Doublet Group distance statistics: 51816

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 4, 2, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.022, 0.042, 0.061, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.042 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.019, 0.040, 0.061, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.040 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.008, 0.034, 0.059, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.034 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.034, 0.064, 0.095, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.064 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.026, 0.103, 0.181, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.103 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.033, 0.134, 0.235, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.134 std_dev=0.101
C4'	A	0, 0.055, 0.209, 0.363, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.209 std_dev=0.154
C3'	A	0, 0.066, 0.226, 0.386, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.226 std_dev=0.160
C4	B	0, 0.098, 0.275, 0.453, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.275 std_dev=0.177
O2'	A	0, 0.056, 0.238, 0.420, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.238 std_dev=0.182
N4	B	0, 0.160, 0.349, 0.539, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.349 std_dev=0.190
N3	B	0, 0.098, 0.292, 0.485, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.292 std_dev=0.194
O3'	A	0, 0.095, 0.317, 0.540, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.317 std_dev=0.222
C5	B	0, 0.059, 0.294, 0.530, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.294 std_dev=0.236
C2	B	0, 0.036, 0.283, 0.531, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.283 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.052, 0.330, 0.608, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.330 std_dev=0.278
N1	B	0, 0.018, 0.301, 0.583, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.301 std_dev=0.282
C5'	A	0, 0.065, 0.365, 0.665, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.365 std_dev=0.300
O2	B	0, 0.041, 0.361, 0.681, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.361 std_dev=0.320
C1'	B	0, 0.009, 0.358, 0.708, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.358 std_dev=0.349
P	A	0, 0.021, 0.387, 0.753, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.387 std_dev=0.366
O4'	B	0, 0.046, 0.422, 0.799, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.422 std_dev=0.376
O5'	A	0, 0.003, 0.437, 0.871, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.437 std_dev=0.434
OP1	A	0, -0.074, 0.391, 0.856, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.391 std_dev=0.465
C4'	B	0, -0.054, 0.456, 0.967, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.456 std_dev=0.510
C3'	B	0, -0.069, 0.464, 0.997, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.464 std_dev=0.533
O5'	B	0, 0.100, 0.655, 1.211, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.655 std_dev=0.556
O3'	B	0, -0.059, 0.501, 1.061, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.501 std_dev=0.560
C2'	B	0, -0.069, 0.508, 1.085, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.508 std_dev=0.577
C5'	B	0, -0.010, 0.569, 1.148, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.569 std_dev=0.579
P	B	0, -0.022, 0.675, 1.372, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.675 std_dev=0.697
O2'	B	0, -0.060, 0.642, 1.344, 2.133 max_d=2.133 avg_d=0.642 std_dev=0.702
OP1	B	0, 0.357, 1.099, 1.842, 2.625 max_d=2.625 avg_d=1.099 std_dev=0.743
OP2	A	0, -0.110, 0.768, 1.645, 3.094 max_d=3.094 avg_d=0.768 std_dev=0.878
OP2	B	0, 0.471, 1.462, 2.453, 3.146 max_d=3.146 avg_d=1.462 std_dev=0.991

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.11	0.36	0.13
C2	0.02	0.00	0.11	0.08	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.09	0.03	0.21	0.14	0.31	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.09	0.11	0.06	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.16	0.30	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.08	0.12	0.07	0.07	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.29	0.25	0.11
C4	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.05	0.03	0.22	0.14	0.31	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.03	0.02	0.10	0.10	0.04	0.04	0.03	0.00	0.02	0.25	0.28	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.08	0.08	0.04	0.27	0.19	0.33	0.15
C5'	0.03	0.08	0.01	0.02	0.10	0.01	0.16	0.00	0.16	0.18	0.12	0.06	0.21	0.20	0.10	0.04	0.06	0.02	0.01	0.29	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.08	0.04	0.27	0.21	0.35	0.16
C8	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.10	0.02	0.18	0.03	0.00	0.02	0.02	0.06	0.00	0.01	0.02	0.12	0.03	0.28	0.18	0.30	0.14
N1	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.07	0.03	0.24	0.18	0.33	0.15
N3	0.02	0.01	0.11	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.08	0.03	0.18	0.12	0.31	0.13
N6	0.04	0.01	0.06	0.10	0.03	0.10	0.03	0.21	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.06	0.04	0.11	0.11	0.07	0.29	0.27	0.40	0.20
N7	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.10	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.31	0.22	0.35	0.17
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.21	0.13	0.31	0.13
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.11	0.04	0.08	0.04	0.12	0.02	0.17	0.18	0.11	0.03	0.04	0.00	0.05	0.05	0.05	0.24	0.31	0.09
O3'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.05	0.03	0.08	0.06	0.08	0.12	0.07	0.08	0.11	0.12	0.05	0.05	0.00	0.01	0.19	0.45	0.27	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.07	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.14	0.18	0.45	0.19
O5'	0.12	0.21	0.05	0.10	0.22	0.02	0.27	0.01	0.27	0.28	0.24	0.18	0.29	0.31	0.21	0.05	0.19	0.14	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.14	0.16	0.29	0.14	0.25	0.19	0.29	0.21	0.18	0.18	0.12	0.27	0.22	0.13	0.24	0.45	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.36	0.31	0.30	0.25	0.31	0.28	0.33	0.22	0.35	0.30	0.33	0.31	0.40	0.35	0.31	0.31	0.27	0.45	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.13	0.08	0.11	0.13	0.06	0.15	0.02	0.16	0.14	0.15	0.13	0.20	0.17	0.13	0.09	0.17	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.21	0.14	0.16	0.16	0.15	0.10	0.16	0.11	0.10	0.24	0.20	0.31	0.16	0.32	0.22	0.17	0.35	0.16	0.15
C2	0.12	0.10	0.11	0.12	0.15	0.13	0.16	0.22	0.14	0.10	0.15	0.25	0.14	0.12	0.20	0.16	0.24	0.40	0.31	0.18
C2'	0.11	0.22	0.10	0.15	0.14	0.13	0.10	0.13	0.12	0.11	0.23	0.16	0.31	0.15	0.32	0.20	0.12	0.40	0.13	0.13
C3'	0.07	0.23	0.06	0.12	0.17	0.09	0.11	0.07	0.11	0.10	0.25	0.19	0.34	0.23	0.32	0.18	0.09	0.32	0.16	0.13
C4	0.14	0.11	0.14	0.12	0.17	0.13	0.14	0.17	0.13	0.08	0.20	0.25	0.18	0.18	0.21	0.17	0.19	0.35	0.21	0.14
C4'	0.10	0.28	0.08	0.14	0.22	0.08	0.15	0.08	0.13	0.15	0.29	0.24	0.38	0.20	0.34	0.16	0.11	0.29	0.18	0.16
C5	0.17	0.08	0.21	0.15	0.18	0.16	0.16	0.17	0.15	0.11	0.16	0.27	0.13	0.27	0.15	0.17	0.21	0.32	0.22	0.16
C5'	0.20	0.35	0.20	0.16	0.30	0.14	0.24	0.19	0.22	0.25	0.36	0.31	0.44	0.38	0.32	0.16	0.21	0.30	0.26	0.21
C6	0.17	0.07	0.21	0.15	0.16	0.15	0.15	0.17	0.13	0.10	0.10	0.27	0.14	0.25	0.13	0.16	0.22	0.33	0.25	0.15
C8	0.20	0.15	0.25	0.18	0.20	0.19	0.18	0.20	0.18	0.15	0.23	0.25	0.21	0.34	0.20	0.22	0.23	0.34	0.23	0.23
N1	0.13	0.06	0.14	0.11	0.14	0.11	0.15	0.18	0.12	0.07	0.08	0.25	0.13	0.17	0.14	0.14	0.23	0.36	0.29	0.15
N3	0.14	0.14	0.13	0.14	0.17	0.15	0.15	0.22	0.15	0.11	0.20	0.25	0.19	0.13	0.24	0.18	0.23	0.41	0.27	0.17
N6	0.22	0.14	0.29	0.22	0.16	0.21	0.16	0.21	0.15	0.15	0.11	0.26	0.21	0.34	0.17	0.20	0.25	0.32	0.27	0.18
N7	0.22	0.14	0.29	0.20	0.21	0.22	0.19	0.21	0.19	0.17	0.21	0.27	0.16	0.37	0.16	0.22	0.24	0.33	0.24	0.22
N9	0.15	0.14	0.16	0.13	0.17	0.13	0.14	0.15	0.14	0.09	0.22	0.23	0.23	0.22	0.23	0.19	0.18	0.33	0.18	0.16
O2'	0.15	0.24	0.16	0.19	0.17	0.18	0.16	0.19	0.18	0.17	0.25	0.17	0.31	0.13	0.33	0.23	0.16	0.48	0.15	0.16
O3'	0.10	0.24	0.09	0.17	0.17	0.14	0.12	0.10	0.12	0.12	0.26	0.19	0.34	0.23	0.36	0.19	0.11	0.33	0.21	0.12
O4'	0.08	0.27	0.08	0.12	0.23	0.09	0.18	0.11	0.14	0.11	0.29	0.25	0.37	0.14	0.32	0.17	0.18	0.32	0.19	0.21
O5'	0.31	0.40	0.41	0.24	0.39	0.26	0.35	0.29	0.34	0.33	0.43	0.41	0.45	0.65	0.15	0.18	0.27	0.34	0.30	0.27
OP1	0.13	0.27	0.18	0.12	0.22	0.24	0.11	0.36	0.11	0.12	0.32	0.26	0.41	0.33	0.23	0.23	0.40	0.67	0.42	0.50
OP2	0.59	0.46	0.52	0.68	0.34	0.55	0.39	0.50	0.46	0.50	0.37	0.27	0.53	0.38	0.91	0.66	0.44	0.43	0.50	0.41
P	0.12	0.20	0.13	0.15	0.15	0.08	0.10	0.10	0.10	0.11	0.22	0.18	0.30	0.34	0.38	0.22	0.13	0.32	0.21	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03	0.15	0.00	0.08	0.09	0.15	0.05
C2	0.03	0.00	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.14	0.07	0.12	0.18	0.23	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.12	0.13	0.13	0.03	0.06	0.07	0.15	0.00	0.02	0.02	0.10	0.16	0.20	0.11
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.27	0.05	0.02
C4	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.05	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.12	0.03	0.24	0.28	0.39	0.14
C4'	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.03	0.05	0.09	0.11	0.04	0.01	0.02	0.22	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.12	0.06	0.01	0.07	0.00	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.11	0.04	0.30	0.24	0.44	0.16
C5'	0.05	0.12	0.13	0.01	0.22	0.01	0.26	0.00	0.24	0.15	0.17	0.24	0.10	0.06	0.07	0.02	0.01	0.22	0.08	0.02
C6	0.01	0.01	0.13	0.06	0.01	0.07	0.00	0.24	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.11	0.06	0.27	0.17	0.38	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.07	0.12	0.02	0.16	0.12	0.25	0.08
N3	0.03	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.17	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.13	0.06	0.17	0.25	0.30	0.12
N4	0.02	0.02	0.07	0.04	0.01	0.05	0.01	0.24	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.16	0.11	0.03	0.27	0.32	0.43	0.17
O2	0.06	0.01	0.15	0.07	0.02	0.09	0.02	0.10	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.18	0.17	0.12	0.09	0.16	0.16	0.12
O2'	0.03	0.06	0.00	0.02	0.15	0.11	0.20	0.06	0.18	0.07	0.08	0.16	0.18	0.00	0.07	0.06	0.08	0.24	0.17	0.06
O3'	0.15	0.14	0.02	0.01	0.12	0.04	0.11	0.07	0.11	0.12	0.13	0.11	0.17	0.07	0.00	0.14	0.07	0.35	0.11	0.06
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.12	0.06	0.14	0.00	0.09	0.10	0.12	0.08
O5'	0.08	0.12	0.10	0.02	0.24	0.02	0.30	0.01	0.27	0.16	0.17	0.27	0.09	0.08	0.07	0.09	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.09	0.18	0.16	0.27	0.28	0.22	0.24	0.22	0.17	0.12	0.25	0.32	0.16	0.24	0.35	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.23	0.20	0.05	0.39	0.07	0.44	0.08	0.38	0.25	0.30	0.43	0.16	0.17	0.11	0.12	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.11	0.02	0.14	0.03	0.16	0.02	0.13	0.08	0.12	0.17	0.12	0.06	0.06	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00