Doublet Group distance statistics: 51765

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.033, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.018, 0.036, 0.054, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.036 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.023, 0.047, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.047 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.021, 0.046, 0.071, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.046 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.018, 0.046, 0.074, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.046 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.032, 0.064, 0.097, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.064 std_dev=0.033
C4	B	0, 0.225, 0.476, 0.726, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.476 std_dev=0.250
N3	B	0, 0.129, 0.438, 0.747, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.438 std_dev=0.309
C2'	A	0, 0.317, 0.644, 0.971, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.644 std_dev=0.327
O4'	A	0, 0.308, 0.639, 0.970, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.639 std_dev=0.331
O5'	A	0, 0.345, 0.704, 1.064, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.704 std_dev=0.359
N9	B	0, 0.221, 0.607, 0.992, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.607 std_dev=0.385
C2	B	0, 0.361, 0.756, 1.151, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.756 std_dev=0.395
C5	B	0, 0.394, 0.834, 1.275, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.834 std_dev=0.440
P	A	0, 0.422, 0.892, 1.363, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.892 std_dev=0.470
C1'	B	0, 0.336, 0.830, 1.324, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.830 std_dev=0.494
N1	B	0, 0.500, 1.001, 1.503, 1.300 max_d=1.300 avg_d=1.001 std_dev=0.501
O2'	A	0, 0.515, 1.038, 1.561, 1.392 max_d=1.392 avg_d=1.038 std_dev=0.523
N2	B	0, 0.529, 1.077, 1.626, 1.503 max_d=1.503 avg_d=1.077 std_dev=0.549
C6	B	0, 0.534, 1.087, 1.641, 1.540 max_d=1.540 avg_d=1.087 std_dev=0.554
C8	B	0, 0.357, 0.929, 1.501, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.929 std_dev=0.572
N7	B	0, 0.484, 1.091, 1.699, 1.790 max_d=1.790 avg_d=1.091 std_dev=0.607
C4'	A	0, 0.553, 1.183, 1.813, 1.886 max_d=1.886 avg_d=1.183 std_dev=0.630
C5'	A	0, 0.545, 1.256, 1.967, 2.190 max_d=2.190 avg_d=1.256 std_dev=0.711
O2'	B	0, 0.449, 1.184, 1.918, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.184 std_dev=0.735
C3'	A	0, 0.709, 1.453, 2.197, 2.121 max_d=2.121 avg_d=1.453 std_dev=0.744
C2'	B	0, 0.552, 1.310, 2.067, 2.145 max_d=2.145 avg_d=1.310 std_dev=0.757
O6	B	0, 0.714, 1.475, 2.235, 2.187 max_d=2.187 avg_d=1.475 std_dev=0.761
OP2	A	0, 0.653, 1.480, 2.306, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.480 std_dev=0.826
O4'	B	0, 0.760, 1.623, 2.485, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.623 std_dev=0.863
C3'	B	0, 0.898, 2.025, 3.152, 3.186 max_d=3.186 avg_d=2.025 std_dev=1.127
C4'	B	0, 1.010, 2.198, 3.385, 3.342 max_d=3.342 avg_d=2.198 std_dev=1.188
O3'	A	0, 1.232, 2.486, 3.739, 3.423 max_d=3.423 avg_d=2.486 std_dev=1.254
C5'	B	0, 1.338, 2.877, 4.415, 4.349 max_d=4.349 avg_d=2.877 std_dev=1.539
OP1	A	0, 1.538, 3.081, 4.624, 3.987 max_d=3.987 avg_d=3.081 std_dev=1.543
O3'	B	0, 1.267, 2.830, 4.392, 4.439 max_d=4.439 avg_d=2.830 std_dev=1.563
O5'	B	0, 1.781, 3.802, 5.823, 5.974 max_d=5.974 avg_d=3.802 std_dev=2.021
OP2	B	0, 2.075, 4.246, 6.416, 5.884 max_d=5.884 avg_d=4.246 std_dev=2.171
P	B	0, 2.312, 4.740, 7.169, 6.509 max_d=6.509 avg_d=4.740 std_dev=2.428
OP1	B	0, 2.689, 5.613, 8.537, 7.990 max_d=7.990 avg_d=5.613 std_dev=2.924

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.18	0.35	0.02	0.18
C2	0.02	0.00	0.12	0.17	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.05	0.30	0.49	0.23	0.28
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.07	0.08	0.04	0.11	0.11	0.07	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.32	0.38	0.16	0.30
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.15	0.00	0.19	0.02	0.21	0.14	0.20	0.13	0.24	0.18	0.11	0.01	0.01	0.02	0.34	0.35	0.09	0.26
C4	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.08	0.09	0.03	0.30	0.49	0.20	0.28
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.14	0.14	0.11	0.05	0.17	0.16	0.08	0.13	0.02	0.00	0.02	0.11	0.22	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.19	0.00	0.14	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.13	0.04	0.32	0.54	0.27	0.30
C5'	0.06	0.20	0.07	0.02	0.21	0.01	0.29	0.00	0.31	0.28	0.27	0.15	0.36	0.33	0.18	0.06	0.11	0.01	0.01	0.18	0.38	0.02
C6	0.02	0.00	0.08	0.21	0.01	0.14	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.15	0.05	0.33	0.56	0.31	0.31
C8	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.14	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.10	0.09	0.05	0.30	0.53	0.21	0.29
N1	0.02	0.00	0.11	0.20	0.01	0.11	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.14	0.05	0.32	0.53	0.28	0.30
N3	0.02	0.01	0.11	0.13	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.04	0.28	0.46	0.18	0.26
N6	0.03	0.01	0.07	0.24	0.02	0.17	0.01	0.36	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.11	0.18	0.06	0.33	0.58	0.35	0.32
N7	0.01	0.01	0.02	0.18	0.00	0.16	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.11	0.13	0.05	0.33	0.57	0.29	0.31
N9	0.00	0.01	0.01	0.11	0.01	0.08	0.02	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.28	0.46	0.15	0.26
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.08	0.13	0.10	0.06	0.10	0.10	0.09	0.07	0.11	0.11	0.07	0.00	0.04	0.09	0.14	0.19	0.13	0.16
O3'	0.12	0.12	0.02	0.01	0.09	0.02	0.13	0.11	0.15	0.09	0.14	0.11	0.18	0.13	0.05	0.04	0.00	0.08	0.29	0.39	0.17	0.27
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.02	0.09	0.08	0.00	0.06	0.27	0.11	0.08
O5'	0.18	0.30	0.32	0.34	0.30	0.02	0.32	0.01	0.33	0.30	0.32	0.28	0.33	0.33	0.28	0.14	0.29	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.35	0.49	0.38	0.35	0.49	0.11	0.54	0.18	0.56	0.53	0.53	0.46	0.58	0.57	0.46	0.19	0.39	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.02	0.23	0.16	0.09	0.20	0.22	0.27	0.38	0.31	0.21	0.28	0.18	0.35	0.29	0.15	0.13	0.17	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.28	0.30	0.26	0.28	0.01	0.30	0.02	0.31	0.29	0.30	0.26	0.32	0.31	0.26	0.16	0.27	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.15	0.25	0.23	0.13	0.20	0.12	0.25	0.15	0.10	0.15	0.19	0.15	0.11	0.12	0.25	0.30	0.22	0.34	0.18	0.97	0.72	0.55
C2	0.16	0.11	0.12	0.16	0.05	0.31	0.08	0.36	0.15	0.06	0.16	0.13	0.06	0.04	0.10	0.16	0.16	0.33	0.42	0.17	0.80	0.68	0.47
C2'	0.17	0.13	0.23	0.18	0.12	0.17	0.07	0.23	0.09	0.10	0.12	0.18	0.15	0.06	0.13	0.23	0.22	0.22	0.34	0.12	0.78	0.67	0.44
C3'	0.16	0.21	0.19	0.16	0.13	0.22	0.11	0.28	0.15	0.09	0.19	0.29	0.18	0.09	0.12	0.21	0.22	0.27	0.36	0.17	0.83	0.65	0.46
C4	0.11	0.11	0.15	0.14	0.08	0.22	0.08	0.29	0.06	0.11	0.08	0.17	0.08	0.10	0.10	0.16	0.17	0.26	0.33	0.06	0.96	0.66	0.51
C4'	0.21	0.28	0.33	0.31	0.21	0.24	0.22	0.27	0.27	0.16	0.30	0.33	0.24	0.19	0.18	0.36	0.40	0.26	0.35	0.31	0.99	0.71	0.55
C5	0.16	0.10	0.18	0.17	0.11	0.25	0.13	0.32	0.08	0.19	0.08	0.18	0.06	0.19	0.16	0.18	0.20	0.29	0.31	0.08	1.06	0.61	0.52
C5'	0.20	0.26	0.31	0.29	0.21	0.24	0.26	0.29	0.32	0.20	0.31	0.30	0.22	0.25	0.19	0.35	0.40	0.27	0.36	0.39	1.03	0.69	0.57
C6	0.22	0.09	0.20	0.21	0.13	0.32	0.13	0.38	0.09	0.24	0.13	0.16	0.06	0.21	0.20	0.21	0.21	0.35	0.33	0.11	1.04	0.59	0.51
C8	0.12	0.10	0.22	0.21	0.11	0.20	0.15	0.27	0.16	0.16	0.09	0.20	0.09	0.19	0.12	0.21	0.27	0.23	0.29	0.20	1.10	0.63	0.55
N1	0.23	0.09	0.19	0.21	0.08	0.35	0.06	0.40	0.13	0.18	0.16	0.13	0.04	0.10	0.18	0.21	0.21	0.37	0.39	0.19	0.91	0.63	0.48
N3	0.11	0.14	0.11	0.11	0.09	0.24	0.08	0.30	0.10	0.06	0.13	0.15	0.11	0.06	0.08	0.12	0.13	0.27	0.38	0.09	0.83	0.69	0.48
N6	0.28	0.10	0.25	0.27	0.18	0.36	0.20	0.42	0.14	0.32	0.15	0.16	0.09	0.30	0.26	0.25	0.26	0.40	0.34	0.17	1.14	0.53	0.53
N7	0.15	0.10	0.20	0.20	0.13	0.24	0.18	0.30	0.15	0.22	0.09	0.20	0.08	0.23	0.16	0.20	0.24	0.27	0.29	0.19	1.14	0.59	0.54
N9	0.11	0.11	0.20	0.18	0.09	0.19	0.11	0.26	0.12	0.11	0.09	0.19	0.10	0.12	0.10	0.20	0.24	0.23	0.31	0.15	1.01	0.67	0.53
O2'	0.24	0.14	0.30	0.25	0.16	0.25	0.13	0.31	0.12	0.16	0.13	0.15	0.18	0.13	0.19	0.32	0.29	0.29	0.47	0.14	0.82	0.79	0.57
O3'	0.34	0.44	0.31	0.33	0.34	0.44	0.30	0.48	0.33	0.26	0.39	0.54	0.41	0.25	0.31	0.38	0.38	0.45	0.56	0.31	0.83	0.71	0.57
O4'	0.23	0.26	0.33	0.33	0.23	0.27	0.25	0.31	0.30	0.21	0.30	0.28	0.24	0.24	0.21	0.34	0.41	0.28	0.37	0.33	1.08	0.75	0.62
O5'	0.30	0.28	0.35	0.36	0.30	0.35	0.34	0.41	0.36	0.33	0.32	0.26	0.27	0.35	0.30	0.34	0.41	0.36	0.49	0.40	1.22	0.86	0.74
OP1	0.57	0.59	0.52	0.56	0.64	0.63	0.74	0.71	0.80	0.70	0.72	0.48	0.55	0.77	0.63	0.51	0.55	0.67	0.76	0.89	1.34	1.02	0.94
OP2	0.19	0.18	0.33	0.34	0.18	0.21	0.20	0.25	0.21	0.19	0.19	0.21	0.18	0.21	0.18	0.30	0.41	0.18	0.32	0.24	1.29	0.75	0.66
P	0.32	0.29	0.35	0.38	0.33	0.39	0.39	0.46	0.42	0.37	0.36	0.25	0.28	0.41	0.33	0.36	0.42	0.40	0.52	0.48	1.28	0.85	0.77

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.03	0.46	0.57	0.27
C2	0.04	0.00	0.20	0.25	0.01	0.11	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.30	0.08	0.24	0.02	1.09	0.65	0.58
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.05	0.17	0.23	0.19	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.12	0.55	0.40	0.28
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.16	0.00	0.16	0.01	0.21	0.08	0.25	0.27	0.21	0.10	0.07	0.02	0.01	0.01	0.18	0.22	0.56	0.26	0.27
C4	0.02	0.01	0.11	0.16	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.18	0.04	0.23	0.01	0.98	0.65	0.55
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.11	0.09	0.12	0.12	0.10	0.10	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.13	0.33	0.40	0.10
C5	0.02	0.02	0.08	0.16	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.03	0.31	0.01	1.20	0.71	0.66
C5'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.13	0.01	0.17	0.00	0.19	0.16	0.18	0.15	0.13	0.19	0.10	0.07	0.03	0.02	0.01	0.22	0.35	0.34	0.01
C6	0.03	0.02	0.13	0.21	0.01	0.11	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.25	0.04	0.32	0.00	1.34	0.73	0.71
C8	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.34	0.01	0.92	0.70	0.58
N1	0.04	0.01	0.17	0.25	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.30	0.07	0.29	0.02	1.26	0.70	0.66
N2	0.05	0.01	0.23	0.27	0.01	0.12	0.02	0.15	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.20	0.35	0.10	0.23	0.04	1.06	0.63	0.55
N3	0.04	0.00	0.19	0.21	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.25	0.07	0.20	0.01	0.94	0.63	0.51
N7	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.37	0.01	1.20	0.74	0.69
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.20	0.02	0.78	0.63	0.47
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.07	0.07	0.06	0.07	0.09	0.05	0.13	0.20	0.14	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.10	0.09	0.46	0.42	0.20
O3'	0.02	0.30	0.02	0.01	0.18	0.02	0.18	0.03	0.25	0.08	0.30	0.35	0.25	0.11	0.08	0.04	0.00	0.02	0.20	0.25	0.64	0.15	0.24
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.10	0.07	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.04	0.21	0.61	0.17
O5'	0.07	0.24	0.12	0.18	0.23	0.02	0.31	0.01	0.32	0.34	0.29	0.23	0.20	0.37	0.20	0.10	0.20	0.09	0.00	0.36	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.12	0.22	0.01	0.13	0.01	0.22	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.09	0.25	0.04	0.36	0.00	1.46	0.76	0.76
OP1	0.46	1.09	0.55	0.56	0.98	0.33	1.20	0.35	1.34	0.92	1.26	1.06	0.94	1.20	0.78	0.46	0.64	0.21	0.02	1.46	0.00	0.01	0.00
OP2	0.57	0.65	0.40	0.26	0.65	0.40	0.71	0.34	0.73	0.70	0.70	0.63	0.63	0.74	0.63	0.42	0.15	0.61	0.02	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.58	0.28	0.27	0.55	0.10	0.66	0.01	0.71	0.58	0.66	0.55	0.51	0.69	0.47	0.20	0.24	0.17	0.01	0.76	0.00	0.01	0.00