Doublet Group distance statistics: 51821

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C8	A	0, -0.003, 0.023, 0.048, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.023 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.022, 0.070, 0.119, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.070 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.043, 0.104, 0.165, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.104 std_dev=0.061
C4'	A	0, 0.051, 0.122, 0.192, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.122 std_dev=0.071
C3'	A	0, 0.053, 0.139, 0.225, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.139 std_dev=0.086
O2'	A	0, 0.055, 0.159, 0.264, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.159 std_dev=0.104
C5'	A	0, 0.106, 0.232, 0.357, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.232 std_dev=0.126
O3'	A	0, 0.055, 0.228, 0.400, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.228 std_dev=0.172
O5'	A	0, 0.134, 0.345, 0.555, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.345 std_dev=0.211
P	A	0, 0.147, 0.415, 0.682, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.415 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.122, 0.428, 0.735, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.428 std_dev=0.306
C5	B	0, 0.132, 0.482, 0.831, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.482 std_dev=0.350
N1	B	0, 0.115, 0.472, 0.829, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.472 std_dev=0.357
C4	B	0, 0.158, 0.530, 0.902, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.530 std_dev=0.372
N3	B	0, 0.175, 0.564, 0.953, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.564 std_dev=0.389
C1'	B	0, 0.111, 0.516, 0.921, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.516 std_dev=0.405
C2	B	0, 0.139, 0.556, 0.972, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.556 std_dev=0.417
N4	B	0, 0.176, 0.626, 1.075, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.626 std_dev=0.449
O2	B	0, 0.110, 0.672, 1.234, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.672 std_dev=0.562
OP2	A	0, 0.086, 0.718, 1.351, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.718 std_dev=0.633
OP1	A	0, -0.114, 0.854, 1.823, 2.918 max_d=2.918 avg_d=0.854 std_dev=0.969
O4'	B	0, -0.089, 0.945, 1.978, 3.159 max_d=3.159 avg_d=0.945 std_dev=1.033
C2'	B	0, -0.376, 0.849, 2.073, 3.536 max_d=3.536 avg_d=0.849 std_dev=1.224
O2'	B	0, -0.349, 0.950, 2.248, 3.777 max_d=3.777 avg_d=0.950 std_dev=1.298
C4'	B	0, -0.416, 1.167, 2.750, 4.642 max_d=4.642 avg_d=1.167 std_dev=1.583
C3'	B	0, -0.674, 1.188, 3.051, 5.314 max_d=5.314 avg_d=1.188 std_dev=1.862
O3'	B	0, -0.999, 1.494, 3.988, 7.039 max_d=7.039 avg_d=1.494 std_dev=2.494
C5'	B	0, -0.902, 1.666, 4.233, 7.365 max_d=7.365 avg_d=1.666 std_dev=2.568
O5'	B	0, -1.132, 1.839, 4.811, 8.453 max_d=8.453 avg_d=1.839 std_dev=2.971
P	B	0, -1.695, 2.379, 6.453, 11.468 max_d=11.468 avg_d=2.379 std_dev=4.074
OP1	B	0, -1.757, 2.576, 6.910, 12.240 max_d=12.240 avg_d=2.576 std_dev=4.333
OP2	B	0, -2.037, 2.688, 7.414, 13.227 max_d=13.227 avg_d=2.688 std_dev=4.725

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.25	0.17	0.03
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.03	0.10	0.43	0.46	0.06
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.09	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.10	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.02	0.10	0.41	0.44	0.06
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02	0.13	0.45	0.57	0.08
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.09	0.06	0.04	0.09	0.10	0.05	0.05	0.05	0.01	0.00	0.10	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02	0.13	0.48	0.62	0.09
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.14	0.41	0.49	0.07
N1	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.11	0.47	0.56	0.08
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.09	0.02	0.08	0.39	0.39	0.05
N6	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.14	0.50	0.70	0.11
N7	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.15	0.46	0.62	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.09	0.36	0.36	0.04
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.09	0.09	0.06	0.04	0.03	0.00	0.05	0.03	0.04	0.03	0.09	0.05
O3'	0.03	0.09	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.06	0.02	0.05	0.00	0.02	0.11	0.28	0.26	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.26	0.09	0.05
O5'	0.04	0.10	0.03	0.06	0.10	0.02	0.13	0.00	0.13	0.14	0.11	0.08	0.14	0.15	0.09	0.04	0.11	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.25	0.43	0.06	0.11	0.41	0.05	0.45	0.10	0.48	0.41	0.47	0.39	0.50	0.46	0.36	0.03	0.28	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.46	0.09	0.10	0.44	0.16	0.57	0.29	0.62	0.49	0.56	0.39	0.70	0.62	0.36	0.09	0.26	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.04	0.05	0.06	0.02	0.08	0.01	0.09	0.07	0.08	0.05	0.11	0.09	0.04	0.05	0.07	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.20	0.96	0.64	0.21	0.18	0.26	0.67	0.13	0.14	0.16	0.30	0.29	1.12	0.99	0.46	0.74	1.63	0.80	1.07
C2	0.34	0.43	0.70	0.51	0.27	0.14	0.18	0.27	0.21	0.33	0.41	0.23	0.52	0.78	0.69	0.14	0.36	0.87	0.48	0.60
C2'	0.20	0.19	1.01	0.73	0.19	0.18	0.24	0.70	0.14	0.13	0.15	0.27	0.29	1.19	1.17	0.51	0.70	1.80	0.77	1.08
C3'	0.14	0.12	1.08	0.93	0.25	0.11	0.30	0.53	0.19	0.08	0.14	0.33	0.21	1.23	1.46	0.52	0.44	1.52	0.41	0.73
C4	0.34	0.36	0.87	0.74	0.09	0.22	0.13	0.14	0.11	0.27	0.26	0.22	0.48	0.90	0.99	0.11	0.16	0.72	0.18	0.34
C4'	0.08	0.12	1.02	0.76	0.31	0.22	0.35	0.75	0.25	0.12	0.20	0.37	0.11	1.24	1.29	0.66	0.69	1.71	0.67	0.99
C5	0.41	0.44	0.89	0.97	0.09	0.51	0.16	0.36	0.19	0.35	0.30	0.24	0.59	0.83	1.18	0.23	0.44	0.13	0.56	0.39
C5'	0.04	0.19	1.03	0.98	0.38	0.04	0.40	0.39	0.31	0.19	0.29	0.44	0.11	1.21	1.63	0.61	0.25	1.13	0.21	0.45
C6	0.43	0.51	0.80	0.89	0.21	0.54	0.19	0.43	0.25	0.40	0.42	0.16	0.64	0.74	1.06	0.33	0.50	0.29	0.62	0.50
C8	0.37	0.27	1.08	1.19	0.22	0.54	0.25	0.36	0.12	0.24	0.10	0.38	0.43	0.98	1.48	0.14	0.49	0.13	0.65	0.41
N1	0.40	0.49	0.72	0.67	0.28	0.34	0.20	0.14	0.25	0.38	0.46	0.20	0.60	0.73	0.84	0.22	0.13	0.28	0.15	0.11
N3	0.30	0.37	0.75	0.50	0.20	0.10	0.15	0.44	0.15	0.27	0.33	0.21	0.46	0.87	0.72	0.20	0.55	1.20	0.69	0.84
N6	0.48	0.55	0.79	1.02	0.27	0.74	0.24	0.77	0.30	0.44	0.46	0.24	0.71	0.67	1.17	0.51	0.91	0.87	1.15	1.05
N7	0.43	0.39	1.00	1.23	0.18	0.73	0.22	0.67	0.18	0.33	0.18	0.37	0.58	0.86	1.46	0.33	0.85	0.51	1.06	0.88
N9	0.30	0.26	0.98	0.85	0.17	0.21	0.22	0.19	0.07	0.20	0.15	0.31	0.39	1.02	1.15	0.18	0.18	0.84	0.18	0.37
O2'	0.18	0.20	0.90	0.47	0.20	0.43	0.24	1.11	0.17	0.15	0.19	0.25	0.27	1.18	0.88	0.67	1.18	2.49	1.43	1.71
O3'	0.12	0.12	1.06	0.88	0.24	0.16	0.29	0.66	0.20	0.09	0.15	0.31	0.19	1.26	1.46	0.61	0.55	1.78	0.56	0.90
O4'	0.15	0.13	0.99	0.66	0.30	0.23	0.35	0.73	0.23	0.10	0.19	0.36	0.17	1.18	1.05	0.58	0.77	1.60	0.76	1.04
O5'	0.14	0.18	1.15	1.40	0.41	0.46	0.41	0.27	0.30	0.17	0.31	0.49	0.10	1.14	2.05	0.29	0.48	0.30	0.79	0.38
OP1	0.81	1.10	0.19	0.75	1.15	0.06	1.07	0.22	0.99	1.00	1.16	1.18	1.06	0.20	1.63	0.85	0.42	0.15	1.03	0.53
OP2	0.33	0.38	1.17	1.79	0.20	0.99	0.14	1.16	0.14	0.28	0.31	0.19	0.53	0.90	2.34	0.22	1.63	1.00	2.15	1.72
P	0.09	0.22	1.06	1.62	0.42	0.80	0.38	0.84	0.26	0.16	0.35	0.51	0.13	0.97	2.40	0.07	1.09	0.47	1.53	1.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.10	0.13	0.15	0.07
C2	0.04	0.00	0.04	0.25	0.01	0.29	0.02	0.43	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.19	0.21	0.25	0.53	0.78	0.56	0.66
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.19	0.06
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.08	0.00	0.28	0.02	0.33	0.05	0.18	0.08	0.48	0.02	0.01	0.02	0.03	0.07	0.20	0.06
C4	0.02	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.06	0.35	0.35	0.39	0.36
C4'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.10	0.00	0.37	0.01	0.43	0.06	0.20	0.11	0.61	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.13	0.02
C5	0.01	0.02	0.03	0.28	0.01	0.37	0.00	0.65	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.23	0.27	0.90	0.92	0.99	0.99
C5'	0.03	0.43	0.01	0.02	0.21	0.01	0.65	0.00	0.70	0.12	0.30	0.23	0.97	0.02	0.04	0.01	0.00	0.08	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.33	0.01	0.43	0.00	0.70	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.26	0.34	0.94	0.89	0.98	0.98
N1	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.22	0.19	0.24	0.19
N3	0.04	0.00	0.03	0.18	0.01	0.20	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.17	0.16	0.39	0.67	0.47	0.54
N4	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.23	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.08	0.06	0.37	0.40	0.43	0.41
O2	0.07	0.00	0.09	0.48	0.02	0.61	0.02	0.97	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.40	0.40	0.50	1.20	1.54	1.26	1.41
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.03	0.02	0.19	0.02	0.22	0.02	0.14	0.04	0.40	0.00	0.04	0.02	0.03	0.09	0.17	0.04
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.07	0.02	0.23	0.04	0.26	0.04	0.17	0.08	0.40	0.04	0.00	0.02	0.07	0.07	0.25	0.09
O4'	0.00	0.25	0.01	0.02	0.06	0.00	0.27	0.01	0.34	0.04	0.16	0.06	0.50	0.02	0.02	0.00	0.09	0.13	0.11	0.06
O5'	0.10	0.53	0.05	0.03	0.35	0.02	0.90	0.00	0.94	0.22	0.39	0.37	1.20	0.03	0.07	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.13	0.78	0.09	0.07	0.35	0.08	0.92	0.08	0.89	0.19	0.67	0.40	1.54	0.09	0.07	0.13	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.56	0.19	0.20	0.39	0.13	0.99	0.11	0.98	0.24	0.47	0.43	1.26	0.17	0.25	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.66	0.06	0.06	0.36	0.02	0.99	0.02	0.98	0.19	0.54	0.41	1.41	0.04	0.09	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00