Doublet Group distance statistics: 51773

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.005, 0.023, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.008, 0.028, 0.047, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.007, 0.032, 0.057, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.032 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.007, 0.033, 0.058, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.033 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.011, 0.038, 0.065, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.014, 0.050, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.050 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.075, 0.270, 0.466, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.270 std_dev=0.195
O4'	A	0, 0.013, 0.231, 0.449, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.231 std_dev=0.218
N9	B	0, 0.077, 0.307, 0.538, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.307 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.089, 0.321, 0.554, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.321 std_dev=0.233
C8	B	0, 0.088, 0.323, 0.558, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.323 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.081, 0.332, 0.584, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.332 std_dev=0.251
C6	B	0, 0.101, 0.358, 0.615, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.358 std_dev=0.257
N7	B	0, 0.097, 0.358, 0.619, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.358 std_dev=0.261
C1'	B	0, 0.095, 0.367, 0.638, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.367 std_dev=0.271
O2'	A	0, 0.112, 0.395, 0.678, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.395 std_dev=0.283
O6	B	0, 0.117, 0.406, 0.696, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.406 std_dev=0.289
C4'	A	0, 0.054, 0.351, 0.647, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.351 std_dev=0.296
N1	B	0, 0.115, 0.422, 0.729, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.422 std_dev=0.307
N3	B	0, 0.097, 0.434, 0.772, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.434 std_dev=0.338
C3'	A	0, 0.138, 0.481, 0.824, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.481 std_dev=0.343
C2	B	0, 0.120, 0.484, 0.847, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.484 std_dev=0.364
OP1	A	0, 0.140, 0.512, 0.885, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.512 std_dev=0.372
P	A	0, 0.023, 0.430, 0.836, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.430 std_dev=0.406
N2	B	0, 0.154, 0.626, 1.098, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.626 std_dev=0.472
O3'	A	0, 0.209, 0.714, 1.219, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.714 std_dev=0.505
C5'	A	0, 0.096, 0.631, 1.167, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.631 std_dev=0.536
OP2	A	0, 0.240, 0.825, 1.409, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.825 std_dev=0.584
O5'	A	0, 0.162, 0.826, 1.491, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.826 std_dev=0.665
O4'	B	0, -0.030, 0.928, 1.887, 2.248 max_d=2.248 avg_d=0.928 std_dev=0.959
C2'	B	0, -0.103, 1.274, 2.651, 3.187 max_d=3.187 avg_d=1.274 std_dev=1.377
C4'	B	0, -0.052, 1.456, 2.963, 3.533 max_d=3.533 avg_d=1.456 std_dev=1.508
C3'	B	0, -0.175, 1.706, 3.588, 4.328 max_d=4.328 avg_d=1.706 std_dev=1.882
O2'	B	0, -0.149, 1.775, 3.699, 4.448 max_d=4.448 avg_d=1.775 std_dev=1.924
O3'	B	0, -0.171, 2.051, 4.272, 5.137 max_d=5.137 avg_d=2.051 std_dev=2.221
C5'	B	0, -0.315, 2.485, 5.286, 6.399 max_d=6.399 avg_d=2.485 std_dev=2.801
O5'	B	0, -0.189, 3.266, 6.721, 8.047 max_d=8.047 avg_d=3.266 std_dev=3.455
P	B	0, -0.856, 3.977, 8.809, 10.779 max_d=10.779 avg_d=3.977 std_dev=4.833
OP1	B	0, -0.212, 4.635, 9.481, 11.325 max_d=11.325 avg_d=4.635 std_dev=4.847
OP2	B	0, -0.459, 5.097, 10.653, 12.824 max_d=12.824 avg_d=5.097 std_dev=5.556

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.03	0.32	0.10
C2	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.18	0.05	0.21	0.13	0.29	0.11
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.10	0.04	0.10	0.09	0.11	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.10	0.21	0.04
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.19	0.12	0.17	0.11	0.22	0.16	0.08	0.02	0.00	0.01	0.23	0.18	0.11	0.12
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.14	0.02	0.21	0.12	0.30	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.09	0.08	0.06	0.02	0.12	0.10	0.04	0.05	0.01	0.00	0.00	0.04	0.24	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.19	0.01	0.28	0.19	0.30	0.16
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.12	0.11	0.08	0.03	0.16	0.13	0.05	0.05	0.03	0.00	0.00	0.04	0.19	0.01
C6	0.03	0.01	0.10	0.19	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.23	0.03	0.30	0.23	0.30	0.18
C8	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.26	0.15	0.30	0.13
N1	0.03	0.01	0.10	0.17	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.22	0.04	0.27	0.19	0.29	0.15
N3	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.05	0.17	0.09	0.29	0.09
N6	0.04	0.02	0.11	0.22	0.02	0.12	0.02	0.16	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.27	0.03	0.36	0.29	0.33	0.24
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.18	0.02	0.31	0.21	0.29	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.17	0.09	0.31	0.09
O2'	0.03	0.06	0.00	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.04	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.13	0.22	0.03
O3'	0.01	0.18	0.02	0.00	0.14	0.01	0.19	0.03	0.23	0.14	0.22	0.14	0.27	0.18	0.08	0.01	0.00	0.01	0.24	0.29	0.07	0.19
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.08	0.36	0.15
O5'	0.05	0.21	0.15	0.23	0.21	0.00	0.28	0.00	0.30	0.26	0.27	0.17	0.36	0.31	0.17	0.09	0.24	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.03	0.13	0.10	0.18	0.12	0.04	0.19	0.04	0.23	0.15	0.19	0.09	0.29	0.21	0.09	0.13	0.29	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.29	0.21	0.11	0.30	0.24	0.30	0.19	0.30	0.30	0.29	0.29	0.33	0.29	0.31	0.22	0.07	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.11	0.04	0.12	0.11	0.04	0.16	0.01	0.18	0.13	0.15	0.09	0.24	0.18	0.09	0.03	0.19	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.13	0.17	0.46	0.18	0.70	0.18	1.54	0.15	0.22	0.14	0.15	0.13	0.20	0.21	0.18	0.30	0.35	1.31	0.15	1.08	1.19	1.42
C2	0.14	0.10	0.45	0.31	0.08	0.21	0.12	0.52	0.03	0.21	0.09	0.18	0.03	0.21	0.16	0.69	0.40	0.07	0.25	0.04	1.00	0.80	0.40
C2'	0.28	0.08	0.25	0.64	0.20	0.73	0.22	1.62	0.16	0.30	0.10	0.13	0.12	0.27	0.27	0.06	0.49	0.24	1.44	0.17	1.15	1.41	1.58
C3'	0.26	0.10	0.24	0.66	0.19	0.79	0.22	1.72	0.19	0.29	0.14	0.17	0.10	0.28	0.25	0.07	0.49	0.30	1.58	0.22	1.34	1.63	1.78
C4	0.22	0.07	0.25	0.30	0.18	0.39	0.20	0.94	0.16	0.24	0.10	0.08	0.11	0.24	0.22	0.32	0.27	0.10	0.55	0.16	0.57	0.13	0.34
C4'	0.17	0.14	0.18	0.61	0.11	0.91	0.13	1.90	0.13	0.16	0.15	0.22	0.09	0.15	0.15	0.24	0.39	0.51	1.77	0.15	1.69	1.91	2.07
C5	0.20	0.07	0.25	0.20	0.17	0.27	0.20	0.71	0.17	0.24	0.09	0.03	0.10	0.24	0.21	0.43	0.21	0.03	0.34	0.19	0.78	0.47	0.09
C5'	0.18	0.16	0.17	0.55	0.13	0.90	0.15	1.88	0.16	0.17	0.18	0.23	0.11	0.16	0.15	0.28	0.34	0.52	1.75	0.19	1.70	1.91	2.07
C6	0.15	0.01	0.34	0.15	0.13	0.13	0.17	0.41	0.13	0.21	0.03	0.06	0.05	0.22	0.17	0.65	0.24	0.08	0.34	0.15	1.21	1.04	0.59
C8	0.24	0.14	0.15	0.25	0.21	0.45	0.22	1.10	0.21	0.24	0.17	0.09	0.16	0.24	0.24	0.17	0.16	0.19	0.77	0.22	0.59	0.40	0.67
N1	0.12	0.06	0.43	0.20	0.09	0.09	0.13	0.30	0.06	0.20	0.05	0.13	0.02	0.21	0.15	0.79	0.33	0.15	0.44	0.08	1.37	1.25	0.80
N3	0.20	0.08	0.35	0.38	0.14	0.39	0.16	0.90	0.10	0.23	0.08	0.17	0.05	0.22	0.20	0.41	0.37	0.07	0.48	0.10	0.57	0.13	0.24
N6	0.12	0.03	0.34	0.09	0.11	0.07	0.15	0.25	0.13	0.18	0.05	0.04	0.05	0.19	0.14	0.74	0.20	0.13	0.52	0.16	1.49	1.39	0.90
N7	0.22	0.12	0.18	0.18	0.20	0.32	0.22	0.84	0.21	0.24	0.15	0.05	0.14	0.25	0.23	0.31	0.14	0.09	0.47	0.22	0.65	0.26	0.21
N9	0.25	0.13	0.18	0.34	0.21	0.52	0.22	1.21	0.19	0.25	0.15	0.10	0.15	0.24	0.24	0.15	0.24	0.21	0.88	0.19	0.64	0.56	0.83
O2'	0.23	0.05	0.30	0.81	0.13	0.91	0.13	1.90	0.06	0.23	0.04	0.18	0.05	0.19	0.21	0.11	0.62	0.38	1.83	0.06	1.61	1.96	2.08
O3'	0.28	0.07	0.30	0.80	0.19	0.86	0.22	1.84	0.18	0.32	0.11	0.17	0.08	0.30	0.27	0.05	0.63	0.29	1.78	0.21	1.58	1.97	2.06
O4'	0.19	0.15	0.16	0.46	0.13	0.82	0.13	1.72	0.14	0.15	0.16	0.20	0.12	0.14	0.15	0.29	0.27	0.50	1.53	0.15	1.42	1.53	1.75
O5'	0.26	0.13	0.10	0.41	0.22	0.73	0.26	1.62	0.26	0.28	0.20	0.06	0.15	0.29	0.25	0.19	0.21	0.38	1.43	0.31	1.32	1.45	1.64
OP1	0.23	0.09	0.08	0.43	0.19	0.78	0.22	1.71	0.21	0.26	0.13	0.02	0.12	0.27	0.23	0.21	0.22	0.41	1.56	0.24	1.45	1.66	1.82
OP2	0.46	0.35	0.21	0.23	0.42	0.48	0.43	1.22	0.41	0.47	0.36	0.29	0.38	0.46	0.46	0.24	0.20	0.26	1.03	0.42	0.61	0.85	1.04
P	0.27	0.14	0.02	0.30	0.23	0.66	0.25	1.53	0.23	0.28	0.17	0.08	0.18	0.28	0.27	0.21	0.09	0.34	1.35	0.25	1.16	1.33	1.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02	0.05	0.08	0.07	0.01	0.00	0.01	0.26	0.01	0.30	0.02	0.67	0.60	0.44
C2	0.07	0.00	0.20	0.05	0.01	0.53	0.00	1.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.33	0.18	0.58	0.76	0.01	0.63	0.43	0.68
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.15	0.09	0.07	0.15	0.24	0.19	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.07	0.45	0.02	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.19	0.01	0.34	0.03	0.31	0.43	0.19	0.07	0.02	0.46	0.25	0.01	0.01	0.03	0.26	0.38	0.34	0.22	0.07
C4	0.03	0.01	0.09	0.19	0.00	0.17	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.29	0.26	0.00	0.81	0.62	0.31
C4'	0.01	0.53	0.01	0.01	0.17	0.00	0.06	0.00	0.08	0.47	0.32	0.73	0.53	0.37	0.11	0.28	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.07	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.34	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.19	0.10	0.63	0.00	1.37	1.26	0.90
C5'	0.05	1.10	0.15	0.03	0.39	0.00	0.07	0.00	0.26	0.72	0.74	1.50	1.04	0.57	0.10	0.12	0.24	0.02	0.00	0.11	0.07	0.01	0.00
C6	0.03	0.01	0.09	0.31	0.00	0.08	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.26	0.21	0.45	0.00	1.14	1.02	0.61
C8	0.02	0.01	0.07	0.43	0.00	0.47	0.01	0.72	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.55	0.06	0.36	1.34	0.01	2.11	2.03	1.75
N1	0.05	0.00	0.15	0.19	0.01	0.32	0.00	0.74	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.25	0.42	0.41	0.01	0.60	0.35	0.15
N2	0.08	0.00	0.24	0.07	0.01	0.73	0.00	1.50	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.53	0.18	0.70	1.24	0.01	1.14	1.09	1.35
N3	0.07	0.00	0.19	0.02	0.00	0.53	0.01	1.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.34	0.09	0.59	0.67	0.01	0.56	0.31	0.57
N7	0.01	0.01	0.04	0.46	0.01	0.37	0.00	0.57	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.52	0.17	0.21	1.24	0.01	2.15	2.07	1.71
N9	0.00	0.02	0.01	0.25	0.01	0.11	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.22	0.01	0.01	0.60	0.01	1.17	1.07	0.83
O2'	0.01	0.33	0.01	0.01	0.06	0.28	0.26	0.12	0.18	0.55	0.13	0.53	0.34	0.52	0.22	0.00	0.04	0.19	0.06	0.28	0.45	0.08	0.14
O3'	0.26	0.18	0.02	0.01	0.10	0.01	0.19	0.24	0.26	0.06	0.25	0.18	0.09	0.17	0.01	0.04	0.00	0.15	0.22	0.30	0.19	0.35	0.10
O4'	0.01	0.58	0.02	0.03	0.29	0.00	0.10	0.02	0.21	0.36	0.42	0.70	0.59	0.21	0.01	0.19	0.15	0.00	0.44	0.13	0.52	0.70	0.49
O5'	0.30	0.76	0.17	0.26	0.26	0.00	0.63	0.00	0.45	1.34	0.41	1.24	0.67	1.24	0.60	0.06	0.22	0.44	0.00	0.64	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.38	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.30	0.13	0.64	0.00	1.44	1.38	0.92
OP1	0.67	0.63	0.45	0.34	0.81	0.12	1.37	0.07	1.14	2.11	0.60	1.14	0.56	2.15	1.17	0.45	0.19	0.52	0.01	1.44	0.00	0.01	0.01
OP2	0.60	0.43	0.02	0.22	0.62	0.07	1.26	0.01	1.02	2.03	0.35	1.09	0.31	2.07	1.07	0.08	0.35	0.70	0.02	1.38	0.01	0.00	0.01
P	0.44	0.68	0.03	0.07	0.31	0.03	0.90	0.00	0.61	1.75	0.15	1.35	0.57	1.71	0.83	0.14	0.10	0.49	0.01	0.92	0.01	0.01	0.00