Doublet Group distance statistics: 51789

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
N9	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
C8	A	0, 0.000, 0.058, 0.115, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.058 std_dev=0.058
N7	B	0, 0.000, 0.166, 0.332, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.166 std_dev=0.166
C8	B	0, 0.000, 0.173, 0.347, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.173 std_dev=0.173
C5	B	0, 0.000, 0.230, 0.461, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.230 std_dev=0.230
N9	B	0, 0.000, 0.263, 0.526, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.263 std_dev=0.263
C6	B	0, 0.000, 0.265, 0.530, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.265 std_dev=0.265
C4	B	0, 0.000, 0.291, 0.582, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.291 std_dev=0.291
N1	B	0, 0.000, 0.298, 0.596, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.298 std_dev=0.298
O6	B	0, 0.000, 0.308, 0.616, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.308 std_dev=0.308
C2	B	0, 0.000, 0.329, 0.658, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.329 std_dev=0.329
N3	B	0, 0.000, 0.354, 0.707, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.354 std_dev=0.354
N2	B	0, 0.000, 0.355, 0.710, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.355 std_dev=0.355
C1'	B	0, 0.000, 0.464, 0.927, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.464 std_dev=0.464
C2'	B	0, 0.000, 0.547, 1.095, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.547 std_dev=0.547
O4'	A	0, 0.000, 0.646, 1.292, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.646 std_dev=0.646
C2'	A	0, 0.000, 0.691, 1.382, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.691 std_dev=0.691
C3'	A	0, 0.000, 0.735, 1.469, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.735 std_dev=0.735
C4'	A	0, 0.000, 0.842, 1.684, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.842 std_dev=0.842
O2'	B	0, 0.000, 0.882, 1.764, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.882 std_dev=0.882
O3'	A	0, 0.000, 0.896, 1.793, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.896 std_dev=0.896
C3'	B	0, 0.000, 1.092, 2.185, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.092 std_dev=1.092
O2'	A	0, 0.000, 1.105, 2.211, 2.211 max_d=2.211 avg_d=1.105 std_dev=1.105
O4'	B	0, 0.000, 1.222, 2.444, 2.444 max_d=2.444 avg_d=1.222 std_dev=1.222
C4'	B	0, 0.000, 1.344, 2.688, 2.688 max_d=2.688 avg_d=1.344 std_dev=1.344
O3'	B	0, 0.000, 1.481, 2.962, 2.962 max_d=2.962 avg_d=1.481 std_dev=1.481
C5'	A	0, 0.000, 1.978, 3.957, 3.957 max_d=3.957 avg_d=1.978 std_dev=1.978
C5'	B	0, 0.000, 2.452, 4.905, 4.905 max_d=4.905 avg_d=2.452 std_dev=2.452
O5'	B	0, 0.000, 2.698, 5.395, 5.395 max_d=5.395 avg_d=2.698 std_dev=2.698
O5'	A	0, 0.000, 2.989, 5.978, 5.978 max_d=5.978 avg_d=2.989 std_dev=2.989
P	B	0, 0.000, 4.080, 8.160, 8.160 max_d=8.160 avg_d=4.080 std_dev=4.080
OP2	B	0, 0.000, 4.097, 8.194, 8.194 max_d=8.194 avg_d=4.097 std_dev=4.097
P	A	0, 0.000, 4.432, 8.863, 8.863 max_d=8.863 avg_d=4.432 std_dev=4.432
OP2	A	0, 0.000, 4.482, 8.963, 8.963 max_d=8.963 avg_d=4.482 std_dev=4.482
OP1	B	0, 0.000, 5.078, 10.157, 10.157 max_d=10.157 avg_d=5.078 std_dev=5.078
OP1	A	0, 0.000, 5.191, 10.381, 10.381 max_d=10.381 avg_d=5.191 std_dev=5.191

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.27	0.34	0.48	0.30
C2	0.01	0.00	0.25	0.14	0.01	0.15	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.45	0.30	0.22	0.06	0.47	0.36	0.13
C2'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.11	0.01	0.03	0.17	0.09	0.16	0.19	0.25	0.03	0.10	0.02	0.00	0.00	0.01	0.55	0.62	0.57	0.57
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.11	0.10	0.13	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.02	0.30	0.13	0.23	0.25
C4	0.01	0.01	0.11	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.16	0.11	0.29	0.73	0.65	0.44
C4'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.16	0.09	0.16	0.00	0.12	0.03	0.11	0.00	0.00	0.00	0.28	0.14	0.04
C5	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.08	0.03	0.43	1.07	0.92	0.69
C5'	0.11	0.05	0.17	0.02	0.12	0.00	0.24	0.00	0.18	0.44	0.06	0.05	0.23	0.41	0.23	0.03	0.14	0.01	0.01	0.32	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.03	0.00	0.03	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.14	0.08	0.34	1.04	0.83	0.59
C8	0.02	0.00	0.16	0.11	0.01	0.16	0.01	0.44	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.14	0.06	0.16	0.70	1.22	1.22	0.99
N1	0.00	0.01	0.19	0.10	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.35	0.24	0.16	0.18	0.76	0.57	0.34
N3	0.02	0.01	0.25	0.13	0.00	0.16	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.28	0.23	0.06	0.39	0.34	0.11
N6	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.08	0.05	0.41	1.23	0.98	0.73
N7	0.01	0.01	0.10	0.08	0.00	0.12	0.00	0.41	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.03	0.10	0.65	1.36	1.26	1.01
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.43	0.78	0.78	0.58
O2'	0.01	0.45	0.00	0.01	0.22	0.11	0.11	0.03	0.20	0.14	0.35	0.44	0.13	0.07	0.03	0.00	0.01	0.02	0.42	0.45	0.47	0.42
O3'	0.11	0.30	0.00	0.00	0.16	0.00	0.08	0.14	0.14	0.06	0.24	0.28	0.08	0.03	0.07	0.01	0.00	0.11	0.12	0.25	0.01	0.00
O4'	0.01	0.22	0.01	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01	0.08	0.16	0.16	0.23	0.05	0.10	0.01	0.02	0.11	0.00	0.08	0.12	0.21	0.05
O5'	0.27	0.06	0.55	0.30	0.29	0.00	0.43	0.01	0.34	0.70	0.18	0.06	0.41	0.65	0.43	0.42	0.12	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.34	0.47	0.62	0.13	0.73	0.28	1.07	0.32	1.04	1.22	0.76	0.39	1.23	1.36	0.78	0.45	0.25	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	0.36	0.57	0.23	0.65	0.14	0.92	0.11	0.83	1.22	0.57	0.34	0.98	1.26	0.78	0.47	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.13	0.57	0.25	0.44	0.04	0.69	0.01	0.59	0.99	0.34	0.11	0.73	1.01	0.58	0.42	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.01	0.26	0.34	0.03	0.21	0.07	0.15	0.13	0.03	0.10	0.02	0.09	0.07	0.10	0.02	0.51	0.52	0.16	0.19	0.48	0.31	0.09
C2	0.20	0.08	0.15	0.20	0.11	0.64	0.04	0.90	0.01	0.10	0.02	0.08	0.13	0.02	0.15	0.25	0.10	0.75	0.78	0.07	1.19	1.10	1.32
C2'	0.41	0.25	0.22	0.31	0.03	0.35	0.13	0.30	0.28	0.12	0.33	0.31	0.08	0.04	0.15	0.09	0.54	0.69	0.08	0.33	0.44	0.34	0.04
C3'	0.20	0.40	0.43	0.66	0.21	0.01	0.28	0.13	0.39	0.07	0.44	0.45	0.27	0.19	0.06	0.03	0.92	0.37	0.51	0.42	1.07	0.86	0.60
C4	0.29	0.06	0.17	0.07	0.10	0.37	0.02	0.42	0.09	0.07	0.04	0.07	0.15	0.04	0.15	0.07	0.19	0.60	0.19	0.16	0.23	0.26	0.49
C4'	0.17	0.20	0.78	1.07	0.29	0.52	0.29	0.66	0.25	0.30	0.21	0.11	0.24	0.31	0.29	0.42	1.35	0.12	0.95	0.25	1.55	1.16	1.02
C5	0.27	0.13	0.08	0.03	0.17	0.32	0.03	0.33	0.04	0.09	0.03	0.14	0.21	0.01	0.18	0.00	0.12	0.51	0.13	0.14	0.23	0.25	0.46
C5'	0.54	0.34	1.21	1.70	0.49	1.16	0.38	1.36	0.27	0.48	0.24	0.26	0.50	0.40	0.54	0.86	2.11	0.61	1.60	0.20	2.35	1.77	1.72
C6	0.22	0.16	0.04	0.13	0.19	0.42	0.10	0.53	0.04	0.12	0.09	0.15	0.21	0.05	0.19	0.05	0.05	0.53	0.41	0.06	0.73	0.72	0.89
C8	0.30	0.07	0.13	0.28	0.10	0.10	0.06	0.02	0.14	0.03	0.08	0.11	0.17	0.07	0.13	0.13	0.41	0.39	0.33	0.23	0.56	0.47	0.22
N1	0.20	0.13	0.06	0.25	0.17	0.58	0.09	0.82	0.04	0.13	0.08	0.13	0.18	0.06	0.18	0.16	0.17	0.64	0.74	0.03	1.22	1.16	1.33
N3	0.25	0.04	0.22	0.04	0.08	0.55	0.02	0.71	0.07	0.07	0.03	0.05	0.10	0.02	0.13	0.22	0.08	0.74	0.51	0.12	0.69	0.66	0.90
N6	0.20	0.18	0.01	0.16	0.20	0.37	0.14	0.46	0.09	0.12	0.13	0.17	0.22	0.08	0.18	0.01	0.10	0.44	0.36	0.01	0.73	0.72	0.86
N7	0.28	0.15	0.06	0.15	0.16	0.16	0.01	0.07	0.08	0.06	0.01	0.17	0.22	0.04	0.16	0.11	0.25	0.39	0.19	0.20	0.27	0.23	0.01
N9	0.31	0.02	0.20	0.25	0.06	0.21	0.07	0.16	0.14	0.03	0.10	0.05	0.12	0.07	0.12	0.03	0.39	0.50	0.13	0.21	0.32	0.22	0.02
O2'	0.76	0.04	0.11	0.16	0.25	0.89	0.13	0.93	0.06	0.44	0.13	0.13	0.17	0.25	0.47	0.34	0.08	1.18	0.55	0.14	0.29	0.30	0.63
O3'	0.55	0.18	0.04	0.24	0.06	0.44	0.03	0.34	0.18	0.23	0.25	0.27	0.00	0.07	0.26	0.35	0.51	0.77	0.07	0.24	0.69	0.48	0.20
O4'	0.11	0.08	0.66	0.87	0.23	0.39	0.26	0.51	0.21	0.29	0.13	0.05	0.12	0.30	0.25	0.28	1.04	0.05	0.80	0.22	1.26	0.94	0.80
O5'	0.98	0.59	1.74	2.31	0.79	1.72	0.58	1.89	0.39	0.74	0.38	0.50	0.86	0.59	0.89	1.39	2.74	1.08	2.09	0.26	2.72	2.10	2.11
OP1	1.11	0.23	1.98	2.63	0.51	2.13	0.16	2.28	0.16	0.50	0.12	0.21	0.61	0.19	0.74	1.95	3.45	1.29	2.25	0.40	2.94	2.01	2.20
OP2	1.01	0.24	1.65	2.56	0.56	2.22	0.26	2.64	0.06	0.57	0.08	0.16	0.63	0.31	0.76	1.37	3.17	1.39	2.74	0.27	3.80	2.74	2.94
P	1.29	0.46	2.05	2.83	0.81	2.34	0.51	2.58	0.20	0.83	0.17	0.35	0.85	0.57	1.02	1.83	3.53	1.54	2.64	0.00	3.38	2.49	2.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.08	0.13	0.10	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.02	0.15	0.07	0.10
C2	0.10	0.00	0.02	0.49	0.01	0.43	0.01	0.79	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.52	0.17	1.11	0.00	1.62	1.44	1.26
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.02	0.02	0.05	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.44	0.01	0.06
C3'	0.00	0.49	0.00	0.00	0.25	0.00	0.08	0.02	0.16	0.24	0.34	0.60	0.51	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.53	0.05	0.15
C4	0.04	0.01	0.02	0.25	0.00	0.24	0.01	0.43	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.24	0.12	0.62	0.02	0.73	0.54	0.47
C4'	0.00	0.43	0.00	0.00	0.24	0.00	0.12	0.01	0.20	0.19	0.34	0.51	0.42	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.17	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.07	0.40	0.01	0.38	0.25	0.18
C5'	0.03	0.79	0.02	0.02	0.43	0.01	0.26	0.00	0.42	0.26	0.65	0.95	0.72	0.10	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.34	0.01	0.01	0.01
C6	0.04	0.00	0.03	0.16	0.02	0.20	0.01	0.42	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.10	0.61	0.00	0.70	0.63	0.49
C8	0.04	0.01	0.06	0.24	0.00	0.19	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.24	0.10	0.29	0.01	0.51	0.68	0.70
N1	0.08	0.00	0.02	0.34	0.03	0.34	0.01	0.65	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.23	0.36	0.14	0.93	0.00	1.28	1.20	0.99
N2	0.13	0.00	0.02	0.60	0.01	0.51	0.01	0.95	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.35	0.68	0.19	1.31	0.02	2.08	1.83	1.61
N3	0.10	0.01	0.05	0.51	0.00	0.42	0.00	0.72	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.24	0.52	0.17	1.01	0.01	1.41	1.16	1.06
N7	0.03	0.01	0.06	0.16	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.03	0.09	0.01	0.34	0.50	0.50
N9	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.17	0.00	0.15	0.05	0.09
O2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.11	0.01	0.08	0.02	0.14	0.05	0.23	0.35	0.24	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.12	0.43	0.01	0.06
O3'	0.00	0.52	0.01	0.00	0.24	0.00	0.07	0.00	0.16	0.24	0.36	0.68	0.52	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.74	0.12	0.27
O4'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.12	0.00	0.07	0.01	0.10	0.10	0.14	0.19	0.17	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.09	0.07	0.15	0.20
O5'	0.10	1.11	0.05	0.00	0.62	0.02	0.40	0.01	0.61	0.29	0.93	1.31	1.01	0.09	0.17	0.04	0.04	0.06	0.00	0.49	0.03	0.00	0.01
O6	0.02	0.00	0.04	0.09	0.02	0.15	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.08	0.09	0.49	0.00	0.49	0.44	0.32
OP1	0.15	1.62	0.44	0.53	0.73	0.17	0.38	0.01	0.70	0.51	1.28	2.08	1.41	0.34	0.15	0.43	0.74	0.07	0.03	0.49	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	1.44	0.01	0.05	0.54	0.03	0.25	0.01	0.63	0.68	1.20	1.83	1.16	0.50	0.05	0.01	0.12	0.15	0.00	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.10	1.26	0.06	0.15	0.47	0.01	0.18	0.01	0.49	0.70	0.99	1.61	1.06	0.50	0.09	0.06	0.27	0.20	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00