Doublet Group distance statistics: 51756

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 1, 2, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.011, 0.031, 0.052, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.015, 0.038, 0.061, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.013, 0.037, 0.061, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.037 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.013, 0.041, 0.070, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.010, 0.038, 0.066, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.038 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.012, 0.049, 0.086, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.049 std_dev=0.037
C4	B	0, 0.077, 0.319, 0.561, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.319 std_dev=0.242
N9	B	0, 0.122, 0.372, 0.622, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.372 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.120, 0.373, 0.627, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.373 std_dev=0.254
N3	B	0, 0.097, 0.351, 0.604, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.351 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.172, 0.435, 0.698, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.435 std_dev=0.263
N1	B	0, 0.106, 0.375, 0.644, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.375 std_dev=0.269
C5	B	0, 0.120, 0.402, 0.684, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.402 std_dev=0.282
C6	B	0, 0.157, 0.446, 0.734, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.446 std_dev=0.289
O4'	B	0, 0.212, 0.514, 0.816, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.514 std_dev=0.302
C8	B	0, 0.177, 0.480, 0.783, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.480 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.149, 0.465, 0.781, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.465 std_dev=0.316
N2	B	0, 0.178, 0.495, 0.812, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.495 std_dev=0.317
C2'	A	0, 0.133, 0.464, 0.795, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.464 std_dev=0.331
N7	B	0, 0.197, 0.530, 0.863, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.530 std_dev=0.333
O6	B	0, 0.249, 0.592, 0.936, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.592 std_dev=0.343
O2'	B	0, 0.234, 0.601, 0.967, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.601 std_dev=0.366
O4'	A	0, 0.131, 0.512, 0.892, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.512 std_dev=0.381
C3'	B	0, 0.126, 0.539, 0.952, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.539 std_dev=0.413
O5'	A	0, 0.260, 0.679, 1.098, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.679 std_dev=0.419
C4'	B	0, 0.174, 0.606, 1.038, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.606 std_dev=0.432
C3'	A	0, 0.054, 0.530, 1.006, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.530 std_dev=0.476
C4'	A	0, 0.192, 0.680, 1.169, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.680 std_dev=0.488
O3'	B	0, 0.186, 0.684, 1.183, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.684 std_dev=0.499
O5'	B	0, 0.076, 0.636, 1.197, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.636 std_dev=0.561
C5'	B	0, 0.106, 0.668, 1.231, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.668 std_dev=0.563
O2'	A	0, 0.285, 0.944, 1.602, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.944 std_dev=0.658
P	B	0, 0.099, 0.810, 1.520, 2.292 max_d=2.292 avg_d=0.810 std_dev=0.711
C5'	A	0, 0.371, 1.291, 2.211, 2.485 max_d=2.485 avg_d=1.291 std_dev=0.920
OP2	B	0, 0.291, 1.212, 2.133, 2.838 max_d=2.838 avg_d=1.212 std_dev=0.921
P	A	0, 0.123, 1.069, 2.014, 2.972 max_d=2.972 avg_d=1.069 std_dev=0.945
O3'	A	0, -0.307, 0.645, 1.597, 3.109 max_d=3.109 avg_d=0.645 std_dev=0.952
OP2	A	0, 0.483, 1.467, 2.452, 2.594 max_d=2.594 avg_d=1.467 std_dev=0.985
OP1	B	0, 0.318, 1.519, 2.721, 3.841 max_d=3.841 avg_d=1.519 std_dev=1.201
OP1	A	0, 0.044, 1.625, 3.206, 5.160 max_d=5.160 avg_d=1.625 std_dev=1.581

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.24	0.00	0.22	0.30	0.61	0.27
C2	0.04	0.00	0.22	0.15	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.40	0.25	0.09	0.31	0.60	0.76	0.46
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.10	0.02	0.04	0.16	0.08	0.13	0.16	0.22	0.06	0.10	0.03	0.00	0.05	0.03	0.52	0.68	0.64	0.46
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.15	0.00	0.22	0.04	0.21	0.30	0.17	0.13	0.25	0.30	0.17	0.01	0.01	0.01	0.34	0.66	0.41	0.29
C4	0.02	0.00	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.15	0.05	0.32	0.61	0.75	0.48
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.16	0.05	0.04	0.11	0.16	0.08	0.22	0.02	0.00	0.02	0.32	0.38	0.09
C5	0.02	0.01	0.04	0.22	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.12	0.02	0.38	0.82	0.77	0.61
C5'	0.07	0.13	0.16	0.04	0.13	0.01	0.18	0.00	0.18	0.21	0.16	0.11	0.22	0.23	0.12	0.07	0.16	0.02	0.01	0.26	0.39	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.21	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.11	0.03	0.38	0.87	0.79	0.63
C8	0.01	0.00	0.13	0.30	0.00	0.16	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.23	0.08	0.38	0.79	0.73	0.60
N1	0.03	0.00	0.16	0.17	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.39	0.16	0.07	0.35	0.75	0.78	0.56
N3	0.04	0.00	0.22	0.13	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.37	0.27	0.10	0.29	0.51	0.74	0.41
N6	0.03	0.01	0.06	0.25	0.01	0.11	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.37	0.13	0.03	0.41	1.00	0.79	0.71
N7	0.01	0.01	0.10	0.30	0.00	0.16	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.29	0.22	0.05	0.42	0.95	0.76	0.69
N9	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.18	0.13	0.01	0.30	0.53	0.71	0.44
O2'	0.02	0.40	0.00	0.01	0.28	0.22	0.31	0.07	0.36	0.24	0.39	0.37	0.37	0.29	0.18	0.00	0.09	0.15	0.46	0.75	0.68	0.49
O3'	0.24	0.25	0.05	0.01	0.15	0.02	0.12	0.16	0.11	0.23	0.16	0.27	0.13	0.22	0.13	0.09	0.00	0.17	0.30	0.63	0.45	0.26
O4'	0.00	0.09	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.03	0.08	0.07	0.10	0.03	0.05	0.01	0.15	0.17	0.00	0.11	0.31	0.57	0.33
O5'	0.22	0.31	0.52	0.34	0.32	0.02	0.38	0.01	0.38	0.38	0.35	0.29	0.41	0.42	0.30	0.46	0.30	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.30	0.60	0.68	0.66	0.61	0.32	0.82	0.26	0.87	0.79	0.75	0.51	1.00	0.95	0.53	0.75	0.63	0.31	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.61	0.76	0.64	0.41	0.75	0.38	0.77	0.39	0.79	0.73	0.78	0.74	0.79	0.76	0.71	0.68	0.45	0.57	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.46	0.46	0.29	0.48	0.09	0.61	0.01	0.63	0.60	0.56	0.41	0.71	0.69	0.44	0.49	0.26	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.07	0.19	0.15	0.05	0.21	0.18	0.18	0.24	0.12	0.17	0.08	0.07	0.21	0.09	0.27	0.17	0.21	0.22	0.32	0.80	0.38	0.20
C2	0.18	0.18	0.18	0.19	0.15	0.19	0.16	0.23	0.17	0.18	0.14	0.24	0.18	0.19	0.17	0.19	0.19	0.19	0.31	0.23	0.67	0.75	0.29
C2'	0.24	0.16	0.23	0.19	0.10	0.27	0.27	0.22	0.38	0.16	0.30	0.16	0.09	0.30	0.10	0.35	0.22	0.27	0.18	0.51	0.94	0.30	0.22
C3'	0.39	0.06	0.40	0.38	0.14	0.44	0.24	0.41	0.28	0.30	0.17	0.09	0.13	0.34	0.25	0.52	0.42	0.43	0.45	0.41	0.68	0.59	0.28
C4	0.16	0.11	0.16	0.15	0.10	0.17	0.12	0.18	0.17	0.11	0.13	0.16	0.14	0.14	0.11	0.21	0.15	0.17	0.25	0.24	0.67	0.54	0.20
C4'	0.50	0.22	0.52	0.48	0.33	0.49	0.37	0.41	0.35	0.46	0.25	0.19	0.28	0.46	0.42	0.59	0.51	0.49	0.42	0.41	0.77	0.46	0.32
C5	0.15	0.13	0.14	0.14	0.12	0.16	0.14	0.17	0.18	0.12	0.14	0.17	0.15	0.15	0.11	0.20	0.14	0.17	0.22	0.23	0.63	0.47	0.19
C5'	0.77	0.34	0.84	0.81	0.48	0.80	0.43	0.68	0.36	0.58	0.30	0.33	0.45	0.51	0.60	0.94	0.88	0.77	0.58	0.38	0.89	0.55	0.55
C6	0.15	0.15	0.15	0.14	0.13	0.16	0.14	0.16	0.17	0.12	0.14	0.22	0.16	0.15	0.12	0.20	0.14	0.16	0.22	0.22	0.61	0.55	0.21
C8	0.15	0.10	0.16	0.16	0.14	0.20	0.20	0.21	0.22	0.17	0.17	0.07	0.12	0.21	0.14	0.24	0.17	0.20	0.24	0.26	0.68	0.29	0.22
N1	0.15	0.16	0.15	0.16	0.13	0.16	0.15	0.18	0.17	0.15	0.13	0.24	0.17	0.17	0.13	0.18	0.15	0.16	0.27	0.23	0.63	0.68	0.25
N3	0.19	0.16	0.19	0.19	0.14	0.20	0.14	0.23	0.16	0.17	0.14	0.21	0.17	0.18	0.16	0.21	0.19	0.20	0.31	0.24	0.69	0.69	0.26
N6	0.17	0.17	0.16	0.16	0.14	0.18	0.15	0.17	0.19	0.13	0.17	0.22	0.18	0.16	0.14	0.22	0.16	0.18	0.21	0.23	0.57	0.51	0.21
N7	0.17	0.13	0.16	0.17	0.15	0.21	0.18	0.21	0.21	0.16	0.17	0.12	0.16	0.19	0.15	0.23	0.17	0.21	0.23	0.24	0.63	0.34	0.22
N9	0.15	0.08	0.16	0.14	0.08	0.17	0.16	0.17	0.21	0.11	0.15	0.10	0.10	0.18	0.09	0.23	0.15	0.17	0.23	0.27	0.71	0.40	0.19
O2'	0.32	0.37	0.31	0.37	0.33	0.43	0.50	0.47	0.59	0.47	0.50	0.36	0.28	0.58	0.33	0.33	0.37	0.42	0.43	0.72	1.41	0.35	0.67
O3'	0.52	0.39	0.51	0.51	0.49	0.54	0.61	0.55	0.62	0.64	0.48	0.33	0.40	0.72	0.53	0.56	0.51	0.54	0.72	0.73	0.51	0.91	0.50
O4'	0.35	0.23	0.36	0.31	0.32	0.29	0.37	0.24	0.36	0.36	0.28	0.19	0.26	0.41	0.34	0.41	0.33	0.29	0.30	0.39	0.77	0.38	0.27
O5'	0.28	0.34	0.34	0.28	0.32	0.26	0.38	0.30	0.38	0.40	0.34	0.36	0.33	0.44	0.32	0.47	0.34	0.24	0.35	0.42	0.79	0.28	0.42
OP1	0.92	1.12	1.15	0.96	0.92	0.72	0.75	0.55	0.79	0.59	0.96	1.24	1.14	0.58	0.81	1.37	1.06	0.63	0.53	0.70	0.77	0.50	0.49
OP2	0.56	0.73	0.66	0.67	0.68	0.61	0.74	0.56	0.80	0.61	0.79	0.72	0.68	0.70	0.60	0.79	0.82	0.49	0.47	0.85	0.93	0.50	0.52
P	0.52	0.70	0.61	0.51	0.62	0.40	0.60	0.35	0.63	0.50	0.67	0.75	0.69	0.55	0.54	0.73	0.59	0.39	0.37	0.62	0.70	0.27	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.27	0.23	0.04
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.02	0.13	0.01	0.34	0.58	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.13	0.27	0.07
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.23	0.28	0.11
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.14	0.01	0.35	0.54	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.15	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.18	0.01	0.40	0.68	0.15
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.09	0.06	0.05	0.12	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.13	0.11	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.19	0.00	0.41	0.75	0.17
C8	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.18	0.01	0.41	0.56	0.11
N1	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.16	0.01	0.38	0.68	0.15
N2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.03	0.12	0.01	0.32	0.55	0.12
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.02	0.11	0.01	0.31	0.49	0.09
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.20	0.01	0.44	0.72	0.16
N9	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.34	0.44	0.08
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.09	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03	0.11	0.23	0.07
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.04	0.10	0.11	0.10	0.12	0.09	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.12	0.44	0.38	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.34	0.11	0.07
O5'	0.05	0.13	0.04	0.07	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.16	0.12	0.11	0.20	0.13	0.05	0.10	0.05	0.00	0.20	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.02	0.20	0.00	0.43	0.83	0.20
OP1	0.27	0.34	0.13	0.23	0.35	0.08	0.40	0.11	0.41	0.41	0.38	0.32	0.31	0.44	0.34	0.11	0.44	0.34	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.58	0.27	0.28	0.54	0.15	0.68	0.23	0.75	0.56	0.68	0.55	0.49	0.72	0.44	0.23	0.38	0.11	0.02	0.83	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.12	0.07	0.11	0.11	0.02	0.15	0.01	0.17	0.11	0.15	0.12	0.09	0.16	0.08	0.07	0.16	0.07	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00