Doublet Group distance statistics: 51787

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C1'	B	0, 0.000, 0.278, 0.555, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.278 std_dev=0.278
N9	B	0, 0.000, 0.307, 0.614, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.307 std_dev=0.307
O4'	B	0, 0.000, 0.310, 0.621, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.310 std_dev=0.310
C4	B	0, 0.000, 0.321, 0.642, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.321 std_dev=0.321
C5	B	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331
C6	B	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331
C8	B	0, 0.000, 0.336, 0.673, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.336 std_dev=0.336
N3	B	0, 0.000, 0.338, 0.675, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.338 std_dev=0.338
O4'	A	0, 0.000, 0.339, 0.677, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.339 std_dev=0.339
N1	B	0, 0.000, 0.339, 0.678, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.339 std_dev=0.339
O6	B	0, 0.000, 0.339, 0.678, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.339 std_dev=0.339
C2	B	0, 0.000, 0.348, 0.696, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.348 std_dev=0.348
N7	B	0, 0.000, 0.349, 0.699, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.349 std_dev=0.349
C2'	B	0, 0.000, 0.351, 0.702, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.351 std_dev=0.351
O2'	B	0, 0.000, 0.371, 0.742, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.371 std_dev=0.371
N2	B	0, 0.000, 0.381, 0.762, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.381 std_dev=0.381
C4'	B	0, 0.000, 0.415, 0.830, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.415 std_dev=0.415
C3'	B	0, 0.000, 0.421, 0.841, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.421 std_dev=0.421
C4'	A	0, 0.000, 0.429, 0.859, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.429 std_dev=0.429
C2'	A	0, 0.000, 0.453, 0.906, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.453 std_dev=0.453
O3'	B	0, 0.000, 0.456, 0.912, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.456 std_dev=0.456
C3'	A	0, 0.000, 0.485, 0.969, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.485 std_dev=0.485
C5'	A	0, 0.000, 0.518, 1.036, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.518 std_dev=0.518
OP1	A	0, 0.000, 0.543, 1.086, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.543 std_dev=0.543
C5'	B	0, 0.000, 0.666, 1.332, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.666 std_dev=0.666
O5'	B	0, 0.000, 0.861, 1.722, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.861 std_dev=0.861
O5'	A	0, 0.000, 0.888, 1.775, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.888 std_dev=0.888
O2'	A	0, 0.000, 0.889, 1.778, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.889 std_dev=0.889
P	B	0, 0.000, 0.896, 1.791, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.896 std_dev=0.896
O3'	A	0, 0.000, 0.942, 1.884, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.942 std_dev=0.942
P	A	0, 0.000, 1.441, 2.883, 2.883 max_d=2.883 avg_d=1.441 std_dev=1.441
OP2	B	0, 0.000, 1.617, 3.235, 3.235 max_d=3.235 avg_d=1.617 std_dev=1.617
OP1	B	0, 0.000, 2.093, 4.186, 4.186 max_d=4.186 avg_d=2.093 std_dev=2.093
OP2	A	0, 0.000, 2.411, 4.822, 4.822 max_d=4.822 avg_d=2.411 std_dev=2.411

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.27	0.00	0.25	0.10	0.49	0.35
C2	0.02	0.00	0.13	0.13	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.15	0.05	0.35	0.17	0.92	0.60
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.20	0.00	0.16	0.08	0.14	0.03	0.13	0.05	0.00	0.02	0.02	0.13	0.25	0.39	0.03
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.14	0.06	0.15	0.11	0.15	0.10	0.07	0.01	0.01	0.01	0.16	0.05	0.44	0.06
C4	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.15	0.03	0.40	0.19	0.86	0.61
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.10	0.02	0.49	0.24	0.96	0.74
C5'	0.09	0.09	0.20	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.13	0.19	0.11	0.08	0.14	0.18	0.13	0.00	0.18	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.09	0.03	0.49	0.25	1.03	0.77
C8	0.01	0.01	0.16	0.06	0.00	0.04	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.11	0.01	0.52	0.24	0.80	0.70
N1	0.01	0.00	0.08	0.15	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.11	0.04	0.43	0.22	1.02	0.71
N3	0.02	0.00	0.14	0.11	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.05	0.32	0.15	0.82	0.53
N6	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.33	0.06	0.02	0.54	0.28	1.08	0.84
N7	0.02	0.01	0.13	0.10	0.01	0.03	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.08	0.00	0.55	0.27	0.93	0.79
N9	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.20	0.16	0.01	0.41	0.18	0.74	0.57
O2'	0.03	0.19	0.00	0.01	0.23	0.17	0.30	0.00	0.30	0.27	0.25	0.15	0.33	0.31	0.20	0.00	0.02	0.09	0.05	0.20	0.41	0.05
O3'	0.27	0.15	0.02	0.01	0.15	0.01	0.10	0.18	0.09	0.11	0.11	0.18	0.06	0.08	0.16	0.02	0.00	0.19	0.14	0.14	0.44	0.09
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.19	0.00	0.40	0.26	0.32	0.39
O5'	0.25	0.35	0.13	0.16	0.40	0.01	0.49	0.00	0.49	0.52	0.43	0.32	0.54	0.55	0.41	0.05	0.14	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.10	0.17	0.25	0.05	0.19	0.05	0.24	0.07	0.25	0.24	0.22	0.15	0.28	0.27	0.18	0.20	0.14	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.49	0.92	0.39	0.44	0.86	0.09	0.96	0.07	1.03	0.80	1.02	0.82	1.08	0.93	0.74	0.41	0.44	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.35	0.60	0.03	0.06	0.61	0.04	0.74	0.01	0.77	0.70	0.71	0.53	0.84	0.79	0.57	0.05	0.09	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.13	0.05	0.11	0.02	0.13	0.03	0.18	0.08	0.08	0.13	0.16	0.08	0.03	0.06	0.04	0.15	0.19	0.20	0.08	0.04	0.54	0.03
C2	0.16	0.07	0.18	0.24	0.16	0.26	0.17	0.39	0.10	0.23	0.06	0.04	0.11	0.22	0.19	0.09	0.25	0.20	0.50	0.08	0.58	0.90	0.40
C2'	0.04	0.08	0.04	0.02	0.08	0.02	0.12	0.04	0.14	0.10	0.12	0.06	0.06	0.13	0.07	0.07	0.07	0.01	0.06	0.16	0.59	0.36	0.31
C3'	0.23	0.09	0.25	0.33	0.06	0.33	0.02	0.30	0.07	0.17	0.12	0.14	0.00	0.09	0.16	0.17	0.42	0.36	0.23	0.09	0.43	0.61	0.02
C4	0.16	0.01	0.15	0.20	0.14	0.22	0.11	0.31	0.03	0.20	0.02	0.03	0.09	0.16	0.18	0.05	0.21	0.22	0.38	0.00	0.34	0.76	0.24
C4'	0.23	0.01	0.22	0.25	0.10	0.21	0.08	0.15	0.01	0.17	0.02	0.05	0.06	0.12	0.18	0.16	0.32	0.31	0.03	0.00	0.41	0.34	0.16
C5	0.18	0.08	0.15	0.20	0.18	0.21	0.15	0.31	0.08	0.21	0.04	0.03	0.15	0.18	0.20	0.05	0.20	0.23	0.38	0.03	0.41	0.75	0.26
C5'	0.23	0.12	0.19	0.18	0.19	0.12	0.17	0.05	0.13	0.21	0.10	0.08	0.17	0.18	0.22	0.12	0.22	0.27	0.07	0.11	0.49	0.28	0.22
C6	0.18	0.14	0.17	0.21	0.20	0.23	0.20	0.34	0.14	0.22	0.11	0.10	0.17	0.21	0.21	0.07	0.21	0.22	0.44	0.10	0.54	0.82	0.33
C8	0.16	0.04	0.10	0.14	0.10	0.16	0.06	0.21	0.02	0.15	0.07	0.10	0.07	0.10	0.15	0.00	0.15	0.23	0.25	0.05	0.17	0.60	0.11
N1	0.17	0.12	0.18	0.23	0.19	0.25	0.20	0.38	0.15	0.23	0.11	0.08	0.15	0.23	0.20	0.09	0.24	0.20	0.49	0.13	0.62	0.88	0.40
N3	0.15	0.02	0.16	0.22	0.12	0.25	0.12	0.36	0.04	0.21	0.01	0.02	0.07	0.17	0.17	0.07	0.24	0.20	0.46	0.01	0.42	0.85	0.32
N6	0.18	0.17	0.17	0.20	0.21	0.22	0.20	0.34	0.17	0.22	0.16	0.15	0.20	0.21	0.21	0.07	0.19	0.21	0.43	0.12	0.58	0.81	0.34
N7	0.18	0.06	0.13	0.17	0.16	0.18	0.12	0.26	0.04	0.18	0.00	0.01	0.15	0.14	0.19	0.03	0.16	0.23	0.31	0.00	0.31	0.67	0.19
N9	0.14	0.06	0.11	0.16	0.08	0.18	0.05	0.24	0.03	0.15	0.08	0.10	0.02	0.10	0.14	0.01	0.18	0.22	0.29	0.05	0.16	0.64	0.13
O2'	0.36	0.10	0.37	0.40	0.20	0.41	0.17	0.41	0.10	0.28	0.07	0.06	0.16	0.21	0.28	0.40	0.33	0.37	0.39	0.07	0.88	0.18	0.58
O3'	0.56	0.18	0.59	0.69	0.39	0.70	0.38	0.67	0.28	0.57	0.19	0.09	0.28	0.48	0.52	0.46	0.75	0.71	0.56	0.26	0.29	0.90	0.28
O4'	0.28	0.03	0.23	0.27	0.14	0.25	0.12	0.24	0.04	0.24	0.03	0.10	0.05	0.18	0.24	0.12	0.29	0.36	0.19	0.03	0.03	0.46	0.03
O5'	0.13	0.65	0.15	0.00	0.40	0.06	0.41	0.08	0.53	0.18	0.64	0.75	0.53	0.29	0.23	0.24	0.11	0.09	0.04	0.54	0.37	0.40	0.10
OP1	0.05	0.37	0.12	0.04	0.19	0.01	0.21	0.02	0.29	0.06	0.37	0.46	0.27	0.13	0.09	0.22	0.01	0.11	0.07	0.31	0.51	0.36	0.18
OP2	0.30	0.40	0.49	0.58	0.15	0.45	0.31	0.33	0.51	0.03	0.55	0.46	0.17	0.22	0.05	0.61	0.84	0.36	0.10	0.61	0.47	0.26	0.19
P	0.01	0.67	0.02	0.17	0.38	0.18	0.45	0.16	0.61	0.17	0.72	0.79	0.48	0.32	0.18	0.01	0.33	0.17	0.07	0.66	0.41	0.37	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.35	0.06	0.06
C2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.01	0.12	0.00	0.51	0.26	0.07
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.09	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.51	0.18	0.01
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.07	0.01	0.07	0.06	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.50	0.31	0.01
C4	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01	0.18	0.00	0.61	0.20	0.11
C4'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.05	0.09	0.03	0.05	0.04	0.00	0.03	0.07	0.24	0.21	0.06
C5	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.28	0.01	0.81	0.30	0.22
C5'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.17	0.21	0.12	0.01	0.03	0.23	0.11	0.03	0.01	0.03	0.00	0.22	0.32	0.31	0.01
C6	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.28	0.00	0.82	0.38	0.24
C8	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.31	0.02	0.89	0.16	0.24
N1	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.20	0.00	0.66	0.34	0.16
N2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.11	0.01	0.07	0.00	0.41	0.25	0.02
N3	0.03	0.00	0.07	0.06	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.07	0.01	0.09	0.00	0.45	0.17	0.02
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.35	0.02	0.98	0.29	0.31
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.18	0.00	0.61	0.10	0.09
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.05	0.04	0.03	0.06	0.02	0.10	0.17	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.33	0.21	0.08
O3'	0.03	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.07	0.04	0.11	0.07	0.06	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.03	0.41	0.34	0.02
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.14	0.10	0.15
O5'	0.03	0.12	0.03	0.01	0.18	0.03	0.28	0.00	0.28	0.31	0.20	0.07	0.09	0.35	0.18	0.07	0.02	0.01	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.34	0.00	0.93	0.45	0.32
OP1	0.35	0.51	0.51	0.50	0.61	0.24	0.81	0.32	0.82	0.89	0.66	0.41	0.45	0.98	0.61	0.33	0.41	0.14	0.01	0.93	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.26	0.18	0.31	0.20	0.21	0.30	0.31	0.38	0.16	0.34	0.25	0.17	0.29	0.10	0.21	0.34	0.10	0.01	0.45	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.07	0.01	0.01	0.11	0.06	0.22	0.01	0.24	0.24	0.16	0.02	0.02	0.31	0.09	0.08	0.02	0.15	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00