Doublet Group distance statistics: 51763

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.008, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C4	B	0, 0.122, 0.288, 0.455, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.288 std_dev=0.167
N9	B	0, 0.241, 0.456, 0.671, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.456 std_dev=0.215
C5	B	0, 0.201, 0.434, 0.667, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.434 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.239, 0.608, 0.976, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.608 std_dev=0.369
C8	B	0, 0.321, 0.701, 1.080, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.701 std_dev=0.380
O4'	A	0, -0.004, 0.384, 0.772, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.384 std_dev=0.388
C2'	A	0, 0.007, 0.411, 0.815, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.411 std_dev=0.404
C1'	B	0, 0.377, 0.789, 1.201, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.789 std_dev=0.412
C6	B	0, 0.184, 0.614, 1.044, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.614 std_dev=0.430
N7	B	0, 0.269, 0.714, 1.160, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.714 std_dev=0.446
C4'	A	0, 0.009, 0.501, 0.993, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.501 std_dev=0.492
C2'	B	0, 0.333, 0.837, 1.341, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.837 std_dev=0.504
N1	B	0, 0.204, 0.716, 1.228, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.716 std_dev=0.512
C3'	B	0, 0.241, 0.768, 1.296, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.768 std_dev=0.528
O5'	B	0, 0.518, 1.051, 1.583, 1.576 max_d=1.576 avg_d=1.051 std_dev=0.532
C2	B	0, 0.181, 0.741, 1.300, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.741 std_dev=0.560
O4'	B	0, 0.451, 1.044, 1.637, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.044 std_dev=0.593
C4'	B	0, 0.440, 1.048, 1.656, 2.060 max_d=2.060 avg_d=1.048 std_dev=0.608
C3'	A	0, -0.019, 0.632, 1.282, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.632 std_dev=0.650
O6	B	0, 0.222, 0.877, 1.532, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.877 std_dev=0.655
C5'	B	0, 0.521, 1.179, 1.837, 2.116 max_d=2.116 avg_d=1.179 std_dev=0.658
O3'	B	0, 0.301, 1.017, 1.732, 2.359 max_d=2.359 avg_d=1.017 std_dev=0.715
O2'	A	0, 0.130, 0.859, 1.587, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.859 std_dev=0.729
O2'	B	0, 0.474, 1.265, 2.055, 2.579 max_d=2.579 avg_d=1.265 std_dev=0.791
OP2	A	0, 0.141, 0.954, 1.766, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.954 std_dev=0.812
P	B	0, 0.559, 1.387, 2.214, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.387 std_dev=0.827
N2	B	0, 0.246, 1.113, 1.981, 2.102 max_d=2.102 avg_d=1.113 std_dev=0.867
OP2	B	0, 0.550, 1.418, 2.285, 2.479 max_d=2.479 avg_d=1.418 std_dev=0.868
C5'	A	0, 0.028, 0.974, 1.920, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.974 std_dev=0.946
O5'	A	0, 0.100, 1.112, 2.124, 2.427 max_d=2.427 avg_d=1.112 std_dev=1.012
P	A	0, 0.151, 1.281, 2.411, 2.627 max_d=2.627 avg_d=1.281 std_dev=1.130
O3'	A	0, -0.332, 0.831, 1.994, 3.335 max_d=3.335 avg_d=0.831 std_dev=1.163
OP1	B	0, 0.349, 1.981, 3.614, 5.241 max_d=5.241 avg_d=1.981 std_dev=1.633
OP1	A	0, 0.196, 2.032, 3.869, 4.622 max_d=4.622 avg_d=2.032 std_dev=1.836

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.23	0.01	0.14	0.51	0.44	0.26
C2	0.02	0.00	0.25	0.21	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.55	0.27	0.07	0.29	0.75	0.54	0.33
C2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.12	0.02	0.05	0.17	0.11	0.12	0.19	0.25	0.07	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.66	0.26	0.41
C3'	0.02	0.21	0.01	0.00	0.20	0.01	0.29	0.01	0.28	0.37	0.24	0.19	0.32	0.39	0.22	0.03	0.02	0.02	0.12	0.23	0.21	0.13
C4	0.01	0.01	0.12	0.20	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.14	0.04	0.20	0.66	0.52	0.26
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.18	0.08	0.05	0.13	0.18	0.09	0.27	0.02	0.00	0.01	0.25	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.29	0.00	0.12	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.14	0.02	0.22	0.64	0.51	0.18
C5'	0.06	0.10	0.17	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.08	0.17	0.07	0.10	0.11	0.17	0.03	0.10	0.19	0.01	0.00	0.27	0.10	0.00
C6	0.01	0.01	0.11	0.28	0.01	0.11	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.39	0.15	0.03	0.25	0.68	0.52	0.21
C8	0.01	0.00	0.12	0.37	0.01	0.18	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.23	0.07	0.23	0.56	0.47	0.11
N1	0.02	0.00	0.19	0.24	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.49	0.18	0.05	0.27	0.74	0.54	0.28
N3	0.02	0.00	0.25	0.19	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.51	0.30	0.07	0.27	0.71	0.53	0.33
N6	0.01	0.01	0.07	0.32	0.00	0.13	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.38	0.20	0.02	0.27	0.64	0.50	0.16
N7	0.01	0.01	0.07	0.39	0.00	0.18	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.26	0.05	0.27	0.55	0.48	0.07
N9	0.00	0.01	0.01	0.22	0.00	0.09	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.08	0.01	0.13	0.58	0.49	0.22
O2'	0.03	0.55	0.00	0.03	0.34	0.27	0.31	0.10	0.39	0.16	0.49	0.51	0.38	0.21	0.15	0.00	0.03	0.21	0.25	0.57	0.15	0.33
O3'	0.23	0.27	0.01	0.02	0.14	0.02	0.14	0.19	0.15	0.23	0.18	0.30	0.20	0.26	0.08	0.03	0.00	0.16	0.22	0.22	0.59	0.34
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.05	0.07	0.02	0.05	0.01	0.21	0.16	0.00	0.13	0.33	0.54	0.19
O5'	0.14	0.29	0.35	0.12	0.20	0.01	0.22	0.00	0.25	0.23	0.27	0.27	0.27	0.27	0.13	0.25	0.22	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.51	0.75	0.66	0.23	0.66	0.25	0.64	0.27	0.68	0.56	0.74	0.71	0.64	0.55	0.58	0.57	0.22	0.33	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.44	0.54	0.26	0.21	0.52	0.22	0.51	0.10	0.52	0.47	0.54	0.53	0.50	0.48	0.49	0.15	0.59	0.54	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.33	0.41	0.13	0.26	0.04	0.18	0.00	0.21	0.11	0.28	0.33	0.16	0.07	0.22	0.33	0.34	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.37	0.18	0.30	0.28	0.06	0.42	0.26	0.36	0.39	0.19	0.29	0.22	0.15	0.34	0.16	0.42	0.30	0.47	0.32	0.55	1.44	0.24	0.54
C2	0.21	0.24	0.18	0.16	0.15	0.23	0.15	0.24	0.19	0.26	0.28	0.32	0.17	0.23	0.20	0.21	0.15	0.28	0.29	0.22	1.25	0.60	0.51
C2'	0.51	0.20	0.43	0.39	0.06	0.58	0.32	0.50	0.52	0.19	0.38	0.25	0.18	0.41	0.20	0.62	0.43	0.63	0.40	0.78	1.60	0.30	0.63
C3'	0.65	0.12	0.59	0.50	0.13	0.71	0.28	0.53	0.46	0.14	0.27	0.19	0.25	0.41	0.28	0.83	0.57	0.76	0.42	0.74	1.27	0.35	0.39
C4	0.27	0.22	0.23	0.19	0.13	0.27	0.07	0.23	0.19	0.20	0.23	0.28	0.20	0.16	0.19	0.30	0.19	0.30	0.26	0.29	1.23	0.46	0.46
C4'	0.76	0.24	0.75	0.69	0.27	0.84	0.13	0.67	0.25	0.17	0.16	0.31	0.38	0.22	0.42	0.93	0.76	0.87	0.60	0.44	1.31	0.46	0.54
C5	0.24	0.29	0.26	0.21	0.18	0.22	0.11	0.17	0.08	0.19	0.20	0.36	0.27	0.16	0.19	0.32	0.23	0.22	0.23	0.08	1.08	0.52	0.40
C5'	1.14	0.48	1.22	1.17	0.53	1.27	0.18	1.01	0.11	0.35	0.21	0.56	0.68	0.10	0.70	1.46	1.29	1.21	0.88	0.28	1.32	0.67	0.74
C6	0.20	0.30	0.24	0.20	0.21	0.19	0.20	0.16	0.19	0.22	0.27	0.37	0.25	0.22	0.20	0.27	0.22	0.19	0.23	0.17	1.06	0.62	0.42
C8	0.33	0.26	0.36	0.28	0.15	0.30	0.10	0.21	0.13	0.19	0.15	0.35	0.30	0.21	0.19	0.48	0.33	0.29	0.23	0.23	1.08	0.32	0.37
N1	0.19	0.24	0.21	0.18	0.18	0.20	0.20	0.19	0.20	0.26	0.24	0.31	0.19	0.26	0.20	0.23	0.19	0.22	0.26	0.20	1.14	0.65	0.48
N3	0.25	0.25	0.18	0.15	0.12	0.27	0.11	0.26	0.27	0.23	0.32	0.30	0.16	0.17	0.19	0.23	0.14	0.33	0.29	0.39	1.31	0.50	0.52
N6	0.18	0.38	0.26	0.22	0.23	0.16	0.24	0.12	0.29	0.21	0.37	0.48	0.29	0.23	0.20	0.29	0.26	0.13	0.21	0.28	0.95	0.67	0.39
N7	0.26	0.35	0.33	0.25	0.20	0.22	0.08	0.16	0.05	0.17	0.19	0.45	0.35	0.15	0.19	0.42	0.30	0.20	0.20	0.07	0.99	0.44	0.35
N9	0.33	0.20	0.29	0.24	0.10	0.33	0.14	0.26	0.26	0.17	0.22	0.27	0.21	0.22	0.18	0.40	0.26	0.36	0.26	0.37	1.25	0.33	0.45
O2'	0.45	0.43	0.36	0.46	0.18	0.72	0.52	0.79	0.81	0.35	0.69	0.47	0.20	0.55	0.18	0.50	0.50	0.71	0.65	1.12	2.11	0.65	1.07
O3'	0.31	0.38	0.20	0.11	0.35	0.37	0.71	0.22	0.87	0.49	0.66	0.30	0.22	0.85	0.24	0.46	0.15	0.45	0.35	1.15	0.94	0.62	0.22
O4'	0.60	0.24	0.57	0.53	0.26	0.62	0.11	0.50	0.18	0.21	0.17	0.28	0.33	0.14	0.38	0.67	0.57	0.67	0.50	0.29	1.35	0.44	0.58
O5'	1.11	0.45	1.21	1.12	0.51	1.18	0.22	0.89	0.22	0.35	0.20	0.53	0.66	0.24	0.66	1.50	1.27	1.09	0.74	0.42	1.29	0.56	0.67
OP1	1.58	0.89	1.87	1.79	0.92	1.71	0.54	1.39	0.46	0.68	0.61	0.99	1.13	0.41	1.07	2.25	2.03	1.47	1.23	0.42	1.49	1.15	1.13
OP2	0.40	0.27	0.64	0.58	0.22	0.57	0.44	0.36	0.52	0.37	0.39	0.34	0.27	0.57	0.16	0.99	0.82	0.36	0.36	0.69	0.64	0.20	0.17
P	1.08	0.56	1.30	1.19	0.52	1.16	0.15	0.85	0.12	0.25	0.26	0.69	0.74	0.09	0.62	1.66	1.40	0.98	0.72	0.29	1.10	0.60	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.12	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.35	0.47	0.17
C2	0.09	0.00	0.13	0.13	0.02	0.09	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.16	0.16	0.07	0.08	0.03	0.43	0.78	0.20
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.11	0.17	0.12	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.05	0.17	0.56	0.21
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.11	0.17	0.12	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.33	0.52	0.26
C4	0.03	0.02	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.02	0.07	0.01	0.48	0.72	0.21
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.08	0.06	0.13	0.09	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.10	0.26	0.09
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.04	0.07	0.01	0.62	0.76	0.23
C5'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.08	0.12	0.09	0.10	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.12	0.26	0.01
C6	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.06	0.01	0.63	0.79	0.23
C8	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.07	0.13	0.03	0.64	0.67	0.25
N1	0.06	0.01	0.11	0.11	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.13	0.04	0.07	0.02	0.53	0.80	0.21
N2	0.12	0.00	0.17	0.17	0.02	0.13	0.01	0.12	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.22	0.21	0.11	0.11	0.04	0.36	0.79	0.19
N3	0.09	0.01	0.12	0.12	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.14	0.13	0.08	0.09	0.02	0.38	0.72	0.19
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.07	0.11	0.02	0.72	0.74	0.26
N9	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.47	0.64	0.21
O2'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.08	0.04	0.13	0.22	0.14	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.07	0.19	0.49	0.20
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.12	0.13	0.21	0.13	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.16	0.10	0.62	0.55	0.34
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.04	0.11	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.14	0.06	0.42	0.31	0.19
O5'	0.08	0.08	0.05	0.10	0.07	0.02	0.07	0.01	0.06	0.13	0.07	0.11	0.09	0.11	0.09	0.05	0.16	0.14	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.03	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.07	0.10	0.06	0.07	0.00	0.71	0.79	0.24
OP1	0.35	0.43	0.17	0.33	0.48	0.10	0.62	0.12	0.63	0.64	0.53	0.36	0.38	0.72	0.47	0.19	0.62	0.42	0.01	0.71	0.00	0.00	0.00
OP2	0.47	0.78	0.56	0.52	0.72	0.26	0.76	0.26	0.79	0.67	0.80	0.79	0.72	0.74	0.64	0.49	0.55	0.31	0.01	0.79	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.20	0.21	0.26	0.21	0.09	0.23	0.01	0.23	0.25	0.21	0.19	0.19	0.26	0.21	0.20	0.34	0.19	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00