Doublet Group distance statistics: 51761

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C2'	A	0, 0.017, 0.094, 0.172, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.094 std_dev=0.077
O4'	A	0, -0.007, 0.077, 0.162, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.077 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.058, 0.257, 0.456, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.257 std_dev=0.199
O2'	A	0, 0.013, 0.236, 0.459, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.236 std_dev=0.223
C3'	A	0, 0.056, 0.293, 0.529, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.293 std_dev=0.237
C5'	A	0, 0.089, 0.393, 0.698, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.393 std_dev=0.304
N3	B	0, 0.100, 0.430, 0.759, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.430 std_dev=0.329
C2	B	0, 0.127, 0.465, 0.803, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.465 std_dev=0.338
N1	B	0, 0.162, 0.509, 0.856, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.509 std_dev=0.347
C4	B	0, 0.134, 0.490, 0.846, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.490 std_dev=0.356
C6	B	0, 0.159, 0.560, 0.960, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.560 std_dev=0.400
C5	B	0, 0.162, 0.570, 0.977, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.570 std_dev=0.408
O3'	A	0, 0.084, 0.493, 0.901, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.493 std_dev=0.408
N9	B	0, 0.159, 0.581, 1.002, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.581 std_dev=0.422
C1'	B	0, 0.157, 0.586, 1.015, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.586 std_dev=0.429
N2	B	0, 0.094, 0.530, 0.966, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.530 std_dev=0.436
O6	B	0, 0.169, 0.645, 1.120, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.645 std_dev=0.476
N7	B	0, 0.211, 0.716, 1.222, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.716 std_dev=0.506
C8	B	0, 0.214, 0.720, 1.226, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.720 std_dev=0.506
O5'	A	0, 0.058, 0.668, 1.278, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.668 std_dev=0.610
C2'	B	0, 0.103, 1.045, 1.986, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.045 std_dev=0.941
O4'	B	0, 0.156, 1.207, 2.258, 2.940 max_d=2.940 avg_d=1.207 std_dev=1.051
P	A	0, -0.026, 1.037, 2.101, 2.820 max_d=2.820 avg_d=1.037 std_dev=1.064
OP2	A	0, -0.034, 1.194, 2.423, 3.302 max_d=3.302 avg_d=1.194 std_dev=1.228
O2'	B	0, 0.021, 1.280, 2.540, 3.173 max_d=3.173 avg_d=1.280 std_dev=1.259
C4'	B	0, 0.111, 1.450, 2.790, 3.631 max_d=3.631 avg_d=1.450 std_dev=1.340
OP1	A	0, 0.118, 1.552, 2.986, 3.604 max_d=3.604 avg_d=1.552 std_dev=1.434
C3'	B	0, 0.013, 1.521, 3.029, 3.735 max_d=3.735 avg_d=1.521 std_dev=1.508
O3'	B	0, -0.027, 1.681, 3.389, 4.165 max_d=4.165 avg_d=1.681 std_dev=1.708
C5'	B	0, -0.128, 2.374, 4.876, 6.280 max_d=6.280 avg_d=2.374 std_dev=2.502
O5'	B	0, -0.273, 2.756, 5.786, 7.391 max_d=7.391 avg_d=2.756 std_dev=3.029
OP2	B	0, -0.507, 3.483, 7.473, 9.607 max_d=9.607 avg_d=3.483 std_dev=3.990
P	B	0, -0.568, 3.634, 7.837, 10.001 max_d=10.001 avg_d=3.634 std_dev=4.203
OP1	B	0, -0.743, 4.192, 9.127, 11.556 max_d=11.556 avg_d=4.192 std_dev=4.935

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.05	0.49	0.18
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.07	0.03	0.34	0.08	0.45	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.26	0.28	0.07
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.15	0.20	0.11	0.06	0.17	0.21	0.11	0.01	0.01	0.00	0.26	0.44	0.18	0.15
C4	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.09	0.02	0.36	0.09	0.44	0.11
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.09	0.15	0.06	0.02	0.11	0.15	0.07	0.08	0.01	0.00	0.00	0.16	0.41	0.15
C5	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.16	0.03	0.42	0.16	0.38	0.10
C5'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.12	0.00	0.18	0.00	0.18	0.22	0.14	0.07	0.21	0.24	0.12	0.07	0.01	0.00	0.00	0.34	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.15	0.03	0.43	0.17	0.36	0.10
C8	0.02	0.01	0.05	0.20	0.00	0.15	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.22	0.04	0.44	0.20	0.38	0.14
N1	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.10	0.03	0.39	0.13	0.40	0.11
N3	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.06	0.03	0.31	0.06	0.47	0.17
N6	0.01	0.01	0.02	0.17	0.01	0.11	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.19	0.03	0.46	0.23	0.30	0.14
N7	0.02	0.00	0.04	0.21	0.00	0.15	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.24	0.04	0.46	0.23	0.33	0.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.02	0.35	0.09	0.44	0.11
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.13	0.08	0.10	0.07	0.14	0.02	0.19	0.20	0.12	0.03	0.04	0.00	0.03	0.08	0.08	0.11	0.38	0.23
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.15	0.22	0.10	0.06	0.19	0.24	0.10	0.03	0.00	0.01	0.16	0.52	0.12	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.15	0.09	0.61	0.29
O5'	0.22	0.34	0.24	0.26	0.36	0.00	0.42	0.00	0.43	0.44	0.39	0.31	0.46	0.46	0.35	0.08	0.16	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.08	0.26	0.44	0.09	0.16	0.16	0.34	0.17	0.20	0.13	0.06	0.23	0.23	0.09	0.11	0.52	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.49	0.45	0.28	0.18	0.44	0.41	0.38	0.34	0.36	0.38	0.40	0.47	0.30	0.33	0.44	0.38	0.12	0.61	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.15	0.07	0.15	0.11	0.15	0.10	0.01	0.10	0.14	0.11	0.17	0.14	0.16	0.11	0.23	0.15	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.19	0.76	0.97	0.17	0.72	0.25	1.37	0.22	0.32	0.15	0.40	0.13	0.34	0.22	0.80	0.90	0.28	1.99	0.26	3.51	2.20	2.54
C2	0.21	0.34	0.62	0.47	0.08	0.25	0.16	0.37	0.12	0.34	0.21	0.47	0.28	0.35	0.20	1.02	0.74	0.25	0.63	0.20	1.48	0.65	0.79
C2'	0.20	0.18	0.96	1.19	0.19	0.74	0.27	1.30	0.21	0.39	0.12	0.39	0.11	0.39	0.28	1.07	1.22	0.23	1.90	0.26	3.26	2.01	2.35
C3'	0.18	0.25	0.93	1.21	0.16	0.79	0.21	1.40	0.18	0.33	0.21	0.44	0.15	0.32	0.24	1.04	1.22	0.25	2.00	0.21	3.52	2.14	2.52
C4	0.15	0.29	0.66	0.64	0.14	0.42	0.23	0.83	0.17	0.33	0.15	0.52	0.20	0.35	0.21	0.93	0.75	0.16	1.29	0.23	2.56	1.42	1.67
C4'	0.17	0.20	0.83	1.15	0.18	0.90	0.24	1.64	0.21	0.32	0.18	0.36	0.14	0.32	0.24	0.82	1.04	0.38	2.29	0.24	4.00	2.56	2.95
C5	0.19	0.31	0.57	0.48	0.17	0.34	0.24	0.66	0.17	0.34	0.18	0.51	0.23	0.37	0.23	0.91	0.63	0.20	1.02	0.25	2.30	1.15	1.38
C5'	0.13	0.28	0.73	1.04	0.16	0.85	0.20	1.61	0.22	0.26	0.26	0.44	0.18	0.26	0.19	0.74	0.92	0.34	2.24	0.25	4.07	2.56	2.96
C6	0.25	0.34	0.49	0.34	0.19	0.26	0.22	0.37	0.09	0.36	0.23	0.49	0.27	0.37	0.25	0.91	0.56	0.28	0.56	0.18	1.63	0.61	0.79
C8	0.14	0.25	0.62	0.67	0.18	0.52	0.27	1.06	0.24	0.33	0.19	0.46	0.18	0.36	0.22	0.83	0.70	0.21	1.56	0.30	3.13	1.80	2.09
N1	0.27	0.36	0.50	0.33	0.18	0.27	0.14	0.27	0.05	0.35	0.27	0.47	0.30	0.36	0.25	0.94	0.60	0.34	0.36	0.16	1.20	0.33	0.47
N3	0.14	0.29	0.72	0.69	0.09	0.39	0.20	0.73	0.14	0.33	0.15	0.49	0.22	0.34	0.19	1.01	0.83	0.13	1.16	0.21	2.19	1.22	1.43
N6	0.28	0.32	0.43	0.28	0.23	0.29	0.24	0.30	0.13	0.38	0.25	0.44	0.27	0.39	0.29	0.87	0.47	0.34	0.37	0.16	1.35	0.34	0.52
N7	0.18	0.27	0.56	0.51	0.19	0.40	0.27	0.82	0.23	0.34	0.20	0.47	0.20	0.38	0.23	0.86	0.62	0.20	1.22	0.30	2.69	1.42	1.68
N9	0.12	0.24	0.68	0.77	0.16	0.56	0.24	1.10	0.21	0.32	0.16	0.48	0.17	0.35	0.21	0.85	0.78	0.20	1.64	0.26	3.12	1.84	2.14
O2'	0.38	0.08	1.17	1.51	0.34	1.00	0.41	1.57	0.33	0.56	0.15	0.23	0.14	0.54	0.45	1.18	1.49	0.44	2.20	0.37	3.40	2.26	2.60
O3'	0.27	0.18	1.10	1.45	0.19	0.93	0.24	1.52	0.18	0.40	0.17	0.37	0.10	0.37	0.31	1.19	1.48	0.32	2.13	0.21	3.57	2.23	2.62
O4'	0.12	0.20	0.67	0.94	0.18	0.79	0.24	1.55	0.22	0.29	0.18	0.38	0.15	0.31	0.21	0.64	0.79	0.36	2.20	0.26	3.93	2.51	2.88
O5'	0.23	0.08	0.72	0.98	0.29	0.89	0.43	1.68	0.40	0.50	0.22	0.21	0.12	0.54	0.35	0.71	0.79	0.49	2.33	0.50	4.19	2.74	3.10
OP1	0.29	0.62	0.28	0.48	0.34	0.47	0.26	1.24	0.34	0.16	0.53	0.87	0.51	0.16	0.24	0.35	0.32	0.16	1.83	0.28	3.73	2.19	2.61
OP2	0.65	0.96	0.40	0.40	0.65	0.35	0.51	0.76	0.55	0.40	0.80	1.26	0.86	0.37	0.55	0.43	0.44	0.45	1.28	0.43	3.06	1.58	1.95
P	0.36	0.59	0.17	0.34	0.34	0.33	0.23	1.09	0.26	0.17	0.44	0.85	0.51	0.17	0.26	0.23	0.19	0.14	1.70	0.21	3.59	2.11	2.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.02	0.05	0.08	0.06	0.01	0.01	0.02	0.35	0.00	0.14	0.02	0.30	0.28	0.19
C2	0.06	0.00	0.07	0.08	0.01	0.49	0.01	1.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.06	0.43	1.44	0.03	2.65	1.97	2.01
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.22	0.04	0.06	0.05	0.08	0.07	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.47	0.04	0.62	0.40	0.50
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.13	0.00	0.31	0.01	0.27	0.50	0.10	0.21	0.12	0.50	0.24	0.02	0.01	0.01	0.03	0.35	0.14	0.13	0.05
C4	0.03	0.01	0.04	0.13	0.00	0.16	0.00	0.42	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.06	0.22	0.54	0.01	1.20	0.76	0.77
C4'	0.00	0.49	0.01	0.00	0.16	0.00	0.06	0.01	0.07	0.48	0.30	0.66	0.48	0.38	0.11	0.31	0.03	0.00	0.00	0.04	0.26	0.22	0.01
C5	0.02	0.01	0.03	0.31	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.07	0.07	0.08	0.01	0.71	0.17	0.21
C5'	0.07	1.09	0.22	0.01	0.42	0.01	0.07	0.00	0.28	0.71	0.74	1.45	1.03	0.56	0.07	0.07	0.21	0.01	0.00	0.10	0.41	0.29	0.01
C6	0.02	0.02	0.04	0.27	0.01	0.07	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.31	0.10	0.16	0.31	0.01	1.21	0.52	0.59
C8	0.02	0.01	0.06	0.50	0.00	0.48	0.01	0.71	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.37	0.07	0.30	0.95	0.02	0.57	0.92	0.95
N1	0.05	0.01	0.05	0.10	0.02	0.30	0.01	0.74	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19	0.08	0.32	0.94	0.02	2.10	1.38	1.43
N2	0.08	0.00	0.08	0.21	0.01	0.66	0.01	1.45	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.14	0.08	0.51	1.92	0.04	3.50	2.67	2.73
N3	0.06	0.00	0.07	0.12	0.00	0.48	0.01	1.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.09	0.43	1.38	0.02	2.26	1.74	1.79
N7	0.01	0.01	0.06	0.50	0.00	0.38	0.01	0.56	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.41	0.10	0.18	0.80	0.02	0.33	0.88	0.80
N9	0.01	0.02	0.02	0.24	0.01	0.11	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.23	0.12	0.02	0.10	0.02	0.35	0.11	0.08
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.19	0.31	0.32	0.07	0.31	0.37	0.19	0.14	0.08	0.41	0.23	0.00	0.02	0.22	0.35	0.37	0.56	0.36	0.42
O3'	0.35	0.06	0.03	0.01	0.06	0.03	0.07	0.21	0.10	0.07	0.08	0.08	0.09	0.10	0.12	0.02	0.00	0.24	0.20	0.14	0.62	0.35	0.33
O4'	0.00	0.43	0.02	0.01	0.22	0.00	0.07	0.01	0.16	0.30	0.32	0.51	0.43	0.18	0.02	0.22	0.24	0.00	0.02	0.10	0.03	0.34	0.06
O5'	0.14	1.44	0.47	0.03	0.54	0.00	0.08	0.00	0.31	0.95	0.94	1.92	1.38	0.80	0.10	0.35	0.20	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.04	0.35	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.37	0.14	0.10	0.09	0.00	0.92	0.19	0.27
OP1	0.30	2.65	0.62	0.14	1.20	0.26	0.71	0.41	1.21	0.57	2.10	3.50	2.26	0.33	0.35	0.56	0.62	0.03	0.01	0.92	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	1.97	0.40	0.13	0.76	0.22	0.17	0.29	0.52	0.92	1.38	2.67	1.74	0.88	0.11	0.36	0.35	0.34	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00
P	0.19	2.01	0.50	0.05	0.77	0.01	0.21	0.01	0.59	0.95	1.43	2.73	1.79	0.80	0.08	0.42	0.33	0.06	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00