Doublet Group distance statistics: 51788

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.000, 0.031, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.000, 0.181, 0.362, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.181 std_dev=0.181
O4'	A	0, 0.000, 0.203, 0.406, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.203 std_dev=0.203
C4	B	0, 0.000, 0.261, 0.522, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.261 std_dev=0.261
N3	B	0, 0.000, 0.277, 0.554, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.277 std_dev=0.277
C4'	A	0, 0.000, 0.321, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.321 std_dev=0.321
N9	B	0, 0.000, 0.329, 0.659, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.329 std_dev=0.329
O4'	B	0, 0.000, 0.406, 0.812, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.406 std_dev=0.406
C1'	B	0, 0.000, 0.415, 0.830, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.415 std_dev=0.415
C5	B	0, 0.000, 0.417, 0.834, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.417 std_dev=0.417
C2	B	0, 0.000, 0.456, 0.912, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.456 std_dev=0.456
O5'	A	0, 0.000, 0.463, 0.927, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.463 std_dev=0.463
C8	B	0, 0.000, 0.487, 0.973, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.487 std_dev=0.487
N7	B	0, 0.000, 0.523, 1.046, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.523 std_dev=0.523
C3'	A	0, 0.000, 0.532, 1.064, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.532 std_dev=0.532
C4'	B	0, 0.000, 0.542, 1.084, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.542 std_dev=0.542
N1	B	0, 0.000, 0.591, 1.182, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.591 std_dev=0.591
C6	B	0, 0.000, 0.591, 1.182, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.591 std_dev=0.591
N2	B	0, 0.000, 0.599, 1.199, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.599 std_dev=0.599
C3'	B	0, 0.000, 0.604, 1.208, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.604 std_dev=0.604
O2'	A	0, 0.000, 0.683, 1.367, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.683 std_dev=0.683
O3'	B	0, 0.000, 0.722, 1.444, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.722 std_dev=0.722
P	A	0, 0.000, 0.788, 1.577, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.788 std_dev=0.788
O6	B	0, 0.000, 0.816, 1.632, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.816 std_dev=0.816
OP1	A	0, 0.000, 0.829, 1.658, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.829 std_dev=0.829
C2'	B	0, 0.000, 0.892, 1.783, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.892 std_dev=0.892
C5'	A	0, 0.000, 0.961, 1.921, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.961 std_dev=0.961
C5'	B	0, 0.000, 1.041, 2.081, 2.081 max_d=2.081 avg_d=1.041 std_dev=1.041
OP2	A	0, 0.000, 1.045, 2.089, 2.089 max_d=2.089 avg_d=1.045 std_dev=1.045
O3'	A	0, 0.000, 1.184, 2.368, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.184 std_dev=1.184
O5'	B	0, 0.000, 1.296, 2.592, 2.592 max_d=2.592 avg_d=1.296 std_dev=1.296
O2'	B	0, 0.000, 1.542, 3.084, 3.084 max_d=3.084 avg_d=1.542 std_dev=1.542
OP2	B	0, 0.000, 2.395, 4.790, 4.790 max_d=4.790 avg_d=2.395 std_dev=2.395
P	B	0, 0.000, 2.461, 4.921, 4.921 max_d=4.921 avg_d=2.461 std_dev=2.461
OP1	B	0, 0.000, 3.145, 6.290, 6.290 max_d=6.290 avg_d=3.145 std_dev=3.145

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.25	0.00	0.14	0.00	0.10	0.08
C2	0.01	0.00	0.07	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.20	0.35	0.09	0.26	0.13	0.36	0.27
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.24	0.07	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.02	0.00	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.05
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.11	0.18	0.05	0.01	0.14	0.17	0.11	0.00	0.01	0.00	0.30	0.09	0.18	0.19
C4	0.00	0.02	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.20	0.06	0.25	0.14	0.32	0.25
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.13	0.13	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.01	0.00	0.19	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.08	0.03	0.26	0.21	0.39	0.30
C5'	0.14	0.01	0.24	0.02	0.11	0.00	0.19	0.00	0.14	0.36	0.06	0.01	0.17	0.32	0.20	0.04	0.19	0.02	0.01	0.04	0.24	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.26	0.13	0.05	0.28	0.23	0.44	0.33
C8	0.02	0.03	0.05	0.18	0.01	0.07	0.01	0.36	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.19	0.09	0.05	0.21	0.18	0.28	0.23
N1	0.01	0.00	0.08	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.25	0.26	0.07	0.27	0.19	0.42	0.31
N3	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.15	0.36	0.09	0.24	0.10	0.30	0.23
N6	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.01	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.06	0.04	0.29	0.28	0.49	0.37
N7	0.01	0.02	0.06	0.17	0.00	0.04	0.00	0.32	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.08	0.02	0.24	0.23	0.38	0.29
N9	0.00	0.03	0.02	0.11	0.01	0.00	0.01	0.20	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.10	0.00	0.21	0.12	0.24	0.20
O2'	0.03	0.20	0.00	0.00	0.18	0.20	0.24	0.04	0.26	0.19	0.25	0.15	0.28	0.24	0.12	0.00	0.05	0.15	0.23	0.10	0.03	0.13
O3'	0.25	0.35	0.05	0.01	0.20	0.00	0.08	0.19	0.13	0.09	0.26	0.36	0.06	0.08	0.10	0.05	0.00	0.22	0.39	0.41	0.44	0.42
O4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.09	0.04	0.02	0.00	0.15	0.22	0.00	0.05	0.08	0.01	0.00
O5'	0.14	0.26	0.13	0.30	0.25	0.01	0.26	0.01	0.28	0.21	0.27	0.24	0.29	0.24	0.21	0.23	0.39	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.00	0.13	0.00	0.09	0.14	0.13	0.21	0.04	0.23	0.18	0.19	0.10	0.28	0.23	0.12	0.10	0.41	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.36	0.01	0.18	0.32	0.13	0.39	0.24	0.44	0.28	0.42	0.30	0.49	0.38	0.24	0.03	0.44	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.27	0.05	0.19	0.25	0.08	0.30	0.02	0.33	0.23	0.31	0.23	0.37	0.29	0.20	0.13	0.42	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.11	0.30	0.11	0.06	0.33	0.02	0.55	0.08	0.19	0.14	0.17	0.00	0.10	0.19	0.72	0.40	0.16	0.40	0.11	1.12	0.63	0.91
C2	0.13	0.15	0.06	0.09	0.17	0.31	0.15	0.63	0.13	0.13	0.14	0.14	0.16	0.13	0.15	0.08	0.22	0.13	0.05	0.11	0.10	0.36	0.27
C2'	0.24	0.16	0.30	0.18	0.03	0.36	0.00	0.56	0.11	0.18	0.18	0.24	0.05	0.09	0.16	0.77	0.51	0.18	0.52	0.14	1.43	0.80	1.12
C3'	0.14	0.48	0.29	0.16	0.19	0.26	0.21	0.35	0.36	0.05	0.48	0.61	0.33	0.07	0.00	0.79	0.52	0.18	0.40	0.38	1.37	0.53	0.93
C4	0.22	0.02	0.18	0.05	0.11	0.32	0.04	0.60	0.04	0.13	0.05	0.01	0.10	0.06	0.17	0.41	0.28	0.20	0.16	0.09	0.44	0.44	0.52
C4'	0.06	0.26	0.25	0.27	0.13	0.42	0.14	0.51	0.22	0.01	0.27	0.31	0.19	0.07	0.03	0.78	0.63	0.33	0.55	0.23	1.49	0.61	1.01
C5	0.17	0.05	0.20	0.01	0.07	0.29	0.04	0.57	0.13	0.03	0.08	0.07	0.12	0.05	0.11	0.37	0.23	0.23	0.06	0.20	0.27	0.35	0.39
C5'	0.23	0.26	0.01	0.53	0.26	0.64	0.25	0.67	0.25	0.22	0.26	0.24	0.27	0.23	0.24	0.43	0.97	0.58	0.66	0.25	1.52	0.68	1.03
C6	0.11	0.15	0.09	0.01	0.09	0.28	0.02	0.58	0.05	0.02	0.05	0.19	0.16	0.08	0.07	0.18	0.18	0.22	0.03	0.14	0.03	0.28	0.22
C8	0.24	0.12	0.38	0.03	0.03	0.27	0.07	0.51	0.20	0.08	0.22	0.14	0.03	0.03	0.13	0.67	0.27	0.23	0.17	0.26	0.72	0.43	0.60
N1	0.10	0.20	0.02	0.03	0.14	0.28	0.09	0.59	0.10	0.03	0.16	0.21	0.18	0.01	0.10	0.05	0.18	0.16	0.05	0.05	0.23	0.27	0.14
N3	0.19	0.07	0.03	0.11	0.15	0.34	0.12	0.65	0.06	0.19	0.04	0.05	0.12	0.15	0.20	0.25	0.28	0.13	0.17	0.04	0.28	0.47	0.50
N6	0.07	0.17	0.10	0.05	0.05	0.26	0.09	0.55	0.12	0.09	0.05	0.25	0.16	0.17	0.02	0.14	0.15	0.23	0.08	0.26	0.14	0.21	0.12
N7	0.19	0.06	0.32	0.05	0.02	0.27	0.11	0.53	0.23	0.01	0.21	0.03	0.07	0.09	0.09	0.52	0.23	0.25	0.09	0.32	0.46	0.36	0.46
N9	0.27	0.07	0.31	0.03	0.08	0.30	0.01	0.55	0.10	0.15	0.13	0.10	0.05	0.06	0.19	0.63	0.31	0.19	0.23	0.14	0.76	0.49	0.67
O2'	0.14	0.07	0.08	0.43	0.07	0.57	0.09	0.75	0.02	0.20	0.05	0.15	0.02	0.16	0.14	0.55	0.76	0.25	0.80	0.02	1.78	1.19	1.48
O3'	0.44	0.37	0.56	0.15	0.06	0.16	0.08	0.16	0.12	0.44	0.32	0.60	0.18	0.30	0.32	1.02	0.25	0.26	0.00	0.12	1.07	0.10	0.55
O4'	0.17	0.16	0.29	0.17	0.04	0.39	0.07	0.54	0.14	0.06	0.18	0.19	0.09	0.01	0.06	0.75	0.47	0.30	0.43	0.16	1.19	0.52	0.86
O5'	0.08	0.60	0.37	0.06	0.40	0.26	0.43	0.35	0.54	0.24	0.60	0.66	0.49	0.34	0.24	0.84	0.39	0.41	0.30	0.56	1.15	0.26	0.65
OP1	0.03	0.71	0.38	0.03	0.40	0.11	0.44	0.12	0.59	0.17	0.71	0.86	0.54	0.30	0.20	0.84	0.38	0.24	0.24	0.63	1.26	0.14	0.62
OP2	0.25	0.96	0.24	0.12	0.66	0.31	0.75	0.39	0.92	0.49	1.01	1.09	0.75	0.64	0.47	0.61	0.43	0.50	0.31	0.98	1.15	0.25	0.64
P	0.17	0.79	0.30	0.09	0.53	0.23	0.58	0.28	0.72	0.34	0.80	0.90	0.64	0.47	0.35	0.72	0.41	0.41	0.28	0.75	1.18	0.18	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00	0.26	0.02	0.01	0.31	0.16
C2	0.01	0.00	0.33	0.22	0.01	0.12	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.08	0.27	0.33	0.02	0.11	0.26	0.20
C2'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.18	0.01	0.10	0.16	0.17	0.14	0.26	0.39	0.31	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.14	0.20	0.18	0.04
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.23	0.00	0.30	0.01	0.32	0.26	0.28	0.20	0.18	0.31	0.19	0.01	0.01	0.02	0.03	0.35	0.28	0.28	0.08
C4	0.00	0.01	0.18	0.23	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.15	0.46	0.01	0.38	0.41	0.39
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.19	0.07	0.17	0.12	0.15	0.05	0.25	0.01	0.00	0.00	0.05	0.40	0.22	0.10
C5	0.01	0.01	0.10	0.30	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.10	0.07	0.64	0.01	0.78	0.57	0.65
C5'	0.07	0.24	0.16	0.01	0.14	0.00	0.07	0.00	0.11	0.10	0.20	0.29	0.22	0.06	0.05	0.10	0.18	0.01	0.00	0.07	0.11	0.32	0.01
C6	0.01	0.00	0.17	0.32	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.11	0.12	0.62	0.00	0.78	0.55	0.63
C8	0.01	0.01	0.14	0.26	0.00	0.19	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.13	0.16	0.80	0.02	0.99	0.72	0.84
N1	0.01	0.00	0.26	0.28	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.22	0.47	0.02	0.43	0.39	0.40
N2	0.01	0.00	0.39	0.20	0.01	0.17	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.14	0.32	0.22	0.03	0.13	0.15	0.03
N3	0.01	0.00	0.31	0.18	0.00	0.12	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.13	0.26	0.29	0.01	0.02	0.25	0.15
N7	0.01	0.01	0.05	0.31	0.00	0.15	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.30	0.18	0.08	0.83	0.02	1.16	0.76	0.92
N9	0.00	0.01	0.02	0.19	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.03	0.01	0.51	0.02	0.44	0.47	0.46
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.25	0.13	0.10	0.07	0.33	0.07	0.32	0.20	0.30	0.14	0.00	0.05	0.17	0.09	0.13	0.19	0.32	0.12
O3'	0.24	0.08	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.18	0.11	0.13	0.02	0.14	0.13	0.18	0.03	0.05	0.00	0.18	0.08	0.18	0.40	0.52	0.16
O4'	0.00	0.27	0.00	0.02	0.15	0.00	0.07	0.01	0.12	0.16	0.22	0.32	0.26	0.08	0.01	0.17	0.18	0.00	0.28	0.08	0.08	0.32	0.10
O5'	0.26	0.33	0.01	0.03	0.46	0.00	0.64	0.00	0.62	0.80	0.47	0.22	0.29	0.83	0.51	0.09	0.08	0.28	0.00	0.72	0.00	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.14	0.35	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.13	0.18	0.08	0.72	0.00	1.03	0.65	0.78
OP1	0.01	0.11	0.20	0.28	0.38	0.40	0.78	0.11	0.78	0.99	0.43	0.13	0.02	1.16	0.44	0.19	0.40	0.08	0.00	1.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.26	0.18	0.28	0.41	0.22	0.57	0.32	0.55	0.72	0.39	0.15	0.25	0.76	0.47	0.32	0.52	0.32	0.01	0.65	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.20	0.04	0.08	0.39	0.10	0.65	0.01	0.63	0.84	0.40	0.03	0.15	0.92	0.46	0.12	0.16	0.10	0.00	0.78	0.01	0.00	0.00