Doublet Group distance statistics: 51766

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.015, 0.030, 0.046, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.003, 0.023, 0.044, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.019, 0.041, 0.063, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.041 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.021, 0.046, 0.072, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.046 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.006, 0.032, 0.058, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.032 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.008, 0.038, 0.067, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.038 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.008, 0.038, 0.067, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.038 std_dev=0.030
N6	A	0, -0.025, 0.063, 0.151, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.063 std_dev=0.088
N7	B	0, 0.028, 0.197, 0.367, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.197 std_dev=0.169
C5	B	0, 0.042, 0.239, 0.437, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.239 std_dev=0.198
O6	B	0, 0.162, 0.381, 0.600, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.381 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.112, 0.332, 0.552, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.332 std_dev=0.220
C8	B	0, 0.059, 0.285, 0.512, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.285 std_dev=0.226
O4'	A	0, 0.166, 0.410, 0.654, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.410 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.075, 0.338, 0.601, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.338 std_dev=0.263
C3'	A	0, 0.155, 0.419, 0.684, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.419 std_dev=0.265
O3'	A	0, 0.200, 0.468, 0.736, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.468 std_dev=0.268
N9	B	0, 0.092, 0.365, 0.638, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.365 std_dev=0.273
N1	B	0, 0.144, 0.454, 0.764, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.454 std_dev=0.310
C2'	A	0, 0.126, 0.444, 0.761, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.444 std_dev=0.317
OP2	B	0, 0.163, 0.481, 0.799, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.481 std_dev=0.318
N3	B	0, 0.107, 0.436, 0.764, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.436 std_dev=0.328
O5'	B	0, 0.147, 0.482, 0.818, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.482 std_dev=0.335
P	B	0, 0.182, 0.521, 0.861, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.521 std_dev=0.339
O4'	B	0, 0.120, 0.471, 0.821, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.471 std_dev=0.351
C4'	A	0, 0.151, 0.503, 0.855, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.503 std_dev=0.352
C2	B	0, 0.136, 0.490, 0.843, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.490 std_dev=0.354
C1'	B	0, 0.120, 0.479, 0.839, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.479 std_dev=0.360
OP1	B	0, 0.271, 0.675, 1.079, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.675 std_dev=0.404
C5'	B	0, 0.188, 0.597, 1.005, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.597 std_dev=0.408
C4'	B	0, 0.167, 0.595, 1.024, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.595 std_dev=0.428
N2	B	0, 0.229, 0.663, 1.098, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.663 std_dev=0.435
C2'	B	0, 0.145, 0.598, 1.052, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.598 std_dev=0.453
C3'	B	0, 0.118, 0.595, 1.071, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.595 std_dev=0.477
O2'	B	0, 0.259, 0.763, 1.267, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.763 std_dev=0.504
O2'	A	0, 0.203, 0.724, 1.245, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.724 std_dev=0.521
O3'	B	0, 0.175, 0.727, 1.278, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.727 std_dev=0.551
O5'	A	0, 0.662, 1.330, 1.998, 1.754 max_d=1.754 avg_d=1.330 std_dev=0.668
C5'	A	0, 0.341, 1.074, 1.807, 1.909 max_d=1.909 avg_d=1.074 std_dev=0.733
P	A	0, 1.019, 2.112, 3.206, 3.050 max_d=3.050 avg_d=2.112 std_dev=1.093
OP2	A	0, 1.189, 2.450, 3.710, 3.532 max_d=3.532 avg_d=2.450 std_dev=1.261
OP1	A	0, 1.152, 2.749, 4.346, 4.503 max_d=4.503 avg_d=2.749 std_dev=1.597

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.04	0.06	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.01	0.18	0.18	0.36	0.08
C2	0.08	0.00	0.18	0.09	0.02	0.11	0.01	0.34	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.31	0.15	0.07	0.15	0.10	0.16	0.10
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01	0.10	0.05	0.08	0.13	0.18	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.24	0.39	0.76	0.41
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.35	0.59	0.87	0.59
C4	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.09	0.01	0.27	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.14	0.06	0.04	0.22	0.33	0.20	0.24
C4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.09	0.03	0.10	0.11	0.09	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.14	0.31	0.13
C5	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.23	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.32	0.55	0.21	0.41
C5'	0.09	0.34	0.10	0.02	0.27	0.01	0.23	0.00	0.27	0.12	0.31	0.34	0.25	0.16	0.17	0.10	0.02	0.03	0.02	0.17	0.15	0.03
C6	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.11	0.06	0.03	0.28	0.53	0.25	0.40
C8	0.04	0.03	0.08	0.05	0.01	0.03	0.00	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.12	0.08	0.05	0.42	0.65	0.20	0.44
N1	0.06	0.01	0.13	0.06	0.02	0.10	0.02	0.31	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.24	0.12	0.06	0.18	0.32	0.23	0.26
N3	0.08	0.01	0.18	0.08	0.01	0.11	0.02	0.34	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.30	0.14	0.08	0.15	0.09	0.18	0.09
N6	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.09	0.04	0.25	0.00	0.07	0.03	0.03	0.00	0.08	0.05	0.05	0.05	0.05	0.34	0.68	0.30	0.51
N7	0.03	0.02	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.01	0.08	0.06	0.03	0.44	0.73	0.22	0.52
N9	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.28	0.39	0.23	0.26
O2'	0.01	0.31	0.01	0.01	0.14	0.02	0.05	0.10	0.11	0.12	0.24	0.30	0.05	0.08	0.02	0.00	0.06	0.01	0.31	0.58	1.03	0.58
O3'	0.05	0.15	0.03	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.06	0.08	0.12	0.14	0.05	0.06	0.05	0.06	0.00	0.07	0.30	0.58	0.93	0.57
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.08	0.05	0.03	0.00	0.01	0.07	0.00	0.36	0.43	0.15	0.33
O5'	0.18	0.15	0.24	0.35	0.22	0.03	0.32	0.02	0.28	0.42	0.18	0.15	0.34	0.44	0.28	0.31	0.30	0.36	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.10	0.39	0.59	0.33	0.14	0.55	0.17	0.53	0.65	0.32	0.09	0.68	0.73	0.39	0.58	0.58	0.43	0.02	0.00	0.02	0.02
OP2	0.36	0.16	0.76	0.87	0.20	0.31	0.21	0.15	0.25	0.20	0.23	0.18	0.30	0.22	0.23	1.03	0.93	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.10	0.41	0.59	0.24	0.13	0.41	0.03	0.40	0.44	0.26	0.09	0.51	0.52	0.26	0.58	0.57	0.33	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.17	0.14	0.12	0.14	0.11	0.11	0.08	0.12	0.07	0.15	0.19	0.16	0.06	0.12	0.12	0.12	0.13	0.04	0.10	0.19	0.26	0.19
C2	0.12	0.21	0.11	0.14	0.07	0.13	0.07	0.16	0.18	0.17	0.24	0.26	0.13	0.14	0.09	0.11	0.13	0.11	0.22	0.19	0.28	0.37	0.32
C2'	0.22	0.15	0.26	0.25	0.17	0.24	0.14	0.24	0.10	0.20	0.12	0.16	0.17	0.16	0.21	0.23	0.27	0.23	0.22	0.06	0.11	0.13	0.11
C3'	0.20	0.18	0.25	0.24	0.19	0.22	0.17	0.21	0.15	0.20	0.16	0.19	0.19	0.18	0.21	0.22	0.25	0.21	0.20	0.13	0.08	0.11	0.08
C4	0.06	0.22	0.06	0.06	0.12	0.06	0.10	0.09	0.18	0.09	0.22	0.25	0.17	0.06	0.04	0.07	0.05	0.05	0.14	0.18	0.25	0.33	0.28
C4'	0.18	0.33	0.22	0.18	0.27	0.15	0.28	0.12	0.34	0.19	0.35	0.35	0.28	0.24	0.22	0.18	0.19	0.16	0.09	0.35	0.16	0.17	0.13
C5	0.09	0.25	0.08	0.09	0.13	0.09	0.12	0.10	0.19	0.12	0.24	0.28	0.20	0.08	0.05	0.10	0.08	0.08	0.16	0.18	0.23	0.31	0.27
C5'	0.36	0.61	0.41	0.36	0.51	0.29	0.55	0.24	0.64	0.39	0.65	0.64	0.53	0.48	0.42	0.37	0.37	0.31	0.24	0.68	0.09	0.11	0.09
C6	0.14	0.26	0.14	0.15	0.08	0.14	0.08	0.15	0.18	0.18	0.25	0.30	0.18	0.12	0.09	0.14	0.14	0.13	0.20	0.18	0.24	0.31	0.29
C8	0.13	0.24	0.14	0.12	0.18	0.11	0.15	0.07	0.18	0.06	0.22	0.26	0.22	0.07	0.14	0.13	0.12	0.13	0.10	0.17	0.22	0.28	0.25
N1	0.16	0.24	0.16	0.18	0.05	0.16	0.04	0.18	0.16	0.20	0.25	0.29	0.14	0.15	0.13	0.15	0.16	0.15	0.24	0.17	0.27	0.35	0.31
N3	0.07	0.21	0.06	0.08	0.10	0.08	0.09	0.12	0.18	0.11	0.22	0.24	0.15	0.10	0.05	0.07	0.07	0.06	0.17	0.19	0.27	0.36	0.29
N6	0.17	0.25	0.18	0.18	0.09	0.16	0.08	0.15	0.15	0.19	0.23	0.30	0.18	0.13	0.13	0.19	0.17	0.15	0.21	0.15	0.22	0.29	0.26
N7	0.12	0.27	0.12	0.11	0.18	0.10	0.15	0.08	0.20	0.09	0.25	0.29	0.23	0.09	0.12	0.12	0.10	0.10	0.13	0.19	0.22	0.28	0.26
N9	0.09	0.21	0.09	0.07	0.15	0.06	0.12	0.04	0.17	0.02	0.20	0.24	0.18	0.04	0.10	0.09	0.07	0.08	0.08	0.16	0.23	0.31	0.26
O2'	0.23	0.09	0.28	0.30	0.09	0.32	0.11	0.34	0.17	0.19	0.15	0.09	0.09	0.10	0.18	0.27	0.32	0.29	0.33	0.25	0.22	0.16	0.23
O3'	0.10	0.07	0.12	0.10	0.07	0.12	0.08	0.12	0.09	0.08	0.08	0.06	0.07	0.09	0.08	0.10	0.11	0.12	0.09	0.11	0.15	0.23	0.10
O4'	0.12	0.25	0.13	0.11	0.18	0.11	0.19	0.10	0.24	0.08	0.26	0.28	0.21	0.12	0.13	0.11	0.12	0.11	0.05	0.25	0.23	0.25	0.21
O5'	0.13	0.51	0.21	0.22	0.36	0.11	0.49	0.11	0.67	0.24	0.64	0.54	0.37	0.43	0.23	0.14	0.25	0.12	0.15	0.83	0.14	0.23	0.13
OP1	0.11	0.71	0.30	0.38	0.50	0.12	0.74	0.16	1.03	0.38	0.95	0.73	0.49	0.68	0.30	0.15	0.44	0.11	0.37	1.32	0.42	0.68	0.42
OP2	0.74	0.89	0.97	1.10	0.90	0.90	1.05	0.98	1.13	0.95	1.01	0.85	0.83	1.11	0.86	0.81	1.19	0.73	1.13	1.28	1.20	1.34	1.17
P	0.24	0.69	0.42	0.49	0.55	0.27	0.75	0.31	0.96	0.46	0.88	0.70	0.52	0.71	0.40	0.28	0.55	0.18	0.48	1.21	0.50	0.69	0.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04
C2	0.02	0.00	0.11	0.19	0.01	0.10	0.03	0.14	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.22	0.01	0.19	0.03	0.21	0.24	0.21
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.09	0.15	0.11	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.13	0.10	0.06
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.12	0.01	0.10	0.01	0.13	0.03	0.18	0.23	0.17	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.11	0.15	0.12	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.11	0.01	0.15	0.01	0.15	0.19	0.17
C4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.10	0.13	0.09	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.03	0.02	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.17	0.01	0.19	0.25	0.21
C5'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.13	0.06	0.15	0.16	0.12	0.09	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.14	0.02	0.19	0.01	0.24	0.29	0.24
C8	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.09	0.03	0.10	0.15	0.14
N1	0.02	0.01	0.09	0.18	0.02	0.10	0.03	0.15	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.20	0.02	0.21	0.02	0.25	0.29	0.24
N2	0.04	0.01	0.15	0.23	0.01	0.13	0.04	0.16	0.04	0.03	0.04	0.00	0.01	0.05	0.02	0.08	0.28	0.03	0.20	0.05	0.23	0.24	0.21
N3	0.02	0.01	0.11	0.17	0.00	0.09	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.18	0.02	0.16	0.01	0.17	0.19	0.17
N7	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.09	0.04	0.00	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.13	0.04	0.17	0.24	0.20
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.02	0.08	0.11	0.12
O2'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.14	0.10	0.07
O3'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.11	0.01	0.09	0.02	0.14	0.04	0.20	0.28	0.18	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.06	0.12	0.21	0.18	0.15
O4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06
O5'	0.03	0.19	0.02	0.03	0.15	0.01	0.17	0.01	0.19	0.09	0.21	0.20	0.16	0.13	0.10	0.02	0.06	0.04	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.03	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.12	0.03	0.18	0.00	0.25	0.31	0.25
OP1	0.04	0.21	0.13	0.15	0.15	0.06	0.19	0.03	0.24	0.10	0.25	0.23	0.17	0.17	0.08	0.14	0.21	0.04	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01
OP2	0.04	0.24	0.10	0.12	0.19	0.04	0.25	0.02	0.29	0.15	0.29	0.24	0.19	0.24	0.11	0.10	0.18	0.06	0.01	0.31	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.21	0.06	0.09	0.17	0.02	0.21	0.01	0.24	0.14	0.24	0.21	0.17	0.20	0.12	0.07	0.15	0.06	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00