Doublet Group distance statistics: 51760

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.005, 0.028, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.028 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.011, 0.039, 0.067, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.039 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.006, 0.037, 0.069, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.037 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.006, 0.045, 0.084, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.045 std_dev=0.039
C1'	B	0, 0.260, 0.491, 0.723, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.491 std_dev=0.232
N9	B	0, 0.212, 0.482, 0.753, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.482 std_dev=0.270
C4	B	0, 0.319, 0.597, 0.874, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.597 std_dev=0.277
N3	B	0, 0.343, 0.649, 0.955, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.649 std_dev=0.306
C5	B	0, 0.385, 0.739, 1.094, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.739 std_dev=0.354
C2	B	0, 0.443, 0.818, 1.193, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.818 std_dev=0.375
C8	B	0, 0.189, 0.578, 0.968, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.578 std_dev=0.390
C6	B	0, 0.495, 0.910, 1.325, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.910 std_dev=0.415
N1	B	0, 0.508, 0.923, 1.339, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.923 std_dev=0.415
N7	B	0, 0.326, 0.745, 1.163, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.745 std_dev=0.418
N2	B	0, 0.509, 0.947, 1.385, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.947 std_dev=0.438
O6	B	0, 0.576, 1.072, 1.569, 1.567 max_d=1.567 avg_d=1.072 std_dev=0.496
C2'	B	0, 0.466, 1.045, 1.625, 1.972 max_d=1.972 avg_d=1.045 std_dev=0.580
O2'	B	0, 0.671, 1.421, 2.171, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.421 std_dev=0.750
O4'	B	0, 0.091, 0.843, 1.595, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.843 std_dev=0.752
C3'	B	0, 0.351, 1.311, 2.271, 2.723 max_d=2.723 avg_d=1.311 std_dev=0.960
C4'	B	0, 0.152, 1.123, 2.095, 2.612 max_d=2.612 avg_d=1.123 std_dev=0.972
O4'	A	0, -0.208, 0.830, 1.868, 2.636 max_d=2.636 avg_d=0.830 std_dev=1.038
C2'	A	0, -0.190, 0.878, 1.945, 2.696 max_d=2.696 avg_d=0.878 std_dev=1.068
O3'	B	0, 0.617, 1.893, 3.169, 3.668 max_d=3.668 avg_d=1.893 std_dev=1.276
O2'	A	0, -0.260, 1.098, 2.456, 3.160 max_d=3.160 avg_d=1.098 std_dev=1.358
C4'	A	0, -0.226, 1.247, 2.719, 3.679 max_d=3.679 avg_d=1.247 std_dev=1.473
C3'	A	0, -0.264, 1.303, 2.870, 4.130 max_d=4.130 avg_d=1.303 std_dev=1.567
C5'	B	0, -0.076, 1.594, 3.264, 4.428 max_d=4.428 avg_d=1.594 std_dev=1.670
O5'	B	0, -0.197, 1.667, 3.530, 5.279 max_d=5.279 avg_d=1.667 std_dev=1.864
O3'	A	0, -0.362, 1.642, 3.647, 5.549 max_d=5.549 avg_d=1.642 std_dev=2.005
C5'	A	0, -0.426, 2.094, 4.614, 6.630 max_d=6.630 avg_d=2.094 std_dev=2.520
O5'	A	0, -0.363, 2.364, 5.090, 7.860 max_d=7.860 avg_d=2.364 std_dev=2.726
P	B	0, -0.284, 2.477, 5.239, 8.184 max_d=8.184 avg_d=2.477 std_dev=2.761
OP2	B	0, -0.239, 2.766, 5.771, 9.118 max_d=9.118 avg_d=2.766 std_dev=3.005
OP1	B	0, -0.291, 2.852, 5.996, 8.847 max_d=8.847 avg_d=2.852 std_dev=3.144
P	A	0, -0.496, 2.954, 6.404, 10.368 max_d=10.368 avg_d=2.954 std_dev=3.450
OP1	A	0, -0.095, 3.543, 7.181, 11.298 max_d=11.298 avg_d=3.543 std_dev=3.638
OP2	A	0, -1.074, 2.879, 6.832, 11.537 max_d=11.537 avg_d=2.879 std_dev=3.953

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.23	0.00	0.31	0.54	0.68	0.18
C2	0.02	0.00	0.43	0.33	0.01	0.54	0.00	0.94	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.53	0.05	0.61	1.20	2.35	0.78	1.42
C2'	0.00	0.43	0.00	0.00	0.23	0.01	0.13	0.16	0.22	0.20	0.35	0.42	0.17	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01	0.58	0.86	0.72	0.52
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.25	0.00	0.29	0.01	0.32	0.30	0.32	0.30	0.35	0.33	0.19	0.01	0.00	0.01	0.29	0.71	0.52	0.28
C4	0.01	0.01	0.23	0.25	0.00	0.21	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.07	0.31	0.58	1.26	0.40	0.41
C4'	0.01	0.54	0.01	0.00	0.21	0.00	0.06	0.00	0.15	0.41	0.37	0.54	0.07	0.31	0.08	0.23	0.01	0.00	0.01	0.31	0.51	0.12
C5	0.01	0.00	0.13	0.29	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.16	0.12	0.49	0.92	0.81	0.12
C5'	0.06	0.94	0.16	0.01	0.32	0.00	0.05	0.00	0.25	0.65	0.66	0.89	0.09	0.51	0.12	0.06	0.18	0.01	0.01	0.27	0.44	0.01
C6	0.01	0.00	0.22	0.32	0.00	0.15	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.17	0.25	0.59	1.35	0.45	0.43
C8	0.01	0.01	0.20	0.30	0.00	0.41	0.00	0.65	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.46	0.20	0.35	0.83	0.21	1.71	0.91
N1	0.01	0.00	0.35	0.32	0.00	0.37	0.01	0.66	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.39	0.10	0.46	0.94	1.99	0.38	1.05
N3	0.02	0.00	0.42	0.30	0.00	0.54	0.00	0.89	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.52	0.08	0.63	1.09	2.08	0.60	1.21
N6	0.01	0.00	0.17	0.35	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.24	0.15	0.52	1.11	0.71	0.22
N7	0.01	0.01	0.10	0.33	0.00	0.31	0.00	0.51	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.23	0.20	0.72	0.20	1.59	0.72
N9	0.00	0.01	0.03	0.19	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.11	0.02	0.44	0.58	0.92	0.24
O2'	0.02	0.53	0.00	0.01	0.23	0.23	0.20	0.06	0.23	0.46	0.39	0.52	0.23	0.39	0.16	0.00	0.04	0.17	0.31	0.72	0.59	0.36
O3'	0.23	0.05	0.02	0.00	0.07	0.01	0.16	0.18	0.17	0.20	0.10	0.08	0.24	0.23	0.11	0.04	0.00	0.16	0.03	0.51	0.39	0.08
O4'	0.00	0.61	0.01	0.01	0.31	0.00	0.12	0.01	0.25	0.35	0.46	0.63	0.15	0.20	0.02	0.17	0.16	0.00	0.06	0.53	0.73	0.35
O5'	0.31	1.20	0.58	0.29	0.58	0.01	0.49	0.01	0.59	0.83	0.94	1.09	0.52	0.72	0.44	0.31	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.54	2.35	0.86	0.71	1.26	0.31	0.92	0.27	1.35	0.21	1.99	2.08	1.11	0.20	0.58	0.72	0.51	0.53	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.68	0.78	0.72	0.52	0.40	0.51	0.81	0.44	0.45	1.71	0.38	0.60	0.71	1.59	0.92	0.59	0.39	0.73	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	1.42	0.52	0.28	0.41	0.12	0.12	0.01	0.43	0.91	1.05	1.21	0.22	0.72	0.24	0.36	0.08	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.26	0.64	0.77	0.14	0.70	0.12	0.83	0.15	0.12	0.22	0.38	0.21	0.11	0.13	0.70	1.11	0.66	0.70	0.15	1.05	1.27	1.07
C2	0.10	0.27	0.57	0.49	0.09	0.61	0.09	0.82	0.17	0.13	0.25	0.32	0.19	0.08	0.08	0.68	0.75	0.64	0.56	0.16	0.80	0.33	0.59
C2'	0.23	0.24	0.95	1.06	0.22	0.57	0.20	0.73	0.19	0.23	0.22	0.31	0.23	0.21	0.23	0.99	1.36	0.30	0.86	0.19	1.23	1.77	1.36
C3'	0.77	0.48	1.51	1.82	0.59	1.39	0.46	1.52	0.34	0.60	0.32	0.49	0.63	0.50	0.67	1.44	2.27	0.91	1.55	0.27	1.90	2.40	2.00
C4	0.16	0.22	0.65	0.69	0.10	0.62	0.10	0.75	0.12	0.17	0.19	0.32	0.15	0.15	0.14	0.64	0.95	0.61	0.58	0.13	0.85	0.82	0.80
C4'	1.00	0.48	1.46	1.82	0.65	1.61	0.51	1.69	0.32	0.76	0.33	0.54	0.65	0.59	0.82	1.41	2.31	1.28	1.58	0.23	1.87	2.16	1.91
C5	0.20	0.16	0.61	0.65	0.15	0.55	0.16	0.65	0.10	0.24	0.13	0.25	0.13	0.22	0.20	0.54	0.85	0.53	0.54	0.11	0.81	0.70	0.76
C5'	1.62	0.76	2.12	2.46	1.05	2.23	0.82	2.26	0.54	1.23	0.56	0.85	1.03	0.95	1.32	2.19	3.00	1.82	2.09	0.40	2.32	2.60	2.38
C6	0.21	0.16	0.54	0.51	0.15	0.46	0.15	0.57	0.06	0.28	0.15	0.23	0.12	0.25	0.22	0.51	0.68	0.47	0.38	0.08	0.60	0.29	0.48
C8	0.20	0.15	0.65	0.79	0.16	0.64	0.17	0.77	0.14	0.22	0.13	0.25	0.15	0.21	0.19	0.55	1.02	0.57	0.75	0.16	1.12	1.21	1.14
N1	0.16	0.20	0.52	0.42	0.05	0.48	0.05	0.66	0.12	0.22	0.21	0.26	0.11	0.16	0.15	0.57	0.63	0.51	0.42	0.13	0.62	0.13	0.44
N3	0.12	0.28	0.63	0.63	0.11	0.67	0.10	0.83	0.16	0.12	0.24	0.36	0.21	0.09	0.09	0.74	0.92	0.68	0.58	0.15	0.85	0.64	0.69
N6	0.24	0.15	0.48	0.45	0.21	0.38	0.23	0.45	0.12	0.34	0.14	0.20	0.15	0.33	0.27	0.46	0.57	0.39	0.30	0.08	0.52	0.22	0.38
N7	0.22	0.15	0.62	0.73	0.20	0.58	0.21	0.69	0.16	0.26	0.12	0.22	0.17	0.26	0.23	0.50	0.90	0.53	0.68	0.17	1.02	0.98	1.01
N9	0.17	0.21	0.66	0.77	0.12	0.66	0.12	0.79	0.12	0.17	0.18	0.33	0.16	0.15	0.14	0.64	1.05	0.62	0.68	0.14	1.01	1.13	1.02
O2'	0.56	0.19	0.89	0.69	0.31	0.19	0.20	0.32	0.13	0.35	0.15	0.19	0.31	0.24	0.41	1.22	0.85	0.50	0.44	0.16	0.81	1.46	0.97
O3'	0.81	0.59	1.48	1.94	0.62	1.59	0.48	1.75	0.37	0.58	0.41	0.64	0.71	0.47	0.68	1.37	2.49	1.10	1.72	0.27	2.16	2.60	2.19
O4'	0.80	0.47	1.05	1.37	0.53	1.35	0.43	1.44	0.31	0.65	0.38	0.64	0.53	0.51	0.66	0.98	1.80	1.19	1.27	0.26	1.54	1.64	1.54
O5'	1.61	1.03	1.96	2.23	1.11	2.11	0.98	2.13	0.88	1.33	0.98	1.23	1.06	1.11	1.36	2.11	2.69	1.82	1.94	0.84	2.11	2.34	2.17
OP1	2.26	0.64	2.59	2.60	1.47	2.52	1.32	2.49	0.80	2.06	0.52	0.58	1.13	1.70	1.98	2.80	2.81	2.32	2.34	0.64	2.39	2.61	2.51
OP2	1.10	1.15	1.59	1.66	0.41	1.55	0.51	1.47	1.04	0.67	1.40	1.61	0.57	0.37	0.67	1.98	2.06	1.22	1.20	1.26	1.26	1.53	1.34
P	1.65	0.63	2.07	2.16	0.81	2.06	0.64	2.02	0.49	1.30	0.71	1.02	0.62	0.93	1.28	2.37	2.52	1.77	1.82	0.56	1.89	2.17	2.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.28	0.00	0.06	0.02	0.04	0.18	0.11
C2	0.05	0.00	0.39	0.63	0.01	0.43	0.01	0.68	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.56	0.30	0.96	0.01	1.33	1.42	1.42
C2'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.19	0.01	0.09	0.16	0.16	0.23	0.29	0.48	0.40	0.14	0.03	0.00	0.02	0.02	0.34	0.12	0.27	0.54	0.37
C3'	0.01	0.63	0.00	0.00	0.34	0.00	0.30	0.01	0.38	0.36	0.51	0.77	0.60	0.33	0.18	0.02	0.00	0.01	0.05	0.37	0.14	0.54	0.20
C4	0.03	0.01	0.19	0.34	0.00	0.20	0.00	0.31	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.21	0.15	0.50	0.01	0.66	0.63	0.69
C4'	0.01	0.43	0.01	0.00	0.20	0.00	0.12	0.01	0.19	0.30	0.33	0.55	0.41	0.22	0.07	0.25	0.01	0.00	0.01	0.16	0.15	0.38	0.07
C5	0.01	0.01	0.09	0.30	0.00	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.09	0.06	0.40	0.01	0.60	0.57	0.54
C5'	0.04	0.68	0.16	0.01	0.31	0.01	0.18	0.00	0.32	0.38	0.55	0.86	0.61	0.27	0.05	0.08	0.17	0.01	0.01	0.27	0.16	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.16	0.38	0.00	0.19	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.18	0.12	0.59	0.01	0.92	0.77	0.84
C8	0.02	0.01	0.23	0.36	0.00	0.30	0.00	0.38	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.41	0.31	0.19	0.48	0.01	0.42	0.82	0.52
N1	0.04	0.00	0.29	0.51	0.01	0.33	0.01	0.55	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.39	0.23	0.84	0.01	1.26	1.14	1.24
N2	0.06	0.00	0.48	0.77	0.01	0.55	0.01	0.86	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.76	0.36	1.14	0.01	1.62	1.86	1.74
N3	0.05	0.01	0.40	0.60	0.00	0.41	0.00	0.61	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.53	0.29	0.84	0.01	1.06	1.22	1.19
N7	0.01	0.01	0.14	0.33	0.00	0.22	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.40	0.25	0.10	0.40	0.01	0.40	0.88	0.46
N9	0.00	0.01	0.03	0.18	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.19	0.13	0.01	0.14	0.01	0.18	0.25	0.19
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.10	0.25	0.25	0.08	0.20	0.41	0.10	0.27	0.16	0.40	0.19	0.00	0.04	0.17	0.27	0.26	0.23	0.64	0.32
O3'	0.28	0.56	0.02	0.00	0.21	0.01	0.09	0.17	0.18	0.31	0.39	0.76	0.53	0.25	0.13	0.04	0.00	0.18	0.16	0.14	0.38	0.79	0.33
O4'	0.00	0.30	0.02	0.01	0.15	0.00	0.06	0.01	0.12	0.19	0.23	0.36	0.29	0.10	0.01	0.17	0.18	0.00	0.08	0.09	0.04	0.20	0.08
O5'	0.06	0.96	0.34	0.05	0.50	0.01	0.40	0.01	0.59	0.48	0.84	1.14	0.84	0.40	0.14	0.27	0.16	0.08	0.00	0.55	0.02	0.03	0.00
O6	0.02	0.01	0.12	0.37	0.01	0.16	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.14	0.09	0.55	0.00	0.90	0.79	0.76
OP1	0.04	1.33	0.27	0.14	0.66	0.15	0.60	0.16	0.92	0.42	1.26	1.62	1.06	0.40	0.18	0.23	0.38	0.04	0.02	0.90	0.00	0.00	0.01
OP2	0.18	1.42	0.54	0.54	0.63	0.38	0.57	0.30	0.77	0.82	1.14	1.86	1.22	0.88	0.25	0.64	0.79	0.20	0.03	0.79	0.00	0.00	0.00
P	0.11	1.42	0.37	0.20	0.69	0.07	0.54	0.02	0.84	0.52	1.24	1.74	1.19	0.46	0.19	0.32	0.33	0.08	0.00	0.76	0.01	0.00	0.00