Doublet Group distance statistics: 51806

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 4, 22, 9, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.020, 0.036, 0.051, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.036 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.015, 0.032, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.032 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.014, 0.036, 0.058, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.036 std_dev=0.022
C2	B	0, 0.359, 0.492, 0.625, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.492 std_dev=0.133
C6	B	0, 0.326, 0.476, 0.626, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.476 std_dev=0.150
C4'	B	0, 0.202, 0.354, 0.505, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.354 std_dev=0.151
N1	B	0, 0.126, 0.277, 0.428, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.277 std_dev=0.151
O4'	B	0, 0.121, 0.276, 0.431, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.276 std_dev=0.155
C1'	B	0, 0.218, 0.375, 0.533, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.375 std_dev=0.157
C4	B	0, 0.386, 0.545, 0.704, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.545 std_dev=0.159
C5	B	0, 0.242, 0.403, 0.563, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.403 std_dev=0.160
O2	B	0, 0.498, 0.663, 0.828, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.663 std_dev=0.165
C5'	B	0, 0.224, 0.395, 0.567, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.395 std_dev=0.171
N3	B	0, 0.532, 0.710, 0.887, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.710 std_dev=0.177
C2'	B	0, 0.320, 0.514, 0.708, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.514 std_dev=0.194
C3'	B	0, 0.259, 0.452, 0.646, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.452 std_dev=0.194
O5'	B	0, 0.198, 0.394, 0.591, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.394 std_dev=0.196
P	B	0, 0.183, 0.392, 0.601, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.392 std_dev=0.209
N4	B	0, 0.625, 0.835, 1.045, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.835 std_dev=0.210
O2'	B	0, 0.465, 0.699, 0.933, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.699 std_dev=0.234
O3'	B	0, 0.272, 0.508, 0.743, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.508 std_dev=0.236
O4'	A	0, -0.170, 0.184, 0.539, 2.393 max_d=2.393 avg_d=0.184 std_dev=0.355
C2'	A	0, -0.199, 0.159, 0.517, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.159 std_dev=0.358
OP1	B	0, 0.064, 0.448, 0.833, 2.629 max_d=2.629 avg_d=0.448 std_dev=0.384
O2'	A	0, -0.160, 0.263, 0.687, 2.897 max_d=2.897 avg_d=0.263 std_dev=0.423
C4'	A	0, -0.245, 0.225, 0.695, 3.169 max_d=3.169 avg_d=0.225 std_dev=0.470
C3'	A	0, -0.287, 0.253, 0.792, 3.628 max_d=3.628 avg_d=0.253 std_dev=0.539
OP2	B	0, -0.092, 0.455, 1.001, 3.738 max_d=3.738 avg_d=0.455 std_dev=0.547
O3'	A	0, -0.287, 0.401, 1.090, 4.684 max_d=4.684 avg_d=0.401 std_dev=0.689
C5'	A	0, -0.440, 0.428, 1.296, 5.856 max_d=5.856 avg_d=0.428 std_dev=0.868
O5'	A	0, -0.339, 0.679, 1.698, 6.889 max_d=6.889 avg_d=0.679 std_dev=1.019
OP1	A	0, -0.358, 0.807, 1.971, 7.911 max_d=7.911 avg_d=0.807 std_dev=1.165
P	A	0, -0.767, 0.537, 1.840, 8.744 max_d=8.744 avg_d=0.537 std_dev=1.303
OP2	A	0, -0.841, 0.643, 2.128, 9.875 max_d=9.875 avg_d=0.643 std_dev=1.485

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.39	0.10	0.10
C2	0.03	0.00	0.14	0.28	0.01	0.17	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.29	0.06	0.36	0.63	0.27	0.46
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.09	0.10	0.15	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.31	0.15	0.07
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.12	0.00	0.05	0.02	0.10	0.18	0.20	0.28	0.06	0.12	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	0.26	0.18	0.07
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.21	0.51	0.10	0.22
C4'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.11	0.13	0.17	0.05	0.08	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.24	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.20	0.49	0.22	0.14
C5'	0.02	0.25	0.02	0.02	0.12	0.00	0.09	0.00	0.12	0.19	0.20	0.24	0.10	0.15	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.13	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.22	0.55	0.16	0.24
C8	0.02	0.01	0.09	0.18	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.17	0.04	0.33	0.39	0.47	0.23
N1	0.02	0.00	0.10	0.20	0.00	0.13	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.22	0.05	0.30	0.62	0.18	0.39
N3	0.02	0.00	0.15	0.28	0.00	0.17	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.28	0.06	0.33	0.58	0.24	0.41
N6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.07	0.03	0.21	0.52	0.24	0.18
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.29	0.41	0.46	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.17	0.42	0.19	0.10
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.30	0.15	0.07
O3'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.11	0.02	0.05	0.04	0.11	0.17	0.22	0.28	0.07	0.13	0.04	0.03	0.00	0.02	0.13	0.30	0.26	0.10
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.40	0.08	0.13
O5'	0.10	0.36	0.04	0.06	0.21	0.01	0.20	0.00	0.22	0.33	0.30	0.33	0.21	0.29	0.17	0.03	0.13	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.39	0.63	0.31	0.26	0.51	0.24	0.49	0.13	0.55	0.39	0.62	0.58	0.52	0.41	0.42	0.30	0.30	0.40	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.27	0.15	0.18	0.10	0.12	0.22	0.17	0.16	0.47	0.18	0.24	0.24	0.46	0.19	0.15	0.26	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.46	0.07	0.07	0.22	0.05	0.14	0.01	0.24	0.23	0.39	0.41	0.18	0.17	0.10	0.07	0.10	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.11	0.10	0.09	0.11	0.09	0.10	0.12	0.10	0.10	0.12	0.12	0.12	0.10	0.09	0.12	0.20	0.18	0.51	0.21
C2	0.12	0.13	0.10	0.08	0.13	0.07	0.14	0.10	0.14	0.13	0.14	0.14	0.12	0.12	0.09	0.11	0.18	0.33	0.18	0.14
C2'	0.11	0.11	0.19	0.17	0.16	0.12	0.20	0.21	0.19	0.13	0.12	0.16	0.09	0.18	0.12	0.09	0.38	0.43	0.74	0.44
C3'	0.11	0.08	0.10	0.13	0.17	0.16	0.20	0.10	0.14	0.08	0.11	0.21	0.10	0.10	0.20	0.15	0.19	0.22	0.57	0.24
C4	0.09	0.11	0.07	0.06	0.11	0.06	0.10	0.13	0.10	0.10	0.12	0.12	0.11	0.07	0.07	0.09	0.21	0.25	0.33	0.18
C4'	0.25	0.16	0.25	0.29	0.09	0.31	0.09	0.25	0.13	0.17	0.12	0.09	0.20	0.26	0.34	0.28	0.15	0.22	0.31	0.12
C5	0.09	0.12	0.07	0.07	0.12	0.08	0.10	0.15	0.10	0.10	0.14	0.13	0.13	0.08	0.08	0.07	0.21	0.23	0.30	0.18
C5'	0.41	0.24	0.45	0.54	0.11	0.53	0.13	0.46	0.21	0.28	0.16	0.11	0.30	0.47	0.61	0.42	0.33	0.43	0.13	0.29
C6	0.09	0.12	0.07	0.07	0.12	0.09	0.10	0.14	0.10	0.10	0.15	0.14	0.13	0.10	0.08	0.08	0.19	0.27	0.21	0.16
C8	0.11	0.13	0.11	0.11	0.11	0.11	0.10	0.19	0.11	0.11	0.13	0.12	0.14	0.11	0.11	0.10	0.23	0.16	0.45	0.22
N1	0.12	0.13	0.09	0.08	0.14	0.08	0.13	0.12	0.13	0.12	0.15	0.15	0.13	0.12	0.09	0.10	0.18	0.31	0.16	0.14
N3	0.10	0.11	0.08	0.06	0.11	0.06	0.12	0.10	0.12	0.11	0.12	0.12	0.11	0.09	0.07	0.10	0.19	0.30	0.26	0.16
N6	0.09	0.12	0.09	0.09	0.13	0.11	0.09	0.16	0.08	0.09	0.15	0.15	0.14	0.11	0.10	0.11	0.19	0.25	0.19	0.16
N7	0.11	0.14	0.10	0.10	0.12	0.11	0.11	0.18	0.10	0.11	0.15	0.13	0.15	0.10	0.10	0.10	0.21	0.17	0.36	0.20
N9	0.10	0.11	0.09	0.08	0.11	0.08	0.10	0.14	0.10	0.10	0.12	0.11	0.13	0.09	0.08	0.10	0.22	0.20	0.44	0.21
O2'	0.18	0.13	0.28	0.30	0.14	0.22	0.19	0.30	0.20	0.17	0.12	0.13	0.12	0.29	0.25	0.14	0.45	0.51	0.89	0.54
O3'	0.09	0.10	0.11	0.11	0.22	0.14	0.26	0.11	0.19	0.10	0.14	0.27	0.09	0.12	0.17	0.13	0.23	0.29	0.64	0.31
O4'	0.28	0.22	0.28	0.29	0.17	0.30	0.18	0.26	0.22	0.24	0.19	0.16	0.23	0.28	0.30	0.29	0.20	0.27	0.25	0.18
O5'	0.45	0.27	0.49	0.60	0.14	0.59	0.14	0.48	0.21	0.30	0.18	0.16	0.34	0.52	0.72	0.47	0.33	0.34	0.16	0.26
OP1	0.39	0.33	0.42	0.52	0.40	0.47	0.39	0.41	0.36	0.35	0.36	0.45	0.32	0.45	0.61	0.39	0.35	0.45	0.39	0.36
OP2	0.72	0.51	0.77	0.90	0.27	0.83	0.26	0.63	0.39	0.53	0.38	0.21	0.64	0.84	1.08	0.69	0.47	0.46	0.15	0.38
P	0.43	0.20	0.51	0.66	0.13	0.60	0.12	0.47	0.15	0.25	0.11	0.21	0.29	0.56	0.81	0.43	0.32	0.40	0.11	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.11	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.05	0.03	0.07	0.22	0.10	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.14	0.07
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.07	0.07
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.11	0.35	0.12	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.12	0.36	0.12	0.10
C5'	0.02	0.05	0.03	0.02	0.07	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.11	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.10	0.30	0.10	0.08
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.21	0.09	0.06
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.09	0.29	0.11	0.07
N4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.12	0.39	0.13	0.10
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.09	0.05	0.05	0.16	0.10	0.05
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.05	0.11	0.00	0.03	0.01	0.07	0.14	0.19	0.08
O3'	0.04	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.09	0.03	0.00	0.03	0.04	0.06	0.08	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.03	0.05	0.05	0.03
O5'	0.04	0.07	0.06	0.04	0.11	0.01	0.12	0.01	0.10	0.07	0.09	0.12	0.05	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.22	0.11	0.05	0.35	0.05	0.36	0.11	0.30	0.21	0.29	0.39	0.16	0.14	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.10	0.14	0.07	0.12	0.10	0.12	0.16	0.10	0.09	0.11	0.13	0.10	0.19	0.08	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.06	0.07	0.07	0.09	0.04	0.10	0.01	0.08	0.06	0.07	0.10	0.05	0.08	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00