Doublet Group distance statistics: 51768

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.018, 0.036, 0.055, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.036 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.018, 0.040, 0.061, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.040 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.014, 0.037, 0.061, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.040 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.013, 0.039, 0.066, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.039 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.025, 0.054, 0.083, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.054 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.026, 0.058, 0.090, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.058 std_dev=0.032
N6	A	0, 0.032, 0.076, 0.121, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.076 std_dev=0.044
C8	B	0, 0.100, 0.231, 0.362, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.231 std_dev=0.131
O3'	A	0, 0.146, 0.301, 0.457, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.301 std_dev=0.156
N7	B	0, 0.097, 0.269, 0.442, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.269 std_dev=0.172
C4'	A	0, 0.062, 0.244, 0.425, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.244 std_dev=0.181
C5	B	0, 0.135, 0.333, 0.531, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.333 std_dev=0.198
O4'	A	0, 0.015, 0.216, 0.417, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.216 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.076, 0.290, 0.504, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.290 std_dev=0.214
N9	B	0, 0.032, 0.268, 0.505, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.268 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.113, 0.353, 0.593, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.353 std_dev=0.240
O5'	B	0, 0.256, 0.521, 0.785, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.521 std_dev=0.264
P	B	0, 0.255, 0.529, 0.803, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.529 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.218, 0.513, 0.808, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.513 std_dev=0.295
OP2	B	0, 0.189, 0.490, 0.791, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.490 std_dev=0.301
C5'	B	0, 0.251, 0.566, 0.881, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.566 std_dev=0.315
OP1	B	0, 0.303, 0.630, 0.957, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.630 std_dev=0.327
O5'	A	0, 0.109, 0.451, 0.792, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.451 std_dev=0.341
C5'	A	0, 0.038, 0.389, 0.739, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.389 std_dev=0.351
O6	B	0, 0.283, 0.643, 1.003, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.643 std_dev=0.360
N3	B	0, 0.151, 0.513, 0.875, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.513 std_dev=0.362
C2'	A	0, -0.088, 0.292, 0.673, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.292 std_dev=0.381
N1	B	0, 0.230, 0.612, 0.994, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.612 std_dev=0.382
C1'	B	0, -0.009, 0.379, 0.767, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.379 std_dev=0.388
C4'	B	0, 0.127, 0.526, 0.924, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.526 std_dev=0.399
P	A	0, 0.084, 0.486, 0.887, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.486 std_dev=0.401
C2	B	0, 0.214, 0.622, 1.030, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.622 std_dev=0.408
C3'	B	0, 0.286, 0.698, 1.109, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.698 std_dev=0.411
OP1	A	0, 0.075, 0.510, 0.945, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.510 std_dev=0.435
O4'	B	0, -0.154, 0.284, 0.722, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.284 std_dev=0.438
C2'	B	0, 0.154, 0.596, 1.039, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.596 std_dev=0.442
O3'	B	0, 0.396, 0.904, 1.413, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.904 std_dev=0.508
O2'	B	0, 0.241, 0.771, 1.301, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.771 std_dev=0.530
N2	B	0, 0.259, 0.800, 1.341, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.800 std_dev=0.541
OP2	A	0, -0.054, 0.497, 1.049, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.497 std_dev=0.551
O2'	A	0, -0.139, 0.516, 1.170, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.516 std_dev=0.654

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.01	0.07	0.06	0.07	0.06
C2	0.03	0.00	0.14	0.06	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.10	0.19	0.08	0.12	0.27	0.17	0.18
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02	0.14	0.02	0.15	0.09	0.15	0.01	0.12	0.05	0.00	0.02	0.02	0.29	0.29	0.28	0.32
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.06	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.04	0.04
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.17	0.04	0.13	0.26	0.18	0.18
C4'	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.10	0.04	0.01	0.02	0.11	0.04	0.05
C5	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.02	0.16	0.33	0.24	0.23
C5'	0.04	0.08	0.14	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.12	0.17	0.09	0.07	0.13	0.17	0.11	0.04	0.17	0.02	0.00	0.06	0.04	0.02
C6	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.02	0.15	0.35	0.24	0.23
C8	0.02	0.02	0.15	0.05	0.01	0.04	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.19	0.15	0.05	0.19	0.32	0.25	0.23
N1	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.17	0.05	0.13	0.31	0.21	0.20
N3	0.04	0.00	0.15	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.19	0.08	0.11	0.23	0.15	0.16
N6	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.13	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.12	0.16	0.02	0.16	0.37	0.27	0.24
N7	0.01	0.02	0.12	0.03	0.01	0.04	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.19	0.15	0.04	0.19	0.37	0.29	0.26
N9	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.16	0.01	0.14	0.22	0.17	0.16
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.03	0.10	0.11	0.04	0.08	0.19	0.04	0.12	0.12	0.19	0.09	0.00	0.05	0.04	0.29	0.27	0.26	0.33
O3'	0.17	0.19	0.02	0.00	0.17	0.04	0.16	0.17	0.17	0.15	0.17	0.19	0.16	0.15	0.16	0.05	0.00	0.10	0.07	0.08	0.16	0.08
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.08	0.02	0.04	0.01	0.04	0.10	0.00	0.10	0.15	0.09	0.13
O5'	0.07	0.12	0.29	0.05	0.13	0.02	0.16	0.00	0.15	0.19	0.13	0.11	0.16	0.19	0.14	0.29	0.07	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.27	0.29	0.02	0.26	0.11	0.33	0.06	0.35	0.32	0.31	0.23	0.37	0.37	0.22	0.27	0.08	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.17	0.28	0.04	0.18	0.04	0.24	0.04	0.24	0.25	0.21	0.15	0.27	0.29	0.17	0.26	0.16	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.18	0.32	0.04	0.18	0.05	0.23	0.02	0.23	0.23	0.20	0.16	0.24	0.26	0.16	0.33	0.08	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.24	0.19	0.14	0.16	0.10	0.08	0.06	0.10	0.08	0.18	0.28	0.24	0.07	0.13	0.21	0.15	0.10	0.08	0.07	0.12	0.14	0.05
C2	0.04	0.15	0.07	0.09	0.08	0.03	0.09	0.08	0.14	0.06	0.16	0.17	0.12	0.08	0.03	0.06	0.10	0.05	0.17	0.15	0.21	0.13	0.17
C2'	0.22	0.19	0.22	0.22	0.17	0.22	0.14	0.24	0.13	0.20	0.15	0.21	0.19	0.17	0.20	0.20	0.21	0.22	0.28	0.12	0.32	0.38	0.32
C3'	0.20	0.22	0.22	0.17	0.15	0.15	0.08	0.11	0.10	0.04	0.16	0.26	0.22	0.02	0.14	0.25	0.18	0.14	0.09	0.06	0.12	0.17	0.08
C4	0.04	0.13	0.08	0.08	0.06	0.03	0.06	0.06	0.05	0.12	0.10	0.16	0.11	0.14	0.03	0.07	0.08	0.04	0.13	0.05	0.16	0.09	0.11
C4'	0.15	0.23	0.19	0.10	0.13	0.04	0.06	0.06	0.09	0.06	0.16	0.28	0.22	0.06	0.10	0.24	0.12	0.04	0.06	0.06	0.17	0.13	0.08
C5	0.10	0.15	0.14	0.14	0.11	0.10	0.12	0.11	0.08	0.15	0.11	0.18	0.15	0.17	0.11	0.14	0.15	0.09	0.16	0.07	0.17	0.06	0.12
C5'	0.12	0.15	0.16	0.09	0.10	0.07	0.10	0.11	0.08	0.16	0.10	0.21	0.15	0.15	0.11	0.20	0.07	0.14	0.12	0.09	0.19	0.13	0.11
C6	0.10	0.20	0.15	0.15	0.14	0.09	0.13	0.11	0.14	0.13	0.18	0.22	0.17	0.15	0.11	0.15	0.17	0.08	0.17	0.13	0.17	0.07	0.14
C8	0.12	0.14	0.13	0.13	0.06	0.13	0.09	0.14	0.05	0.19	0.10	0.21	0.11	0.17	0.12	0.13	0.12	0.15	0.15	0.07	0.17	0.09	0.10
N1	0.06	0.19	0.11	0.12	0.11	0.05	0.11	0.09	0.16	0.08	0.20	0.21	0.15	0.11	0.06	0.10	0.14	0.03	0.18	0.16	0.20	0.10	0.17
N3	0.06	0.13	0.07	0.08	0.07	0.04	0.05	0.07	0.09	0.06	0.12	0.15	0.11	0.09	0.03	0.07	0.08	0.07	0.15	0.10	0.19	0.13	0.15
N6	0.13	0.23	0.19	0.19	0.16	0.13	0.15	0.13	0.16	0.14	0.21	0.27	0.20	0.15	0.13	0.19	0.21	0.11	0.19	0.14	0.18	0.07	0.15
N7	0.16	0.13	0.19	0.18	0.14	0.16	0.13	0.16	0.07	0.19	0.06	0.18	0.15	0.19	0.16	0.19	0.18	0.16	0.18	0.09	0.17	0.07	0.12
N9	0.04	0.17	0.09	0.06	0.05	0.03	0.03	0.06	0.04	0.14	0.12	0.21	0.14	0.14	0.02	0.09	0.06	0.05	0.10	0.04	0.14	0.11	0.07
O2'	0.52	0.28	0.51	0.60	0.38	0.63	0.35	0.69	0.26	0.55	0.23	0.27	0.33	0.46	0.49	0.44	0.58	0.62	0.75	0.22	0.81	0.85	0.82
O3'	0.26	0.17	0.30	0.28	0.12	0.31	0.07	0.25	0.09	0.03	0.11	0.22	0.19	0.11	0.13	0.37	0.32	0.27	0.16	0.13	0.13	0.19	0.11
O4'	0.08	0.20	0.09	0.09	0.08	0.15	0.09	0.23	0.06	0.26	0.13	0.28	0.18	0.22	0.12	0.14	0.04	0.18	0.25	0.06	0.32	0.26	0.27
O5'	0.11	0.11	0.14	0.08	0.09	0.07	0.11	0.11	0.09	0.18	0.07	0.18	0.12	0.18	0.11	0.17	0.06	0.13	0.12	0.10	0.19	0.13	0.11
OP1	0.08	0.10	0.09	0.05	0.14	0.06	0.19	0.08	0.17	0.22	0.12	0.16	0.09	0.24	0.15	0.13	0.09	0.11	0.08	0.19	0.12	0.14	0.08
OP2	0.20	0.14	0.19	0.18	0.18	0.19	0.20	0.20	0.17	0.25	0.14	0.17	0.16	0.24	0.20	0.19	0.15	0.23	0.19	0.18	0.20	0.19	0.17
P	0.12	0.09	0.13	0.10	0.12	0.11	0.16	0.13	0.12	0.21	0.07	0.16	0.10	0.21	0.14	0.14	0.08	0.16	0.13	0.14	0.17	0.15	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.03	0.14	0.10	0.08
C2	0.05	0.00	0.10	0.15	0.01	0.10	0.02	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.17	0.05	0.22	0.01	0.23	0.13	0.21
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.09	0.12	0.09	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.07	0.09	0.03
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.01	0.15	0.09	0.16	0.16	0.13	0.11	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.16	0.03	0.07	0.03
C4	0.03	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.23	0.02	0.24	0.12	0.21
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.08	0.10	0.11	0.09	0.09	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.10	0.09	0.07	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.13	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.14	0.01	0.27	0.01	0.28	0.16	0.26
C5'	0.03	0.15	0.01	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.17	0.16	0.14	0.19	0.14	0.02	0.04	0.01	0.00	0.20	0.09	0.01	0.01
C6	0.03	0.00	0.07	0.15	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.17	0.01	0.27	0.01	0.27	0.18	0.27
C8	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.26	0.02	0.29	0.14	0.25
N1	0.04	0.00	0.09	0.16	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.18	0.03	0.25	0.01	0.25	0.16	0.24
N2	0.07	0.01	0.12	0.16	0.02	0.11	0.03	0.16	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.09	0.19	0.07	0.22	0.01	0.22	0.13	0.20
N3	0.05	0.01	0.09	0.13	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.05	0.20	0.01	0.22	0.10	0.18
N7	0.00	0.02	0.02	0.11	0.00	0.09	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.29	0.03	0.31	0.18	0.29
N9	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.21	0.02	0.24	0.09	0.19
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.06	0.09	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.07	0.03	0.04	0.10	0.07	0.03
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.04	0.17	0.09	0.18	0.19	0.14	0.12	0.08	0.02	0.00	0.01	0.06	0.18	0.03	0.06	0.05
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.02	0.13	0.16	0.08
O5'	0.08	0.22	0.03	0.03	0.23	0.02	0.27	0.00	0.27	0.26	0.25	0.22	0.20	0.29	0.21	0.03	0.06	0.06	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.07	0.16	0.02	0.10	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.18	0.02	0.29	0.00	0.29	0.21	0.29
OP1	0.14	0.23	0.07	0.03	0.24	0.09	0.28	0.09	0.27	0.29	0.25	0.22	0.22	0.31	0.24	0.10	0.03	0.13	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.13	0.09	0.07	0.12	0.07	0.16	0.01	0.18	0.14	0.16	0.13	0.10	0.18	0.09	0.07	0.06	0.16	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.21	0.03	0.03	0.21	0.03	0.26	0.01	0.27	0.25	0.24	0.20	0.18	0.29	0.19	0.03	0.05	0.08	0.01	0.29	0.00	0.00	0.00