Doublet Group distance statistics: 51783

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N3	A	0, 0.000, 0.038, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C2	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
C8	A	0, 0.000, 0.052, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.052 std_dev=0.052
O2'	A	0, 0.000, 0.157, 0.315, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.157 std_dev=0.157
C3'	A	0, 0.000, 0.162, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.162 std_dev=0.162
C4'	A	0, 0.000, 0.172, 0.344, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.172 std_dev=0.172
OP2	B	0, 0.000, 0.222, 0.444, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.222 std_dev=0.222
P	B	0, 0.000, 0.233, 0.466, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.233 std_dev=0.233
O5'	B	0, 0.000, 0.270, 0.540, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.270 std_dev=0.270
O3'	A	0, 0.000, 0.285, 0.571, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.285 std_dev=0.285
OP1	B	0, 0.000, 0.288, 0.577, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.288 std_dev=0.288
C5'	A	0, 0.000, 0.335, 0.670, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.335 std_dev=0.335
C5	B	0, 0.000, 0.346, 0.692, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.346 std_dev=0.346
C6	B	0, 0.000, 0.356, 0.712, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.356 std_dev=0.356
C8	B	0, 0.000, 0.373, 0.745, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.373 std_dev=0.373
N7	B	0, 0.000, 0.381, 0.761, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.381 std_dev=0.381
O6	B	0, 0.000, 0.386, 0.772, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.386 std_dev=0.386
C5'	B	0, 0.000, 0.386, 0.773, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.386 std_dev=0.386
N9	B	0, 0.000, 0.401, 0.802, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.401 std_dev=0.401
C4	B	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
O5'	A	0, 0.000, 0.454, 0.909, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.454 std_dev=0.454
N1	B	0, 0.000, 0.455, 0.910, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.455 std_dev=0.455
O4'	B	0, 0.000, 0.497, 0.995, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.497 std_dev=0.497
C4'	B	0, 0.000, 0.507, 1.015, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.507 std_dev=0.507
C1'	B	0, 0.000, 0.514, 1.027, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.514 std_dev=0.514
C3'	B	0, 0.000, 0.544, 1.089, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.544 std_dev=0.544
N3	B	0, 0.000, 0.588, 1.176, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.588 std_dev=0.588
C2'	B	0, 0.000, 0.592, 1.184, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.592 std_dev=0.592
C2	B	0, 0.000, 0.594, 1.187, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.594 std_dev=0.594
O3'	B	0, 0.000, 0.687, 1.373, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.687 std_dev=0.687
O2'	B	0, 0.000, 0.728, 1.457, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.728 std_dev=0.728
N2	B	0, 0.000, 0.759, 1.518, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.759 std_dev=0.759
P	A	0, 0.000, 0.811, 1.623, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.811 std_dev=0.811
OP2	A	0, 0.000, 0.972, 1.945, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.972 std_dev=0.972
OP1	A	0, 0.000, 1.253, 2.505, 2.505 max_d=2.505 avg_d=1.253 std_dev=1.253

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.65	0.37	0.29
C2	0.04	0.00	0.01	0.08	0.03	0.08	0.01	0.20	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.12	0.04	0.17	0.16	0.05	0.01
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.59	0.33	0.23
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.11	0.06	0.09	0.07	0.11	0.09	0.06	0.00	0.00	0.01	0.13	0.38	0.19	0.10
C4	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.43	0.21	0.16
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.10	0.04	0.09	0.08	0.10	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.49	0.33	0.26
C5	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.08	0.00	0.17	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.11	0.43	0.20	0.15
C5'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.16	0.00	0.17	0.00	0.21	0.10	0.21	0.18	0.21	0.15	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00
C6	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.10	0.01	0.21	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.13	0.00	0.15	0.33	0.12	0.09
C8	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.10	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.61	0.31	0.25
N1	0.04	0.01	0.01	0.09	0.03	0.09	0.02	0.21	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.12	0.03	0.17	0.19	0.04	0.02
N3	0.04	0.00	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.18	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.09	0.04	0.13	0.28	0.13	0.09
N6	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.10	0.01	0.21	0.00	0.04	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.13	0.00	0.15	0.33	0.12	0.09
N7	0.02	0.02	0.03	0.09	0.01	0.07	0.01	0.15	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.09	0.03	0.08	0.55	0.27	0.22
N9	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.57	0.30	0.24
O2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.06	0.75	0.52	0.39
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.13	0.05	0.12	0.09	0.13	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.18	0.30	0.16	0.06
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.62	0.37	0.31
O5'	0.02	0.17	0.09	0.13	0.10	0.01	0.11	0.00	0.15	0.04	0.17	0.13	0.15	0.08	0.04	0.06	0.18	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.65	0.16	0.59	0.38	0.43	0.49	0.43	0.07	0.33	0.61	0.19	0.28	0.33	0.55	0.57	0.75	0.30	0.62	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.05	0.33	0.19	0.21	0.33	0.20	0.05	0.12	0.31	0.04	0.13	0.12	0.27	0.30	0.52	0.16	0.37	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.29	0.01	0.23	0.10	0.16	0.26	0.15	0.00	0.09	0.25	0.02	0.09	0.09	0.22	0.24	0.39	0.06	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.35	0.30	0.21	0.28	0.23	0.20	0.09	0.21	0.12	0.29	0.38	0.36	0.08	0.26	0.35	0.20	0.30	0.02	0.15	0.14	0.04	0.03
C2	0.10	0.28	0.09	0.00	0.14	0.01	0.04	0.07	0.10	0.13	0.22	0.34	0.25	0.15	0.05	0.14	0.01	0.03	0.10	0.03	0.14	0.02	0.08
C2'	0.32	0.30	0.29	0.22	0.26	0.25	0.20	0.13	0.20	0.16	0.25	0.31	0.31	0.12	0.26	0.31	0.20	0.32	0.05	0.16	0.15	0.02	0.03
C3'	0.17	0.15	0.13	0.07	0.13	0.12	0.09	0.06	0.09	0.07	0.12	0.16	0.16	0.04	0.13	0.15	0.05	0.18	0.01	0.06	0.07	0.06	0.00
C4	0.24	0.37	0.23	0.12	0.26	0.08	0.15	0.04	0.18	0.02	0.29	0.42	0.37	0.02	0.18	0.28	0.12	0.14	0.09	0.12	0.18	0.00	0.09
C4'	0.18	0.15	0.14	0.07	0.12	0.14	0.05	0.08	0.05	0.03	0.11	0.18	0.17	0.03	0.12	0.18	0.05	0.20	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01
C5	0.20	0.40	0.23	0.11	0.25	0.04	0.12	0.08	0.18	0.07	0.31	0.47	0.39	0.05	0.14	0.29	0.14	0.06	0.11	0.11	0.20	0.03	0.11
C5'	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.03	0.08	0.08	0.03	0.04	0.03	0.14	0.00	0.05	0.05	0.08	0.02	0.11	0.01	0.13	0.04
C6	0.09	0.39	0.14	0.04	0.18	0.03	0.06	0.12	0.13	0.15	0.29	0.47	0.36	0.13	0.04	0.20	0.07	0.04	0.14	0.07	0.19	0.04	0.12
C8	0.33	0.42	0.35	0.24	0.31	0.18	0.19	0.00	0.23	0.05	0.34	0.48	0.43	0.05	0.24	0.42	0.26	0.22	0.06	0.16	0.20	0.02	0.09
N1	0.05	0.33	0.08	0.01	0.13	0.04	0.02	0.11	0.10	0.17	0.25	0.40	0.28	0.17	0.01	0.13	0.02	0.04	0.12	0.03	0.16	0.01	0.10
N3	0.17	0.29	0.15	0.06	0.19	0.05	0.10	0.04	0.13	0.05	0.23	0.34	0.28	0.07	0.13	0.20	0.05	0.11	0.08	0.07	0.14	0.03	0.07
N6	0.03	0.39	0.12	0.03	0.13	0.06	0.03	0.14	0.11	0.17	0.28	0.51	0.34	0.14	0.01	0.18	0.07	0.10	0.15	0.05	0.20	0.05	0.13
N7	0.26	0.43	0.30	0.18	0.28	0.09	0.16	0.07	0.20	0.02	0.33	0.50	0.43	0.01	0.17	0.39	0.22	0.10	0.10	0.14	0.22	0.04	0.12
N9	0.32	0.39	0.30	0.20	0.29	0.18	0.19	0.02	0.21	0.07	0.31	0.43	0.39	0.05	0.24	0.36	0.20	0.25	0.04	0.15	0.17	0.01	0.07
O2'	0.35	0.29	0.33	0.27	0.26	0.33	0.18	0.22	0.18	0.17	0.24	0.31	0.31	0.11	0.27	0.37	0.26	0.36	0.09	0.13	0.14	0.02	0.02
O3'	0.10	0.03	0.04	0.00	0.03	0.08	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.07	0.03	0.13	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00
O4'	0.29	0.32	0.25	0.17	0.26	0.20	0.17	0.09	0.18	0.10	0.26	0.36	0.33	0.06	0.23	0.30	0.15	0.27	0.02	0.13	0.11	0.08	0.00
O5'	0.18	0.08	0.15	0.12	0.09	0.20	0.03	0.21	0.01	0.08	0.03	0.09	0.10	0.00	0.13	0.18	0.10	0.23	0.18	0.05	0.22	0.34	0.25
OP1	0.06	0.20	0.10	0.18	0.10	0.21	0.15	0.27	0.24	0.01	0.25	0.22	0.12	0.08	0.01	0.13	0.23	0.14	0.24	0.31	0.36	0.07	0.20
OP2	0.16	0.32	0.13	0.05	0.26	0.04	0.31	0.01	0.36	0.22	0.36	0.33	0.27	0.28	0.21	0.10	0.00	0.11	0.01	0.41	0.10	0.26	0.01
P	0.21	0.35	0.18	0.11	0.29	0.11	0.31	0.06	0.36	0.23	0.37	0.37	0.31	0.27	0.25	0.17	0.07	0.17	0.07	0.38	0.03	0.31	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05
C2	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.07	0.00
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.08	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.04
C4	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.05	0.06	0.05
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00
C5	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.12	0.07
C5'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00
C6	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.07	0.12	0.07
C8	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.17	0.10
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05
N2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01
N3	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03
N7	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.19	0.10
N9	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.06
O2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01
O3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.11	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.22	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.06
O5'	0.04	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.05	0.01	0.03	0.07	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.09	0.16	0.08
OP1	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.09	0.05	0.00	0.03	0.09	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.02	0.07	0.13	0.06	0.07	0.12	0.06	0.12	0.17	0.07	0.01	0.01	0.19	0.08	0.09	0.22	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.05	0.01	0.03	0.10	0.06	0.01	0.08	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00