Doublet Group distance statistics: 51751

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C6	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.008 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N3	A	0, -0.001, 0.014, 0.029, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.027 std_dev=0.022
N9	A	0, -0.003, 0.020, 0.043, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.020 std_dev=0.023
N6	A	0, -0.001, 0.029, 0.059, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.029 std_dev=0.030
O4'	A	0, -0.013, 0.071, 0.156, 0.290 max_d=0.290 avg_d=0.071 std_dev=0.084
C2'	A	0, -0.008, 0.089, 0.186, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.089 std_dev=0.097
C8	B	0, 0.075, 0.214, 0.352, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.214 std_dev=0.138
N7	B	0, 0.088, 0.235, 0.382, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.235 std_dev=0.147
N9	B	0, 0.103, 0.250, 0.397, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.250 std_dev=0.147
C4	B	0, 0.128, 0.278, 0.427, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.278 std_dev=0.150
C5	B	0, 0.101, 0.262, 0.423, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.262 std_dev=0.161
N3	B	0, 0.166, 0.351, 0.537, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.351 std_dev=0.185
C3'	A	0, -0.020, 0.169, 0.359, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.169 std_dev=0.189
O4'	B	0, 0.060, 0.265, 0.470, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.265 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.106, 0.325, 0.545, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.325 std_dev=0.219
C2	B	0, 0.167, 0.387, 0.607, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.387 std_dev=0.220
O2'	A	0, -0.032, 0.194, 0.419, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.194 std_dev=0.226
C6	B	0, 0.093, 0.319, 0.544, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.319 std_dev=0.226
C4'	A	0, -0.053, 0.186, 0.425, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.186 std_dev=0.239
N1	B	0, 0.125, 0.369, 0.612, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.369 std_dev=0.244
O6	B	0, 0.093, 0.365, 0.637, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.365 std_dev=0.272
N2	B	0, 0.200, 0.472, 0.744, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.472 std_dev=0.272
O3'	A	0, -0.033, 0.260, 0.554, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.260 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.032, 0.353, 0.674, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.353 std_dev=0.321
C2'	B	0, 0.112, 0.453, 0.794, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.453 std_dev=0.341
C5'	B	0, -0.013, 0.360, 0.732, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.360 std_dev=0.372
C3'	B	0, 0.066, 0.444, 0.822, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.444 std_dev=0.378
C5'	A	0, -0.104, 0.333, 0.770, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.333 std_dev=0.437
O2'	B	0, 0.124, 0.576, 1.028, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.576 std_dev=0.452
P	B	0, -0.080, 0.425, 0.930, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.425 std_dev=0.505
O3'	B	0, 0.053, 0.574, 1.094, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.574 std_dev=0.521
O5'	B	0, -0.081, 0.442, 0.965, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.442 std_dev=0.523
OP2	B	0, -0.074, 0.498, 1.070, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.498 std_dev=0.572
OP1	B	0, -0.083, 0.593, 1.269, 2.244 max_d=2.244 avg_d=0.593 std_dev=0.676
O5'	A	0, -0.185, 0.519, 1.223, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.519 std_dev=0.704
P	A	0, -0.406, 0.836, 2.078, 3.465 max_d=3.465 avg_d=0.836 std_dev=1.242
OP1	A	0, -0.533, 1.039, 2.610, 4.353 max_d=4.353 avg_d=1.039 std_dev=1.571
OP2	A	0, -0.813, 1.229, 3.270, 5.597 max_d=5.597 avg_d=1.229 std_dev=2.041

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.29	0.34	0.16
C2	0.02	0.00	0.06	0.19	0.02	0.23	0.01	0.41	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.22	0.06	0.35	0.51	1.05	0.68
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.06	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.15	0.52	0.16
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.13	0.00	0.12	0.01	0.15	0.04	0.18	0.17	0.14	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.20	0.06	0.44	0.09
C4	0.01	0.02	0.03	0.13	0.00	0.14	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.12	0.05	0.16	0.14	0.42	0.30
C4'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.00	0.18	0.03	0.21	0.20	0.16	0.09	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.41	0.15
C5	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.28	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.05	0.19	0.17	0.50	0.34
C5'	0.04	0.41	0.02	0.01	0.27	0.00	0.28	0.00	0.35	0.13	0.40	0.35	0.35	0.22	0.14	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.18	0.01	0.35	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.16	0.06	0.28	0.35	0.81	0.53
C8	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.03	0.02	0.13	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.11	0.04	0.02	0.03	0.18	0.08	0.03
N1	0.02	0.01	0.05	0.18	0.01	0.21	0.01	0.40	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.20	0.06	0.35	0.51	1.07	0.68
N3	0.02	0.00	0.06	0.17	0.01	0.20	0.01	0.35	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.18	0.05	0.25	0.31	0.70	0.47
N6	0.01	0.02	0.04	0.14	0.00	0.16	0.01	0.35	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.07	0.14	0.05	0.29	0.37	0.85	0.55
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.09	0.00	0.22	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.10	0.06	0.05	0.11	0.06	0.24	0.18
N9	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.02	0.04	0.13	0.05	0.05
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.04	0.11	0.04	0.07	0.07	0.10	0.04	0.00	0.03	0.05	0.07	0.29	0.81	0.30
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.12	0.01	0.11	0.04	0.16	0.04	0.20	0.18	0.14	0.06	0.04	0.03	0.00	0.01	0.33	0.17	0.71	0.14
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.02	0.05	0.01	0.00	0.15	0.28	0.23	0.13
O5'	0.08	0.35	0.09	0.20	0.16	0.01	0.19	0.00	0.28	0.03	0.35	0.25	0.29	0.11	0.04	0.07	0.33	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.29	0.51	0.15	0.06	0.14	0.16	0.17	0.01	0.35	0.18	0.51	0.31	0.37	0.06	0.13	0.29	0.17	0.28	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	1.05	0.52	0.44	0.42	0.41	0.50	0.05	0.81	0.08	1.07	0.70	0.85	0.24	0.05	0.81	0.71	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.68	0.16	0.09	0.30	0.15	0.34	0.01	0.53	0.03	0.68	0.47	0.55	0.18	0.05	0.30	0.14	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.10	0.13	0.09	0.07	0.10	0.10	0.15	0.13	0.08	0.11	0.11	0.09	0.12	0.07	0.20	0.10	0.12	0.15	0.16	0.07	0.09	0.06
C2	0.11	0.19	0.11	0.11	0.14	0.10	0.20	0.14	0.25	0.15	0.24	0.20	0.15	0.18	0.12	0.12	0.11	0.10	0.25	0.29	0.26	0.35	0.27
C2'	0.13	0.07	0.12	0.10	0.06	0.11	0.08	0.16	0.10	0.07	0.08	0.08	0.07	0.11	0.06	0.18	0.10	0.13	0.19	0.13	0.09	0.14	0.10
C3'	0.11	0.19	0.12	0.15	0.18	0.11	0.24	0.16	0.26	0.20	0.23	0.18	0.16	0.26	0.15	0.12	0.13	0.11	0.05	0.30	0.02	0.06	0.01
C4	0.12	0.12	0.11	0.07	0.08	0.08	0.12	0.11	0.16	0.13	0.15	0.13	0.08	0.13	0.09	0.16	0.08	0.10	0.13	0.18	0.11	0.17	0.11
C4'	0.09	0.22	0.09	0.13	0.19	0.09	0.27	0.16	0.31	0.19	0.28	0.21	0.17	0.28	0.13	0.12	0.11	0.11	0.05	0.36	0.02	0.12	0.03
C5	0.17	0.13	0.17	0.13	0.10	0.13	0.11	0.11	0.14	0.16	0.14	0.14	0.10	0.13	0.13	0.21	0.14	0.13	0.16	0.15	0.11	0.16	0.11
C5'	0.15	0.38	0.17	0.20	0.32	0.11	0.41	0.15	0.48	0.29	0.45	0.38	0.31	0.41	0.24	0.13	0.17	0.13	0.08	0.55	0.05	0.21	0.08
C6	0.17	0.17	0.18	0.14	0.14	0.13	0.15	0.12	0.18	0.17	0.19	0.19	0.14	0.15	0.15	0.22	0.15	0.14	0.21	0.19	0.17	0.24	0.17
C8	0.21	0.13	0.23	0.18	0.12	0.17	0.10	0.16	0.11	0.15	0.12	0.15	0.13	0.12	0.15	0.28	0.20	0.17	0.21	0.12	0.15	0.11	0.10
N1	0.14	0.21	0.15	0.12	0.16	0.11	0.20	0.13	0.25	0.17	0.25	0.23	0.17	0.18	0.15	0.17	0.12	0.12	0.26	0.28	0.24	0.32	0.25
N3	0.10	0.15	0.08	0.09	0.10	0.09	0.16	0.14	0.20	0.11	0.19	0.16	0.10	0.16	0.08	0.11	0.09	0.10	0.19	0.24	0.20	0.28	0.21
N6	0.21	0.19	0.24	0.19	0.16	0.18	0.14	0.14	0.16	0.18	0.19	0.21	0.17	0.15	0.18	0.29	0.21	0.18	0.22	0.15	0.17	0.22	0.16
N7	0.22	0.13	0.25	0.20	0.12	0.19	0.10	0.15	0.11	0.17	0.13	0.15	0.13	0.12	0.16	0.30	0.22	0.18	0.17	0.11	0.12	0.11	0.08
N9	0.14	0.11	0.14	0.09	0.08	0.09	0.10	0.12	0.13	0.11	0.12	0.12	0.09	0.12	0.09	0.20	0.10	0.11	0.13	0.15	0.06	0.10	0.04
O2'	0.19	0.09	0.19	0.14	0.07	0.15	0.05	0.17	0.06	0.05	0.05	0.12	0.12	0.09	0.09	0.28	0.16	0.17	0.32	0.10	0.15	0.15	0.16
O3'	0.12	0.20	0.15	0.20	0.20	0.13	0.27	0.20	0.29	0.25	0.25	0.18	0.17	0.31	0.18	0.12	0.18	0.11	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00
O4'	0.12	0.12	0.10	0.07	0.09	0.09	0.15	0.13	0.19	0.10	0.16	0.13	0.09	0.16	0.07	0.16	0.07	0.11	0.11	0.23	0.03	0.07	0.02
O5'	0.34	0.55	0.42	0.52	0.51	0.39	0.61	0.49	0.67	0.51	0.63	0.54	0.49	0.63	0.44	0.34	0.52	0.31	0.43	0.75	0.52	0.77	0.55
OP1	0.30	0.70	0.41	0.52	0.62	0.30	0.80	0.40	0.92	0.60	0.85	0.68	0.58	0.81	0.49	0.28	0.51	0.23	0.38	1.07	0.50	0.90	0.53
OP2	0.15	0.80	0.12	0.09	0.63	0.31	0.91	0.38	1.13	0.54	1.03	0.78	0.59	0.90	0.40	0.17	0.16	0.24	0.34	1.37	0.69	0.19	0.40
P	0.23	0.65	0.27	0.29	0.56	0.14	0.73	0.15	0.86	0.51	0.80	0.64	0.52	0.73	0.41	0.18	0.25	0.16	0.14	1.01	0.18	0.51	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.02	0.12	0.11	0.06
C2	0.04	0.00	0.13	0.15	0.00	0.09	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.18	0.03	0.26	0.00	0.22	0.17	0.19
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.04	0.10	0.16	0.14	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.04	0.20	0.07	0.11
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.10	0.11	0.20	0.15	0.08	0.03	0.01	0.01	0.01	0.22	0.05	0.25	0.06	0.15
C4	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.02	0.29	0.01	0.23	0.16	0.21
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.07	0.07	0.12	0.09	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.21	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.38	0.01	0.32	0.27	0.30
C5'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.10	0.11	0.14	0.11	0.11	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.11	0.12	0.27	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.38	0.00	0.34	0.31	0.32
C8	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.39	0.02	0.31	0.22	0.29
N1	0.04	0.00	0.10	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.13	0.03	0.33	0.01	0.28	0.24	0.26
N2	0.04	0.00	0.16	0.20	0.00	0.12	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.25	0.04	0.23	0.01	0.19	0.15	0.17
N3	0.04	0.00	0.14	0.15	0.00	0.09	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.17	0.04	0.23	0.00	0.18	0.13	0.15
N7	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.43	0.02	0.37	0.33	0.36
N9	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.27	0.01	0.22	0.12	0.18
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.08	0.03	0.12	0.17	0.13	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.07	0.13	0.10	0.04
O3'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.07	0.10	0.13	0.25	0.17	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.15	0.06	0.24	0.08	0.13
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.21	0.06
O5'	0.12	0.26	0.18	0.22	0.29	0.01	0.38	0.01	0.38	0.39	0.33	0.23	0.23	0.43	0.27	0.07	0.15	0.03	0.00	0.42	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.06	0.02	0.42	0.00	0.39	0.38	0.38
OP1	0.12	0.22	0.20	0.25	0.23	0.09	0.32	0.12	0.34	0.31	0.28	0.19	0.18	0.37	0.22	0.13	0.24	0.05	0.02	0.39	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.17	0.07	0.06	0.16	0.21	0.27	0.27	0.31	0.22	0.24	0.15	0.13	0.33	0.12	0.10	0.08	0.21	0.02	0.38	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.19	0.11	0.15	0.21	0.03	0.30	0.01	0.32	0.29	0.26	0.17	0.15	0.36	0.18	0.04	0.13	0.06	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00