Doublet Group distance statistics: 51825

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.010, 0.029, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.018, 0.047, 0.077, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.047 std_dev=0.030
C2'	B	0, 0.114, 0.372, 0.631, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.372 std_dev=0.259
O4'	B	0, 0.143, 0.401, 0.660, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.401 std_dev=0.259
O2'	B	0, 0.025, 0.297, 0.568, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.297 std_dev=0.272
C1'	B	0, -0.014, 0.266, 0.545, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.266 std_dev=0.279
P	A	0, 0.185, 0.468, 0.752, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.468 std_dev=0.284
O2	B	0, 0.034, 0.319, 0.603, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.319 std_dev=0.285
O5'	A	0, 0.173, 0.464, 0.755, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.464 std_dev=0.291
O4'	A	0, 0.196, 0.488, 0.779, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.488 std_dev=0.292
C2	B	0, -0.039, 0.259, 0.558, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.259 std_dev=0.299
C5	B	0, 0.012, 0.311, 0.610, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.311 std_dev=0.299
C4	B	0, 0.029, 0.329, 0.630, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.329 std_dev=0.301
N3	B	0, -0.006, 0.297, 0.600, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.297 std_dev=0.303
C2'	A	0, 0.206, 0.515, 0.824, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.515 std_dev=0.309
N1	B	0, -0.087, 0.222, 0.531, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.222 std_dev=0.309
C6	B	0, -0.068, 0.241, 0.551, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.241 std_dev=0.310
N4	B	0, 0.094, 0.406, 0.719, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.406 std_dev=0.313
P	B	0, 0.140, 0.468, 0.796, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.468 std_dev=0.328
O2'	A	0, 0.217, 0.546, 0.875, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.546 std_dev=0.329
C3'	B	0, 0.242, 0.573, 0.904, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.573 std_dev=0.331
OP2	B	0, 0.210, 0.555, 0.899, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.555 std_dev=0.345
C4'	B	0, 0.257, 0.611, 0.964, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.611 std_dev=0.353
OP1	B	0, 0.191, 0.561, 0.931, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.561 std_dev=0.370
OP1	A	0, 0.170, 0.597, 1.024, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.597 std_dev=0.427
O3'	B	0, 0.269, 0.700, 1.131, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.700 std_dev=0.431
C4'	A	0, 0.294, 0.734, 1.174, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.734 std_dev=0.440
OP2	A	0, 0.143, 0.584, 1.025, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.584 std_dev=0.441
O5'	B	0, 0.315, 0.760, 1.205, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.760 std_dev=0.445
C3'	A	0, 0.320, 0.800, 1.281, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.800 std_dev=0.480
C5'	B	0, 0.349, 0.831, 1.312, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.831 std_dev=0.481
O3'	A	0, 0.445, 1.116, 1.787, 1.792 max_d=1.792 avg_d=1.116 std_dev=0.671
C5'	A	0, 0.518, 1.281, 2.044, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.281 std_dev=0.763

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.26	0.21	0.12
C2	0.03	0.00	0.09	0.15	0.02	0.10	0.02	0.15	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.16	0.04	0.35	0.08	0.28	0.02
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.23	0.32	0.09
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.10	0.15	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.22	0.41	0.16
C4	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.33	0.19	0.27	0.07
C4'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.07	0.10	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.25	0.26	0.05
C5	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.19	0.29	0.07
C5'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.04	0.11	0.14	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.27	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.36	0.14	0.30	0.04
C8	0.02	0.03	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.28	0.26	0.26	0.11
N1	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.07	0.02	0.11	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.11	0.03	0.36	0.09	0.30	0.03
N3	0.03	0.00	0.09	0.15	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.16	0.04	0.33	0.14	0.26	0.04
N6	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.37	0.14	0.32	0.04
N7	0.02	0.02	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.33	0.24	0.28	0.09
N9	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.24	0.25	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.22	0.25	0.07
O3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.11	0.16	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.31	0.26	0.47	0.26
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.23	0.31	0.21	0.18
O5'	0.17	0.35	0.10	0.18	0.33	0.00	0.35	0.00	0.36	0.28	0.36	0.33	0.37	0.33	0.27	0.07	0.31	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.26	0.08	0.23	0.22	0.19	0.25	0.19	0.27	0.14	0.26	0.09	0.14	0.14	0.24	0.24	0.22	0.26	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.28	0.32	0.41	0.27	0.26	0.29	0.32	0.30	0.26	0.30	0.26	0.32	0.28	0.25	0.25	0.47	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.02	0.09	0.16	0.07	0.05	0.07	0.01	0.04	0.11	0.03	0.04	0.04	0.09	0.10	0.07	0.26	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.16	0.23	0.33	0.09	0.34	0.13	0.40	0.19	0.20	0.11	0.07	0.17	0.14	0.33	0.29	0.21	0.12	0.14	0.05
C2	0.08	0.10	0.09	0.08	0.19	0.07	0.24	0.03	0.18	0.12	0.12	0.19	0.06	0.07	0.08	0.11	0.23	0.16	0.28	0.14
C2'	0.16	0.12	0.22	0.36	0.07	0.35	0.07	0.49	0.11	0.14	0.08	0.09	0.16	0.12	0.36	0.25	0.25	0.18	0.08	0.12
C3'	0.13	0.05	0.21	0.33	0.11	0.26	0.10	0.34	0.03	0.08	0.05	0.16	0.10	0.15	0.34	0.18	0.10	0.02	0.12	0.01
C4	0.19	0.19	0.19	0.24	0.19	0.25	0.24	0.22	0.27	0.23	0.17	0.15	0.17	0.14	0.23	0.25	0.23	0.11	0.22	0.08
C4'	0.17	0.10	0.24	0.33	0.08	0.24	0.09	0.26	0.14	0.15	0.07	0.13	0.12	0.18	0.33	0.20	0.14	0.09	0.28	0.11
C5	0.24	0.27	0.22	0.26	0.25	0.30	0.27	0.26	0.29	0.28	0.25	0.21	0.24	0.18	0.24	0.30	0.22	0.10	0.22	0.05
C5'	0.22	0.15	0.29	0.36	0.17	0.28	0.18	0.29	0.20	0.20	0.15	0.22	0.15	0.25	0.38	0.24	0.26	0.24	0.44	0.24
C6	0.19	0.26	0.16	0.17	0.29	0.21	0.28	0.15	0.25	0.24	0.28	0.27	0.21	0.16	0.17	0.22	0.22	0.09	0.26	0.07
C8	0.30	0.26	0.29	0.39	0.19	0.46	0.21	0.50	0.26	0.29	0.21	0.15	0.27	0.22	0.38	0.41	0.19	0.14	0.16	0.03
N1	0.11	0.16	0.10	0.09	0.27	0.10	0.26	0.02	0.20	0.16	0.21	0.27	0.10	0.10	0.09	0.13	0.22	0.12	0.28	0.11
N3	0.11	0.12	0.13	0.15	0.15	0.13	0.22	0.08	0.21	0.15	0.11	0.13	0.09	0.09	0.14	0.15	0.24	0.16	0.25	0.13
N6	0.20	0.29	0.17	0.17	0.30	0.23	0.26	0.17	0.23	0.24	0.31	0.29	0.26	0.19	0.17	0.22	0.20	0.08	0.26	0.05
N7	0.32	0.30	0.28	0.35	0.24	0.43	0.25	0.43	0.28	0.31	0.26	0.21	0.31	0.24	0.34	0.39	0.20	0.14	0.19	0.03
N9	0.23	0.20	0.24	0.32	0.15	0.35	0.19	0.38	0.25	0.24	0.16	0.12	0.20	0.16	0.31	0.32	0.22	0.11	0.18	0.05
O2'	0.16	0.12	0.23	0.38	0.06	0.37	0.06	0.55	0.10	0.14	0.07	0.08	0.16	0.14	0.40	0.25	0.28	0.26	0.02	0.16
O3'	0.09	0.03	0.19	0.31	0.18	0.21	0.19	0.33	0.08	0.03	0.11	0.24	0.07	0.14	0.34	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00
O4'	0.20	0.16	0.25	0.32	0.14	0.27	0.18	0.29	0.24	0.21	0.13	0.13	0.16	0.17	0.32	0.25	0.16	0.04	0.25	0.06
O5'	0.32	0.35	0.39	0.36	0.28	0.21	0.32	0.07	0.37	0.36	0.30	0.21	0.35	0.32	0.34	0.27	0.28	0.31	0.03	0.16
OP1	0.14	0.04	0.22	0.21	0.12	0.09	0.04	0.06	0.10	0.11	0.08	0.24	0.05	0.18	0.22	0.14	0.36	0.06	0.27	0.18
OP2	0.45	0.50	0.40	0.42	0.54	0.51	0.49	0.63	0.43	0.45	0.54	0.56	0.50	0.43	0.41	0.45	0.30	0.51	0.41	0.42
P	0.04	0.09	0.09	0.08	0.18	0.06	0.11	0.17	0.05	0.05	0.15	0.26	0.08	0.05	0.08	0.03	0.22	0.23	0.02	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.33	0.07
C2	0.03	0.00	0.03	0.11	0.01	0.07	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.11	0.01	0.17	0.07	0.38	0.10
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.21	0.20	0.20	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.14	0.00	0.11	0.02	0.08	0.07	0.14	0.15	0.09	0.00	0.01	0.01	0.33	0.30	0.13	0.19
C4	0.02	0.01	0.03	0.14	0.00	0.17	0.01	0.35	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.14	0.07	0.16	0.25	0.47	0.23
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.17	0.00	0.18	0.00	0.14	0.07	0.12	0.19	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.33	0.04
C5	0.03	0.01	0.02	0.11	0.01	0.18	0.00	0.35	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.16	0.27	0.48	0.25
C5'	0.04	0.20	0.02	0.02	0.35	0.00	0.35	0.00	0.27	0.17	0.29	0.40	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.39	0.01
C6	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.07	0.16	0.18	0.42	0.19
N1	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.17	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.16	0.08	0.36	0.10
N3	0.02	0.01	0.03	0.14	0.00	0.12	0.01	0.29	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.13	0.04	0.16	0.15	0.43	0.17
N4	0.02	0.00	0.03	0.15	0.00	0.19	0.01	0.40	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.15	0.07	0.16	0.31	0.48	0.26
O2	0.07	0.00	0.04	0.09	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.09	0.05	0.19	0.07	0.33	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.06	0.15	0.00	0.01	0.05	0.05	0.13	0.26	0.02
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.14	0.01	0.11	0.01	0.08	0.07	0.13	0.15	0.09	0.01	0.00	0.02	0.31	0.38	0.08	0.23
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.04	0.07	0.05	0.05	0.02	0.00	0.10	0.06	0.37	0.12
O5'	0.09	0.17	0.21	0.33	0.16	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.16	0.16	0.19	0.05	0.31	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.07	0.20	0.30	0.25	0.10	0.27	0.15	0.18	0.08	0.15	0.31	0.07	0.13	0.38	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.38	0.20	0.13	0.47	0.33	0.48	0.39	0.42	0.36	0.43	0.48	0.33	0.26	0.08	0.37	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.09	0.19	0.23	0.04	0.25	0.01	0.19	0.10	0.17	0.26	0.05	0.02	0.23	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00