Doublet Group distance statistics: 51822

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C8	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.033 std_dev=0.017
N4	B	0, 0.060, 0.273, 0.487, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.273 std_dev=0.214
C4	B	0, -0.040, 0.188, 0.415, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.188 std_dev=0.227
N1	B	0, 0.045, 0.332, 0.619, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.332 std_dev=0.287
N3	B	0, 0.021, 0.313, 0.605, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.313 std_dev=0.292
C2	B	0, 0.033, 0.337, 0.640, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.337 std_dev=0.304
C2'	B	0, 0.123, 0.434, 0.745, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.434 std_dev=0.311
C5	B	0, 0.024, 0.360, 0.696, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.360 std_dev=0.336
C1'	B	0, 0.111, 0.456, 0.801, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.456 std_dev=0.345
C3'	B	0, 0.137, 0.500, 0.864, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.500 std_dev=0.363
C6	B	0, 0.060, 0.432, 0.803, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.432 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.178, 0.563, 0.948, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.563 std_dev=0.385
O4'	B	0, 0.148, 0.554, 0.959, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.554 std_dev=0.405
C4'	B	0, 0.184, 0.620, 1.056, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.620 std_dev=0.436
O2	B	0, 0.085, 0.529, 0.974, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.529 std_dev=0.445
O3'	B	0, 0.113, 0.577, 1.041, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.577 std_dev=0.464
C5'	B	0, 0.219, 0.718, 1.218, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.718 std_dev=0.499
P	B	0, 0.248, 0.795, 1.342, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.795 std_dev=0.547
O5'	B	0, 0.241, 0.790, 1.339, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.790 std_dev=0.549
OP2	B	0, 0.226, 0.919, 1.612, 1.911 max_d=1.911 avg_d=0.919 std_dev=0.693
OP1	B	0, 0.377, 1.229, 2.081, 1.971 max_d=1.971 avg_d=1.229 std_dev=0.852
O4'	A	0, 0.440, 1.485, 2.531, 2.406 max_d=2.406 avg_d=1.485 std_dev=1.046
C2'	A	0, 0.446, 1.538, 2.630, 2.507 max_d=2.507 avg_d=1.538 std_dev=1.092
O2'	A	0, 0.523, 1.736, 2.949, 2.836 max_d=2.836 avg_d=1.736 std_dev=1.213
C4'	A	0, 0.619, 2.147, 3.674, 3.518 max_d=3.518 avg_d=2.147 std_dev=1.528
C3'	A	0, 0.695, 2.417, 4.140, 3.955 max_d=3.955 avg_d=2.417 std_dev=1.722
O3'	A	0, 0.984, 3.361, 5.739, 5.414 max_d=5.414 avg_d=3.361 std_dev=2.377
C5'	A	0, 1.083, 3.739, 6.396, 6.073 max_d=6.073 avg_d=3.739 std_dev=2.657
O5'	A	0, 1.148, 4.074, 7.001, 6.888 max_d=6.888 avg_d=4.074 std_dev=2.927
P	A	0, 1.633, 5.824, 10.014, 9.828 max_d=9.828 avg_d=5.824 std_dev=4.191
OP1	A	0, 1.854, 6.383, 10.912, 10.302 max_d=10.302 avg_d=6.383 std_dev=4.529
OP2	A	0, 2.030, 6.994, 11.957, 11.255 max_d=11.255 avg_d=6.994 std_dev=4.964

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.33	0.42	0.15	0.24
C2	0.01	0.00	0.18	0.64	0.01	0.65	0.01	1.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.62	0.42	1.02	1.34	1.17	1.01
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.02	0.06	0.10	0.12	0.19	0.03	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.30	0.40	0.18	0.28
C3'	0.01	0.64	0.00	0.00	0.26	0.01	0.06	0.02	0.21	0.35	0.45	0.64	0.10	0.24	0.04	0.03	0.01	0.01	0.32	0.40	0.21	0.32
C4	0.01	0.01	0.08	0.26	0.00	0.27	0.00	0.39	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.23	0.22	0.71	1.16	0.43	0.62
C4'	0.01	0.65	0.01	0.01	0.27	0.00	0.08	0.01	0.23	0.38	0.47	0.63	0.13	0.26	0.04	0.04	0.04	0.00	0.04	0.12	0.16	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.09	0.80	1.55	0.40	0.81
C5'	0.02	1.01	0.02	0.02	0.39	0.01	0.12	0.00	0.35	0.60	0.75	0.93	0.20	0.44	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.09	0.03
C6	0.01	0.01	0.06	0.21	0.01	0.23	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.20	0.19	0.84	1.64	0.43	0.83
C8	0.01	0.01	0.10	0.35	0.01	0.38	0.01	0.60	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.11	0.31	0.24	0.96	1.51	0.94	1.08
N1	0.01	0.00	0.12	0.45	0.01	0.47	0.01	0.75	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.45	0.33	0.94	1.51	0.84	0.90
N3	0.01	0.00	0.19	0.64	0.00	0.63	0.01	0.93	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.59	0.42	0.91	1.12	1.03	0.87
N6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.13	0.01	0.20	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.10	0.12	0.86	1.87	0.43	0.93
N7	0.01	0.01	0.07	0.24	0.00	0.26	0.01	0.44	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.08	0.23	0.13	0.97	1.80	0.90	1.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.62	0.99	0.33	0.58
O2'	0.01	0.21	0.01	0.03	0.09	0.04	0.03	0.03	0.07	0.11	0.15	0.21	0.03	0.08	0.02	0.00	0.10	0.03	0.05	0.17	0.29	0.07
O3'	0.04	0.62	0.04	0.01	0.23	0.04	0.06	0.02	0.20	0.31	0.45	0.59	0.10	0.23	0.03	0.10	0.00	0.04	0.18	0.16	0.33	0.19
O4'	0.00	0.42	0.01	0.01	0.22	0.00	0.09	0.00	0.19	0.24	0.33	0.42	0.12	0.13	0.01	0.03	0.04	0.00	0.15	0.10	0.11	0.07
O5'	0.33	1.02	0.30	0.32	0.71	0.04	0.80	0.02	0.84	0.96	0.94	0.91	0.86	0.97	0.62	0.05	0.18	0.15	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.42	1.34	0.40	0.40	1.16	0.12	1.55	0.04	1.64	1.51	1.51	1.12	1.87	1.80	0.99	0.17	0.16	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	1.17	0.18	0.21	0.43	0.16	0.40	0.09	0.43	0.94	0.84	1.03	0.43	0.90	0.33	0.29	0.33	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	1.01	0.28	0.32	0.62	0.05	0.81	0.03	0.83	1.08	0.90	0.87	0.93	1.13	0.58	0.07	0.19	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.26	0.08	0.14	0.12	0.20	0.14	0.33	0.18	0.09	0.25	0.13	0.40	0.13	0.14	0.15	0.42	0.77	0.35	0.37
C2	0.05	0.21	0.06	0.18	0.15	0.16	0.18	0.25	0.16	0.07	0.24	0.19	0.29	0.06	0.20	0.09	0.36	0.90	0.23	0.41
C2'	0.68	0.64	0.69	0.70	0.46	0.71	0.45	0.69	0.52	0.61	0.56	0.41	0.73	0.70	0.70	0.72	0.60	1.20	0.48	0.72
C3'	0.42	0.46	0.44	0.52	0.44	0.58	0.51	0.76	0.50	0.43	0.45	0.44	0.55	0.46	0.55	0.54	0.71	1.34	0.81	0.99
C4	0.02	0.24	0.03	0.16	0.10	0.18	0.19	0.28	0.23	0.04	0.25	0.13	0.35	0.05	0.15	0.14	0.39	0.79	0.27	0.36
C4'	0.43	0.41	0.55	0.41	0.21	0.30	0.10	0.07	0.09	0.30	0.34	0.22	0.57	0.72	0.54	0.25	0.03	0.64	0.18	0.28
C5	0.09	0.18	0.08	0.19	0.04	0.20	0.25	0.28	0.29	0.07	0.22	0.08	0.31	0.05	0.18	0.19	0.36	0.68	0.27	0.33
C5'	0.76	0.69	0.98	0.74	0.31	0.54	0.18	0.21	0.23	0.55	0.53	0.29	0.96	1.26	0.92	0.46	0.16	0.60	0.38	0.40
C6	0.07	0.14	0.08	0.21	0.05	0.19	0.27	0.26	0.26	0.06	0.19	0.09	0.24	0.03	0.21	0.16	0.34	0.70	0.28	0.35
C8	0.15	0.21	0.12	0.20	0.04	0.26	0.20	0.32	0.28	0.10	0.22	0.07	0.39	0.12	0.18	0.27	0.38	0.61	0.30	0.31
N1	0.04	0.17	0.07	0.20	0.11	0.18	0.21	0.26	0.19	0.04	0.21	0.16	0.25	0.03	0.22	0.12	0.34	0.79	0.26	0.39
N3	0.05	0.24	0.03	0.15	0.15	0.14	0.17	0.26	0.17	0.08	0.25	0.17	0.33	0.07	0.15	0.07	0.39	0.91	0.25	0.41
N6	0.11	0.08	0.11	0.22	0.08	0.20	0.30	0.25	0.28	0.11	0.13	0.07	0.19	0.07	0.23	0.17	0.31	0.62	0.30	0.33
N7	0.16	0.16	0.12	0.21	0.04	0.24	0.25	0.29	0.32	0.14	0.21	0.06	0.33	0.11	0.18	0.25	0.35	0.59	0.28	0.29
N9	0.07	0.25	0.07	0.16	0.09	0.21	0.17	0.32	0.23	0.06	0.24	0.11	0.39	0.09	0.14	0.20	0.41	0.73	0.31	0.35
O2'	0.81	0.71	0.90	0.85	0.44	0.82	0.39	0.69	0.48	0.65	0.59	0.38	0.85	1.00	0.89	0.78	0.57	1.23	0.42	0.64
O3'	0.66	0.60	0.73	0.91	0.58	0.99	0.69	1.20	0.72	0.64	0.56	0.55	0.66	0.72	0.97	0.85	1.11	1.77	1.22	1.39
O4'	0.65	0.41	0.75	0.73	0.24	0.70	0.27	0.58	0.40	0.47	0.32	0.19	0.48	0.82	0.80	0.63	0.58	0.51	0.48	0.34
O5'	0.93	0.75	1.21	1.04	0.57	0.84	0.56	0.49	0.58	0.72	0.62	0.57	0.93	1.55	1.30	0.68	0.41	0.32	0.16	0.05
OP1	1.33	1.40	1.76	1.60	1.36	1.27	1.18	0.89	1.08	1.23	1.43	1.45	1.56	2.20	2.02	0.97	0.73	0.15	0.48	0.32
OP2	0.99	1.01	1.37	1.02	0.42	0.66	0.19	0.34	0.31	0.75	0.79	0.31	1.42	1.80	1.32	0.52	0.25	0.89	0.62	0.68
P	1.29	1.15	1.72	1.49	0.73	1.17	0.60	0.75	0.69	1.01	0.96	0.68	1.47	2.17	1.85	0.92	0.58	0.20	0.46	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.18	0.05
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.15	0.03	0.04	0.05	0.29	0.05
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.08	0.05	0.12	0.00	0.03	0.01	0.05	0.16	0.09	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.08	0.07	0.13	0.12	0.14	0.01	0.01	0.01	0.05	0.23	0.17	0.03
C4	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.16	0.03	0.06	0.12	0.48	0.10
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.03	0.07	0.16	0.54	0.13
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.05	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.20	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.03	0.06	0.13	0.44	0.12
N1	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.30	0.06
N3	0.02	0.00	0.08	0.13	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.18	0.03	0.05	0.08	0.37	0.07
N4	0.02	0.00	0.05	0.12	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.18	0.04	0.07	0.14	0.52	0.11
O2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.18	0.04	0.05	0.03	0.23	0.02
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.08	0.00	0.07	0.01	0.03	0.13	0.13	0.03
O3'	0.03	0.15	0.03	0.01	0.16	0.04	0.11	0.02	0.08	0.07	0.18	0.18	0.18	0.07	0.00	0.04	0.08	0.34	0.40	0.05
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.06	0.13	0.13	0.03
O5'	0.05	0.04	0.05	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.07	0.05	0.03	0.08	0.06	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.03	0.05	0.16	0.23	0.12	0.06	0.16	0.08	0.13	0.06	0.08	0.14	0.03	0.13	0.34	0.13	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.29	0.09	0.17	0.48	0.16	0.54	0.20	0.44	0.30	0.37	0.52	0.23	0.13	0.40	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.05	0.05	0.03	0.10	0.01	0.13	0.01	0.12	0.06	0.07	0.11	0.02	0.03	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00