Doublet Group distance statistics: 51784

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.000, 0.033, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N6	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C8	B	0, 0.000, 0.248, 0.496, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.248 std_dev=0.248
N7	B	0, 0.000, 0.291, 0.581, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.291 std_dev=0.291
N9	B	0, 0.000, 0.338, 0.677, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.338 std_dev=0.338
C5	B	0, 0.000, 0.381, 0.762, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.381 std_dev=0.381
C1'	B	0, 0.000, 0.392, 0.784, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.392 std_dev=0.392
C4	B	0, 0.000, 0.399, 0.798, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.399 std_dev=0.399
O4'	B	0, 0.000, 0.452, 0.904, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.452 std_dev=0.452
C6	B	0, 0.000, 0.493, 0.987, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.493 std_dev=0.493
N3	B	0, 0.000, 0.512, 1.025, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.512 std_dev=0.512
O6	B	0, 0.000, 0.552, 1.104, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.552 std_dev=0.552
N1	B	0, 0.000, 0.579, 1.158, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.579 std_dev=0.579
C2	B	0, 0.000, 0.590, 1.179, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.590 std_dev=0.590
O2'	B	0, 0.000, 0.631, 1.263, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.631 std_dev=0.631
OP1	B	0, 0.000, 0.638, 1.277, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.638 std_dev=0.638
C2'	B	0, 0.000, 0.666, 1.333, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.666 std_dev=0.666
N2	B	0, 0.000, 0.723, 1.446, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.723 std_dev=0.723
C4'	B	0, 0.000, 0.756, 1.513, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.756 std_dev=0.756
C3'	B	0, 0.000, 0.880, 1.760, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.880 std_dev=0.880
O5'	B	0, 0.000, 0.886, 1.772, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.886 std_dev=0.886
C5'	B	0, 0.000, 0.994, 1.989, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.994 std_dev=0.994
P	B	0, 0.000, 1.032, 2.064, 2.064 max_d=2.064 avg_d=1.032 std_dev=1.032
O3'	B	0, 0.000, 1.200, 2.400, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.200 std_dev=1.200
O4'	A	0, 0.000, 1.337, 2.674, 2.674 max_d=2.674 avg_d=1.337 std_dev=1.337
C2'	A	0, 0.000, 1.369, 2.738, 2.738 max_d=2.738 avg_d=1.369 std_dev=1.369
OP2	B	0, 0.000, 1.530, 3.060, 3.060 max_d=3.060 avg_d=1.530 std_dev=1.530
C4'	A	0, 0.000, 1.696, 3.392, 3.392 max_d=3.392 avg_d=1.696 std_dev=1.696
O2'	A	0, 0.000, 1.899, 3.798, 3.798 max_d=3.798 avg_d=1.899 std_dev=1.899
C3'	A	0, 0.000, 1.919, 3.839, 3.839 max_d=3.839 avg_d=1.919 std_dev=1.919
O3'	A	0, 0.000, 2.387, 4.773, 4.773 max_d=4.773 avg_d=2.387 std_dev=2.387
C5'	A	0, 0.000, 3.199, 6.399, 6.399 max_d=6.399 avg_d=3.199 std_dev=3.199
O5'	A	0, 0.000, 3.822, 7.644, 7.644 max_d=7.644 avg_d=3.822 std_dev=3.822
OP1	A	0, 0.000, 4.573, 9.145, 9.145 max_d=9.145 avg_d=4.573 std_dev=4.573
P	A	0, 0.000, 4.957, 9.914, 9.914 max_d=9.914 avg_d=4.957 std_dev=4.957
OP2	A	0, 0.000, 6.031, 12.062, 12.062 max_d=12.062 avg_d=6.031 std_dev=6.031

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.45	0.39	0.26
C2	0.01	0.00	0.30	0.81	0.00	0.60	0.01	0.87	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.80	0.33	0.97	0.32	0.76	0.86
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.17	0.02	0.11	0.04	0.17	0.08	0.25	0.29	0.13	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.09	0.63	0.26	0.31
C3'	0.01	0.81	0.00	0.00	0.42	0.01	0.25	0.01	0.42	0.23	0.66	0.78	0.33	0.07	0.06	0.00	0.03	0.03	0.03	0.49	0.03	0.21
C4	0.01	0.00	0.17	0.42	0.00	0.27	0.01	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.39	0.17	0.26	0.35	0.15	0.07
C4'	0.00	0.60	0.02	0.01	0.27	0.00	0.12	0.01	0.24	0.26	0.46	0.58	0.16	0.15	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05
C5	0.01	0.01	0.11	0.25	0.01	0.12	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.27	0.06	0.02	0.73	0.56	0.27
C5'	0.07	0.87	0.04	0.01	0.29	0.01	0.06	0.00	0.28	0.53	0.64	0.79	0.14	0.37	0.11	0.05	0.10	0.05	0.00	0.06	0.10	0.02
C6	0.01	0.01	0.17	0.42	0.01	0.24	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.44	0.12	0.26	0.48	0.23	0.04
C8	0.00	0.01	0.08	0.23	0.00	0.26	0.00	0.53	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.16	0.17	0.72	1.41	1.30	1.04
N1	0.01	0.01	0.25	0.66	0.00	0.46	0.00	0.64	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.67	0.24	0.70	0.01	0.40	0.57
N3	0.01	0.00	0.29	0.78	0.00	0.58	0.01	0.79	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.17	0.72	0.34	0.85	0.24	0.57	0.70
N6	0.02	0.01	0.13	0.33	0.02	0.16	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.36	0.06	0.09	0.70	0.49	0.17
N7	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.10	0.54	1.33	1.24	0.90
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.22	0.74	0.63	0.42
O2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.07	0.04	0.05	0.08	0.06	0.13	0.17	0.06	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.43	0.17	0.20
O3'	0.03	0.80	0.04	0.03	0.39	0.05	0.27	0.10	0.44	0.16	0.67	0.72	0.36	0.02	0.09	0.04	0.00	0.04	0.13	0.29	0.20	0.07
O4'	0.01	0.33	0.01	0.03	0.17	0.01	0.06	0.05	0.12	0.17	0.24	0.34	0.06	0.10	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.11	0.25	0.09
O5'	0.16	0.97	0.09	0.03	0.26	0.02	0.02	0.00	0.26	0.72	0.70	0.85	0.09	0.54	0.22	0.03	0.13	0.11	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.45	0.32	0.63	0.49	0.35	0.06	0.73	0.06	0.48	1.41	0.01	0.24	0.70	1.33	0.74	0.43	0.29	0.11	0.00	0.00	0.02	0.00
OP2	0.39	0.76	0.26	0.03	0.15	0.03	0.56	0.10	0.23	1.30	0.40	0.57	0.49	1.24	0.63	0.17	0.20	0.25	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.26	0.86	0.31	0.21	0.07	0.05	0.27	0.02	0.04	1.04	0.57	0.70	0.17	0.90	0.42	0.20	0.07	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.30	0.21	0.33	0.22	0.40	0.16	0.45	0.19	0.09	0.26	0.35	0.30	0.08	0.18	0.16	0.44	0.27	0.01	0.16	0.36	0.94	0.65
C2	0.01	0.10	0.02	0.03	0.05	0.11	0.02	0.16	0.05	0.04	0.09	0.12	0.09	0.04	0.00	0.05	0.06	0.10	0.38	0.04	0.16	0.83	0.25
C2'	0.60	0.29	0.62	0.56	0.47	0.52	0.50	0.41	0.43	0.65	0.33	0.19	0.35	0.60	0.57	0.60	0.43	0.61	0.87	0.44	1.01	1.69	1.41
C3'	0.60	0.33	0.44	0.44	0.61	0.48	0.78	0.55	0.70	1.00	0.49	0.14	0.35	1.00	0.74	0.22	0.17	0.72	1.20	0.79	1.52	2.26	1.95
C4	0.05	0.22	0.01	0.10	0.13	0.19	0.10	0.24	0.13	0.01	0.19	0.25	0.20	0.02	0.07	0.04	0.15	0.16	0.18	0.11	0.26	0.91	0.47
C4'	0.20	0.30	0.46	0.52	0.07	0.44	0.14	0.30	0.10	0.32	0.12	0.48	0.32	0.37	0.02	0.67	0.84	0.10	0.45	0.22	1.00	1.54	1.29
C5	0.03	0.19	0.10	0.02	0.09	0.09	0.07	0.15	0.12	0.02	0.18	0.23	0.15	0.00	0.01	0.15	0.02	0.08	0.17	0.11	0.23	0.84	0.42
C5'	0.32	0.48	0.72	0.68	0.12	0.51	0.21	0.20	0.16	0.47	0.18	0.76	0.50	0.56	0.02	1.11	1.12	0.10	0.59	0.35	1.39	1.85	1.56
C6	0.09	0.10	0.16	0.10	0.01	0.03	0.02	0.09	0.07	0.06	0.11	0.12	0.06	0.03	0.05	0.19	0.07	0.04	0.26	0.07	0.17	0.76	0.30
C8	0.06	0.28	0.01	0.08	0.16	0.18	0.13	0.23	0.18	0.02	0.25	0.34	0.24	0.04	0.08	0.07	0.16	0.13	0.00	0.16	0.32	0.88	0.57
N1	0.09	0.05	0.13	0.08	0.02	0.03	0.02	0.08	0.02	0.08	0.06	0.06	0.02	0.06	0.07	0.15	0.06	0.04	0.35	0.03	0.14	0.74	0.22
N3	0.07	0.18	0.07	0.14	0.12	0.21	0.08	0.27	0.10	0.01	0.15	0.20	0.17	0.01	0.08	0.02	0.18	0.18	0.30	0.08	0.23	0.94	0.39
N6	0.12	0.05	0.23	0.17	0.03	0.01	0.01	0.04	0.05	0.08	0.08	0.07	0.01	0.04	0.08	0.24	0.16	0.01	0.25	0.07	0.15	0.69	0.27
N7	0.02	0.24	0.12	0.03	0.11	0.09	0.09	0.16	0.15	0.01	0.22	0.29	0.18	0.02	0.03	0.17	0.02	0.08	0.06	0.15	0.28	0.84	0.49
N9	0.12	0.28	0.08	0.18	0.18	0.26	0.13	0.31	0.17	0.04	0.24	0.32	0.26	0.05	0.12	0.03	0.26	0.19	0.05	0.14	0.32	0.93	0.58
O2'	0.50	0.23	0.67	0.59	0.30	0.52	0.24	0.30	0.18	0.31	0.18	0.21	0.29	0.25	0.36	0.82	0.59	0.44	0.74	0.14	0.75	1.27	1.10
O3'	0.77	0.52	0.66	0.70	0.79	0.76	0.95	0.89	0.88	1.17	0.67	0.32	0.54	1.17	0.91	0.43	0.45	0.92	1.67	0.96	1.99	2.50	2.41
O4'	0.59	0.58	0.80	0.89	0.44	0.87	0.26	0.75	0.27	0.15	0.43	0.70	0.62	0.09	0.39	0.91	1.12	0.56	0.14	0.17	0.41	0.96	0.66
O5'	0.58	0.74	1.05	0.95	0.33	0.75	0.07	0.38	0.01	0.35	0.39	1.07	0.79	0.46	0.18	1.53	1.41	0.32	0.32	0.25	1.16	1.69	1.30
OP1	0.92	1.38	1.26	1.08	0.86	0.88	0.48	0.49	0.58	0.10	1.03	1.76	1.36	0.03	0.63	1.67	1.43	0.62	0.20	0.34	1.24	1.56	1.24
OP2	1.01	1.49	1.55	1.26	0.84	0.93	0.32	0.38	0.42	0.12	1.00	1.99	1.49	0.25	0.58	2.18	1.74	0.57	0.25	0.08	1.36	1.68	1.31
P	0.74	1.06	1.21	1.05	0.54	0.81	0.09	0.39	0.17	0.24	0.65	1.47	1.08	0.37	0.35	1.73	1.51	0.43	0.28	0.11	1.25	1.69	1.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.24	0.01	0.12	0.26	0.05
C2	0.03	0.00	0.09	0.18	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.23	0.06	0.36	0.00	0.19	0.07	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.06	0.10	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.01	0.34	0.15	0.17
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.14	0.01	0.12	0.02	0.14	0.02	0.17	0.18	0.17	0.07	0.07	0.04	0.00	0.01	0.27	0.13	0.51	0.35	0.33
C4	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.02	0.38	0.01	0.17	0.11	0.12
C4'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.06	0.21	0.14	0.04
C5	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.15	0.01	0.46	0.01	0.19	0.06	0.21
C5'	0.01	0.07	0.03	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.08	0.09	0.04	0.05	0.11	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.13	0.31	0.11	0.06
C6	0.02	0.00	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.02	0.46	0.00	0.20	0.01	0.23
C8	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.02	0.48	0.01	0.17	0.13	0.19
N1	0.03	0.00	0.06	0.17	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.22	0.05	0.42	0.00	0.20	0.03	0.19
N2	0.05	0.00	0.10	0.18	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.23	0.08	0.33	0.01	0.20	0.06	0.11
N3	0.03	0.01	0.11	0.17	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.05	0.32	0.01	0.17	0.11	0.08
N7	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.50	0.01	0.18	0.06	0.25
N9	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.38	0.01	0.16	0.17	0.09
O2'	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.10	0.01	0.06	0.06	0.22	0.00	0.02
O3'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.16	0.03	0.15	0.03	0.19	0.03	0.22	0.23	0.20	0.09	0.07	0.10	0.00	0.02	0.15	0.18	0.62	0.51	0.38
O4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.02	0.02	0.46	0.18
O5'	0.24	0.36	0.24	0.27	0.38	0.03	0.46	0.02	0.46	0.48	0.42	0.33	0.32	0.50	0.38	0.06	0.15	0.15	0.00	0.49	0.02	0.04	0.02
O6	0.01	0.00	0.01	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.02	0.49	0.00	0.20	0.02	0.28
OP1	0.12	0.19	0.34	0.51	0.17	0.21	0.19	0.31	0.20	0.17	0.20	0.20	0.17	0.18	0.16	0.22	0.62	0.02	0.02	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.07	0.15	0.35	0.11	0.14	0.06	0.11	0.01	0.13	0.03	0.06	0.11	0.06	0.17	0.00	0.51	0.46	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.17	0.33	0.12	0.04	0.21	0.06	0.23	0.19	0.19	0.11	0.08	0.25	0.09	0.02	0.38	0.18	0.02	0.28	0.00	0.01	0.00