Doublet Group distance statistics: 51771

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.011, 0.039, 0.068, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.039 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.013, 0.045, 0.078, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.045 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.014, 0.051, 0.088, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.051 std_dev=0.037
N6	A	0, 0.014, 0.051, 0.088, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.051 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.018, 0.068, 0.117, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.068 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.085, 0.396, 0.706, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.396 std_dev=0.310
C3'	A	0, 0.105, 0.420, 0.736, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.420 std_dev=0.315
C2'	A	0, -0.006, 0.335, 0.675, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.335 std_dev=0.340
O3'	A	0, 0.143, 0.490, 0.837, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.490 std_dev=0.347
C4'	A	0, 0.142, 0.543, 0.944, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.543 std_dev=0.401
C2	B	0, 0.206, 0.774, 1.342, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.774 std_dev=0.568
N1	B	0, 0.171, 0.740, 1.309, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.740 std_dev=0.569
N2	B	0, 0.204, 0.775, 1.345, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.775 std_dev=0.571
C6	B	0, 0.187, 0.760, 1.333, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.760 std_dev=0.573
O2'	A	0, -0.075, 0.500, 1.076, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.500 std_dev=0.575
C5	B	0, 0.228, 0.806, 1.384, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.806 std_dev=0.578
N3	B	0, 0.236, 0.820, 1.405, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.820 std_dev=0.584
C4	B	0, 0.240, 0.828, 1.416, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.828 std_dev=0.588
O6	B	0, 0.163, 0.753, 1.342, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.753 std_dev=0.589
N7	B	0, 0.247, 0.846, 1.445, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.846 std_dev=0.599
N9	B	0, 0.256, 0.876, 1.496, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.876 std_dev=0.620
C8	B	0, 0.259, 0.886, 1.513, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.886 std_dev=0.627
C1'	B	0, 0.268, 0.919, 1.569, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.919 std_dev=0.651
C2'	B	0, 0.278, 0.962, 1.646, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.962 std_dev=0.684
O4'	B	0, 0.300, 1.026, 1.752, 1.569 max_d=1.569 avg_d=1.026 std_dev=0.726
C5'	A	0, 0.293, 1.071, 1.849, 1.825 max_d=1.825 avg_d=1.071 std_dev=0.778
O2'	B	0, 0.367, 1.303, 2.240, 2.159 max_d=2.159 avg_d=1.303 std_dev=0.937
C3'	B	0, 0.400, 1.367, 2.333, 2.062 max_d=2.062 avg_d=1.367 std_dev=0.966
P	B	0, 0.409, 1.450, 2.491, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.450 std_dev=1.041
C4'	B	0, 0.441, 1.520, 2.599, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.520 std_dev=1.079
O5'	B	0, 0.410, 1.538, 2.667, 2.676 max_d=2.676 avg_d=1.538 std_dev=1.129
O3'	B	0, 0.531, 1.816, 3.101, 2.782 max_d=2.782 avg_d=1.816 std_dev=1.285
C5'	B	0, 0.540, 1.857, 3.174, 2.904 max_d=2.904 avg_d=1.857 std_dev=1.317
OP2	A	0, 0.592, 2.025, 3.458, 3.112 max_d=3.112 avg_d=2.025 std_dev=1.433
OP1	B	0, 0.669, 2.307, 3.945, 3.643 max_d=3.643 avg_d=2.307 std_dev=1.638
OP2	B	0, 0.723, 2.481, 4.239, 3.868 max_d=3.868 avg_d=2.481 std_dev=1.758
O5'	A	0, 0.776, 2.654, 4.531, 4.049 max_d=4.049 avg_d=2.654 std_dev=1.877
P	A	0, 0.998, 3.410, 5.821, 5.163 max_d=5.163 avg_d=3.410 std_dev=2.411
OP1	A	0, 1.383, 4.721, 8.059, 7.082 max_d=7.082 avg_d=4.721 std_dev=3.338

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.15	0.11	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.15	0.11	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.27	0.11	0.33	0.19	0.28	0.33
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.02	0.07	0.04	0.12	0.10	0.16	0.02	0.09	0.03	0.00	0.10	0.01	0.14	0.37	0.08	0.14
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.04	0.03	0.14	0.06	0.11	0.05	0.12	0.04	0.03	0.01	0.02	0.27	0.38	0.10	0.23
C4	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.14	0.07	0.21	0.16	0.21	0.18
C4'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.12	0.05	0.09	0.07	0.11	0.04	0.11	0.01	0.01	0.02	0.18	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.05	0.15	0.28	0.19	0.12
C5'	0.04	0.12	0.07	0.04	0.14	0.01	0.23	0.00	0.22	0.30	0.16	0.10	0.27	0.31	0.16	0.06	0.03	0.02	0.01	0.21	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.07	0.19	0.25	0.22	0.17
C8	0.00	0.00	0.12	0.14	0.00	0.12	0.00	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.10	0.05	0.12	0.45	0.10	0.07
N1	0.01	0.00	0.10	0.06	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.21	0.09	0.28	0.17	0.26	0.27
N3	0.02	0.00	0.16	0.11	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.26	0.11	0.32	0.18	0.26	0.31
N6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.06	0.15	0.34	0.21	0.14
N7	0.00	0.00	0.09	0.12	0.00	0.11	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.04	0.09	0.46	0.14	0.06
N9	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.14	0.22	0.14	0.08
O2'	0.05	0.28	0.00	0.03	0.13	0.11	0.05	0.06	0.09	0.10	0.19	0.29	0.05	0.07	0.01	0.00	0.20	0.07	0.10	0.36	0.06	0.12
O3'	0.08	0.27	0.10	0.01	0.14	0.01	0.07	0.03	0.12	0.10	0.21	0.26	0.08	0.07	0.05	0.20	0.00	0.02	0.47	0.52	0.27	0.43
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.09	0.11	0.06	0.04	0.03	0.07	0.02	0.00	0.27	0.07	0.19	0.23
O5'	0.15	0.33	0.14	0.27	0.21	0.02	0.15	0.01	0.19	0.12	0.28	0.32	0.15	0.09	0.14	0.10	0.47	0.27	0.00	0.04	0.01	0.01
OP1	0.11	0.19	0.37	0.38	0.16	0.18	0.28	0.21	0.25	0.45	0.17	0.18	0.34	0.46	0.22	0.36	0.52	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.28	0.08	0.10	0.21	0.02	0.19	0.04	0.22	0.10	0.26	0.26	0.21	0.14	0.14	0.06	0.27	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.33	0.14	0.23	0.18	0.02	0.12	0.01	0.17	0.07	0.27	0.31	0.14	0.06	0.08	0.12	0.43	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.36	0.17	0.33	0.29	0.30	0.30	0.27	0.36	0.21	0.35	0.15	0.14	0.26	0.31	0.35	0.40	0.30	0.29	0.66	0.20	0.77	0.78	0.60
C2	0.10	0.30	0.08	0.09	0.19	0.11	0.17	0.21	0.20	0.13	0.25	0.34	0.27	0.17	0.11	0.10	0.08	0.06	0.42	0.19	0.93	0.40	0.42
C2'	0.49	0.19	0.47	0.46	0.39	0.47	0.40	0.52	0.31	0.53	0.21	0.09	0.28	0.49	0.49	0.52	0.42	0.49	0.67	0.31	0.76	1.04	0.70
C3'	0.44	0.07	0.45	0.45	0.28	0.50	0.30	0.58	0.21	0.46	0.11	0.05	0.16	0.40	0.41	0.56	0.43	0.47	0.59	0.22	0.57	0.99	0.61
C4	0.18	0.22	0.18	0.12	0.24	0.10	0.24	0.12	0.21	0.25	0.17	0.25	0.26	0.26	0.23	0.19	0.13	0.11	0.58	0.22	0.90	0.60	0.53
C4'	0.34	0.03	0.38	0.32	0.15	0.35	0.15	0.40	0.08	0.29	0.04	0.11	0.06	0.23	0.27	0.54	0.33	0.30	0.44	0.09	0.40	0.69	0.40
C5	0.15	0.22	0.16	0.12	0.21	0.12	0.24	0.13	0.24	0.23	0.18	0.26	0.23	0.26	0.20	0.17	0.14	0.12	0.57	0.28	0.92	0.57	0.52
C5'	0.25	0.27	0.39	0.32	0.02	0.31	0.04	0.36	0.15	0.18	0.25	0.39	0.15	0.09	0.14	0.60	0.37	0.22	0.30	0.17	0.24	0.60	0.30
C6	0.09	0.22	0.11	0.04	0.15	0.05	0.20	0.13	0.22	0.19	0.17	0.31	0.20	0.23	0.13	0.11	0.06	0.07	0.50	0.28	0.93	0.46	0.46
C8	0.26	0.19	0.26	0.24	0.27	0.28	0.27	0.29	0.26	0.29	0.20	0.14	0.26	0.29	0.28	0.28	0.29	0.24	0.65	0.28	0.85	0.72	0.58
N1	0.06	0.26	0.06	0.06	0.13	0.08	0.13	0.20	0.16	0.13	0.21	0.34	0.22	0.18	0.08	0.06	0.05	0.04	0.42	0.20	0.93	0.39	0.41
N3	0.15	0.27	0.14	0.08	0.24	0.03	0.23	0.10	0.21	0.21	0.22	0.30	0.28	0.24	0.20	0.18	0.07	0.04	0.51	0.19	0.92	0.52	0.49
N6	0.09	0.19	0.11	0.05	0.15	0.08	0.21	0.14	0.25	0.20	0.18	0.28	0.17	0.25	0.14	0.13	0.08	0.10	0.50	0.34	0.94	0.45	0.45
N7	0.21	0.21	0.22	0.19	0.25	0.22	0.27	0.21	0.28	0.26	0.23	0.20	0.25	0.28	0.24	0.23	0.23	0.20	0.62	0.31	0.89	0.64	0.55
N9	0.26	0.18	0.25	0.22	0.27	0.24	0.26	0.26	0.22	0.30	0.16	0.16	0.26	0.29	0.29	0.29	0.24	0.22	0.65	0.23	0.85	0.71	0.58
O2'	0.72	0.40	0.70	0.68	0.63	0.65	0.65	0.65	0.54	0.82	0.43	0.29	0.50	0.76	0.75	0.73	0.60	0.72	0.75	0.53	0.85	1.16	0.81
O3'	0.58	0.18	0.60	0.63	0.43	0.67	0.47	0.78	0.36	0.67	0.23	0.06	0.27	0.60	0.57	0.68	0.57	0.64	0.66	0.37	0.57	1.05	0.69
O4'	0.16	0.06	0.18	0.21	0.11	0.32	0.13	0.40	0.13	0.16	0.11	0.08	0.04	0.16	0.15	0.30	0.26	0.21	0.62	0.15	0.63	0.67	0.52
O5'	0.64	0.47	0.77	0.44	0.53	0.19	0.50	0.05	0.45	0.55	0.44	0.44	0.52	0.51	0.58	0.97	0.34	0.39	0.14	0.43	0.07	0.40	0.09
OP1	0.75	0.42	1.08	0.82	0.53	0.49	0.51	0.27	0.46	0.66	0.43	0.40	0.46	0.58	0.65	1.32	0.85	0.51	0.43	0.46	0.44	0.19	0.29
OP2	0.31	0.37	0.44	0.21	0.28	0.18	0.27	0.27	0.31	0.28	0.36	0.46	0.32	0.26	0.28	0.60	0.25	0.15	0.22	0.31	0.17	0.51	0.23
P	0.66	0.54	0.85	0.52	0.58	0.23	0.55	0.02	0.53	0.60	0.53	0.54	0.57	0.57	0.61	1.04	0.44	0.40	0.11	0.52	0.10	0.35	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.25	0.01	0.43	0.23	0.22
C2	0.05	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.04	0.11	0.31	0.01	0.70	0.33	0.30
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.12	0.03	0.27	0.09	0.15
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.16	0.03	0.15	0.21	0.10	0.06	0.05	0.21	0.11	0.04	0.00	0.00	0.04	0.18	0.10	0.07	0.07
C4	0.03	0.01	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.05	0.06	0.27	0.00	0.68	0.32	0.29
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.11	0.20	0.09	0.15	0.10	0.20	0.09	0.10	0.02	0.00	0.02	0.14	0.02	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.12	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.14	0.04	0.24	0.00	0.78	0.38	0.33
C5'	0.05	0.18	0.03	0.03	0.19	0.02	0.27	0.00	0.27	0.32	0.22	0.18	0.15	0.35	0.18	0.08	0.04	0.03	0.00	0.31	0.01	0.03	0.02
C6	0.02	0.00	0.02	0.15	0.00	0.11	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.14	0.13	0.05	0.24	0.00	0.83	0.40	0.35
C8	0.01	0.01	0.01	0.21	0.00	0.20	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.21	0.05	0.22	0.02	0.70	0.37	0.31
N1	0.04	0.00	0.01	0.10	0.00	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.05	0.09	0.28	0.01	0.78	0.36	0.32
N2	0.06	0.00	0.02	0.06	0.01	0.15	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.09	0.13	0.34	0.00	0.66	0.32	0.29
N3	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.10	0.31	0.00	0.63	0.31	0.28
N7	0.00	0.01	0.02	0.21	0.00	0.20	0.01	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.22	0.03	0.23	0.02	0.81	0.43	0.35
N9	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.02	0.25	0.00	0.61	0.29	0.27
O2'	0.00	0.16	0.00	0.04	0.12	0.10	0.12	0.08	0.14	0.06	0.16	0.17	0.14	0.09	0.07	0.00	0.09	0.11	0.04	0.14	0.04	0.15	0.02
O3'	0.02	0.04	0.03	0.00	0.05	0.02	0.14	0.04	0.13	0.21	0.05	0.09	0.05	0.22	0.09	0.09	0.00	0.01	0.22	0.17	0.27	0.22	0.19
O4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.06	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.09	0.13	0.10	0.03	0.02	0.11	0.01	0.00	0.28	0.04	0.35	0.26	0.20
O5'	0.25	0.31	0.12	0.04	0.27	0.02	0.24	0.00	0.24	0.22	0.28	0.34	0.31	0.23	0.25	0.04	0.22	0.28	0.00	0.23	0.03	0.05	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.18	0.00	0.14	0.00	0.31	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.14	0.17	0.04	0.23	0.00	0.89	0.45	0.37
OP1	0.43	0.70	0.27	0.10	0.68	0.02	0.78	0.01	0.83	0.70	0.78	0.66	0.63	0.81	0.61	0.04	0.27	0.35	0.03	0.89	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.33	0.09	0.07	0.32	0.06	0.38	0.03	0.40	0.37	0.36	0.32	0.31	0.43	0.29	0.15	0.22	0.26	0.05	0.45	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.30	0.15	0.07	0.29	0.02	0.33	0.02	0.35	0.31	0.32	0.29	0.28	0.35	0.27	0.02	0.19	0.20	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00