Doublet Group distance statistics: 51758

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.005, 0.025, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.016, 0.038, 0.059, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.038 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.011, 0.035, 0.060, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.034 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.007, 0.036, 0.065, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.036 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.024, 0.057, 0.090, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.057 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.006, 0.056, 0.105, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.056 std_dev=0.050
N3	B	0, 0.226, 0.464, 0.702, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.464 std_dev=0.238
C4	B	0, 0.255, 0.529, 0.803, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.529 std_dev=0.274
C2'	A	0, 0.110, 0.401, 0.691, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.401 std_dev=0.290
O4'	A	0, 0.074, 0.379, 0.683, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.379 std_dev=0.305
N9	B	0, 0.259, 0.570, 0.880, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.570 std_dev=0.311
C1'	B	0, 0.257, 0.598, 0.939, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.598 std_dev=0.341
C2	B	0, 0.220, 0.582, 0.944, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.582 std_dev=0.362
C2'	B	0, 0.316, 0.692, 1.068, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.692 std_dev=0.376
O2'	A	0, 0.204, 0.594, 0.983, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.594 std_dev=0.390
C4'	A	0, 0.146, 0.553, 0.959, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.553 std_dev=0.407
C3'	A	0, 0.186, 0.601, 1.015, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.601 std_dev=0.415
O2'	B	0, 0.277, 0.693, 1.109, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.693 std_dev=0.416
C5	B	0, 0.299, 0.723, 1.147, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.723 std_dev=0.424
N2	B	0, 0.237, 0.671, 1.105, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.671 std_dev=0.434
C8	B	0, 0.281, 0.746, 1.212, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.746 std_dev=0.465
N1	B	0, 0.261, 0.753, 1.245, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.753 std_dev=0.492
O3'	A	0, 0.355, 0.855, 1.355, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.855 std_dev=0.500
N7	B	0, 0.341, 0.855, 1.369, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.855 std_dev=0.514
C6	B	0, 0.341, 0.858, 1.375, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.858 std_dev=0.517
O4'	B	0, 0.347, 0.876, 1.405, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.876 std_dev=0.529
C3'	B	0, 0.417, 1.007, 1.597, 1.892 max_d=1.892 avg_d=1.007 std_dev=0.590
O3'	B	0, 0.576, 1.214, 1.852, 2.078 max_d=2.078 avg_d=1.214 std_dev=0.638
O6	B	0, 0.467, 1.111, 1.754, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.111 std_dev=0.643
OP1	A	0, 0.558, 1.220, 1.882, 2.126 max_d=2.126 avg_d=1.220 std_dev=0.662
O5'	A	0, 0.480, 1.142, 1.804, 1.984 max_d=1.984 avg_d=1.142 std_dev=0.662
C4'	B	0, 0.420, 1.109, 1.799, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.109 std_dev=0.690
C5'	A	0, 0.272, 0.974, 1.675, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.974 std_dev=0.702
O5'	B	0, 0.223, 1.220, 2.216, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.220 std_dev=0.996
P	A	0, 0.955, 1.969, 2.984, 3.108 max_d=3.108 avg_d=1.969 std_dev=1.014
C5'	B	0, 0.386, 1.401, 2.416, 2.996 max_d=2.996 avg_d=1.401 std_dev=1.015
OP2	B	0, 0.693, 2.316, 3.939, 4.415 max_d=4.415 avg_d=2.316 std_dev=1.623
P	B	0, 0.235, 1.887, 3.539, 4.080 max_d=4.080 avg_d=1.887 std_dev=1.652
OP2	A	0, 1.973, 3.670, 5.368, 5.206 max_d=5.206 avg_d=3.670 std_dev=1.698
OP1	B	0, -0.036, 2.554, 5.145, 5.879 max_d=5.879 avg_d=2.554 std_dev=2.590

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.21	0.32	0.29	0.25
C2	0.04	0.00	0.12	0.17	0.01	0.28	0.01	0.48	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.22	0.18	0.21	0.33	0.13	0.54	0.26
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.12	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.29	0.24	0.34	0.20
C3'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.14	0.06	0.16	0.15	0.13	0.08	0.07	0.02	0.01	0.02	0.45	0.40	0.44	0.38
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.13	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.10	0.34	0.21	0.46	0.30
C4'	0.01	0.28	0.01	0.00	0.13	0.00	0.08	0.00	0.14	0.07	0.23	0.26	0.12	0.03	0.03	0.09	0.02	0.01	0.02	0.22	0.22	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.10	0.04	0.39	0.28	0.57	0.39
C5'	0.01	0.48	0.02	0.01	0.24	0.00	0.19	0.00	0.28	0.09	0.41	0.43	0.25	0.08	0.08	0.08	0.05	0.01	0.01	0.37	0.30	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.14	0.01	0.28	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.13	0.08	0.41	0.24	0.65	0.39
C8	0.02	0.02	0.05	0.06	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.03	0.11	0.35	0.40	0.47	0.40
N1	0.03	0.01	0.09	0.16	0.01	0.23	0.01	0.41	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.20	0.17	0.16	0.37	0.18	0.63	0.34
N3	0.04	0.01	0.12	0.15	0.00	0.26	0.01	0.43	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.14	0.21	0.30	0.10	0.43	0.23
N6	0.02	0.02	0.04	0.13	0.01	0.12	0.02	0.25	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.15	0.13	0.06	0.43	0.28	0.72	0.44
N7	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.09	0.06	0.06	0.40	0.38	0.57	0.44
N9	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.31	0.31	0.40	0.32
O2'	0.01	0.22	0.00	0.02	0.14	0.09	0.12	0.08	0.16	0.08	0.20	0.20	0.15	0.09	0.06	0.00	0.05	0.07	0.16	0.16	0.32	0.11
O3'	0.03	0.18	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.05	0.13	0.03	0.17	0.14	0.13	0.06	0.04	0.05	0.00	0.02	0.51	0.47	0.64	0.50
O4'	0.01	0.21	0.01	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.11	0.16	0.21	0.06	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.33	0.36	0.43	0.40
O5'	0.21	0.33	0.29	0.45	0.34	0.02	0.39	0.01	0.41	0.35	0.37	0.30	0.43	0.40	0.31	0.16	0.51	0.33	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.32	0.13	0.24	0.40	0.21	0.22	0.28	0.37	0.24	0.40	0.18	0.10	0.28	0.38	0.31	0.16	0.47	0.36	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.54	0.34	0.44	0.46	0.22	0.57	0.30	0.65	0.47	0.63	0.43	0.72	0.57	0.40	0.32	0.64	0.43	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.26	0.20	0.38	0.30	0.08	0.39	0.01	0.39	0.40	0.34	0.23	0.44	0.44	0.32	0.11	0.50	0.40	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.21	0.22	0.33	0.20	0.36	0.24	0.47	0.26	0.22	0.23	0.20	0.19	0.25	0.20	0.18	0.34	0.30	0.20	0.28	0.48	0.41	0.51
C2	0.17	0.34	0.18	0.18	0.17	0.14	0.16	0.12	0.15	0.27	0.27	0.43	0.29	0.31	0.16	0.20	0.19	0.16	0.41	0.16	0.65	0.72	0.45
C2'	0.23	0.23	0.20	0.19	0.16	0.24	0.27	0.21	0.36	0.14	0.32	0.22	0.15	0.26	0.14	0.26	0.19	0.26	0.39	0.45	0.17	0.29	0.16
C3'	0.26	0.10	0.24	0.23	0.10	0.25	0.08	0.24	0.12	0.25	0.13	0.13	0.09	0.15	0.21	0.27	0.23	0.26	0.52	0.19	0.22	0.42	0.26
C4	0.20	0.23	0.19	0.20	0.17	0.25	0.14	0.25	0.15	0.14	0.19	0.25	0.22	0.14	0.16	0.20	0.21	0.25	0.15	0.15	0.21	0.32	0.13
C4'	0.14	0.11	0.14	0.21	0.08	0.26	0.08	0.34	0.09	0.14	0.10	0.14	0.10	0.13	0.11	0.15	0.24	0.20	0.20	0.13	0.42	0.32	0.36
C5	0.26	0.14	0.23	0.25	0.14	0.34	0.13	0.34	0.13	0.15	0.09	0.17	0.19	0.18	0.17	0.26	0.26	0.35	0.12	0.18	0.23	0.31	0.15
C5'	0.15	0.18	0.15	0.16	0.18	0.24	0.25	0.30	0.26	0.29	0.21	0.19	0.16	0.34	0.19	0.16	0.19	0.19	0.27	0.33	0.29	0.39	0.25
C6	0.23	0.17	0.21	0.19	0.12	0.26	0.21	0.22	0.23	0.19	0.10	0.25	0.23	0.28	0.13	0.28	0.20	0.28	0.19	0.32	0.46	0.50	0.24
C8	0.31	0.09	0.29	0.44	0.17	0.56	0.17	0.64	0.14	0.25	0.10	0.08	0.13	0.21	0.24	0.26	0.44	0.53	0.31	0.15	0.40	0.34	0.50
N1	0.17	0.30	0.18	0.16	0.13	0.15	0.21	0.10	0.19	0.25	0.14	0.41	0.28	0.35	0.13	0.22	0.17	0.18	0.34	0.32	0.67	0.69	0.42
N3	0.18	0.31	0.18	0.18	0.20	0.16	0.16	0.12	0.20	0.21	0.29	0.36	0.27	0.19	0.17	0.19	0.18	0.18	0.34	0.19	0.43	0.53	0.29
N6	0.27	0.11	0.25	0.23	0.14	0.33	0.28	0.29	0.37	0.18	0.27	0.15	0.19	0.30	0.15	0.35	0.25	0.34	0.17	0.46	0.48	0.49	0.24
N7	0.35	0.06	0.31	0.41	0.15	0.54	0.15	0.56	0.14	0.21	0.10	0.05	0.12	0.18	0.23	0.33	0.41	0.52	0.25	0.17	0.22	0.24	0.34
N9	0.22	0.19	0.22	0.31	0.19	0.38	0.20	0.44	0.20	0.19	0.19	0.18	0.19	0.20	0.20	0.20	0.31	0.35	0.13	0.20	0.25	0.26	0.34
O2'	0.29	0.40	0.29	0.32	0.38	0.32	0.55	0.30	0.62	0.44	0.53	0.36	0.33	0.62	0.32	0.32	0.31	0.34	0.38	0.72	0.52	0.72	0.53
O3'	0.29	0.12	0.27	0.28	0.09	0.35	0.11	0.36	0.21	0.21	0.20	0.14	0.08	0.13	0.20	0.32	0.28	0.34	0.59	0.30	0.25	0.41	0.31
O4'	0.22	0.15	0.25	0.37	0.14	0.45	0.11	0.56	0.11	0.13	0.12	0.17	0.16	0.11	0.16	0.24	0.40	0.37	0.20	0.12	0.55	0.35	0.51
O5'	0.35	0.45	0.35	0.34	0.38	0.33	0.38	0.36	0.43	0.30	0.46	0.47	0.42	0.31	0.35	0.36	0.34	0.32	0.23	0.44	0.45	0.38	0.41
OP1	0.33	0.16	0.33	0.34	0.17	0.39	0.13	0.45	0.15	0.22	0.17	0.19	0.18	0.15	0.25	0.38	0.35	0.36	0.41	0.21	0.53	0.43	0.46
OP2	0.32	0.40	0.31	0.25	0.33	0.25	0.32	0.29	0.36	0.29	0.40	0.44	0.37	0.30	0.31	0.36	0.25	0.25	0.26	0.38	0.46	0.45	0.41
P	0.23	0.19	0.22	0.17	0.16	0.19	0.16	0.25	0.20	0.19	0.21	0.22	0.18	0.17	0.19	0.28	0.17	0.19	0.23	0.24	0.36	0.34	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.03	0.48	0.24	0.18
C2	0.06	0.00	0.23	0.28	0.01	0.13	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.34	0.03	0.25	0.02	0.93	0.56	0.47
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.13	0.02	0.09	0.01	0.13	0.06	0.19	0.27	0.22	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.54	0.16	0.15
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.18	0.00	0.16	0.02	0.21	0.07	0.26	0.32	0.25	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.18	0.20	0.53	0.13	0.14
C4	0.03	0.01	0.13	0.18	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01	0.23	0.01	0.78	0.49	0.40
C4'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.04	0.12	0.16	0.12	0.06	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.11	0.33	0.09	0.08
C5	0.02	0.02	0.09	0.16	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.17	0.02	0.26	0.01	0.82	0.55	0.44
C5'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.11	0.01	0.11	0.00	0.14	0.05	0.15	0.17	0.13	0.09	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.16	0.15	0.02	0.01
C6	0.03	0.02	0.13	0.21	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.24	0.02	0.28	0.01	0.91	0.61	0.49
C8	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.07	0.04	0.21	0.02	0.57	0.40	0.30
N1	0.05	0.01	0.19	0.26	0.01	0.12	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.15	0.32	0.02	0.28	0.01	0.96	0.61	0.50
N2	0.08	0.00	0.27	0.32	0.01	0.16	0.03	0.17	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.24	0.41	0.05	0.26	0.04	0.97	0.57	0.48
N3	0.06	0.01	0.22	0.25	0.01	0.12	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.16	0.29	0.04	0.24	0.02	0.84	0.50	0.41
N7	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.04	0.24	0.02	0.69	0.51	0.39
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.20	0.02	0.62	0.38	0.30
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.08	0.04	0.06	0.04	0.10	0.04	0.15	0.24	0.16	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.09	0.47	0.14	0.13
O3'	0.01	0.34	0.01	0.01	0.19	0.01	0.17	0.02	0.24	0.07	0.32	0.41	0.29	0.09	0.07	0.02	0.00	0.01	0.27	0.24	0.49	0.16	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.15	0.03	0.34	0.18	0.12
O5'	0.11	0.25	0.09	0.18	0.23	0.02	0.26	0.01	0.28	0.21	0.28	0.26	0.24	0.24	0.20	0.07	0.27	0.15	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.12	0.20	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.09	0.24	0.03	0.29	0.00	0.93	0.64	0.52
OP1	0.48	0.93	0.54	0.53	0.78	0.33	0.82	0.15	0.91	0.57	0.96	0.97	0.84	0.69	0.62	0.47	0.49	0.34	0.01	0.93	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.56	0.16	0.13	0.49	0.09	0.55	0.02	0.61	0.40	0.61	0.57	0.50	0.51	0.38	0.14	0.16	0.18	0.01	0.64	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.47	0.15	0.14	0.40	0.08	0.44	0.01	0.49	0.30	0.50	0.48	0.41	0.39	0.30	0.13	0.13	0.12	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00