Doublet Group distance statistics: 51812

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 4, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.014, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N3	A	0, -0.001, 0.010, 0.020, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C5	A	0, -0.003, 0.010, 0.023, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.010 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	0, -0.002, 0.012, 0.025, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.004, 0.018, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N6	A	0, -0.015, 0.021, 0.057, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.021 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.138, 0.333, 0.528, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.333 std_dev=0.195
C2'	A	0, 0.131, 0.344, 0.557, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.344 std_dev=0.213
O4'	B	0, 0.194, 0.426, 0.659, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.426 std_dev=0.232
O2'	A	0, 0.120, 0.375, 0.630, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.375 std_dev=0.255
C4'	A	0, 0.248, 0.529, 0.810, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.529 std_dev=0.281
C1'	B	0, 0.194, 0.493, 0.791, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.493 std_dev=0.299
C3'	A	0, 0.257, 0.578, 0.898, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.578 std_dev=0.320
N1	B	0, 0.159, 0.514, 0.869, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.514 std_dev=0.355
O2	B	0, 0.158, 0.536, 0.913, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.536 std_dev=0.377
C2	B	0, 0.147, 0.531, 0.914, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.531 std_dev=0.384
C4'	B	0, 0.216, 0.605, 0.994, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.605 std_dev=0.389
C6	B	0, 0.185, 0.583, 0.981, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.583 std_dev=0.398
N3	B	0, 0.184, 0.614, 1.045, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.614 std_dev=0.430
C5	B	0, 0.225, 0.691, 1.157, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.691 std_dev=0.466
C2'	B	0, 0.250, 0.717, 1.185, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.717 std_dev=0.467
O3'	A	0, 0.366, 0.836, 1.306, 1.719 max_d=1.719 avg_d=0.836 std_dev=0.470
C4	B	0, 0.227, 0.702, 1.177, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.702 std_dev=0.475
C5'	A	0, 0.413, 0.910, 1.408, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.910 std_dev=0.498
C5'	B	0, 0.214, 0.734, 1.253, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.734 std_dev=0.520
O2'	B	0, 0.246, 0.768, 1.289, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.768 std_dev=0.521
OP2	A	0, 0.497, 1.019, 1.542, 1.714 max_d=1.714 avg_d=1.019 std_dev=0.522
C3'	B	0, 0.260, 0.788, 1.316, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.788 std_dev=0.528
N4	B	0, 0.289, 0.837, 1.385, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.837 std_dev=0.548
O5'	A	0, 0.439, 1.001, 1.563, 1.895 max_d=1.895 avg_d=1.001 std_dev=0.562
P	A	0, 0.511, 1.077, 1.643, 1.896 max_d=1.896 avg_d=1.077 std_dev=0.566
OP1	A	0, 0.519, 1.128, 1.736, 2.027 max_d=2.027 avg_d=1.128 std_dev=0.608
O3'	B	0, 0.287, 0.935, 1.582, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.935 std_dev=0.648
O5'	B	0, 0.447, 1.211, 1.976, 2.251 max_d=2.251 avg_d=1.211 std_dev=0.765
OP1	B	0, 0.566, 1.436, 2.306, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.436 std_dev=0.870
P	B	0, 0.510, 1.380, 2.251, 2.706 max_d=2.706 avg_d=1.380 std_dev=0.871
OP2	B	0, 0.659, 1.727, 2.795, 3.071 max_d=3.071 avg_d=1.727 std_dev=1.068

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.29	0.07	0.11
C2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.04	0.13	0.32	0.18	0.19
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.01	0.05	0.07	0.08	0.11	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.20	0.13	0.05
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.17	0.10	0.10	0.10	0.16	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.19	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.02	0.13	0.33	0.17	0.18
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.04	0.03	0.05	0.09	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.12	0.07	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.17	0.35	0.23	0.22
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.11	0.14	0.10	0.06	0.12	0.15	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.18	0.35	0.24	0.23
C8	0.02	0.01	0.07	0.17	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.05	0.19	0.04	0.19	0.36	0.21	0.20
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.12	0.03	0.16	0.34	0.22	0.21
N3	0.02	0.00	0.11	0.10	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.13	0.04	0.11	0.32	0.15	0.17
N6	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.09	0.13	0.03	0.18	0.35	0.26	0.24
N7	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.18	0.03	0.21	0.37	0.26	0.24
N9	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.12	0.33	0.15	0.15
O2'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.10	0.05	0.07	0.05	0.10	0.05	0.13	0.15	0.09	0.05	0.04	0.00	0.04	0.07	0.03	0.17	0.16	0.05
O3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.11	0.19	0.12	0.13	0.13	0.18	0.08	0.04	0.00	0.01	0.06	0.07	0.31	0.13
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.28	0.08	0.14
O5'	0.03	0.13	0.03	0.03	0.13	0.01	0.17	0.01	0.18	0.19	0.16	0.11	0.18	0.21	0.12	0.03	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.29	0.32	0.20	0.10	0.33	0.12	0.35	0.04	0.35	0.36	0.34	0.32	0.35	0.37	0.33	0.17	0.07	0.28	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.18	0.13	0.19	0.17	0.07	0.23	0.03	0.24	0.21	0.22	0.15	0.26	0.26	0.15	0.16	0.31	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.19	0.05	0.05	0.18	0.04	0.22	0.01	0.23	0.20	0.21	0.17	0.24	0.24	0.15	0.05	0.13	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.15	0.13	0.20	0.13	0.19	0.14	0.19	0.18	0.20	0.21	0.19	0.16	0.13	0.11	0.18	0.39	0.28	0.12
C2	0.14	0.15	0.14	0.19	0.19	0.24	0.18	0.35	0.13	0.12	0.18	0.22	0.18	0.16	0.19	0.22	0.37	0.20	0.41	0.16
C2'	0.17	0.19	0.15	0.13	0.22	0.13	0.23	0.16	0.22	0.19	0.21	0.23	0.18	0.17	0.13	0.13	0.18	0.40	0.25	0.15
C3'	0.16	0.19	0.16	0.14	0.21	0.14	0.21	0.16	0.19	0.17	0.20	0.22	0.20	0.19	0.15	0.13	0.18	0.48	0.24	0.19
C4	0.09	0.17	0.12	0.11	0.21	0.16	0.19	0.21	0.15	0.13	0.20	0.23	0.15	0.17	0.12	0.14	0.26	0.24	0.38	0.08
C4'	0.17	0.19	0.18	0.17	0.20	0.17	0.20	0.19	0.19	0.18	0.20	0.20	0.21	0.19	0.19	0.16	0.18	0.55	0.22	0.21
C5	0.16	0.23	0.18	0.16	0.28	0.18	0.25	0.21	0.21	0.19	0.27	0.30	0.20	0.23	0.17	0.18	0.27	0.22	0.45	0.14
C5'	0.17	0.21	0.20	0.20	0.19	0.19	0.18	0.21	0.17	0.17	0.21	0.20	0.24	0.22	0.24	0.16	0.17	0.57	0.24	0.21
C6	0.16	0.22	0.16	0.16	0.31	0.20	0.28	0.26	0.23	0.19	0.28	0.33	0.17	0.21	0.16	0.22	0.30	0.18	0.48	0.16
C8	0.22	0.26	0.27	0.25	0.27	0.21	0.24	0.18	0.23	0.23	0.28	0.28	0.27	0.33	0.27	0.16	0.24	0.34	0.43	0.18
N1	0.16	0.15	0.14	0.18	0.25	0.23	0.24	0.33	0.19	0.15	0.21	0.29	0.16	0.17	0.17	0.23	0.35	0.18	0.46	0.17
N3	0.11	0.15	0.12	0.14	0.18	0.20	0.16	0.30	0.11	0.11	0.18	0.20	0.16	0.14	0.15	0.17	0.33	0.23	0.35	0.11
N6	0.20	0.29	0.19	0.18	0.37	0.21	0.33	0.26	0.28	0.25	0.36	0.41	0.25	0.24	0.18	0.23	0.31	0.19	0.54	0.21
N7	0.22	0.29	0.27	0.24	0.31	0.21	0.27	0.19	0.25	0.25	0.32	0.32	0.29	0.33	0.26	0.18	0.26	0.28	0.48	0.19
N9	0.15	0.20	0.17	0.15	0.22	0.15	0.20	0.16	0.18	0.17	0.22	0.23	0.20	0.21	0.16	0.11	0.22	0.32	0.35	0.11
O2'	0.20	0.21	0.16	0.15	0.26	0.16	0.28	0.19	0.26	0.22	0.23	0.27	0.18	0.17	0.15	0.17	0.20	0.44	0.23	0.22
O3'	0.16	0.18	0.16	0.16	0.22	0.16	0.23	0.20	0.22	0.18	0.20	0.23	0.19	0.18	0.17	0.14	0.21	0.56	0.23	0.27
O4'	0.17	0.20	0.17	0.15	0.20	0.15	0.18	0.15	0.18	0.18	0.20	0.20	0.22	0.17	0.16	0.15	0.17	0.47	0.27	0.15
O5'	0.17	0.24	0.18	0.15	0.22	0.14	0.18	0.14	0.16	0.19	0.25	0.24	0.29	0.21	0.20	0.15	0.15	0.47	0.34	0.13
OP1	0.39	0.51	0.38	0.37	0.49	0.33	0.43	0.33	0.40	0.44	0.52	0.50	0.55	0.39	0.38	0.30	0.32	0.46	0.57	0.35
OP2	0.22	0.34	0.24	0.22	0.31	0.17	0.25	0.17	0.22	0.26	0.35	0.32	0.39	0.27	0.27	0.16	0.14	0.47	0.38	0.16
P	0.23	0.35	0.22	0.20	0.33	0.16	0.27	0.16	0.24	0.27	0.37	0.35	0.40	0.24	0.23	0.15	0.15	0.42	0.43	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.27	0.20	0.44	0.11
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.03	0.40	0.14	0.42	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.10	0.13	0.55	0.18
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.13	0.06	0.06	0.09	0.08	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.55	0.21
C4	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.49	0.14	0.33	0.14
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.06	0.09	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.25	0.40	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.10	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.03	0.51	0.15	0.32	0.14
C5'	0.04	0.14	0.01	0.01	0.20	0.00	0.22	0.00	0.19	0.13	0.17	0.22	0.10	0.02	0.05	0.02	0.01	0.36	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.04	0.47	0.14	0.38	0.12
N1	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.39	0.15	0.43	0.11
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.45	0.13	0.38	0.13
N4	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.09	0.01	0.22	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.10	0.03	0.50	0.17	0.28	0.15
O2	0.02	0.00	0.11	0.08	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.11	0.05	0.35	0.15	0.45	0.13
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.03	0.14	0.00	0.03	0.05	0.05	0.15	0.54	0.18
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.09	0.01	0.14	0.05	0.13	0.06	0.07	0.10	0.11	0.03	0.00	0.02	0.30	0.16	0.57	0.31
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.28	0.30	0.34	0.13
O5'	0.27	0.40	0.10	0.09	0.49	0.01	0.51	0.01	0.47	0.39	0.45	0.50	0.35	0.05	0.30	0.28	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.20	0.14	0.13	0.12	0.14	0.25	0.15	0.36	0.14	0.15	0.13	0.17	0.15	0.15	0.16	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.44	0.42	0.55	0.55	0.33	0.40	0.32	0.29	0.38	0.43	0.38	0.28	0.45	0.54	0.57	0.34	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.18	0.21	0.14	0.08	0.14	0.01	0.12	0.11	0.13	0.15	0.13	0.18	0.31	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00