.10	0.19	0.11	0.25	0.18	0.30	0.16	0.28	0.22	0.18	0.24	0.12	0.12	0.11	0.08	0.30	0.33	0.64	0.28	0.09
O4'	0.18	0.23	0.17	0.18	0.15	0.26	0.23	0.26	0.31	0.05	0.30	0.23	0.16	0.18	0.07	0.23	0.20	0.27	0.17	0.35	0.92	0.12	0.26
O5'	0.11	0.13	0.11	0.21	0.11	0.27	0.12	0.43	0.11	0.20	0.11	0.16	0.12	0.18	0.12	0.14	0.20	0.22	0.53	0.12	0.18	0.42	0.37
OP1	0.81	0.84	0.89	0.68	0.73	0.53	0.59	0.20	0.62	0.46	0.74	0.92	0.86	0.43	0.68	1.03	0.72	0.56	0.11	0.54	0.37	0.10	0.09
OP2	0.11	0.23	0.15	0.13	0.22	0.12	0.28	0.12	0.30	0.23	0.28	0.22	0.20	0.29	0.18	0.27	0.23	0.11	0.21	0.33	0.38	0.10	0.11
P	0.21	0.29	0.26	0.13	0.19	0.09	0.14	0.21	0.16	0.08	0.23	0.34	0.28	0.10	0.15	0.37	0.18	0.09	0.30	0.14	0.23	0.21	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.34	0.11	0.10
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.06	0.01	0.35	0.37	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.08	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.10	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.04	0.09	0.06	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.18	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.08	0.01	0.37	0.35	0.07
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.08	0.02	0.04	0.03	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.09	0.04
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.13	0.01	0.39	0.47	0.04
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.12	0.05	0.03	0.03	0.13	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.07	0.19	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.12	0.00	0.38	0.52	0.03
C8	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.01	0.17	0.01	0.43	0.39	0.05
N1	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.09	0.01	0.36	0.46	0.04
N2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.02	0.05	0.01	0.34	0.34	0.08
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.05	0.01	0.35	0.30	0.08
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.18	0.01	0.42	0.51	0.04
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.38	0.27	0.07
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.07	0.11	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.16	0.05	0.05
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.05	0.11	0.06	0.12	0.08	0.11	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.36	0.10	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.38	0.08	0.14
O5'	0.03	0.06	0.02	0.05	0.08	0.01	0.13	0.01	0.12	0.17	0.09	0.05	0.05	0.18	0.09	0.02	0.07	0.04	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.14	0.00	0.38	0.59	0.04
OP1	0.34	0.35	0.16	0.18	0.37	0.12	0.39	0.07	0.38	0.43	0.36	0.34	0.35	0.42	0.38	0.16	0.36	0.38	0.01	0.38	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.37	0.10	0.07	0.35	0.09	0.47	0.19	0.52	0.39	0.46	0.34	0.30	0.51	0.27	0.05	0.10	0.08	0.01	0.59	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.07	0.05	0.05	0.07	0.04	0.04	0.01	0.03	0.05	0.04	0.08	0.08	0.04	0.07	0.05	0.10	0.14	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00